| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 2021642 | 93 (1.150) | 5 (0.070) | 5/250 | 12.2 | 5.7% | intergenic (+201/+59) | yfkA/ykhA | possible dehydrogenase/acyl‑CoA hydrolase |
| ? | CP000730 | = 2021681 | 81 (1.110) | intergenic (+240/+20) | yfkA/ykhA | possible dehydrogenase/acyl‑CoA hydrolase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TTTAATGCTATTATAAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000730/2021494‑2021642‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaagacagattgtTAAGGATGAATTGAACTGTTATGTTCGAATATTCCACCTACAATCTGTCTTTTTGATTATGCACGTTTATGCTTTTAGTTAAAATTTACCCCTTTTATTATAGACTATTAGTCCTATTAAATGCCCTTTATTATTTAAG < CP000730/2021681‑2021543 TTTAATGCTATTATAAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGA > 2:833991/1‑141 TTAATGCTATTATAAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGAC > 2:46208/1‑141 TTAATGCTATTATAAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAATACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAGTAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGAC > 2:749812/1‑141 AATGCTATTATAAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAG > 2:73870/1‑141 ATGCTATTATAAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGA < 1:322673/141‑1 ATGCTATTATAAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGA < 1:322706/141‑1 TGCTATTATAAAATAAAAAACAATTAATTGATGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGAT > 1:51876/1‑141 TGCTATTATAAAATAAAAAACAATTAATTGATGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGAT > 1:51782/1‑141 AAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTTAAGGAT > 1:623614/1‑141 CAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTTAAGGATGAATTGAACT > 1:319722/1‑141 AATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTTAAGGATGAATTGAACTGTTATGTTCGAATATTCCACCTACAATC < 2:33881/141‑1 TAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTTAAGGATGAATTGAACTGTTATGTTCGAATATTCCACCTACAATCTG < 2:319722/141‑1 AGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTTAAGGATGAATTGAACTGTTATGTTCGAATATTCCACCTACAATCTGTCTTTT < 2:623614/141‑1 AAAGACAGATTGTTAAGGATGAATTGAACTGTTATGTTCGAATATTCCACCTACAATCTGTCTTTTTGATTATGCACGTTTATGCTTTTAGTTACACTTTACCCCCATTCTTATAGACAATTAGTCCTATTAAATGCCCTT > 1:612026/1‑141 AAAGACAGATTGTTAAGGATGAATTGAACTGTTATGTTCGAATATTCCACCTACAATCTGTCTTTTTGATTATGCACGTTTATGCTTTTAGTTAAAATTTACCCCTTTTATTATAGACTATTAGTCCTATTAAATGCCCTT > 1:329852/1‑141 AAAGACAGATTGTTAAGGATGAATTGAACTGTTATGTTCGAATATTCCACCTACAATCTGTCTTTTTGATTATGCACGTTTATGCTTTTAGTTAAAATTTACCCCTTTTATTATAGACTATTAGTCCTATTAAATGCCCTT < 2:589723/141‑1 aacACAGATTGTTAAGGATGAATTGAACTGTTATGTTCGAATATTCCACCTACAATCTGTCTTTTTGATTATGCACGTTTATGCTTTTAGTTATAATTTACCCCTTTTATTATAGACTATTAGTCCTATTAAATGCCCTTT < 2:595615/138‑1 AAGACAGATTGTTAAGGATGAATTGAACTGTTATGTTCGAATATTCCACCTACAATCTGTCTTTTTGATTATGCACGTTTATGCTTTTAGTTAAAATTTACCCCTTTTATTATAGACTATTAGTCCTATTGAATGCCCTTT < 2:209388/141‑1 AAGACAGATTGTTAAGGATGAATTGAACTGTTATGTTCGAATATTCCACCTACAATCTGTCTTTTTGATTATGCACGTTTATGCTTTTAGTTAAAATTTACCCCTTTTATTATAGACTATTAGTCCTATTAAATGCCCTTT < 1:160299/141‑1 AAGACAGATTGTTAAGGATGAATTGAACTGTTATGTTCGAATATTCCACCTACAATCTGTCTTTTTGATTATGCACGTTTATGCTTTTAGTTAAAATTTACCCCTTTGATTATAGACTATTAGTCCTATTAAATGCCCTTT < 1:453079/141‑1 GATTGTTAAGGATGAATTGAACTGTTATGTTCGAATATTCCACCTACAATCTGTCTTTTTGATTATGCACGTTTATGCTTTTAGTTAAAATTTACCCCTTTTATTATAGACTATTAGTCCTATTAAATGCCCTTTATTATT > 1:532248/1‑141 GTTAAGGATGAATTGAACTGTTATGTTCGAATATTCCACCTACAATCTGTCTTTTTGATTATGCACGTTTATGCTTTTAGTTAAAATTTACCCCTTTTATTATAGACTATTAGTCCTATTAAATGCCCTTTATTATTTAAG > 2:232432/1‑141 TTTAATGCTATTATAAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000730/2021494‑2021642‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaagacagattgtTAAGGATGAATTGAACTGTTATGTTCGAATATTCCACCTACAATCTGTCTTTTTGATTATGCACGTTTATGCTTTTAGTTAAAATTTACCCCTTTTATTATAGACTATTAGTCCTATTAAATGCCCTTTATTATTTAAG < CP000730/2021681‑2021543 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |