| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 830841 = | 24 (0.880) | 3 (0.120) | 3/246 | 3.9 | 11.6% | intergenic (+10/‑404) | raiA/secA1 | possible ribosome‑associated inhibitor protein Y/Sec family Type I general secretory pathway preprotein translocase subunit SecA |
| ? | CP000730 | 830871 = | 24 (0.960) | intergenic (+40/‑374) | raiA/secA1 | possible ribosome‑associated inhibitor protein Y/Sec family Type I general secretory pathway preprotein translocase subunit SecA | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TATTACAAATGAATCTATTAGGTCATGACTTCTTTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGA > CP000730/830707‑830973 | tATTACAAATGAATCTATTAGGTCATGACTTCTTTGTATTCACAGACAGATAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAACCAc < 1:26726/141‑1 (MQ=255) ttACAAATGAATCTATTAGGTCATGACTTCTTTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACtt < 1:128085/141‑1 (MQ=255) aCAAATGAATCTATTAGGTCATGACTTCTTTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTtgt > 2:65468/1‑141 (MQ=255) aaTGAATCTATTAGGTCATGACTTCTTTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGGCGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGtt < 2:260924/141‑1 (MQ=255) tATTAGGTCATGACTTCTTTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGcaca < 2:71707/141‑1 (MQ=255) cttcttTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTtat < 1:93561/141‑1 (MQ=255) ttGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACACGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTcc > 2:224245/1‑141 (MQ=255) aTGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCAt > 2:85239/1‑141 (MQ=255) tGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATa > 2:64878/1‑141 (MQ=255) aTCGTTTACCGCCGTGAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCAAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAAt > 2:22411/1‑141 (MQ=255) tCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATg > 1:106405/1‑141 (MQ=255) ttACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAAt < 1:161391/141‑1 (MQ=255) aCCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAAttt < 1:6286/141‑1 (MQ=255) aGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTtgaatgaa > 1:236031/1‑141 (MQ=255) gACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGaaa > 2:128659/1‑141 (MQ=255) aCGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAAc < 2:49494/141‑1 (MQ=255) gTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATa > 1:198441/1‑141 (MQ=255) ggCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTAt > 1:264579/1‑141 (MQ=255) tCAAACTAGTGAACAATAAACTAAATTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTTAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGt > 2:136758/1‑141 (MQ=255) aGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGa > 1:8554/1‑141 (MQ=255) aCAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGtat > 2:222645/1‑141 (MQ=255) cAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGtata > 1:92934/1‑141 (MQ=255) tAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTatatat > 1:296538/1‑141 (MQ=255) ttAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGa < 2:264579/141‑1 (MQ=255) | TATTACAAATGAATCTATTAGGTCATGACTTCTTTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGA > CP000730/830707‑830973 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |