New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | = 2021642 | 93 (1.150) | 5 (0.070) | 5/250 | 12.2 | 5.7% | intergenic (+201/+59) | yfkA/ykhA | possible dehydrogenase/acyl‑CoA hydrolase |
? | CP000730 | = 2021681 | 81 (1.110) | intergenic (+240/+20) | yfkA/ykhA | possible dehydrogenase/acyl‑CoA hydrolase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCTTTTCTTCGTTCAACACGTTGTGGTGCTGTATCATAAAACCATTTTTCAACATCA > CP000730/2021543‑2021821 | cTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAAc < 2:232432/141‑1 (MQ=255) aataatAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATc < 1:532248/141‑1 (MQ=255) aaaGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATCAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCtt > 1:453079/1‑141 (MQ=255) aaaGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCtt > 1:160299/1‑141 (MQ=255) aaaGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTATAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTGtt > 2:595615/1‑141 (MQ=255) aaaGGGCATTCAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCtt > 2:209388/1‑141 (MQ=255) aaGGGCATTTAATAGGACTAATTGTCTATAAGAATGGGGGTAAAGTGTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCttt < 1:612026/141‑1 (MQ=255) aaGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCttt > 2:589723/1‑141 (MQ=255) aaGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCttt < 1:329852/141‑1 (MQ=255) gCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTCTCTTTata‑t > 2:755191/1‑141 (MQ=255) cATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑tt > 1:524197/1‑141 (MQ=255) aTTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑ttt > 1:661932/1‑141 (MQ=255) aTTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑ttt < 1:679406/141‑1 (MQ=255) tttAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑tttt > 1:848880/1‑141 (MQ=255) ttAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑ttttt > 2:560451/1‑141 (MQ=255) aTAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGt > 2:156886/1‑141 (MQ=255) tAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGtc > 1:627345/1‑141 (MQ=255) tAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGtc < 2:794628/141‑1 (MQ=255) tAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGtc < 2:759332/141‑1 (MQ=255) aGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGtct > 1:150015/1‑141 (MQ=255) ggACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGtctc < 2:18449/141‑1 (MQ=255) gACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTctct > 2:99217/1‑141 (MQ=255) gACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTctct < 1:850707/141‑1 (MQ=255) aCTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTa > 1:276821/1‑141 (MQ=255) gaTAGGCTAGAATAAAAGGGGGAAATTTTAACTAAAAGCTTAGACGTGGATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTNTCTaaga > 2:652983/2‑139 (MQ=255) aTAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAatat < 1:64318/141‑1 (MQ=255) aTAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAatat > 1:699391/1‑141 (MQ=255) aTAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAatat < 2:487094/141‑1 (MQ=255) cTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGc > 1:678505/1‑141 (MQ=255) aataaAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACtt > 2:836002/1‑141 (MQ=255) aataaAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACtt < 1:157656/141‑1 (MQ=255) aaaaGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAg < 2:699391/141‑1 (MQ=255) aGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTa > 2:633415/1‑141 (MQ=255) gggTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTaa > 2:257394/1‑141 (MQ=255) ggTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTTTAGGTTGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAat < 1:215326/141‑1 (MQ=255) ggTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAat < 1:397111/141‑1 (MQ=255) ggTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAat > 1:331918/1‑141 (MQ=255) gTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGGATAAACAAAAAGACGGATTGTAGGTGGAAGATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAACCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCGCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAata < 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agaaatgtaTAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAAttgttt < 2:122855/133‑1 (MQ=255) agaaatgtaTAAACATGCATAAACAAAACGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAAttgttt < 2:632644/133‑1 (MQ=255) aaGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTgtttgttt < 2:289819/141‑1 (MQ=255) aGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTa < 2:453079/141‑1 (MQ=255) cATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTCACt > 2:470906/1‑141 (MQ=255) aTAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACtt < 1:589723/141‑1 (MQ=255) aaaCGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTc > 1:1661/1‑141 (MQ=255) aaaCGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTc > 2:239333/1‑141 (MQ=255) aaCGGGCATAAGCAAAAAGACAGATTGTAAGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCa < 2:645844/141‑1 (MQ=255) aCGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCaa > 1:52009/1‑141 (MQ=255) aCGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCaa > 1:775303/1‑141 (MQ=255) 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aaCAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCTTTTCTTCGTTCAACACGTTGTGGTGCTGTCTCATa > 2:168187/1‑141 (MQ=255) aGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCTTTTCTTCGTTCAACACGTTGTGGTGCTGTATCATaaaa > 1:93795/1‑141 (MQ=255) gTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCTTTTCTTCGTTCAACACGTTGTGGTGCTGTATCATAAAAc < 2:497884/141‑1 (MQ=255) ttCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCTTTTCTTCGTTCAACACGTTGTGGTGCTGTATCATAAAAcc < 1:427198/141‑1 (MQ=255) aTTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTTTTTTTTTTTTTGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCTTTTCTTCGTTCTACACGTTGTGGTGCTGTATCATAAAACCAttt > 2:511896/1‑141 (MQ=255) aTTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGTACTTGAGCTAAATATTTAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCTTTTCTTCGTTCAACACGTTGTGCTGTTGTATCTTCAAACCAttt > 2:736087/1‑141 (MQ=255) aTTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCTTTTCTTCGTTCAACACGTTGTGGTGCTGTATCATAAAACCAttt < 2:510802/141‑1 (MQ=255) aTTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGATAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCTTTTCTTCGTTCAACACGTTGTGGTGCTGTATCATAAAACCAttt < 1:634365/141‑1 (MQ=255) cATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCTTTTCTTCGTTCAACACGTTGTGGTGCTGTATCATAAAACCATTTTTc < 2:627345/141‑1 (MQ=255) ccTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCTTTTCTTCGTTCAACACGTTGTGGTGCTGTATCATAAAACCATTTTTCaat < 1:415013/141‑2 (MQ=255) ttAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCTTTTCTTCGTTCAACACGTTGTGGTGCTGTATCATAAAACCATTTTTCaatat < 2:349820/141‑4 (MQ=255) ttAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCTTTTCTTCGTTCAACACGTTGTGGTGCTGTATCATAAAACCATTTTTCAatat > 2:250171/1‑141 (MQ=255) aaCAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCTTTTCTTCGTTCAACACGTTGTGGTGCTGTATCATAAAACCATTTTTCAAtatca < 2:577643/141‑1 (MQ=255) aaCAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCTTTTCTTCGTTCAACACGTTGTGGTGCTGTATCATAAAACCATTTTTCAAtatca < 1:2627/141‑1 (MQ=255) | CTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATA‑TTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCTTTTCTTCGTTCAACACGTTGTGGTGCTGTATCATAAAACCATTTTTCAACATCA > CP000730/2021543‑2021821 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |