New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | = 514456 | 199 (1.050) | 250 (1.360) | 5/288 | 17.2 | 57.0% | intergenic (+124/‑250) | rrs1/rrl1 | 16S ribosomal RNA/23S ribosomal RNA |
? | CP000730 | 514473 = | 183 (1.000) | intergenic (+141/‑233) | rrs1/rrl1 | 16S ribosomal RNA/23S ribosomal RNA | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 282 total aligned reads displayed.
CGTATCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTAAGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000730/514305‑514456 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tatgCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCATAAGAAATAATCGCTAGTGTTCGAAAGAACACTCAC > CP000730/514473‑514620 CGTATCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTAAGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTT > 1:1748613/1‑149 GGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTAAGGATATATTCGGGACCTCTTCTTCAGAAGAAGCGGAATAACGTGACATATCGTATTCAGTTTTCAACGGTTATTGAAGAATCAAATATTTTTTGGGTAAAGGGATATTGCTTATGCGA > 2:174384/1‑149 GACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACC < 2:689113/149‑1 gCATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCGTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCG < 2:1834688/148‑1 ACATCTTGTAGTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTGAAATTTTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCG < 1:1639492/149‑1 ACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTATTTGATATAGGCGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCG < 1:1551445/149‑1 catagtgatTTCAGGTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTACGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGA < 2:404257/140‑1 ATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAG < 2:570646/149‑1 TATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGT < 2:856048/149‑1 TGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGATCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACAGAGTGAA > 2:494740/1‑149 TGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAA < 2:1725410/149‑1 GTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCCAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAAT < 1:1497486/149‑1 TATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGTTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATA > 2:940361/1‑149 ATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAA > 1:41724/1‑149 TTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAA < 1:222675/149‑1 TTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATAGTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAA < 1:455735/149‑1 TCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACGGAGGGAATAAAG > 2:614848/1‑149 TCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAG < 1:1324370/149‑1 TCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAG > 2:151895/1‑149 TCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGGGAATAAAG > 2:1740747/1‑149 TCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACAGAGTGAATAAAa > 2:1644545/1‑148 TCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGA > 1:749717/1‑80 CAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGA > 1:1687275/1‑149 CAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGA > 1:1817083/1‑149 AGTTTTGAGTGGTTCCTCAACATTCAAATATTTTTTGGTGAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAACACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGcggacatagcgag > 2:1877488/1‑136 AGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGTGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTCCATTGAAAACTAGGTAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATCAAGAG > 2:1447813/1‑149 TTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTT < 2:762581/149‑1 TTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTT < 1:931511/149‑1 TTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTT < 1:696838/149‑1 TTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGTTTTTATTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTT > 2:1687007/1‑149 TTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTT > 1:1476102/1‑149 TTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTAGGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCTAAACCGAGTGAATAAAGAGTTT < 1:1043484/149‑1 TTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTT < 1:262712/149‑1 aaaGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATCGGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAA < 2:270734/146‑1 AATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAA > 1:298574/1‑149 AATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAA < 1:587253/149‑1 AATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAA > 1:1579954/1‑149 AATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAACTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAA < 1:1370729/149‑1 TTTATTTAACATTCAAATATTTTTTTTTTTTTTTTATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAATAAATTTTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACTGAGTGAATAAATAGTTTTTAATAAa > 2:1393162/1‑148 TTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAG > 1:1349620/1‑149 ATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGGGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTT > 1:1030853/1‑149 TTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGA > 2:116910/1‑149 TTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGA > 1:178622/1‑149 accTTCAAATATTTTGTTGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATT < 1:902899/146‑1 ACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAACTTGTACATTGAAAACTGAATAAGCAAGTAAAATATAGAGTTTACCAAGCAAAACCGAGTGCATAAATAGTTTGAAATAAGCTTGAATT > 2:323476/1‑149 ACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATGGATTTTACCAAGCAAAACGGAGTGTATAAGGAGTTTTAAATAAGCTTGAATT < 1:1095064/149‑1 ACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATT > 2:745114/1‑149 ACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATT < 2:755538/149‑1 CATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAATGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTGGAATgc > 2:1285800/1‑147 ATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCA < 2:441651/149‑1 ATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCA < 2:122520/149‑1 ATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTATAAATAAGCTTGAATTCA < 2:364866/149‑1 ATTCAAACATTTTTTGGCCAAAGGGATATTGCGTAGGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCA < 2:1375116/149‑1 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1:1414664/149‑1 ATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCATAAGAAATAATCGCTAGTGTTCttt < 2:1774868/149‑4 ATATTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAAGGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCATAAGAAATAATCGCTAGTGTTCGAA > 2:1994239/1‑149 TTGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCATAAGAAATAATCGCTAGTGTTCGAAAGA < 2:1673421/149‑1 TGCTTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCATAAGAAATAATCGCTAGTGTTCGAAAGAA > 1:1946103/1‑149 CTTATGCGAGCGCGTGACTAAAAAGGAATTGTACATTGAAAACTAGGTAGGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAGTCAAAACCGAGTGAATAAAGAGATTTAAATAAGCTTGAATTCATAAGAAATAATCGCTATTGTTTGAAAGAACA > 2:992115/1‑149 TTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCATAAGAAATAATCGCTAGTGTTCGAAAGAACAC < 1:1246986/149‑1 TTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCATAAGAAATAATCGCTAGTGTTCGAAAGAACAC > 1:1121768/1‑149 TTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCATAAGAAATAATCGCTAGTGTTCGAAAGAACAC < 2:23967/149‑1 TTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCATAAGAAATAATCGCTAGTGTTCGAAAGAACAC < 2:1902265/149‑1 agGCGGGCGCTTGGCTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGGAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGCGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCATAAGAAATAATCGCTAGTGTTCGAAAGAACACTC < 2:297200/147‑1 ATGCGATCGCTTAACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCATAAGAAATAATCGCTAGTGTTCGAAAGAACACTC < 2:667917/149‑1 ATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCATAAGAAATAATCGCTAGTGTTCGAAAGAACACTC > 2:542133/1‑149 TGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGCAAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACAAAGCAAAACCGAGTGAATAAGGAGTTTTAACTAAGATTGCATACATAAGAAATAATCGCTAGTGTTCGAAAGAACACTCA > 2:232661/1‑149 TGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCATAAGAAATAATCGCTAGTGTTCGAAAGAACACTCc > 1:36173/1‑148 TGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCATAAGAAATAATCGCTAGTGTTCGAAAGAACACTCA > 1:1718178/1‑149 TGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGAGTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCATAAGAAATAATCGCTAGTGTTCGAAAGAACACTCA > 1:1331853/1‑149 TGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGAACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTATCAAGCAACACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCATGAGAAATAATCGCTAGTGTTCGAAAGAACACTCA > 2:1116415/1‑149 TGCGAGCGCTTGACAAAAAAGAGATTGTAAATTGAAAAATAGAGAAGTAAGTAAAAGATAAATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTCAATTCCTAAGAAATCATCGCTAGTGTTCGATAGAACACTta > 2:466430/1‑147 GCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCATAAGAAATAATCGCTAGTGTTCGAAAGAACACTCAC > 2:1019109/1‑149 CGTATCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTAAGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000730/514305‑514456 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tatgCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCATAAGAAATAATCGCTAGTGTTCGAAAGAACACTCAC > CP000730/514473‑514620 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |