| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 2760876 | 54 (0.850) | 3 (0.050) | 3/262 | 10.3 | 5.5% | coding (123/1371 nt) | citM | CitMHS family citrate‑magnesium (Mg2+):proton (H+) citrate‑calcium (Ca2+):proton (H+) symporter |
| ? | CP000730 | = 2760923 | 52 (0.870) | coding (76/1371 nt) | citM | CitMHS family citrate‑magnesium (Mg2+):proton (H+) citrate‑calcium (Ca2+):proton (H+) symporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TTGAATAAACCACTATCGTTCATGATGCCAAAGAAAATAATGGCAAAGATAAACATAATAACAACGTTGATGACTTGATCTAACCCTTTAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGCCCCATTACTGTTAACCACATATTATCACTATTCATATTATTTTCTCCCTCCAC > CP000730/2760739‑2761016 | ttGAATAAACCACTATCGTTCATGATGCCAAAGAAAATAATGGCAAAGATAAACATAATAACAACGTTGATGACTTGATCTAACCCTTTAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCt < 1:148793/141‑1 (MQ=255)ttGAATAAACCACTATCGTTCATGATGCCAAAGAAAATAATGGCAAAGATAAACATAATAACAACGTTGATGACTTGATCTAACCCTTTAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCt > 1:172656/1‑141 (MQ=255) gAATAAACCACTATCGTTCATGATGCCAAAGAAAATAATGGCAAAGATAAACATAATAACAACGTTGATGACTTGATCTAACCCTTTAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTaa > 2:154128/1‑141 (MQ=255) gAATAAACCACTATCGTTCATGATGCCAAAGAAAATAATGGCAAAGATAAACATAATAACAACGTTGATGACTTGATCTAACCCTTTAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCATAAAATCATTGCCCCTaa > 1:427361/1‑141 (MQ=255) gAATAAACCACTATCGATAATGATGGCAAAGAAAATAATGGCAAAGACAAACATAATAACAACGTTGATGACTTTATCTAACCCTGTAGCAAAAACTCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTACAATCATTGCCCCTaa < 2:207548/141‑1 (MQ=255) aaaaCCACTATCGTTCATGATGCCAAAGAAAATAATGGCAAAGATAAACATAATAACAACGTTGATGACTTGATCTAAAAAAAAAAAAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCa < 2:482945/140‑1 (MQ=255) cTATCGTTCATGATGCCAAAGAAAATAATGGCAAAGATAAACATAATAACAACGTTGATGACTTGATCTAACCCTTTAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATg < 1:167512/141‑1 (MQ=255) tATCGTTCATGATGCCAAAGAAAATAATGGCAAAGATAAACATAATAACAACGTTGATGACTTGATCTAACCCTTTAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGa < 1:33031/141‑1 (MQ=255) tCATGATGCCAAAGAAAATAATGGCAAAGATAAACATAATAACAACGTTGCTGACTTGATCTAACCCTTTAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCa > 1:156974/1‑141 (MQ=255) atgatgCCAAAGAAAATAATGGCAAAGATAAACATAATAACAACGTTGATGACTTGATCTAACCCTTTAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATa < 2:234704/141‑1 (MQ=255) atgCCAAAGAAAATAATGGCAAAGATAAACATAATAACAACGTTGATGACTTGATCTAACCCTTTAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCt < 1:636389/141‑1 (MQ=255) tgCCAAAGAAAATAATGGCAAAGATAAACATAATAACAACGTTGATGACTTGATCTAACCCTTTAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTa < 2:566822/141‑1 (MQ=255) aaaGAAAATAATGGCAAAGATAAACATAATAACAACGTTGATGACTTGATCTAACCCTTTAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAAc < 2:195857/141‑1 (MQ=255) aaGAAAATAATGGCAAAGATAAACATAATAACAACGTTGATGACTTGATCTAACCCTTTAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACt < 1:57449/141‑1 (MQ=255) aGAAAATAATGGCAAAGATAAACATAATAACAACGTTGATGACTTGATCTAACCCTTTAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTg > 2:613395/1‑141 (MQ=255) aataatGGCAAAGATAAACATAATAACAACGTTGATGACTTGATCTAACCCTTTAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATCATTCTCATACCTAAAACTGGAtt > 1:518911/1‑141 (MQ=255) ataatGGCAAAGATAAACATAATAACAACGTTGATGACTTGATCTAACCCTTTAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGAttt < 2:254551/141‑1 (MQ=255) cAAAGATAAACATAATAACAACGTTGATGACTTGATCTAACCCTTTAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCtttt < 1:139764/141‑1 (MQ=255) gATAAACATAATAACAACGTTGATGACTTGATCTAACCCTTTAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGc > 1:544326/1‑141 (MQ=255) tAAACATAATAACAACGTTGATGACTTGATCTAACCCTTTAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCaa < 2:289813/141‑1 (MQ=255) ataaCAACGTTGATGACTTGATCTAACCCTTTAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAACATCATTGCCCCTGAGCTAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTaaa < 1:135999/141‑1 (MQ=255) caacGTTGATGACTTGATCTAACCCTTTAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTa > 2:79060/1‑141 (MQ=255) caacGTTGATGACTTGATCTAACCCTTTAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTa < 1:568515/141‑1 (MQ=255) cGTTGATGACTTGATCTAACCCTTTAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACaa < 1:643347/141‑1 (MQ=255) gTTGATGACTTGATCTAACCCTTTAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAAt < 1:273551/141‑1 (MQ=255) tgatgaCTTGATCTAACCCTTTAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTg < 2:172656/141‑1 (MQ=255) gatgaCTTGATCTAACCCTTTAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGa < 1:77028/141‑1 (MQ=255) tgaCTTGATCTAACCCTTTAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGaaa > 1:42762/1‑141 (MQ=255) gATCTAACCCTTTAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAaataataa < 2:124203/141‑1 (MQ=255) aCCCTTTAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGa < 2:167375/141‑1 (MQ=255) cccTTTAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAg > 1:275583/1‑141 (MQ=255) atcgtcgaaaaaTCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCGTACTTACAACTGGATTTATCTTTTTGTCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGctc < 2:542706/134‑3 (MQ=255) ttAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGcccc < 2:459476/141‑1 (MQ=255) cAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGCCCCATTa > 1:343795/1‑141 (MQ=255) aaaaaTCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCATAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGCCCCATTACt > 1:157341/1‑141 (MQ=255) aaTCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGCCCCATTACTGtt > 1:332501/1‑141 (MQ=255) caaccaaATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGCCCCATTACTGTTAAcc < 2:544326/141‑1 (MQ=255) caaccaaATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGCCCCATTACTGTTAAcc < 1:60248/141‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) aaaaTCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGCCCCATTACTGTTAACCACATATTATCACTATTCATATTAttt < 2:579687/141‑1 (MQ=255) aaaaTCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGCCCCATTACTGTTAACCACATATTATCACTATTCATATTAttt > 2:221705/1‑141 (MQ=255) aaaaTCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGCCCCATTACTGTTAACCACATATTATCACTATTCATATTAttt > 2:446678/1‑141 (MQ=255) aaaTCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGCCCCATTACTGTTAACCACATATTATCACTATTCATATTAtttt > 2:183491/1‑141 (MQ=255) aTCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGTCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGCCCCATTACTGTTAACCACATATTATCACTATTCATATTATTTtct > 1:142685/1‑141 (MQ=255) aTCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGCCCCATTACTGTTAACCACATATTATCACTATTCATATTATTTtct < 2:608488/141‑1 (MQ=255) cATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGCCCCATTACTGTTAACCACATATTATCACTATTCATATTATTTTctcc < 2:673587/141‑1 (MQ=255) gCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGCCCCATTACTGTTAACCACATATTATCACTATTCATATTATTTTctccctcc < 2:60493/141‑1 (MQ=255) ccccTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGCCCCATTACTGTTAACCACATATTATCACTATTCATATTATTTTCTCCCTCCa > 1:291987/1‑141 (MQ=255) cccTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGCCCCATTACTGTTAACCACATATTATCACTATTCATATTATTTTCTCCCTCCAc < 2:678996/141‑1 (MQ=255) | TTGAATAAACCACTATCGTTCATGATGCCAAAGAAAATAATGGCAAAGATAAACATAATAACAACGTTGATGACTTGATCTAACCCTTTAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGCCCCATTACTGTTAACCACATATTATCACTATTCATATTATTTTCTCCCTCCAC > CP000730/2760739‑2761016 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |