| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | CP000730 | 1,333,784 | 30 bp→TCGGTGGTCGCCGTATCATTAAAAAAAAAA | 12.9% | coding (185‑214/1239 nt) | hflX → | GTP‑binding protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 1333783 | 70 (0.710) | 8 (0.110) +TCGGTGGTCGCCGTATCATTAAAAAAAAAA |
5/198 | NT | 12.9% | coding (184/1239 nt) | hflX | GTP‑binding protein |
| ? | CP000730 | 1333814 = | 71 (0.720) | coding (215/1239 nt) | hflX | GTP‑binding protein | |||||
GATAAGCAATTTAATTTTGAGTCTACAATGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGACTGCACAATCCAAATCACTAAATGAAGCTTTAGGTGTAAAAATTATTGATAGAACTCAGTTGATTCTTGA > CP000730/1333675‑1333949 | gatAAGCAATTTAATTTTGAGTCTACAATGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTgaa < 1:831288/141‑1 (MQ=255) gcaatttaattttgagtctacaatggaggaattatcatctttatcagagacttgccaacttgaagtgttgggtcaaattactcaaaacagagatcgtgtagatctcggagatcgccgtatcattaaaaaaaaaaAAGAAAt > 2:425792‑M2/135‑141 (MQ=255) tttaatttTGAGTCTACAATGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCaa < 2:423524/141‑1 (MQ=255) tttaatttTGAGTCTACAATGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCaa > 1:162592/1‑141 (MQ=255) 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(MQ=255) tGGAGGAATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAg < 2:197168/141‑1 (MQ=255) gaggaATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCGAATATCACGGTAGCAAAGAAAAAATAGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGat > 2:522452/1‑141 (MQ=255) ggaATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGatat > 1:370386/1‑141 (MQ=255) gaATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATAtt < 2:561290/141‑1 (MQ=255) gaATTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATAtt > 1:539431/1‑141 (MQ=255) aTTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACTGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGa < 1:140378/141‑1 (MQ=255) aTTATCATCTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCGGATATCACCTTGTCAAAAGAAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGa > 2:1152537/1‑141 (MQ=255) atcatcTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGt > 1:774262/1‑141 (MQ=255) catcTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCGGTGATTGCGTTAGCAAAGGAAAAAATGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAg > 2:307265/1‑141 (MQ=255) atcTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGt < 1:227598/141‑1 (MQ=255) atcTTTATCAGAGACTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGt < 1:336071/141‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) cagagacttgccaacttgaagtgttgggtcaaattactcaaaacagagatcgtgtagatctcggtggtcgccgtatcataaaaaaaaaagAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACaa > 2:890742‑M2/91‑141 (MQ=255) gagaCTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAat < 2:923781/141‑1 (MQ=255) agaCTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAGAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAatg > 1:687729/1‑141 (MQ=255) gaCTTGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAatga > 1:308765/1‑141 (MQ=255) ttGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAAtgatga < 1:187230/141‑1 (MQ=255) tgccaacttgaagtgttgggtcaaattactcaaaacagagatcgtgtagatctcggtggttgccgtagcaataaaaaaaaagAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGaa > 2:177770‑M2/83‑141 (MQ=255) tgccaacttgaagtgttgggtcaaattactcaaaacagagatcgtgtagatctcggtggtcgccgtatcattaaaaaaaaaaAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGCTGaa > 2:932236‑M2/83‑141 (MQ=255) tgccaacttgaagtgttgggtcaaattactcaaaacagagatcgtgtagatcgcggtggtcgcggtagcaaaaaaaaaaaaaAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGaa > 2:426761‑M2/83‑141 (MQ=255) tGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGaa < 2:105710/141‑1 (MQ=255) tGCCAACTTGAAGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGaa < 1:5663/141‑1 (MQ=255) gCCAACTTGACGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGCTCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAAt < 1:246691/141‑1 (MQ=255) 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2:462780/141‑1 (MQ=255) aGTGTTGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGACTGc > 1:804086/1‑141 (MQ=255) ttGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGACTGCACaa < 1:960971/141‑1 (MQ=255) ttGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGACTGCACaa < 2:706476/141‑1 (MQ=255) ttGGGTCAAATTACTCAAAACAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGACTGCACaa < 1:779430/141‑1 (MQ=255) tgggtcaaattactcaaaacagagatcgtgtagatctcggtggtcgccgtatcattaaaaaaaaaaAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGACTGCACAAt > 2:130305‑M2/67‑141 (MQ=255) 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(MQ=255) aaaaCAGAGATCGTGTAGATCGCACAAATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGACTGCACAATCCAAATCACTAAATg > 1:875667/1‑141 (MQ=255) aaaaCAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGACTGCACAATCCAAATCACTAAATg < 1:91483/141‑1 (MQ=255) aaaaCAGAGATCGCGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAACATTGACGACCTTAGAGCATTTATTGAGTACAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGACTGCACAATCCAAATCACTAAATg < 1:712720/141‑1 (MQ=255) aaCAGAGATCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGACTGCACAATCCAAATCACTAAATGaa < 1:691297/141‑1 (MQ=255) agaTCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGACTGcaca > 1:447481/1‑117 (MQ=255) agaTCGTGTAGATCGCAAATATTATGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGACTGcaca < 2:447481/117‑1 (MQ=255) 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1:188804/1‑141 (MQ=255) atGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGACTGCACAATCCAAATCACTAAATGAAGCTTTAGGTGTAAAAATTATTGATAGaa > 2:1060306/1‑141 (MQ=255) tGTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGACTGCACAATCCAAATCACTAAATGAAGCTTTAGGTGTAAAAATTATTNATAGAAc > 2:896978/1‑141 (MQ=255) gTTGGTAAAGGTAAAATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGACTGCACAATCCAAATCACTAAATGAAGCTTTAGGTGTAAAAATTATTGATAGAACt > 2:359300/1‑141 (MQ=255) ggtaaaggtaaaATTGACGAAATTCAAGCAGTTATTGAGTTCAAAGATATTGGTGTAGTCATCACAAATGATGAGTTAACGACTGCACAATCCAAATCACTAAATGAATCTTTAGGTGTAAAAATTATTGATAGAACTCAg < 2:1186064/141‑1 (MQ=255) gtaaaggtaaaATTGAAGAAATTCAAGCATTTATTGAGTTCAAAGATATTGATGTAGTCATCACAAATGATGAATTAACGACTGCACAATCCAAATCACTAAATGAAGCTTTAGGTGTAAAAATTATTGATAGAACTCAGt < 2:1022055/141‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |