| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | CP000730 | 1,747,382 | (TAC)3→2 | 95.3% | coding (2065‑2067/2280 nt) | secDF ← | RND superfamily resistance‑nodulation‑cell division protein:proton (H+) antiporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 1747377 = | 2 (0.030) | 39 (0.650) | 31/242 | NT | 95.3% | coding (2072/2280 nt) | secDF | RND superfamily resistance‑nodulation‑cell division protein:proton (H+) antiporter |
| ? | CP000730 | = 1747373 | 2 (0.030) | coding (2076/2280 nt) | secDF | RND superfamily resistance‑nodulation‑cell division protein:proton (H+) antiporter | |||||
TTTCAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAACG > CP000730/1747238‑1747515 | ttttttcaactgacgttttttcattattccccatagcggaacggcaatgaagattgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaa < 1:87887‑M1/1‑1 (MQ=255) tttcaactgacgttttttcattattccccatagcggaacggcaatgaagattgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaacgttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaacta < 2:86082‑M1/4‑1 (MQ=255) tttcaactgacgttttttcattattccccatagcggaacggcaaagaggattgaagagaatacagcagaactcaatccgataaataatgctaaagtgaacttgaatatcgtaggagcaccgaagcatagtatagcaacta < 2:271357‑M1/4‑1 (MQ=255) tattgtcGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAACGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactac < 1:522256/134‑1 (MQ=255) ttttccattattccccatagcggaacggcaatgaagattgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGt > 2:436278‑M1/124‑140 (MQ=255) tgtttcagtattccccatagcggaacggcaaggaagattgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtacagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGt > 2:331622‑M1/124‑140 (MQ=255) ttcattattccccatagcggaacggcaatgaagattgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaggttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTaa < 1:192496‑M1/20‑1 (MQ=255) attttttcccctagcgcaacgtcaattaagattgaagagaattcaccagaaatcaatctgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATAc > 1:6183‑M1/118‑140 (MQ=255) ttccccatagcggaacggcaatgaagattgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtataacaACTACTACAATAACTCTTAATACTGTa < 2:255971‑M1/27‑1 (MQ=255) ccccatagcggaacggcaatgaagattgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtcggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTAtt < 1:351381‑M1/29‑1 (MQ=255) aGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAAt > 1:46687/1‑140 (MQ=255) gaacggcaatgaagattgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACgt < 1:349604‑M1/39‑1 (MQ=255) atgaagattgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATtgt > 2:646007‑M1/94‑140 (MQ=255) agatttaagaaaatacaccagaaatcaatcctataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATtgtctgt > 1:261633‑M1/90‑140 (MQ=255) aaattgaagagaatacaccagaaatcaatttgataaataattctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATtgtctgt > 1:50717‑M1/90‑140 (MQ=255) aatacaccagaaataaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCt > 1:543499‑M1/79‑140 (MQ=255) atacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTa < 1:634932‑M1/63‑1 (MQ=255) aGAAATCAATCCGATAAATAATGCAAAAGTAAAGTTGAATATCGTAAGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCCTTGCGTGGGGAATTGATCTATTaa < 2:540760/140‑1 (MQ=255) atcaatcctataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATatc > 1:724374‑M1/67‑140 (MQ=255) atcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatgtcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCGAATTGATCTATTAACGATatc < 1:526070‑M1/74‑1 (MQ=255) tcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcttaggatcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACGGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATatca > 1:223541‑M1/66‑140 (MQ=255) taatccgataaatattgctaaattaaagttgaatatcgtaggagcatcgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATatcat > 1:584416‑M1/65‑140 (MQ=255) caatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATatcat < 2:628176‑M1/76‑1 (MQ=255) aatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTCCTACTGTATTAATTGAACGTGTATTTGTCTGTCTAGTTGATCTATTAACGATatcatc > 2:536640‑M1/64‑140 (MQ=255) atccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATGGATCTATTAACGATAtcatca < 2:6015‑M1/78‑1 (MQ=255) ataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATTTCATCAATttgtcct < 1:125105‑M1/87‑4 (MQ=255) tgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATAATGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATAATCAATTTGTTCtgttg < 1:478795‑M1/91‑1 (MQ=255) agtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatatcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTaa > 2:209807‑M1/44‑140 (MQ=255) agtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTaa > 1:303791‑M1/44‑140 (MQ=255) taaggttgaatatcgcaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGCTTTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATc > 2:192496‑M1/42‑140 (MQ=255) aggtgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACt > 2:669251‑M1/39‑140 (MQ=255) gaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTaa > 1:303659‑M1/35‑140 (MQ=255) aatatcgtatgagcattgaagaatagttttgcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGAGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAAc > 1:305394‑M1/34‑140 (MQ=255) aatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAAc > 2:320422‑M1/34‑140 (MQ=255) aatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAAc > 2:490300‑M1/34‑140 (MQ=255) aatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAAc > 1:538673‑M1/34‑140 (MQ=255) accgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCTTAATCACTATAACCTTTTTTAAGtttt < 1:655493‑M1/121‑1 (MQ=255) cctaagaatagtataccaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTTTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTc > 1:216233‑M1/19‑140 (MQ=255) ccgaagaatagtattgcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTc > 1:651009‑M1/19‑140 (MQ=255) ccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCACCAATTCGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTc > 2:499090‑M1/19‑140 (MQ=255) agaatagtatcgcaTCTACGACAATAATTGTTAAAACTGTATTAATTGACTGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGt > 2:433124‑M1/15‑140 (MQ=255) tagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTTTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAGGTTTTCACgtaccc < 2:677381‑M1/130‑3 (MQ=255) gtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTTTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACgg < 1:576729‑M1/132‑1 (MQ=255) tatagcaAGTACTACAATAACTGTTAGTACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGt > 2:703350‑M1/8‑140 (MQ=255) atagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACCATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATAAATTTAACCTTTTCTAAGTTTTCACGTACAAGgta < 1:530638‑M1/134‑2 (MQ=255) caACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGAGATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAAc < 2:5260‑M1/138‑1 (MQ=255) aACTACTACAAGAACTTTTAATTCTGTACTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAACg > 2:748100‑M1/2‑140 (MQ=255) | TTTCAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAACG > CP000730/1747238‑1747515 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |