New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | = 2670076 | 101 (1.020) | 3 (0.030) | 3/234 | NT | 3.0% | intergenic (+13/+69) | yicL/USA300HOU_2525 | DMT superfamily drug/metabolite transporter/esterase |
? | CP000730 | = 2670127 | 101 (1.120) | intergenic (+64/+18) | yicL/USA300HOU_2525 | DMT superfamily drug/metabolite transporter/esterase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
CCGTTATCGCAAGCAGTCTATGGTTACATGTGGCATTCAAACCATTTCAAATCGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATG > CP000730/2669936‑2670216 | ccGTTAGCGCAATCAGTCTATTGTTACATGCTGCATTCAAACCATTTCAAATCTTATGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATA < 1:1133889‑M1/141‑1 (MQ=255) cGTTATCGCAAGCAGTCTATGGTTACATGTGGCATTCAAACCATTTCAAATCGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACATGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATaa > 1:1141574/1‑141 (MQ=255) ttATCGCAAGCAGTCTATGGTTACATGTGGCATTCAAACCATTTCAAATCGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATc < 2:468876/141‑1 (MQ=255) ttATCGCAAGCAGTCTATGGTTACATGTGGCATTCAAACCATTTCAAATCGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATc < 1:28548/141‑1 (MQ=255) ttATCGCAAACAGTCTATGGTTACATGTGGCATTCAAACCATTTCAAATCGTAAGCATCACTCTTATACTGATTTTAATTCTATTACTATCACTTAAAAAACCACCCACAACATAAGATAAATAAAAAAACTCTGATAATc > 2:623060/1‑141 (MQ=255) aGCAGTCTATGGTTACATGTGGCATTCAAACCATTTCAAATCGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGc > 2:956271/1‑141 (MQ=255) aGCAGTCTATGGTTACATGTGGCATTCAAACCATTTCAAATCGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGc > 2:667226/1‑141 (MQ=255) cTATGGTTACATGTGGCATTCAAACCATTTCAAATCGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTaa > 2:9944/1‑141 (MQ=255) cTATGGTTACATGTGGCATTCAAACCATTTCAAATCGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTaa < 2:1160243/141‑1 (MQ=255) ggTTACATGTGGCATTCAAACCATTTCAAATCGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACtat > 1:598310/1‑141 (MQ=255) ggTTACATGTGGCATTCAAACCATTTCAAATCGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACtat < 1:388071/141‑1 (MQ=255) tgtgGCATTCAAACCATTTCAAATCGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTaa < 2:509618/141‑1 (MQ=255) tgtgGCATTCAAACCATTTCAAATCGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTaa > 1:328556/1‑141 (MQ=255) tgGCATTCATACCATTTCAAATCGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTaaca > 1:1051869/1‑141 (MQ=255) tgGCATTCAAACCATTTCAAATCGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTaaca > 2:915956/1‑141 (MQ=255) ggCATTCAAACCATTTCAAATCGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTaacaa > 1:631008/1‑141 (MQ=255) aaaCCATTTCAAATCGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGtt < 1:754464/141‑1 (MQ=255) aaCCATTTCAAATCGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTa > 2:638655/1‑141 (MQ=255) aaCCATTTCAAATCGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTa > 1:422247/1‑141 (MQ=255) aCCATTTCAAATCGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTAc > 1:295910/1‑141 (MQ=255) aCCATTTCAAATCGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTAc < 2:552889/141‑1 (MQ=255) ccATTTCAAATCGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTAcc > 2:434726/1‑141 (MQ=255) ccATTTCAAATCGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTAcc > 1:682390/1‑141 (MQ=255) ccATTTCAAATCGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTAcc < 2:185859/141‑1 (MQ=255) tttCAAATCGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTta > 1:774208/1‑141 (MQ=255) tttCAAATCGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTta > 2:105965/1‑141 (MQ=255) tttCAAATCGTAGGCATAATTCTTATTATGATTTTAATTTTCTTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTta > 2:413646/1‑141 (MQ=255) cAAATCGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAg > 2:907281/1‑141 (MQ=255) cAAATCGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAg > 2:178739/1‑141 (MQ=255) aaaTCGTAGTCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAgg > 1:1047354/1‑141 (MQ=255) aaTCGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGt > 1:1008590/1‑141 (MQ=255) cGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATAACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGAt > 1:698160‑M2/1‑140 (MQ=255) gTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGAta < 2:923715‑M2/141‑3 (MQ=255) tAGGCATCATTCTTAGTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAtcacctataaggtaactacgttgttaaataatagttacttgctaaagtgattat < 1:811520‑M1/141‑55 (MQ=255) ggCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGAtatca > 1:558564‑M2/1‑136 (MQ=255) gCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGAtatcag > 2:763270‑M2/1‑135 (MQ=255) atTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGAtatcagagttt > 1:802409‑M2/1‑130 (MQ=255) atTCTAATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAATGACAACCTGAAACATTAGATAAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTGACCTTATAGGTGAtatcagagttt > 2:1004866‑M2/1‑130 (MQ=255) ttCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAtcacctataaggtaactacgttgttaaataatagttacttgctaaagtgattatcagagtttt < 2:812597‑M1/141‑64 (MQ=255) tCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGttttt < 1:939885/141‑1 (MQ=255) cTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGtttttt < 1:1114517/141‑1 (MQ=255) tattatGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTttttat > 2:206106/1‑141 (MQ=255) tattatGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTttttat > 1:605068/1‑141 (MQ=255) attatGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTttttatt > 2:552979/1‑141 (MQ=255) ttatGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTttttattt < 2:215012/141‑1 (MQ=255) atGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTttttatttta > 1:422153/1‑141 (MQ=255) ttttaattttaTTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTt‑a > 1:553660/1‑141 (MQ=255) tttaattttaTTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGAtat < 1:301743‑M2/119‑4 (MQ=255) tttaattttaTTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTt‑aa > 2:808749/1‑141 (MQ=255) ttaattttaTTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTt‑aat < 1:370890/141‑1 (MQ=255) ttaattttaTTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTt‑aat > 2:885364/1‑141 (MQ=255) ttaattttaTTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTt‑aat < 1:508307/141‑1 (MQ=255) ttaattttaTTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTt‑aat > 2:230288/1‑141 (MQ=255) aattttaTTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTt‑aataa > 1:1128568/1‑141 (MQ=255) attttaTTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑aataat < 1:1059928/141‑1 (MQ=255) ttttaTTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑Aataata > 1:305052/1‑141 (MQ=255) ttattaCTATCACTTAAAAGACAACCTGATACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACATTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATAtt < 2:516193/141‑1 (MQ=255) ttattaCTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATAtt > 1:413749/1‑141 (MQ=255) ttattaCTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATAtt > 1:1090232/1‑141 (MQ=255) ctattaCCATCACTTAAAAGACACCCTGAAACATTAGATGACTACGAACAGAAAGATAGTCTTTCTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAACAtt > 2:1134556/2‑141 (MQ=255) tATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACt > 1:594372/1‑141 (MQ=255) aCTTAAATGACAACCTGTAACATTAGATGAATAAGAAACCTCGGATAATCACTTTAATCAGTACCTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGTTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCTCttatt < 2:779721/141‑4 (MQ=255) aCTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGt < 2:871603/141‑1 (MQ=255) tAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGtata < 1:732658/141‑1 (MQ=255) aaaGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATaaa > 1:370630/1‑141 (MQ=255) aaaGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATaaa > 1:530098/1‑141 (MQ=255) aaaGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCACAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAAAATTTTTCACTTGGAATaaa > 2:591831/1‑141 (MQ=255) aCAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGc > 2:180385/1‑141 (MQ=255) aaCCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGcgt > 2:877807/1‑141 (MQ=255) aaCCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGcgt > 2:980893/1‑141 (MQ=255) aCCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGcgtc < 1:98653/141‑1 (MQ=255) cTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGcgtcgt < 2:790812/141‑1 (MQ=255) gAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGtcgtcg > 1:816918/1‑141 (MQ=255) aaaCATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGc > 1:497373/1‑141 (MQ=255) aCATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGctc < 1:640532/141‑1 (MQ=255) aCATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGctc < 1:802879/141‑1 (MQ=255) aCATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGctc < 1:962598/141‑1 (MQ=255) ttAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCAAAAAATATAAAAAGCGTCGTCGCTCTgg < 2:758886/141‑1 (MQ=255) ttAGATGAATAAGAAAACACTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTgg < 1:170629/141‑1 (MQ=255) gATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGAAAAATAAT‑TTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTAt < 1:871083/141‑1 (MQ=255) aaTAAGAAAACTCTGATAATCTCTTTAGCAATTTACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATTGTTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTGTCACTTGTTATAAAAAGCGTCGTCGTTCTGGTATCGGa < 2:358680/141‑1 (MQ=255) aaTAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGa > 1:1007990/1‑141 (MQ=255) aaTAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGa < 2:524015/141‑1 (MQ=255) aGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTTGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCTTCGCTCTGGTATCTGAAATa > 2:444529/1‑141 (MQ=255) aGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCTTTTTTTATAAAAACCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATa > 2:583066/1‑141 (MQ=255) gAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATACAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATAc > 2:388728/1‑141 (MQ=255) aaaaCTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACt > 1:132772/1‑141 (MQ=255) aaCTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGAtatcagagttttcttattcatctaatgtttcaggttgtcttttaagtgatagtaataaaattaaaatcataataagaatg < 2:259606‑M2/141‑81 (MQ=255) aaCTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTgg > 2:206762/1‑141 (MQ=255) tctGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATa < 1:899846/141‑1 (MQ=255) ctGATAtcacctataaggtaactacgttgttaaataatagttacttgctaaagtgattatcagagttttcttattcatctaatgtttcaggttgtcttttaagtgatagtaataaaattaaaatcataataagaatgatgc > 2:763270‑M1/1‑6 (MQ=255) gATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAat < 2:1020554/141‑1 (MQ=255) gATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAat < 2:664687/141‑1 (MQ=255) atatcacctataaggtaactacgttgttaaataatagttacttgctaaagtgattatcagagttttcttattcatctaatgtttcaggttgtcttttaagtgatagtaataaaattaaaatcataataagaatgatgccta < 2:526648‑M1/141‑139 (MQ=255) atatcacctataaggtaactacgttgttaaataatagttacttgctaaagtgattatcagagttttcttattcatctaatgtttcaggttgtcttttaagtgatagtaataaaattaaa > 2:301743‑M1/1‑3 (MQ=255) aTAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGAtatcagagttttcttattcatctaatgtttcaggttgtcttttaagtgatagtaataaaattaaaatcatactaagaatgatgccta < 1:811520‑M2/141‑88 (MQ=255) aTAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGGATTTACCTTATAGGTGATATCAGATTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAata < 1:950301/141‑1 (MQ=255) aaaTCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAatat < 2:487304/140‑1 (MQ=255) aaTCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATCAAAAGCGTCGCCGCTTTGGTAGCGGAAATACTGGATAAATATg < 2:53855/141‑1 (MQ=255) aaTCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATg < 1:481837/141‑1 (MQ=255) | CCGTTATCGCAAGCAGTCTATGGTTACATGTGGCATTCAAACCATTTCAAATCGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATG > CP000730/2669936‑2670216 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |