| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 2080726 = | 72 (0.890) | 12 (0.160) | 10/252 | 8.9 | 15.7% | intergenic (‑194/+49) | USA300HOU_1938/USA300HOU_1939 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | CP000730 | 2080759 = | 64 (0.870) | intergenic (‑227/+16) | USA300HOU_1938/USA300HOU_1939 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TTTCAACTAAAATAGCGCAACAAAACCATTCAATCAAAATGATTATTGATTGCGATATATTGTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGCCACCTGTAATAAGTGTCATCATCCCTTCTTGCCACCACATCATTACACTACACCTCCGTTCGACTAA > CP000730/2080619‑2080897 | tttCAACTAAAATAGCGCAACAAAACCATTCAATCAAAATGATTATTGATTGCGATATATTGTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGtta < 1:564099/141‑1 (MQ=255)tttCAACTAAAATAGCGCAACAAAACCATTCAATCAAAATGATTATTGATTGCGAGATTTTTTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGtta < 1:189915/141‑1 (MQ=255) tCAACTAAAATAGCGCAACAAAACCATTCAATCAAAATGATTATTGATTGCGATATATTGTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGttatt > 1:793163/1‑141 (MQ=255) aaCTAAAATAGCGCAACAAAACCATTCAATCAAAATGATTATTGATTGCGATATATTGTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATGCTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGGCTGGGGGttattta > 1:265531/1‑141 (MQ=255) aaCTAAAATAGCGCAACAAAACCATTCAATCAAAATGATTATTGATTGCGATATATTGTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGttattta < 2:409280/141‑1 (MQ=255) cTAAAATAGCGCAACAAAACCATTCAATCAAAATGATTATTGATTGCGATATATTGTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTAtg < 1:311993/141‑1 (MQ=255) aaaTAGCGCAACAAAACCATTCAATCAAAATGATTATTGATTGCGATATATTGTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTAtgtgt > 2:764563/1‑141 (MQ=255) aaaTAGCGCAACAAAACCATTCAATCAAAATGATTATTGATTGCGATATATTGTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTAtgtgt > 2:313857/1‑141 (MQ=255) aGCGCAACAAAACCATTCAATCAAAATGATTATTGATTGCGATATATTGTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAg > 2:666659/1‑141 (MQ=255) gcAACAAAACCATTCAATCAAAATGATTATTGATTGCGATATATTGTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGAt < 1:542847/141‑1 (MQ=255) gcAACAAAACCATTCAATCAAAATGATTATTGATTGCGATATATTGTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGAt < 1:489044/141‑1 (MQ=255) acaaAACCATTCAATCAAAATGATTATTGATTGCGATATATTGTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGTAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCAt > 1:333581/1‑141 (MQ=255) aaaaTCATTCAATATAAATGATTATTTATTGCGGTATATTGTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTAGACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCAttt < 2:254270/141‑1 (MQ=255) aaaCCATTCAATCAAAATGATTATTGATTGCGATATATTGTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCAtttt < 2:713763/141‑1 (MQ=255) aaCCATTCAATCAAAATGATTATTGATTGCGATATATTGTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCAttttt < 2:618989/141‑1 (MQ=255) aaCCATTCAATCAAAATGATTATTGATTGCGATATATTGTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCAttttt < 2:466159/141‑1 (MQ=255) cATTCAATCAAAATGATTATTGATTGCGATATATTGTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTAt > 2:387805/1‑141 (MQ=255) caatcaaAATGATTATTGATTGCGATATATTGTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTAttttt < 2:468552/141‑1 (MQ=255) atcaaAATGATTATTGATTGCGATATATTGTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTAATTATGTGTGTAGGATCATGTTTTATTTTTcc < 2:500864/141‑1 (MQ=255) aaTGATTATTGATTGCGATATATTGTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTc < 1:295960/141‑1 (MQ=255) gATTATTGATTGCGATATATTGTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTTTTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGt < 2:743805/141‑1 (MQ=255) gATTATTGATTGCGATATATTGTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGt > 2:5515/1‑141 (MQ=255) attattGATTGCGATATATTGTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGtt < 1:177782/141‑1 (MQ=255) attgattgCGATATATTGTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTa < 2:242010/141‑1 (MQ=255) tgattgCGATATATTGTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAAc > 1:743979/1‑141 (MQ=255) gattgCGATATATTGTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAAcc < 2:58680/141‑1 (MQ=255) gattgCGATATATTGTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAAcc < 2:550749/141‑1 (MQ=255) ttgCGATATATTGTATTCAATGATATTATTTAAGTCTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTTTTTCCAGTTTATGTTGTTTTATTTAGATGTGTATGATCATTTTTTATTTTTCCACTTCAGTTCTAACCaa < 2:561322/141‑1 (MQ=255) tgCGATATATTGTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTAAACTAAAAAAAAAAAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTATaaaaaaa < 2:814142/141‑6 (MQ=255) cGATATATTGTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGt < 1:279445/141‑1 (MQ=255) atatatTGTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCg < 1:195422/141‑1 (MQ=255) atTGTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑aaaa < 2:579977/141‑1 (MQ=255) ttGTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑aaaaa > 1:360501/1‑141 (MQ=255) gtgtTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAaata > 1:652520/1‑141 (MQ=255) aaTGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCTATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGt > 2:193864/1‑141 (MQ=255) aTGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTa > 2:692025/1‑141 (MQ=255) aTGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTa > 1:216439/1‑141 (MQ=255) atatTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGc < 1:423604/141‑1 (MQ=255) tattatTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAGATAATTAGTAAGcc > 1:537018/1‑141 (MQ=255) tattTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGCCAcc < 1:211619/141‑1 (MQ=255) attTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTTAGTTCTAACCAAAGTCGAAAAAATAATTAGTAAGCCAcc > 2:319095/1‑141 (MQ=255) tAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGCCACCTGta > 1:193791/1‑141 (MQ=255) aaGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTTGTACTCCACCTGtaa > 2:217889/1‑141 (MQ=255) aGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAGGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGCCACCTGtaat < 1:855656/141‑1 (MQ=255) gtgtATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAACTAATTAGTAAGCCACCTGtaata > 2:29806/1‑141 (MQ=255) tgtATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGCCACCTGtaataa < 1:22501/141‑1 (MQ=255) aGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGCCACCTGTAATAAGTGtcatca < 1:754762/141‑1 (MQ=255) ataCTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGCCACCTGTAATAAGTGTCATCATCCctt < 1:681728/141‑1 (MQ=255) ataCTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGCCACCTGTAATAAGTGTCATCATCCctt > 1:827446/1‑141 (MQ=255) ataCTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGCCACCTGTAATAAGTGTCATCATCCctt < 2:476399/141‑1 (MQ=255) tactacACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGCCACCTGTAATAAGTGTCATCATCCcttc > 1:280060/1‑141 (MQ=255) aaCCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGCCACCTGTAATAAGTGTCATCATACCTTCTTGccacc > 1:208053/1‑141 (MQ=255) ccccAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGCCACCTGTAATAAGTGTCATCATCCCTTCTTGCcaccac < 2:601638/141‑1 (MQ=255) cccGAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGCCACCTGTAATAAGTGTCATCATCCCTTCTTGCCACcaca < 2:432741/141‑1 (MQ=255) cccAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGCCACCTGTAATAAGTGTCATCATCCCTTCTTGCCACcaca < 1:835972/141‑1 (MQ=255) ccAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTAATTTTT‑AATAATTATTAGTTATTCTTCTGTAATAATTGTCATCATCCCTTCTTTCCACCAcat > 2:667039/1‑141 (MQ=255) cAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGCCACCTGTAATAAGTGTCATCATCCCTTCTTGCCACCAcatc < 1:764563/141‑1 (MQ=255) gtctgctggtaccagACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAGATAATTAGTAAGCCACCTGTAATAAGTGTCATCATCTCTTCTTGCCACCACATCAtt > 2:593387/13‑141 (MQ=255) tGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTTTTTTTTCTTTTCGGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGCAACCTGTAATAAGTGTAATAATCCCTTCTTGCCACCCCGTCATtaca > 2:152447/1‑141 (MQ=255) ggTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGCCACCTGTAATAAGTGTCATCATCCCTTCTTGCCACCACATCATtacac > 1:710185/1‑141 (MQ=255) ggTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGCCACCTGTAATAAGTGTCATCATCCCTTCTTGCCACCACATCATtacac > 1:169122/1‑141 (MQ=255) gctggtaccagACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTATGCCACATGTCATAAGTGTCATCATCCCTTCTTGCCACCACATCATtacac > 2:318627/9‑141 (MQ=255) gctggtaccagACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGCCACCTGTAATAAGTGTCATCATCCCTTCTTGCCACCACATCATtaccc > 2:639137/9‑139 (MQ=255) gTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGCCACCTGTAATAAGTGTCATCATCCCTTCTTGCCACCACATCATtacact > 1:104843/1‑141 (MQ=255) gTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGCCACCTGTAATAAGTGTCATCATCCCTTCTTGCCACCACATCATtacact > 1:750805/1‑141 (MQ=255) ctggtaccagACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGCTACCTTTAATAAGTGTCATCATCCCTTCTTGCCACCACATCATtaaact > 2:99634/8‑141 (MQ=255) tggtaccagACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGCCACCTGTAATAAGTGTCATCATCCCTTCTTGCCACCACATCATtacacta > 1:184291/7‑141 (MQ=255) tggtaccagACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGCCACCTGTAATAAGTGTCATCATCCCTTCTTGCCACCACATCATtacacta > 2:183536/7‑141 (MQ=255) tACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGCCACCTGTAATAAGTGTCATCATCCCTTCTTGCCACCACATCATtacacta > 1:50281/1‑141 (MQ=255) agcagACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGCCACCTGTAATAAGTGTCATCATCCCTTCTTGCCACCACATCATTACACTACAcc > 2:689750/1‑141 (MQ=255) accagACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGCCACCTGTAATAAGTGTCATCATCCCTTCTTGCCACCACATCATTACACTACAcc < 2:73655/139‑1 (MQ=255) cagACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGCCACCTGTAATAAGTGTCATCATCCCTTCTTGCCACCACATCATTACACTACACCTc < 2:793163/141‑1 (MQ=255) tGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGCCACCTGTAATAAGTGTCATCATCCCTTCTTGCCACCACATCATTACACTACACCTCCGTTCg > 1:686653/1‑141 (MQ=255) ggggTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑TAAAATAATTAGTAAGCTACCTGTAATAAGTGTCATCATCCCTTCTTGCCACCACATCATTACACTACACCTCCGTTCGa > 2:851440/1‑141 (MQ=255) ggggTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGCCACCTGTAATAAGTGTCATCATCCCTTCTTGCCACCACATCATTACACTACACCTCCGTTCGa < 2:62175/141‑1 (MQ=255) gggTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGCCACCTGTAATAAGTGTCATCATCCCTTCTTGCCACCACATCATTACACTACACCTCCGTTCGAc < 2:604051/141‑1 (MQ=255) ttatttatGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGCCACCTGTAATAAGTGTCATCATCCCTTCTTGCCACCACATCATTACACTACACCTCCGTTCGACTaa < 2:366266/141‑1 (MQ=255) | TTTCAACTAAAATAGCGCAACAAAACCATTCAATCAAAATGATTATTGATTGCGATATATTGTGTTCAATGATATTATTTAAGTGTATCCACAGAATTATACTACACAACCCCAAGTCTGGTACCAGCAGACTTGGGGTTATTTATGTGTGTAGGATCATTTTTTATTTTTCCATTTCAGTTCTAACCAAAGTCG‑AAAAATAATTAGTAAGCCACCTGTAATAAGTGTCATCATCCCTTCTTGCCACCACATCATTACACTACACCTCCGTTCGACTAA > CP000730/2080619‑2080897 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |