| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 2682927 | 117 (1.180) | 4 (0.040) | 3/240 | NT | 3.5% | intergenic (‑106/‑148) | mvaA/mvaS | hydroxymethylglutaryl‑CoA reductase/hydroxymethylglutaryl‑CoA synthase |
| ? | CP000730 | = 2682968 | 115 (1.250) | intergenic (‑147/‑107) | mvaA/mvaS | hydroxymethylglutaryl‑CoA reductase/hydroxymethylglutaryl‑CoA synthase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
CTCCTTTTACTTCACATAATTTTTAACATTTCAATCACTACTATTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAATTTGAAAGGATGTAAAACCTTATGACAATAGGTATCGATAAAATAAACTTTTACG > CP000730/2682829‑2683108 | cTCCTTTTACTTCACATAATTTTTAACATTTCAATCACTACTATTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTTTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGAAAATTAAAACGCTTACAAGa < 1:1014788‑M2/141‑2 (MQ=255) ccTTTTACTTCACATAATTTTTAACATTTCAATCACTACTATTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGaaa < 1:840919‑M2/141‑4 (MQ=255) ttttACTTCACATAATTTTTAACATTTCAATCACTACTATTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGaaacg < 2:1179907‑M2/141‑6 (MQ=255) tttACTTCACATAATTTTTAACATTTCAATCACTACTATTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGaaacga < 2:898747‑M2/141‑7 (MQ=255) aCTTCACATAATTTTTAACATTTCAATCACTACTATTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGaaacgacaa < 2:685228‑M2/141‑10 (MQ=255) cTTCACATAATTTTTAACATTTCAATCACTACTATTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACaaa > 1:493167/1‑141 (MQ=255) ttCACATAATTTTTAACATTTCAATCACTACTATTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAAGGACAAAt < 1:944180/141‑1 (MQ=255) ttCACATAATTTTTAACATTTCAATCACTACTATTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAAt < 2:1008164/141‑1 (MQ=255) cacaTAATTTTTAACATTTCAATCACTACTATTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATc < 1:181796/140‑1 (MQ=255) cacaTAATTTTTAACATTTCAATCACTACTATTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATc > 2:181796/1‑140 (MQ=255) cacaTAATTTTTAACATTTCAATCACTACTATTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCa > 2:140283/1‑141 (MQ=255) aTAATTTTTAACATTTCAATCACTACTATTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCAttt < 1:729315/141‑1 (MQ=255) aTAATTTTTAACATTTCAATCACTACTATTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCAttt < 2:843330/141‑1 (MQ=255) tAATTTTTAACATTTCAATCACTACTATTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCAtttt < 2:462545/141‑1 (MQ=255) tttAACCTTTTAATCATTTTTTTTTGTATCACTAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTGTAAAATAAAACAAGGTAATTTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAAt < 2:772772/141‑1 (MQ=255) tttAACATTTCAATCACTACTATTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAAt > 2:357537/1‑141 (MQ=255) tAACATTTCAATCACTACTATTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAAttt < 2:25794/141‑1 (MQ=255) tAACATTTCAATCACTACTATTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAAttt > 1:439859/1‑141 (MQ=255) aaCATTTCAATCACTACTATTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTa > 1:293831/1‑141 (MQ=255) aaaTTTCAATCACTACTATTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAg < 2:447527/139‑1 (MQ=255) aCATTTCAATCACTACTATTTTTATTTTTTTTTAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAAACATTTTTAAATTTAg > 2:502964/1‑141 (MQ=255) aCATTTCAATCACTACTATTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAg > 2:593294/1‑141 (MQ=255) aCATTTCAATCACTACTATTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAg > 1:82025/1‑141 (MQ=255) cATTTCAATCACTACTATTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTCTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGt < 1:387701/141‑1 (MQ=255) aTTTCAATCACTACTATTTTTACCACAATATAACGTCATTCGTCTTAAAATTAAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGta < 2:801314/141‑1 (MQ=255) aTTTCAATCACTACTATTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGta < 2:390766/141‑1 (MQ=255) aTTTCAATCACTACTATTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGta < 1:750094/141‑1 (MQ=255) tttCAATCACTACTATTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGtat < 2:610344/141‑1 (MQ=255) ttCAATCACTACTATTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAATTTTCGtata > 2:965600/1‑141 (MQ=255) ttCAATCACTACTATTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAAATTAGtata > 2:729862/1‑141 (MQ=255) tCAATCACTACTATTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTatat < 2:1160730/141‑1 (MQ=255) tCAATCACTACTATTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTatat > 2:380575/1‑141 (MQ=255) ctactaTTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGGATAATCAGCCTATAGACTTAAAAAGGAAACAAGGTAGATTGAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCGTTg > 1:1009642/1‑141 (MQ=255) tactaTTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGt < 1:1053224/141‑1 (MQ=255) ctaTTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGtat < 1:678320/141‑1 (MQ=255) aTTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATaa < 1:904523/141‑1 (MQ=255) ttttACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATaaaa > 1:552367/1‑141 (MQ=255) tttgtggtaaaaaTAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTATTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATaaaa > 1:50941/10‑141 (MQ=255) ttACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAAtt > 1:1094573/1‑141 (MQ=255) aCCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAg < 2:581950/141‑1 (MQ=255) ccACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGc > 2:548633/1‑141 (MQ=255) ccACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGc < 1:1058234/141‑1 (MQ=255) cacaAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCa < 2:491834/141‑1 (MQ=255) acaAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCat > 1:1076644/1‑141 (MQ=255) aTAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCt < 1:886085/141‑1 (MQ=255) aCGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCtgat < 2:538139/141‑1 (MQ=255) cGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCtgata > 2:714120/1‑141 (MQ=255) cGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCtgata > 2:313665/1‑141 (MQ=255) gTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCtgatat < 1:1056942/141‑1 (MQ=255) tCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCtgatatg < 1:233491/141‑1 (MQ=255) cATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCtgatatga < 2:178128/141‑1 (MQ=255) cGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACa < 2:247857/141‑1 (MQ=255) tCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAg < 2:123688/141‑1 (MQ=255) tAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAgtgt < 1:438202/141‑1 (MQ=255) aaTTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGc < 1:1073742/141‑1 (MQ=255) ttCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCtt < 2:1157584/141‑1 (MQ=255) tCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCttt < 1:766206/141‑1 (MQ=255) aTTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTtat > 2:953240/1‑141 (MQ=255) aTTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTtat < 1:309520/141‑1 (MQ=255) ttGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTtata < 1:548633/141‑1 (MQ=255) ttGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATGTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTtata > 1:1130118/1‑141 (MQ=255) gAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAATCGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATaaa < 1:20439/141‑1 (MQ=255) ataatTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTGTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAAtt > 1:972192/1‑141 (MQ=255) aatTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAATTTg < 1:637942/141‑1 (MQ=255) atTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAATTTGa > 2:20209/1‑141 (MQ=255) ttggctttttGAATTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAATTTGaa < 2:902893/135‑1 (MQ=255) ttGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGaaacgacaattattcaattgaattttaagacgaatgacgttattttgtggtaaaaatagtagtgattgaaatgttaaaaattatgtgaagt < 2:559845‑M2/141‑92 (MQ=255) ttGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAATTTGaa > 2:460678/1‑141 (MQ=255) tGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGaaacgacaattattcaattgaattttaagacgaatgacgttattttgtggtaaaaatagtagtgattgaaatgttaaaaattatgtgaagta < 2:873995‑M2/141‑93 (MQ=255) tgTTTTAACTATAAAATAAAGCAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGTCAAATCATTTTTAAATTTAGTGTATTTCTTTGTATAAGATAAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAATTTGAAAGGa > 1:1172207/2‑141 (MQ=255) cGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGaaacgacaattattcaattgaattttaagacgaatgacgttattttgtggtaaaaatagtagtgattgaaatgttaaaaattatgtgaagtaaaa < 2:550789‑M2/141‑96 (MQ=255) cGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAATTTGAAAGGa < 1:553424/141‑1 (MQ=255) cGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTATATAAATTTGAAAGGa > 2:652483/1‑141 (MQ=255) tttGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAATTTGAAAGGATGt < 1:1082695/141‑1 (MQ=255) tttGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAATTTGAAAGGATGt < 2:2325/141‑1 (MQ=255) gACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAATTTGAAAGGATGTaaa < 1:803451/141‑1 (MQ=255) aCTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCGTTTATAAATTTGAAAGGATGTaaaa < 2:339718/141‑1 (MQ=255) cTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAATTTGAAAGGATGTAAAAc < 1:733272/141‑1 (MQ=255) taaaataaaaCAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAATTTGAAAGGATGTAAAACCtt < 1:429411/141‑1 (MQ=255) aaaataaaaCAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAATTTGAAAGGATGTAAAACCTTa < 1:1170601/141‑1 (MQ=255) aaaataaaaCAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAATTTGAAAGGATGTAAAACCTTa < 1:39283/141‑1 (MQ=255) taaaaCAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAATTTGAAAGGATGTAAAACCTTATGAc < 1:164356/141‑1 (MQ=255) taaaaCAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAATTTGAAAGGATGTAAAACCTTATGAc > 1:1098103/1‑141 (MQ=255) aagcAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGTCAAATCATTTTTAAATTTAGTGTATTTCTTTGTATAAGATAAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAATTTGAAAGGATGTAAAACCTTATGACaa > 2:143183/4‑141 (MQ=255) aaaCAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAATTTGAAAGGATGTAAAACCTTATGACaa > 1:317384/1‑141 (MQ=255) aaaCAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAATTTGAAAGGATGTAAAACCTTATGACaa > 2:910267/1‑141 (MQ=255) aaaCAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAATTTGAAAGGATGTAAAACCTTATGACaa < 2:493167/141‑1 (MQ=255) aaaCAAGGTAAATAAAACCCCTCACAAGACAAGACAAATCATCTTTAAAAATAGTAAATATCTAAAAATAAAATTAACATATCCTGATATAATAAAAGTGTTGCTTTTATAAATCTGCAAGGATGTAAAACCCTATgcatc > 2:558997/1‑137 (MQ=255) cAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAATTTGAAAGGATGTAAAACCTTATGACAATAg > 2:472793/1‑141 (MQ=255) aaGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAATTTGAAAGGATGTAAAACCTTATGACAATAgg > 2:884492/1‑141 (MQ=255) ggTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAATTTGAAAGGATGTAAAACCTTATGACAATAGGTa < 1:401197/141‑1 (MQ=255) gTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTTTTTTTTTTTTATTTCTTAGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAATTTCAAAGGATGTAAAACCTTATGACAATAGGTAt > 2:237837/1‑141 (MQ=255) gTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAATTTGAAAGGATGTAAAACCTTATGACAATAGGTAt > 1:219820/1‑141 (MQ=255) aaTTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAATTTGAAAGGATGTAAAACCTTATGACAATAGGTATCGa > 2:201393/1‑141 (MQ=255) aaCGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAATTTGAAAGGATGTAAAACCTTATGACAATAGGTATCGataaaat > 2:29455/1‑141 (MQ=255) aaCGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAATTTGAAAGGATGTAAAACCTTATGACAATAGGTATCGataaaat < 1:705133/141‑1 (MQ=255) cGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAATTTGAAAGGATGTAAAACCTTATGACAATAGGTATCGataaaataa > 1:1030854/1‑141 (MQ=255) ttACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAATTTGAAAGGATGTAAAACCTTATGACAATAGGTATCGATAAAATAAACt < 2:883478/141‑1 (MQ=255) tACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAATTTGAAAGGATGTAAAACCTTATGACAATAGGTATCGATAAAATAAACtt > 1:789363/1‑141 (MQ=255) aaGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAATTTGAAAGGATGTAAAACCTTATGACAATAGGTATCGATAAAATAAACTTTTa < 2:243169/141‑1 (MQ=255) | CTCCTTTTACTTCACATAATTTTTAACATTTCAATCACTACTATTTTTACCACAAAATAACGTCATTCGTCTTAAAATTCAATTGAATAATTGTCGTTTTGACTTTAAAATAAAACAAGGTAAATTAAAACGCTTACAAGAAACGACAAATCATTTTTAAATTTAGTATATTTCTTTGTATAAAATTAGCATATTCTGATATGATACAAGTGTTGCTTTTATAAATTTGAAAGGATGTAAAACCTTATGACAATAGGTATCGATAAAATAAACTTTTACG > CP000730/2682829‑2683108 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |