New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | = 1114106 | 87 (0.690) | 6 (0.050) | 3/262 | 7.1 | 7.1% | intergenic (+35/‑4) | USA300HOU_1045/USA300HOU_1046 | hypothetical membrane protein/hypothetical protein |
? | CP000730 | = 1114131 | 80 (0.720) | coding (22/105 nt) | USA300HOU_1046 | hypothetical protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CTTATGGGTTATCGTGATGATTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTCCCATCAAGTCTTT > CP000730/1113984‑1114278 | cTTATGGGTTATCGTGATGATTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATAcaacca > 2:97501/1‑149 (MQ=255) cTTATGGGTTATCGTGATGATTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATAcaacca > 2:96746/1‑149 (MQ=255) tGGGTTATCGTGATGATTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACAt < 2:768822/149‑1 (MQ=255) tGGGTTATCGTGATGATTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACAt < 1:602136/149‑1 (MQ=255) gTTATCGTGATGATTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACAtttt > 2:176752/1‑149 (MQ=255) gTTATCGTGATGATTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACAtttt > 2:838183/1‑149 (MQ=255) gTTATCGTGATGATTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACAtttt > 2:122464/1‑149 (MQ=255) tCGTGATGATTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATg > 2:357115/1‑149 (MQ=255) tCGTGATGATTATGTTCATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATTTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATg < 1:130007/149‑1 (MQ=255) gTGATGGTTATGGTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGt < 2:576559/149‑1 (MQ=255) tgatgaTTATGTTGACTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGtt < 1:1162955/149‑1 (MQ=255) cgatgatTATGTGGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGtt < 1:787243/148‑1 (MQ=255) agaacataaagatGATTTCTAAAAAAGAAACAAAAAAAACAACACATAACGACGATAAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATATTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGtt < 2:403965/137‑1 (MQ=255) atgatTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGtttt > 1:653750/1‑149 (MQ=255) atgatTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGtttt > 1:221610/1‑149 (MQ=255) tATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTAtttt < 2:1341572/149‑1 (MQ=255) tGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATAATTATCATTACTATGTTATTAGCAAACGAAAAAACATTATAAAGTTAAGTGGTGAATTATTACAGACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTa > 2:449625/1‑149 (MQ=255) gTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTaa > 2:753643/1‑149 (MQ=255) tGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACt > 1:368470/1‑149 (MQ=255) tGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACt > 2:1199421/1‑149 (MQ=255) tGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACt > 2:1143073/1‑149 (MQ=255) tGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACt > 1:943395/1‑149 (MQ=255) aaaGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCtt > 1:786731/1‑149 (MQ=255) aaaGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCtt > 2:848105/1‑149 (MQ=255) aaaGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATATTTAACTTTGTAGTTCtt > 2:1184342/1‑149 (MQ=255) aacaacACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACg < 1:293879/149‑1 (MQ=255) acaTAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTaaa < 2:1249139/149‑1 (MQ=255) caTAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAACATGTTAAGTTGGTAATTCTTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAGCTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAAGGATTAAAt > 1:315107/1‑149 (MQ=255) caTAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAAt > 1:468897/1‑149 (MQ=255) tAAGGACTATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAg < 1:1050248/149‑1 (MQ=255) aaaGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAg < 1:658717/148‑1 (MQ=255) aaCGAAGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACAt < 2:61780/148‑1 (MQ=255) cGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACAttt < 2:1253928/149‑1 (MQ=255) cGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACAttt < 2:1054031/149‑1 (MQ=255) cGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACAttt < 2:112398/149‑1 (MQ=255) agATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACAttt < 1:1296945/148‑1 (MQ=255) atatTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACt < 2:265026/149‑1 (MQ=255) tatTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACtt < 2:727780/149‑1 (MQ=255) tttATCATTAATATGTTCCTAGTAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAg > 2:910372/1‑149 (MQ=255) tttATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGATTGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTaa > 2:994542/1‑148 (MQ=255) tttATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAg > 1:1267461/1‑149 (MQ=255) tttATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAg > 2:157368/1‑149 (MQ=255) tCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCACCATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTATAGTTCTTAGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTATAATACTTAGaata > 1:136099/1‑149 (MQ=255) tCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGTAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTTAAATACTAAAaata > 2:1025297/1‑149 (MQ=255) tCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAACTACTTAGaata > 2:234744/1‑149 (MQ=255) tCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGaata > 2:1215818/1‑149 (MQ=255) tCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAAACATTTAAAATACTTAGaata > 2:100786/1‑149 (MQ=255) tAATATGTTCATAGCCAAAGAAAAACCACTAAAAGGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGaataataa < 1:28544/149‑1 (MQ=255) aaTATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGaataataat > 1:563698/1‑149 (MQ=255) tatGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACAGGTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAAtaataataa > 1:191036/1‑149 (MQ=255) gCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAGATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGa > 1:1253207/1‑149 (MQ=255) cAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTACATGaa > 2:457100/1‑149 (MQ=255) aaaaGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGaaa < 1:925279/149‑1 (MQ=255) aaaaGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTATAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACGTTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTGAATGaaa > 1:240177/1‑149 (MQ=255) aaGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATg < 1:204840/149‑1 (MQ=255) aaaaCCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCAATGAAATGatat > 1:573151/1‑149 (MQ=255) cATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAAcc < 2:907478/149‑1 (MQ=255) aaaTGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGt < 2:1328970/149‑1 (MQ=255) aaaTGTTAAGGTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATTGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTTAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGt < 2:175166/149‑1 (MQ=255) aaTGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGtt > 1:953005/1‑149 (MQ=255) aaTGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCAATGtt > 1:455378/1‑149 (MQ=255) tGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGCTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGtttt < 1:753643/149‑1 (MQ=255) gTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTtta < 1:157368/149‑1 (MQ=255) gTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTtta < 1:910372/149‑1 (MQ=255) gTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTtta < 2:653750/149‑1 (MQ=255) gTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTACAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTtta < 2:221610/149‑1 (MQ=255) ttAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAGTAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTttat > 2:972822/1‑149 (MQ=255) ttAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTttat > 2:1058324/1‑149 (MQ=255) ttAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTttat > 2:151038/1‑149 (MQ=255) ttAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTACTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTttat > 2:135973/1‑149 (MQ=255) ttAAGTTCTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTttat < 1:80662/149‑1 (MQ=255) aGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCAGTAAATGATATTAACCCATGTTAtaatat > 2:439500/1‑149 (MQ=255) ttgttAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTATAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAg < 1:888959/149‑1 (MQ=255) ttgttAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAATTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAg > 2:516746/1‑149 (MQ=255) ttgttAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAg < 1:67069/149‑1 (MQ=255) tgttAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGa > 1:109802/1‑149 (MQ=255) attattAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGt < 1:1076410/149‑1 (MQ=255) tattaGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTACTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTcc < 1:899656/149‑1 (MQ=255) aCAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTCCCATCAAGt < 1:595736/149‑1 (MQ=255) caaccaacATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTCCCATCAAGTc > 1:587616/1‑149 (MQ=255) caaccaacATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTCCCATCAAGTc > 1:1264970/1‑149 (MQ=255) caaccaacATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACACATGTTTTATTATAGAAAGGTCCCATCAAGtt > 2:268881/1‑148 (MQ=255) acacaaaATTTTACTGGTTTTATTTTCAACTTTTTATTGCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTCCCATCAAGTCt < 2:1267461/146‑1 (MQ=255) aaccaccATTTTAATGGTTTCATTTTTAACTTTGTAGTTCGTGGAATGTTTCAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTCCCATCAAGTCt < 1:122464/149‑1 (MQ=255) aaccaacATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGGACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTCCCATCAAGTCt < 2:857315/149‑1 (MQ=255) aaccaacATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTCCCATCAAGTCt < 1:176752/149‑1 (MQ=255) aaccaacATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTCCCATCAAGTCt > 2:463811/1‑149 (MQ=255) aaccaacATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTCCCATCAAGTCt > 1:1022613/1‑149 (MQ=255) aaccaacATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTCCAATCAAGTCt > 2:157067/1‑149 (MQ=255) aaccaacATTTTAATCGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAGGGTCCCATCAAGTCt < 1:838183/149‑1 (MQ=255) ccaacATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTCCCATCAAGTCttt < 2:566360/149‑1 (MQ=255) ccaacATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTCCCATCAAGTCttt < 1:720956/149‑1 (MQ=255) ccaacATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTCCCATCAAGTCttt < 1:737862/149‑1 (MQ=255) ccaacATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTCCCATCAAGTCttt < 1:1229828/149‑1 (MQ=255) ccaacATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTCCCATCAAGTCttt < 2:249445/149‑1 (MQ=255) | CTTATGGGTTATCGTGATGATTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTCCCATCAAGTCTTT > CP000730/1113984‑1114278 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |