| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 514456 | 199 (1.050) | 250 (1.360) | 5/288 | 17.2 | 57.0% | intergenic (+124/‑250) | rrs1/rrl1 | 16S ribosomal RNA/23S ribosomal RNA |
| ? | CP000730 | 514473 = | 183 (1.000) | intergenic (+141/‑233) | rrs1/rrl1 | 16S ribosomal RNA/23S ribosomal RNA | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
ATCACCTCCTTTCTAAGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCATAAGAAATAATCGCTAGTGTTCGAAAGAACA > CP000730/514326‑514615 | aTCACCTCCTTTCTAAGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGca > 2:1682404/1‑148 (MQ=255)aTCACCTCCTTTCTAAGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCg < 1:238222/149‑1 (MQ=255) cACCTCCTTTCTAAGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAg < 1:467278/149‑1 (MQ=255) cACCTCCTTTCTAAGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAg < 1:1650656/149‑1 (MQ=255) cctcctTTCTAAGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGTAATAACTTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAgcg < 2:905485/149‑1 (MQ=255) tcctTTCTAAGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCt > 2:1662680/1‑149 (MQ=255) ctTTCTAAGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTg < 1:170276/149‑1 (MQ=255) ctTTCTAAGGATATATTCGGAACATCTTCCTCAGAAGAAGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTg < 1:296651/149‑1 (MQ=255) tttCTGAGGATATATTCGGAAAATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTGAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGa < 2:5594/149‑1 (MQ=255) tttCTAAGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGa < 2:1246357/149‑1 (MQ=255) tttCTAAGGATATATTCGGAACATCTTATTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTCATCAGTTCTGAATGTGTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGa < 2:1206869/149‑1 (MQ=17) aaGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTaaa < 2:1381991/149‑1 (MQ=255) aGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGTTTTTTTTTATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTagaa > 2:1088747/1‑149 (MQ=17) aGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTaaaa < 2:765050/149‑1 (MQ=255) ggATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTaaaaa > 1:1077252/1‑149 (MQ=255) ggATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTaaaaa < 2:1281339/149‑1 (MQ=255) tatatTCGGACAATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGaa < 2:1552773/149‑1 (MQ=255) atatTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGaaa < 1:1861366/149‑1 (MQ=255) tatTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAAt < 2:632685/149‑1 (MQ=255) tatTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAAt > 1:1185627/1‑149 (MQ=255) tCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGt > 2:950999/1‑149 (MQ=255) tCGGAACATCTTCTTCAGAAGACGTGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGt > 2:438438/1‑149 (MQ=255) cGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGGGAGCGCTTGACTAGAAAGAAATGGTa > 1:1668084/1‑149 (MQ=255) cGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTa > 2:307290/1‑149 (MQ=255) aaCATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACAt > 2:282906/1‑149 (MQ=255) aCATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACAtt < 2:249223/149‑1 (MQ=255) aTCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGa < 1:90476/149‑1 (MQ=255) aTCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTAGTTAAAATGTTATTGCTTATGACACTAAATCAGTATGCGAGCGCTTGACTTAAAAGAAATTGTACATTGa < 2:911288/149‑1 (MQ=18) ttcttcAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGaaaa < 1:72808/149‑1 (MQ=255) ctcttcAGAAGAAGAGGAATAACGTAACAGATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTTATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGaaaa < 1:540828/148‑1 (MQ=21) tcttcAGAAGATTCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAAc < 2:865429/149‑1 (MQ=255) cttcAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACt < 2:1825379/149‑1 (MQ=255) cttcAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTAGTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACt < 1:700037/149‑1 (MQ=255) cttcAGAAGATGCGGAATAACGTCACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACt < 1:1839724/149‑1 (MQ=255) cAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGa > 2:144379/1‑149 (MQ=255) cAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGa > 1:1937369/1‑149 (MQ=255) cAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGAAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGa > 2:880945/1‑149 (MQ=255) ataagaTGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGAt < 2:507400/147‑1 (MQ=255) gaagaTGTGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGAta < 1:399574/149‑1 (MQ=255) gaagaTGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTCAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGAta > 1:602033/1‑149 (MQ=255) gaagaTGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGAta > 2:1182403/1‑149 (MQ=255) gaagaTGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGAta > 2:1295075/1‑149 (MQ=255) gaagaTGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGAta < 2:1784648/149‑1 (MQ=255) gaagaTGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTAAAAACTAGAta > 2:85207/1‑149 (MQ=255) aagaTGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGACAACTATAtaa < 2:21482/149‑1 (MQ=255) aagaTGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGAtaa > 2:172530/1‑149 (MQ=255) aagaTGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGAtaa > 2:1460648/1‑149 (MQ=255) agctggggAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGAtaag < 1:11094/143‑1 (MQ=255) agaTGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGAtaag < 1:1091856/149‑1 (MQ=255) tGCGGGATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACAGTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGAtaagtaa < 2:453845/149‑1 (MQ=255) tGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGAtaagtaa < 2:232637/149‑1 (MQ=255) ggCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGAtaagtaa < 2:779000/148‑1 (MQ=255) aaTAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTaaa < 2:673317/149‑1 (MQ=255) aTAACGTGCTATATTGTATTTAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTATGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAACTACAGCAGTATGCGCGCGCTTGCCTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTaaaa < 2:1167077/149‑1 (MQ=25) aTAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTaaaa < 1:1361130/149‑1 (MQ=255) gACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGCTAAGTAAGTAAAATATAGAt > 1:1906063/1‑149 (MQ=255) tatTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTa < 1:519901/149‑1 (MQ=255) atTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTAc > 1:1568363/1‑149 (MQ=255) atTGTATTCAGTTTTGAACGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTAc > 1:1451762/1‑149 (MQ=255) 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ttCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTaa > 1:36763/1‑149 (MQ=255) atatTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAg < 1:756089/149‑1 (MQ=255) tatTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAACTATAGATTTTGCCCAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGATTTAAATaggt > 1:545087/1‑146 (MQ=18) tGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAAtt > 2:1330491/1‑149 (MQ=255) tGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAAtt < 1:84171/149‑1 (MQ=255) tGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAAtt < 2:1574205/149‑1 (MQ=255) tGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTGTTAAATAAACTTGAAtt > 2:1883643/1‑149 (MQ=255) ggTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTc < 1:345926/149‑1 (MQ=255) gTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAAttaa > 2:492291/1‑147 (MQ=255) gTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCa > 1:201855/1‑149 (MQ=255) tAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTCCCAAGCAAAACCGAGTGAATAAATAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCATa > 2:96896/1‑149 (MQ=255) aaGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAGATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCATAAg < 2:1384798/149‑1 (MQ=255) aaGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCATAAg < 1:1621865/149‑1 (MQ=255) aGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCTAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACCAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCATAAGa > 1:1004851/1‑149 (MQ=255) aGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTAAATTCATAAGa > 2:1599722/1‑149 (MQ=255) gCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTATTAAATAAGCTTGAATTCATAAGAAATAATCGc > 2:1152830/1‑149 (MQ=255) ttATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCATAAGAAATAATCGCTa > 1:874559/1‑149 (MQ=255) aaaaTAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCATAAGAAATAATCGCTAGTGtt < 1:1996621/149‑1 (MQ=39) aaTAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCACGCAAAACCGAGGGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCATAAGAAAGAATCGCTACTGTTCg > 2:682537/1‑149 (MQ=255) aGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCATAAGAAATAATCGCTAGTGTTCGAAAGa > 1:158309/1‑149 (MQ=33) gCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCATAAGAAATAATCGCTAGTGTTCGAAAGaa > 2:1962746/1‑149 (MQ=32) | ATCACCTCCTTTCTAAGGATATATTCGGAACATCTTCTTCAGAAGATGCGGAATAACGTGACATATTGTATTCAGTTTTGAATGTTTATTTAACATTCAAATATTTTTTGGTTAAAGTGATATTGCTTATGAAAATAAAGCAGTATGCGAGCGCTTGACTAAAAAGAAATTGTACATTGAAAACTAGATAAGTAAGTAAAATATAGATTTTACCAAGCAAAACCGAGTGAATAAAGAGTTTTAAATAAGCTTGAATTCATAAGAAATAATCGCTAGTGTTCGAAAGAACA > CP000730/514326‑514615 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |