| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP000730 | = 2670076 | 101 (1.020) | 3 (0.030) | 3/234 | NT | 3.0% | intergenic (+13/+69) | yicL/USA300HOU_2525 | DMT superfamily drug/metabolite transporter/esterase |
| ? | CP000730 | = 2670127 | 101 (1.120) | intergenic (+64/+18) | yicL/USA300HOU_2525 | DMT superfamily drug/metabolite transporter/esterase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
CGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTCGATACCTTTCGCACTCAA > CP000730/2669988‑2670267 | gTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGAta < 2:923715‑M2/141‑3 (MQ=255) tAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGAtat < 2:526648‑M2/141‑4 (MQ=255) atTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGAtatcagagttt > 1:802409‑M2/1‑130 (MQ=255) tCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGttttt < 1:939885/141‑1 (MQ=255) cTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGtttttt < 1:1114517/141‑1 (MQ=255) tattatGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTttttat > 2:206106/1‑141 (MQ=255) attatGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTttttatt > 2:552979/1‑141 (MQ=255) attatGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTttttatt > 2:517886/1‑141 (MQ=255) tatGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTttttatttt > 2:972257/1‑141 (MQ=255) atGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTttttatttta > 1:422153/1‑141 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2:885364/1‑141 (MQ=255) attttaTTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTaataat < 1:1059928/141‑1 (MQ=255) attttaTTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTCATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTaataat > 2:1178588/1‑141 (MQ=255) ttttaTTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAataata > 1:305052/1‑141 (MQ=255) ttattaCTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATAtt > 2:771004/1‑141 (MQ=255) ttattaCTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATAtt > 1:413749/1‑141 (MQ=255) ctattaCCATCACTTAAAAGACACCCTGAAACATTAGATGACTACGAACAGAAAGATAGTCTTTCTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAACAtt > 2:1134556/2‑141 (MQ=255) tattaCTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATAttt < 2:796038/141‑1 (MQ=255) aCTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACTACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATATTTTTCa < 2:594534/141‑1 (MQ=255) aCTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATATTTTTCa > 1:747354/1‑141 (MQ=255) tATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATATTTTTCACt > 1:594372/1‑141 (MQ=255) tCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATATTTTTCACTTg < 1:1051490/141‑1 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ctGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATaa < 2:577813/141‑1 (MQ=255) gATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAat < 2:664687/141‑1 (MQ=255) gATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAat < 2:1020554/141‑1 (MQ=255) aTAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAata < 1:818210/141‑1 (MQ=255) aTAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGGATTTACCTTATAGGTGATATCAGATTTTTTTATTTTAGTTAATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAata < 1:950301/141‑1 (MQ=255) tAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAatat < 1:430505/141‑1 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(MQ=255) aacaacGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTc < 2:865570/141‑1 (MQ=255) aacaacGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTc > 1:1139915/1‑141 (MQ=255) acaacGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTATTTAATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTNTCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCACGTATAAAGTCa > 2:464940/1‑141 (MQ=255) acaacGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCa > 1:862799/1‑141 (MQ=255) caacGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATATTTTTTACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCAt > 2:885990/1‑141 (MQ=255) acGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATATTTTTTTCTTTTTTTAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAATTCTTGt > 2:1084290/1‑141 (MQ=255) gTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTc > 1:71464/1‑141 (MQ=255) tAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTGTTTTATTTTAGTTAATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTCg < 2:1179697/141‑1 (MQ=255) gTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCAAGGTATAAAGTCATGTTCGAt > 2:481537/1‑141 (MQ=255) ccTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTCGATACCt > 1:875101/1‑141 (MQ=255) cTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTCGATACCtt < 2:370630/141‑1 (MQ=255) ttATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTCGATACCttt < 2:328556/141‑1 (MQ=255) tataGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTCGATACCTTTc < 1:963444/141‑1 (MQ=255) ggTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTCGATACCTTTCGCAc < 2:17450/141‑1 (MQ=255) gTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTCGATACCTTTCGCACt > 2:61772/1‑141 (MQ=255) tGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTCGATACCTTTCGCACTc < 2:870967/141‑1 (MQ=255) tGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTCGATACCTTTCGCACTc < 1:121342/141‑1 (MQ=255) gATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTCGATACCTTTCGCACTca > 1:1091111/1‑141 (MQ=255) gATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTCGATACCTTTCGCACTca < 1:980893/141‑1 (MQ=255) atatCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTCGATACCTTTCGCACTcaa > 1:902619/1‑141 (MQ=255) atatCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTCGATACCTTTCGCACTcaa > 1:258721/1‑141 (MQ=255) atagCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTCGATACCTTTCGCACTcaa < 2:354675/141‑1 (MQ=255) | CGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTTAATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTCGATACCTTTCGCACTCAA > CP000730/2669988‑2670267 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |