| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 514456 | 199 (1.050) | 250 (1.360) | 5/288 | 17.2 | 57.0% | intergenic (+124/‑250) | rrs1/rrl1 | 16S ribosomal RNA/23S ribosomal RNA |
| ? | CP000730 | 514473 = | 183 (1.000) | intergenic (+141/‑233) | rrs1/rrl1 | 16S ribosomal RNA/23S ribosomal RNA | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 200 total aligned reads displayed.
TCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTAAGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCATAAGAAATAATCGCTAGTG > CP000730/514309‑514603 | tgggAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTAAGGATATATGCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGa < 2:40798/147‑1 (MQ=18)tCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTTTAAGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGa < 2:373207/149‑1 (MQ=17)tCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTAAGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGa < 2:1953147/149‑1 (MQ=32) ggAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTAAGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAGTGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGaaa < 1:1133300/149‑1 (MQ=21) ggAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTAAGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTAAAAGTGATATTGCTAATGaaa > 1:1384798/1‑149 (MQ=25) gAAGGTTCGGCTGGATCACCTCCTTTCTAAGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGaaaa < 2:1281300/149‑1 (MQ=25) gAAGGGGCGGCTGGATCACCTTCTTTCTAAGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTTTATTAAGTTTTGAATGTTTATTTATCATTTTAATATTTTTTGGTTAATGTGATATTGCTTATGaaaa < 2:831173/149‑1 (MQ=11) aaGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTAAGGATATATTCGGAACATCTACTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAAt > 2:1300023/1‑149 (MQ=25) tGCGGCTGGATCACCTCCTTGTGAAGGATATATTCGGAACATCTTTTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAg < 2:545871/149‑1 (MQ=255) ggCGGCCGGATCACCTCCGTTCTAAGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAg < 2:800742/148‑1 (MQ=255) ggCTGGATCACCTCCTTTCTAAGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAg < 1:1719755/149‑1 (MQ=255) cacTGTATCACCTCCTTTCTAAGTATAGATTCAGAACATCTTCTTCAGAAAATGCGGAATAACGTGACATATTGCATTCACATTTAAATGATTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAg < 2:1209887/147‑1 (MQ=14) cTGGATCACCTCCTTTCTAAGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTa > 1:673317/1‑149 (MQ=255) cTGGATCACCTCCTTTCTAAGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTa > 2:574926/1‑149 (MQ=255) tGGATCACCTCCTTTCTAAGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTAt < 2:1706028/149‑1 (MQ=255) gtCACCTCCTTTCTAAGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCg < 1:1240511/148‑1 (MQ=255) aTCACCTCCTTTCTAAGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATACAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCCTATGAAAATAAAGCAGTATGCg < 1:1092987/149‑1 (MQ=255) cACCTCCTTTCTAAGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAg < 1:1650656/149‑1 (MQ=255) cACCTCCTTTCTAAGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAg < 1:467278/149‑1 (MQ=255) 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aGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGTTTTTTTTTATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTagaa > 2:1088747/1‑149 (MQ=17) aGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTaaaa > 1:1289298/1‑149 (MQ=255) aGGAAATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACAGATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTGGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTaaaa < 1:776205/149‑1 (MQ=255) atTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAAtt > 1:109145/1‑149 (MQ=255) tCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGt > 1:622035/1‑149 (MQ=255) tCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGt > 2:950999/1‑149 (MQ=255) tCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGt < 2:607996/149‑1 (MQ=255) tCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTGTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGTCTAAAAAGAAATTGt < 1:421607/149‑1 (MQ=255) tCGGAACATCTTCTTCAGAAGACGTGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGt > 2:438438/1‑149 (MQ=255) cGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGGGAGCGCTTGACTAGAAAGAAATGGTa > 1:1668084/1‑149 (MQ=255) 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cTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCATAAGAAATAATCGCt < 2:682291/149‑1 (MQ=255) | TCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTAAGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCATAAGAAATAATCGCTAGTG > CP000730/514309‑514603 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |