| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | CP000730 | 1,333,784 | 30 bp→TCGGTGGTCGCCGTATCATTAAAAAAAAAA | 12.9% | coding (185‑214/1239 nt) | hflX → | GTP‑binding protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 1333783 | 70 (0.710) | 8 (0.110) +TCGGTGGTCGCCGTATCATTAAAAAAAAAA |
5/198 | NT | 12.9% | coding (184/1239 nt) | hflX | GTP‑binding protein |
| ? | CP000730 | 1333814 = | 71 (0.720) | coding (215/1239 nt) | hflX | GTP‑binding protein | |||||
AGCTGTCTTAGTCGGTGTACATGCTCAAGATGATAAGCAATTTAATTTTGAGTCTACAATGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGACTGCACAATCCAAATCACTAAATGAAGCTTTAGGTGTAAAAAT > CP000730/1333644‑1333922 | aGCTGTCTTAGTCGGTGTACATGCTCAAGATGATAAGCAATTTAATTTTGAGTCTACAATGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCg < 2:920347/141‑1 (MQ=255) gCTGTCTTAGTCGGTGTACATGCTCAAGATGATAAGCAATTTAATTTTGAGTCTACAATGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGc > 2:10384/1‑141 (MQ=255) cTGTCTTAGTCGGTGTACATGCTCAAGATGATAAGCAATTTAATTTTGAGTCTACAATGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGcg > 2:530169/1‑140 (MQ=255) cTGTCTTAGTCGGTGTACATGCTCAAGATGATAAGCAATTTAATTTTGAGTCTACAATGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCa > 2:943108/1‑141 (MQ=255) gTCTTAGTCGGTGTACATGCTCAAGATGATAAGCAATTTAATTTTGAGTCTACAATGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCaaa > 2:1191434/1‑141 (MQ=255) gTCTTAGTCGGTGTACATGCTCAAGATGATAAGCAATTTAATTTTGAGTCTACAATGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCaaa > 1:765580/1‑141 (MQ=255) tCTTAGTCGGTGTACATGCTCAAGATGATAAGCAATTTAATTTTGAGTCTACAATGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAat < 1:234311/141‑1 (MQ=255) gTCGGTGTACATGCTCAAGATGATAAGCAATTTAATTTTGAGTCTACAATGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAAtattat < 2:4368/141‑1 (MQ=255) ggTGTACATGCTCAAGATGATAAGCAATTTAATTTTGAGTCTACAATGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGtt > 1:601319/1‑141 (MQ=255) aCATGCTCAAGATGATAAGCAATTTAATTTTGAGTCTACAATGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAAGATTgtggtgtaaa > 2:173041/1‑137 (MQ=255) cATGCTCAAGATGATAAGCAATTTAATTTTGAGTCTACAATGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCGGATATTACGGTggtata > 2:93493/1‑139 (MQ=255) gCTCAAGATGATAAGCAATTTAATTTTGAGTCTACAATGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTggtaaaggt < 2:344948/141‑1 (MQ=255) gCTCAAGATGATAAGCAATTTAATTTTGAGTCTACAATGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTggtaaaggt < 1:824413/141‑1 (MQ=255) cTCAAGATGATAAGCAATTTAATTTTGAGTCTACAATGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTggtaaaggta < 2:554489/141‑1 (MQ=255) cAAGATGATAAGCAATTTAATTTTGAGTCTACAATGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTggtaaaggtaaa < 1:508046/141‑1 (MQ=255) aaGATGATAAGCAATTTAATTTTGAGTCTACAATGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTaaaa > 1:501670/1‑141 (MQ=255) aGATGATAAGCAATTTAATTTTGAGTCTACAATGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATAGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAAt < 2:1002417/141‑1 (MQ=255) atgatAAGCAATTTAATTTTGAGTCTACAATGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTg > 1:684130/1‑141 (MQ=255) gatAAGCAATTTAATTTTGAGTCTACAATGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTgaa < 1:831288/141‑1 (MQ=255) gCAATTTAATTTTGAGTCTACAATGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCtcggagatcgccgtatcattaaaaaaaaaaaagaaat > 2:425792‑M1/1‑104 (MQ=255) tttaatttTGAGTCTACAATGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCaa < 2:423524/141‑1 (MQ=255) tttaatttTGAGTCTACAATGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCaa > 1:162592/1‑141 (MQ=255) taatttTGAGTCTACAATGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGc < 1:221385/141‑1 (MQ=255) aatttTGAGTCTACAATGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCa < 1:131806/141‑1 (MQ=255) tGAGTCTACAATGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTAt < 2:787896/141‑1 (MQ=255) tGAGTCTACAATGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTAt < 1:562431/141‑1 (MQ=255) cTACCATGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAACACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGt < 2:597541/141‑1 (MQ=255) tGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAg < 1:98639/141‑1 (MQ=255) tGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAg < 2:197168/141‑1 (MQ=255) gaggaATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCGAATATCACGGTAGCAAAGAAAAAATAGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGat > 2:522452/1‑141 (MQ=255) ggaATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGatat > 1:370386/1‑141 (MQ=255) gaATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATAtt > 1:539431/1‑141 (MQ=255) gaATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATAtt < 2:561290/141‑1 (MQ=255) aTTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACTGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGa < 1:140378/141‑1 (MQ=255) aTTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCGGATATCACCTTGTCAAAAGAAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGa > 2:1152537/1‑141 (MQ=255) atcatcTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGt > 1:774262/1‑141 (MQ=255) catcTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCGGTGATTGCGTTAGCAAAGGAAAAAATGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAg > 2:307265/1‑141 (MQ=255) atcTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGt < 1:336071/141‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) tCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATcaca > 1:248453/1‑141 (MQ=255) cAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCtcggtggtcgccgtatcataaaaaaaaaagaagaaattcaagcatttattgagttcaaagatattgatgtagtcatcacaa > 2:890742‑M1/1‑60 (MQ=255) gagaCTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAat < 2:923781/141‑1 (MQ=255) agaCTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAGAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAatg > 1:687729/1‑141 (MQ=255) gaCTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAatga > 1:308765/1‑141 (MQ=255) ttGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAAtgatga < 1:187230/141‑1 (MQ=255) tGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCtcggtggttgccgtagcaataaaaaaaaagaagaaattcaagcatttattgagttcaaagatattgatgtagtcatcacaaatgatgaa > 2:177770‑M1/1‑52 (MQ=255) tGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCtcggtggtcgccgtatcattaaaaaaaaaaaagaaattcaagcatttattgagttcaaagatattgatgtagtcatcacaaatgctgaa > 2:932236‑M1/1‑52 (MQ=255) tGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCgcggtggtcgcggtagcaaaaaaaaaaaaaaagaaattcaagcatttattgagttcaaagatattgatgtagtcatcacaaatgatgaa > 2:426761‑M1/1‑52 (MQ=255) tGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGaa < 1:5663/141‑1 (MQ=255) tGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGaa < 2:105710/141‑1 (MQ=255) 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2:104697‑M1/1‑44 (MQ=255) tGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGAc < 2:462780/141‑1 (MQ=255) aGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGACTGc > 1:804086/1‑141 (MQ=255) ttGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGACTGCACaa < 1:779430/141‑1 (MQ=255) ttGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGACTGCACaa < 1:960971/141‑1 (MQ=255) ttGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGACTGCACaa < 2:706476/141‑1 (MQ=255) 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1:135910/1‑141 (MQ=255) cAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGACTGCACAATCCAAATCACTAAAt < 2:238313/141‑1 (MQ=255) aaaaCAGAGATCGTGTAGATCGCACAAATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGACTGCACAATCCAAATCACTAAATg > 1:875667/1‑141 (MQ=255) aaaaCAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGACTGCACAATCCAAATCACTAAATg < 1:91483/141‑1 (MQ=255) aaaaCAGAGATCGCGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAACATTGACGACCTTAGAGCATTTATTGAGTACAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGACTGCACAATCCAAATCACTAAATg < 1:712720/141‑1 (MQ=255) aaCAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGACTGCACAATCCAAATCACTAAATGaa < 1:691297/141‑1 (MQ=255) agaTCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGACTGcaca < 2:447481/117‑1 (MQ=255) agaTCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGACTGcaca > 1:447481/1‑117 (MQ=255) aTCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGACTGCACAATCCAAATCACTAAATGAAGCTTTAg < 2:268106/141‑1 (MQ=255) tCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGACTGCACAATCCAAATCACTAAATGAAGCTTTAgg < 1:428174/141‑1 (MQ=255) gtgtAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGACTGCACAATCCAAATCACTAAATGAAGCTTTAGgtg < 1:725881/141‑1 (MQ=255) tgtAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGACTGCACAATCCAAATCACTAAATGAAGCTTTAGgtgt < 1:388070/141‑1 (MQ=255) tAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGACTGCACAATCCAAATCACTAAATGAAgataaaaaagaaa < 2:240228/141‑13 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |