Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | CP000730 | 819,056 | Δ596 bp | [ytxJ] | [ytxJ] |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | CP000730 | 819056 | 819651 | 596 | 39 [0] | [0] 39 | [ytxJ] | [ytxJ] |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | = 819055 | 0 (0.000) | 39 (1.030) | 32/276 | 0.3 | 100% | coding (2/321 nt) | ytxJ | hypothetical protein |
? | CP000730 | 819652 = | 0 (0.000) | intergenic (+278/‑147) | ytxJ/glxK | hypothetical protein/glycerate kinase |
AAAGTTAAAAATTTTGAATTTATGGTTAACATGTCAACTTACTATGTGTATAATGGTAAACATTGATATTAACTATATGTATAAAAATGTCACGCAGATGCTATTTAAATGTGATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000730/818916‑819055 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATATAATCACGAGATAAAATCTAAAATTTAAGATTAATCTTTTATGAATAAAAAACGTATCACAACAAATAATAAAGTAAGGTGG > CP000730/819652‑819790 attGTTAATAATTTTGAATTTATGGTTAACATGTCAACTTACTATGTGTATAATGGTAAACATTGATATTAACTATATGTATAAAAATGTCACGCATATGCTATTTAAATGTGATAAATATTTTTAGAGGTGTATAGAGTA > 2:41084/4‑141 AAAAATTTTGAATTTATGGTTAACATGTCAACTTACTATGTGTATAATGGTAAACATTGATATTAACTATATGTATAAAAATGTCACGCAGATGCTATTTAAATGTGATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGTAGCATAT > 1:135329/1‑141 AAATTTTGAATTTATGGTTAACATGTCAACTTACTATGTGTATAATGGTAAACATTGATATTAACTATATGTATAAAAATGTCACGCAGATGCTATTTAAATGTGATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGTAGCATATTG < 1:107915/141‑1 AATTTTGAATTTATGGTTAACATGTCAACTTACTATGTGTATAATGGTAAACATTGATATTAACTATATGTATAAAAATGTCACGCAGATGCTATTTAAATGTGATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGTAGCATATTGT < 1:271300/141‑1 AATTTTGAATTTATGGTTAACATGTCAACTTACTATGTGTATAATGGTAAACATTGATATTAACTATATGTATAAAAATGTCACGCAGATGCTATTTAAATGTGATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGTAGCATATTGT > 1:334355/1‑141 AATTTTGAATTTATGGTTAACATGTCAACTTACTATGTGTATAATGGTAAACATTGATATTAACTATATGTATAAAAATGTCACGCAGATGCTATTTAAATGTGATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGTAGCATATTGT < 2:402640/141‑1 TTGAATTTATGGTTAACATGTCAACTTACTATGTGTATAATGGTAAACATTGATATTAACTATATGTATAAAAATGTCACGCAGATGCTATTTAAATGTGATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGTAGCATATTGTTATT > 1:122075/1‑141 TTGAATTTATGGTTAACATGTCAACTTACTATGTGTATAATGGTAAACATTGATATTAACTATATGTATAAAAATGTCACGCAGATGCTATTTAAATGTGATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGTAGCATATTGTTATT > 1:293449/1‑141 TTGAATTTATGGTTAACATGTCAACTTACTATGTGTATAATGGTAAACATTGATATTAACTATATGTATAAAAATGTCACGCAGATGCTATTTAAATGTGATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGTAGCATATTGTTATT > 1:118999/1‑141 ATTTATGGTTAACATGTCAACTTACTATGTGTATAATGGTAAACATTGATATTAACTATATGTATAAAAATGTCACGCAGATGCTATTTAAATGTGATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGTAGCATATTGTTATTTACT < 2:88045/141‑1 TTATGGTTAACATGTCAACTTACTATGTGTATAATGGTAAACATTGATATTAACTATATGTATAAAAATGTCACGCAGATGCTATTTAAATGTGATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGTAGCATATTGTTATTTACTGG < 1:256238/141‑1 TAACATGTCAACTTACTATGTGTATAATGGTAAACATTGATATTAACTATATGTATAAAAATGTCACGCAGATGCTATTTAAATGTGATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGTAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATT < 1:347629/141‑1 ACTTACTATGTGTATAATGGTAAACATTGATATTAACTATATGTATAAAAATGTCACGCAGATGCTATTTAAATGTGATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGTAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATG > 1:158367/1‑141 ATAATGGTAAACATTGATATTAACTATATGTATAAAAATGTCACGCAGATGCTATTTAAATGTGATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGTAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGT > 1:68913/1‑141 TGGTAAACATTGATATTAACTATATGTATAAAAATGTCACGCAGATGCTATTTAAATGTGATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGTAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGC > 1:146670/1‑141 AAACATTGATATTAACTATATGTATAAAAATGTCACGCAGATGCTATTTAAATGTGATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGTAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATAT > 1:350774/1‑141 AAACATTGATATTAACTATATGTATAAAAATGTCACGCAGATGCTATTTAAATGTGATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGTAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATAT > 1:50139/1‑141 AACATTGATATTAACTATATGTATAAAAATGTCACGCAGATGCTATTTAAATGTGATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGTAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATATA > 1:74423/1‑141 ATATTAACTATATGTATAAAAATGTCACGCAGATGCTATTTAAATGTGATAAATATTTTTACAGGTTAATAGAGTAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATATAATCACGA < 1:110188/141‑1 AACTATATGTATAAAAATGTCACGCAGATGCTATTTAAATGTGATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGTAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATATAATCACGAGATAA > 2:97988/1‑141 TATGTATAAAAATGTCACGCAGATGCTATTTAAATGTGATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGTAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATATAATCACGAGATAAAATCT < 2:146670/141‑1 AAAAATGTCGCGCAGATGCTATTTAAATGTGATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGTAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATATAATCACGAGATAAAATCTAAAATTT > 1:358880/1‑141 GCTATTTAAATGTGATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGTAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATATAATCACGAGATAAAATCTAAAATTTAAGATTAATCTTTTATG < 1:126904/141‑1 CTATTTAAATGTGATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGTAGCATATAGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATATAATCACGAGATAAAATCTAAAATTTAATATTAATCTTTTATGA > 2:15688/1‑141 TTAAATGTGATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGTAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATATAATCACGAGATAAAATCTAAAATTTAAGATTAATCTTTTATGAATAA < 1:149253/141‑1 GTGATAAATATTTTTATTGTTGTGTTGAGTAGCAGATGGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCTCATATAATCACGAGATAAAATCTAAAATTTAAGATTAATCTTTTATGAATAAAAAACG > 2:90312/1‑141 GTGATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGTAGCATATTGTTATTTACTGTAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATATAATCACGAGATAAAATCTAAAATTTAAGATTAATCTTTTATGAATAAAAAACG > 2:119462/1‑141 GTGATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGTAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATATAATCACGAGATAAAATCTAAAATTTAAGATTAATCTTTTATGAATAAAAAACG < 1:392711/141‑1 TGATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGTAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATATAATCACGAGATAAAATCTAAAATTTAAGATTAATCTTTTATGAATAAAAAACGT < 1:274013/141‑1 GATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGTAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATATAATCACGAGATAAAATCTAAAATTTAAGATTAATCTTTTATGAATAAAAAACGTA > 1:189827/1‑141 ATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGTAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATATAATCACGAGATAAAATCTAAAATTTAAGATTAATCTTTTATGAATAAAAAACGTAT < 2:187300/141‑1 AAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGTAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATATAATCACGAGATAAAATCTAAAATTTAAGATTAATCTTTTATGAATAAAAAACGTATCA > 1:115859/1‑141 TATTTTTAGAGGTGAATAGAGTAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATATAATCACGAGATAAAATCTAAAATTTAAGATTAATCTTTTATGAATAAAAAACGTATCACAA > 2:226394/1‑141 TATTTTTAGAGGTGAATAGAGTAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATATAATCACGAGATAAAATCTAAAATTTAAGATTAATCTTTTATGAATAAAAAACGTATCACAA < 1:147518/141‑1 gTTTTAGAGGTGAATAGAGGAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATTATGTCATGTTAAATGTTCGTATATAATCACGAGATAAAATCTAAAATTTAAGATTAATCTTTTATGAATAAAAAACGTATCACAACA < 2:92329/140‑1 TTTTTAGAGGTGAATAGAGTAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATATAATCACGAGATAAAATCTAAAATTTAAGATTAATCTTTTATGAATAAAAAACGTATCACAACA > 1:310562/1‑141 TTTTTAGAGGTGAATAGAGTAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATATAATCACGAGATAAAATCTAAAATTTAAGATTAATCTTTAATGAATAAAAAACGTATCACAACA < 2:182777/141‑1 AGAGGTGAATAGAGTAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATATAATCACGAGATAAAATCTAAAATTTAAGATTAATCTTTTATGAATAAAAAACGTATCACAACAAATAA < 1:354562/141‑1 GTAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATATAATCACGAGATAAAATCTAAAATTTAAGATTAATCTTTTATGAATAAAAAACGTATCACAACAAATAATAAAGTAAGGTGG > 2:324330/1‑141 AAAGTTAAAAATTTTGAATTTATGGTTAACATGTCAACTTACTATGTGTATAATGGTAAACATTGATATTAACTATATGTATAAAAATGTCACGCAGATGCTATTTAAATGTGATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000730/818916‑819055 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATATAATCACGAGATAAAATCTAAAATTTAAGATTAATCTTTTATGAATAAAAAACGTATCACAACAAATAATAAAGTAAGGTGG > CP000730/819652‑819790 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |