New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | 1236098 = | 70 (1.010) | 3 (0.050) | 3/282 | 2.2 | 4.9% | coding (254/642 nt) | yloS | thiamine diphosphokinase |
? | CP000730 | 1236143 = | 50 (0.770) | coding (299/642 nt) | yloS | thiamine diphosphokinase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TGAAGCATCAAATTATCCCTTTTTTCTCAGTGGGAGACTTTGATTCAGTCAGTAAAGAAGAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGATCACTTTTTTGGGGCAATTCAGTTATTATTGAAAAAAGCATATTATAAACATGATGTTCATATAGAAGTTATCGATCAACAAAATAA > CP000730/1235951‑1236242 | tGAAGCATCAAATTATCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTACTTTGATTCAGTCAGTAAAGAAGAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGTATTTATCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGt > 2:408761/1‑151 (MQ=255) gAAGCATCAAATTATCCCTTTTTTCTCAGTGGGAGACTTTGATTCAGTCAGTAAAGAAGAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGtt < 1:456336/151‑1 (MQ=255) cttatctttttcaactgtatgttgacctttaggcaataattcaattttattttgttgatcgataacttctatatgaacatcatgtttataatatgcttttttcaataataactgaattgccccaaaaaagtgatctaatcgtccgcCTGtt < 1:21767‑M1/5‑1 (MQ=255) cATCAAATTATCCCTTTTTTCTCAGTGGGAGACTTTGATTCAGTCAGTAAAGAAGAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCAc > 1:664652/1‑151 (MQ=255) aTCAAATTATCCCTTTTTTCTCAGTGGGAGACTTTGATTCAGTCAGTAAAGAAGAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACt > 1:99743/1‑151 (MQ=255) tCAAATTATCCCTTTTTTCTCAGTGGGAGACTTTGATTCAGTCAGTAAAGAAGAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACtt > 2:104037/1‑151 (MQ=255) aaTTATCCGTTTTTTCTCAGTGGGAGACTTTGATTCAGTCAGTAAAGAAGAACGCCAACTTCTAACAGAACAGATACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGCAAAAGCCGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGa < 1:913480/151‑1 (MQ=255) caactgtatgttgacctttaggcaataattcaattttattttgttgatcgataacttctatatgaacatcatgtttataatatgcttttttcaataataactgaattgccccaaaaaagtgatctaatcgtccgcCTGTTGCACTTGGAtt < 1:434594‑M1/16‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTTCTCAGTGGGAGACTTTGATTCAGTCAGTAAAGAAGAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTg < 1:242647/151‑1 (MQ=255) cccTTTTTTCTCAGTGGGAGACTTTGATTCAGTCAGTAAAGAAGAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGAt < 1:190849/151‑1 (MQ=255) cccTTTTTTCTCAGTGGGAGACTTTGATTCAGTCAGTAAAGAAGAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGAt < 2:386184/151‑1 (MQ=255) ccTTTTTTCTCAGTGGGAGACTTTGATTCAGTCAGTAAAGAAGAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATa > 1:112735/1‑151 (MQ=255) tttCTCAGTGGGAGACTTTGATTCAGTCAGTAAAGAAGAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTAtt > 2:800926/1‑151 (MQ=255) ctcAGTGGGAGACTTTGATTCAGTCAGTAAAGAAGAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACa > 1:339913/1‑151 (MQ=255) cAGTGGGAGACTTTGATTCAGTCAGTAAAGAAGAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAAt > 1:608618/1‑151 (MQ=255) cAGTGGGAGACTTTGATTCAGTCAGTAAAGAAGAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAAt > 2:1061849/1‑151 (MQ=255) cAGTGGGAGACTTTGATTCAGTCAGTAAAGAAGAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAAt > 2:48123/1‑151 (MQ=255) gggAGACTTTGATTCAGTCAGTAAAGAAGAACGCCAACTTCTACCAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTAt < 1:835680/151‑1 (MQ=255) gggAGACTTTGATTCAGTCAGTAAAGAAGAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTAt < 1:207828/151‑1 (MQ=255) gagaCTTTGATTCAGTCAGTAAAGAAGAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATgg < 2:361039/151‑1 (MQ=255) gagaCTTTGATTCAGTCAGTAAAGAAGAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATgg < 1:993031/151‑1 (MQ=255) gagaCTATGATTCAGTCAGTAAAGAAGAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATgg < 2:1060819/151‑1 (MQ=255) gaCTTTGATTCAGTCAGTAAAGAAGAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTg < 1:954981/151‑1 (MQ=255) cTTTGATTCAGTCAGTAAAGAAGAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCa > 1:58427/1‑151 (MQ=255) cTTTGATTCAGTCAGTAAAGAAGAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCa > 2:899972/1‑151 (MQ=255) cTTTGATTCAGTCAGTAAAGAAGAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCa > 2:578834/1‑151 (MQ=255) cTTTGATTCAGTCAGTAAAGAAGAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCa > 1:130785/1‑151 (MQ=255) tGATTCAGTCAGTAAAGAAGAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACa > 1:543479/1‑151 (MQ=255) aattttattttgttgatcgataacttctatatgaacatcatgtttataatatgcttttttcaataataactgaattgccccaaaaaagtgatctaatcgtccgcCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGc > 1:788395‑M1/105‑151 (MQ=255) cagtcaatAAATAAAAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTATAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTATAATTTATGGTGCAACAGGCgg < 2:667675/151‑1 (MQ=255) agtcagtAAAGAAGAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGa < 1:264773/151‑1 (MQ=255) tattttgttgatcgataacttctatatgaacatcatgtttataatatgcttttttcaataataactgaattgccccaaaaaagtgatctaatcgtccgcCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACg > 2:434594‑M1/100‑151 (MQ=255) gtAAAGAAGAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGAtt > 1:1048302/1‑151 (MQ=255) tAAAGAAGAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACACTTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTa > 2:70703/1‑151 (MQ=255) tAAAGAAGAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTa < 2:648461/151‑1 (MQ=255) aaaGAAGAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAg > 1:599910/1‑151 (MQ=255) aaaGAAGAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAg > 2:336298/1‑151 (MQ=255) aagaagAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGa > 2:910434/1‑151 (MQ=255) agaagaACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGAt < 1:15653/151‑1 (MQ=255) agagCGCTAACTTCTAACAGATCATTTACAAATCAAACCAGTTCTGGCTGAATAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGTGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATGTGATAGTATTACGATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGATCAc < 2:277811/151‑1 (MQ=255) agaaCGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGGCGATTAGCTCAc > 1:459222/1‑151 (MQ=255) agaaCGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGATCAc > 1:927463/1‑151 (MQ=255) gaaCGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGATCACt > 2:486126/1‑151 (MQ=255) cTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGATCACTTTTTTgggg > 1:557281/1‑151 (MQ=255) ttCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGATCACTTTTTTGGGGc > 1:570679/1‑151 (MQ=255) ttCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGATCACTTTTTTGGGGc < 1:413329/151‑1 (MQ=255) tCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGATCACTTTTTTGGGGCa > 2:727491/1‑151 (MQ=255) tAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGAt > 2:778553/1‑95 (MQ=255) tAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGAt < 1:778553/95‑1 (MQ=255) aacagaacagTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGATCACTTTTTTGGGGCAAtt > 1:804422/1‑151 (MQ=255) acagaacagTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGTAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGATCACTTTTTTGGGGCAATTc < 1:981467/151‑1 (MQ=255) gaacagTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGATCACTTTTTTGGGGCAATTCAGt < 1:1023730/151‑1 (MQ=255) tACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGATCACTTTTTTGGGGCAATTCAGTTattatt < 1:957575/151‑1 (MQ=255) aCAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGATCACTTTTTTGGGGCAATTCAGTTATTATTg < 1:954512/151‑1 (MQ=255) aaaTCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGATCACTTTTTTGGGGCAATTCAGTTATTATTGaa < 2:585740/151‑1 (MQ=255) aaaCCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGATCACTTTTTTGGGGCAATTCAGTTATTATTGAAAAAAg > 1:608461/1‑151 (MQ=255) aaaCCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGATCACTTTTTTGGGGCAATTCAGTTATTATTGAAAAAAg < 1:578834/151‑1 (MQ=255) aCCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGATCACTTTTTTGGGGCAATTCAGTTATTATTGAAAAAAGCa < 2:664652/151‑1 (MQ=255) cAAGATGAAAAAGCGAATACGGATTTAACTTAAGCAGATAATAAAAATGTTGAAATTGGATTTGAGAGTAGTACAATTTATGGTGCAACAGGCAGACGATTAGATCATTTTTTTGTGGCAATTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGCATATtata < 2:10864/151‑1 (MQ=255) aaGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGATCACTTTTTTGGGGCAATTCAGTTATTATTGAAAAAAGCATATTATaa < 1:48123/151‑1 (MQ=255) tGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGATCACTTTTTTGGGGCAATTCAGTTATTATTGAAAAAAGCATATTATAAACat > 1:556557/1‑151 (MQ=255) gCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGATCACTTTTTTGGGGCAATTCAGTTATTATTGAAAAAAGCATATTATAAACATGATGTTc > 1:355409/1‑151 (MQ=255) tGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATACAGCTCTCTTCCAGCGTTTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGATCACTTTTTTGGGGCAATTCAGTTATTATTGAAAAAAGCATATTATAAACATGATGTTCat > 1:515429/1‑151 (MQ=255) aTACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGATCACTTTTTTGGGGCAATTCAGTTATTATTGAAAAAAGCATATTATAAACATGATGTTCatat < 1:902236/151‑1 (MQ=255) gATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGATCACTTTTTTGGGGCAATTCAGTTATTATTGAAAAAAGCGTATTATATTCATGATGTTCATATAGAAg < 2:508335/151‑1 (MQ=255) aTTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGATCACTTTTTTGGGGCAATTCAGTTATTATTGAAAAAAGCATATTATAAACATGATGTTCATATAGAAGt > 1:884875/1‑151 (MQ=255) ttagctttagcGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGATCACTTTTTTGGGGCAATTCAGTTATTATTGAAAAAAGCATATTATAAACATGATGTTCATATAGAAGTTa < 2:1048302/151‑1 (MQ=255) tttagcGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGATCACTTTTTTGGGGCAATTCAGTTATTATTGAAAAAAGCATATTATAAACATGATGTTCATATAGAAGTTATCGAt < 1:1012435/151‑1 (MQ=255) ttagcGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGATCACTTTTTTGGGGCAATTCAGTTATTATTGAAAAAAGCATATTATGAACATCATGTTtataatatgcttttttcaa < 1:941384/151‑16 (MQ=255) ttagcGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGATCACTTTTTTGGGGCAATTCAGTTATTATTGAAAAAAGCATATTATAAACATGATGTTCATATAGAAGTTATCGATc < 1:741599/151‑1 (MQ=255) tagcGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGTTTTGATATTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGATCACTTTTTTAAAGCAATTCAGTTATTATTGAAAAAAGCATATTATAAACATGATGTTCATATAGAAGTTATCGATca < 2:967151/151‑1 (MQ=255) cGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGATCACTTTTTTGGGGCAATTCAGTTATTATTGAAAAAAGCATATTATAAACATGATGTTCATATAGAAGTTATCGATcaaca > 2:625190/1‑151 (MQ=255) tgctAAAGCTGTTCAACCTGGTTTGGTTAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGATCACTTTTTTGGGGCAATTCAGTTATTATTGAAAAAAGCATATTATAAACATGATGTTCATATAGAAGTTATCGATCAACaaaat < 1:152376/148‑1 (MQ=255) aTAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGATCACTTTTTTGGGGCAATTCAGTTATTATTGAAAAAAGCATATTATAAACATGATGTTCATATAGAAGTTATCGATCAACaaaataa < 1:899972/151‑1 (MQ=255) | TGAAGCATCAAATTATCCCTTTTTTCTCAGTGGGAGACTTTGATTCAGTCAGTAAAGAAGAACGCCAACTTCTAACAGAACAGTTACAAATCAAACCAGTTCAAGCTGAAAAAGCTGATACGGATTTAGCTTTAGCGGTTGATAAAGCTGTTGCACTTGGATTTGATAGTATTACAATTTATGGTGCAACAGGCGGACGATTAGATCACTTTTTTGGGGCAATTCAGTTATTATTGAAAAAAGCATATTATAAACATGATGTTCATATAGAAGTTATCGATCAACAAAATAA > CP000730/1235951‑1236242 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |