New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | = 2021642 | 93 (1.150) | 5 (0.070) | 5/250 | 12.2 | 5.7% | intergenic (+201/+59) | yfkA/ykhA | possible dehydrogenase/acyl‑CoA hydrolase |
? | CP000730 | = 2021681 | 81 (1.110) | intergenic (+240/+20) | yfkA/ykhA | possible dehydrogenase/acyl‑CoA hydrolase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
ATTATAAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCTTTTCTTCGTTCA > CP000730/2021503‑2021779 | attatAAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTa > 1:289819/1‑141 (MQ=255) taaaataaaaAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTg < 2:429693/141‑1 (MQ=255) aaaataaaaAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTgg < 1:534059/141‑1 (MQ=255) aaaataaaaAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTgg < 1:369457/141‑1 (MQ=255) aaataaaaAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGttaaggat > 1:623614/1‑134 (MQ=255) aaataaaaAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGa > 2:2627/1‑141 (MQ=255) aaataaaaAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGa < 2:785213/141‑1 (MQ=255) aataaaaAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGaa < 2:55563/141‑1 (MQ=255) aataaaaAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGaa < 1:89816/141‑1 (MQ=255) aataaaaAACAATTAATTGCCGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGaa < 1:416911/141‑1 (MQ=255) aaaaCAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTc > 2:703461/1‑141 (MQ=255) aaaCAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCg < 1:256571/141‑1 (MQ=255) aaaCAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCg > 2:608249/1‑141 (MQ=255) aCAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGaa > 1:730693/1‑141 (MQ=255) cacttcattGCTGGGAGTACTCTACTTAAAAAAGAAAGGGCATTTAATAGGACTAATCGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTACCTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAAc > 2:480561/7‑141 (MQ=255) aattGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAAc > 1:349820/1‑141 (MQ=255) ttGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAg > 2:564490/1‑141 (MQ=255) tGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGt < 2:776375/141‑1 (MQ=255) tGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGt < 1:870710/141‑1 (MQ=255) ggCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCaa > 2:516525/1‑141 (MQ=255) gCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAAt < 2:287500/141‑1 (MQ=255) gTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCa > 2:428364/1‑141 (MQ=255) tctACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAGAGCATAAACGTGCATAAGCAAAGAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCt > 1:473921/1‑141 (MQ=255) cTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAAc < 2:232432/141‑1 (MQ=255) aataatAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATc < 1:532248/141‑1 (MQ=255) aaaGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATCAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCtt > 1:453079/1‑141 (MQ=255) aaaGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCtt > 1:160299/1‑141 (MQ=255) aaaGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTATAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTGtt > 2:595615/1‑141 (MQ=255) aaaGGGCATTCAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCtt > 2:209388/1‑141 (MQ=255) aaGGGCATTTAATAGGACTAATTGTCTATAAGAATGGGGGTAAAGTGTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCttt < 1:612026/141‑1 (MQ=255) aaGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCttt > 2:589723/1‑141 (MQ=255) aaGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCttt < 1:329852/141‑1 (MQ=255) gCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTCTCTTTata‑t > 2:755191/1‑141 (MQ=255) cATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑tt > 1:524197/1‑141 (MQ=255) aTTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑ttt > 1:661932/1‑141 (MQ=255) aTTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑ttt < 1:679406/141‑1 (MQ=255) tttAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑tttt > 1:848880/1‑141 (MQ=255) ttAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑ttttt > 2:560451/1‑141 (MQ=255) 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2:18449/141‑1 (MQ=255) gACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTctct < 1:850707/141‑1 (MQ=255) gACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTctct > 2:99217/1‑141 (MQ=255) aCTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTa > 1:276821/1‑141 (MQ=255) gaTAGGCTAGAATAAAAGGGGGAAATTTTAACTAAAAGCTTAGACGTGGATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTNTCTaaga > 2:652983/2‑139 (MQ=255) aTAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAatat < 1:64318/141‑1 (MQ=255) 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< 1:157656/141‑1 (MQ=255) aaaaGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAg < 2:699391/141‑1 (MQ=255) aGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTa > 2:633415/1‑141 (MQ=255) gggTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTaa > 2:257394/1‑141 (MQ=255) ggTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTTTAGGTTGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAat < 1:215326/141‑1 (MQ=255) ggTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAat > 1:331918/1‑141 (MQ=255) 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2:645844/141‑1 (MQ=255) aCGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCaa > 1:775303/1‑141 (MQ=255) aCGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCaa > 1:52009/1‑141 (MQ=255) tGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCACTTGTTTGTTTACTTTCAATGc > 1:518399/1‑141 (MQ=255) gCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCg > 1:118047/1‑141 (MQ=255) aTAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGAc > 1:49754/1‑141 (MQ=255) aaTCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTTATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGt > 2:55767/1‑141 (MQ=255) tCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGc < 1:590068/141‑1 (MQ=255) cAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCt > 1:60376/1‑141 (MQ=255) aaaaGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCttt < 2:115351/141‑1 (MQ=255) aaGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCTTttc < 1:512106/141‑1 (MQ=255) aGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCTTttct < 2:770637/141‑1 (MQ=255) cAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCTTTTCTTCg < 2:52009/141‑1 (MQ=255) gATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCTTTTCTTCGtt > 1:473406/1‑141 (MQ=255) ttGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCTTTTCTTCGTTCa > 2:840150/1‑141 (MQ=255) ttGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCTTTTCTTCGTTCa > 2:840153/1‑141 (MQ=255) | ATTATAAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCTTTTCTTCGTTCA > CP000730/2021503‑2021779 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |