New junction evidence
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ATCATGCCTATCGTTAATGAAACATGTCCACATATTGAAGTATATGTCCTAACAAGCGGTCAACACCCTAATTTAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGATCTCTT  >  CP000730/57411‑57680                                                                                                                                             |                                                                                                                                  tctgattaaactaatacagttgatgaattaacagaaaatccagtatgtactgagtacataagagatcgaacagaagctagagaaaaaggtcaaggtagaacttattaagcatattaaattaattaacttgatacttttcaa                                                                                                                                   >  1:585637‑M1/141‑141 (MQ=255) tctgattaaactaatacagttgatgaattaacagaaaatccagtatgtactgagtacataagagatcgaacaaaaaaaaaaaaaaaaggtcaaggtagaacttattaagcatattaaattaattaacttgatacttttcaa                                                                                                                                   >  2:175003‑M1/141‑141 (MQ=255)  tCATGCCTATCGTTAATGAAACATGTCCACATATTGAAGTATATGTCCTAACAAGCGGTCAACACCCTAATTTAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTtat                                                                                                                                  <  1:74173/141‑1 (MQ=255)   cATGCCTATCGTTAATGAAACATGTCCACATATTGAAGTATATGTCCTAACAAGCGGTCAACACCCTAATTTAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTtata                                                                                                                                 >  1:370064/1‑141 (MQ=255)   cATGCCTATCGTTAATGAAACATGTCCACATATTGAAGTATATGTCCTAACAAGCGGTCAACACCCTAATTTAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTtata                                                                                                                                 >  1:368556/1‑141 (MQ=255)    gattaaactaatacagttgatgaattaacagaaaatccagtatgtactgagtacataagagatcgaacagaagctagagaaaaaggtcaaggtagaacttattaagcatattaaattaattaacttgatacttttcaATaa                                                                                                                                <  1:436882‑M1/4‑1 (MQ=255)    gattaaactaatacagttgatgaattaacagaaaatccagtatgtactgagtacataagagatcgaacagaagctagagaaaaaggtcaaggtagaacttattaagcatattaaattaattaacttgatacttttaaATaa                                                                                                                                >  2:37089‑M1/138‑141 (MQ=255) 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   aTGCCTATCGTTAATGAAACATGTCCACATATTGAAGTATATGTCCTAACAAGCGGTCAACACCCTAATTTAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATaa                                                                                                                                <  1:743383/141‑1 (MQ=255)       taaactaatacagttgatgaattaacagaaaatccagtatgtactgcgtacataagagatcgaacagaagctagagaaaaaggtcaaggtagaacttattaagcatattaaattaattaacttgatacttttcaATaaaaa                                                                                                                             <  2:38011‑M1/7‑1 (MQ=255)         aactaatacagttgatgaattaacagaaaatccagtatgtactgagtacataagagatcgaacagaagctagagaaaaaggtcaaggtagaacttattaagcatattaaattaattaacttgatacttttcaataaacaac                                                                                                                           <  1:663052‑M1/9‑5 (MQ=255)                   gAAACATGTCCACATATTGAACTATATGTCCTAACAAGCGGTCAACACCCTAATTTAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATCTTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCAtcc                                                                                                                 >  2:663052/1‑141 (MQ=255)                    ttgatgaattaacagaaaatccagtatgtactgagtacataagagatcgaacagaagctagagaaaaaggtcaaggtagaacttattaagcatattaaattaattaacttgatacttttcaATAAAAAAATAGAGCAtcct                                                                                                                <  1:178060‑M1/20‑1 (MQ=255)                      aCATGTCCACATATTGAAGTATATGTCCTAACAAGCGGTCAACACCCTAATTTAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCAtcctcc                                                                                                              >  2:181532/1‑141 (MQ=255)                       cATGTCCACATATTAAAGTATATGTCCTAACAAGCGGTCAACACCCTAATTTAGTAAATATTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAAGATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCa                                                                                                             <  1:88321/141‑1 (MQ=255)                        aTGTCCACATATTGAAGTATATGTCCTAACAAGCGGTCAACACCCTAATTTAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCAc                                                                                                            <  2:274989/141‑1 (MQ=255)                          gTCCACATATTGAAGTATATGTCCTAACAAGCGGTCAACACCCTAATTTAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGt                                                                                                          >  2:666732/1‑141 (MQ=255)                          gTCCACATATTGAAGTATATGTCCTAACAAGCGGTCAACACCCTAATTTAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGt                                                                                                          <  2:750070/141‑1 (MQ=255)                          gTCCACATATTGAAGTATATGTCCTAACAAGCGGTCAACACACTAATTTAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCATTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGt                                                                                                          <  2:188123/141‑1 (MQ=255)                            ccACATATTGAAGTATATGTCCTAACAAGCGGTCAACACCCTAATTTAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTa                                                                                                        >  1:284217/1‑141 (MQ=255)                                 tatTGAAGTATATGTCCTAACAAGCGGTCAACACCCTAATTTAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAg                                                                                                   <  1:428119/141‑1 (MQ=255)                                  atTGAAGTATATGTCCTAACAAGCGGTCAACACCCTAATTTAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAgg                                                                                                  >  1:586546/1‑141 (MQ=255)                                      atccagtatgtactgagtacataagagatcgaacagaagctagagaaaaaggtcaaggtagaacttattaagcatattaaattaattaacttgatacttttcaATAAAAAA‑TAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGctc                                                                                             >  1:503056‑M1/104‑141 (MQ=255)                                      atccagtatgtactgagtacataagagatcgaacagaagctagagaaaaaggtcaaggtagaacttattaagcatattaaattaattaacttgatacttttcaATAAAAAA‑TAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGctc                                                                                             >  1:656096‑M1/104‑141 (MQ=255)                                      aaGTATATGTCCTAACAAGCGGTCAACACCCTAATTTAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGct                                                                                              >  1:628019/1‑141 (MQ=255)                                      aaGTATATGTCCTAACAAGCGGTCAACACCCTAATTTAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGct                                                                                              >  1:40562/1‑141 (MQ=255) 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                                        tataTGTCCTAACAAGCGGTCAACACCCTAATTTAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGAATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTg                                                                                           >  2:621954/1‑141 (MQ=255)                                         tataTGTCCTAACAAGCGGTCAACACCCTAATTTAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAAGAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTg                                                                                           <  2:126031/141‑1 (MQ=255)                                         cagtatgtactgagtacataagagatcgaacagaagctagagaaaaaggtcaaggtagaacttattaagcatattaaattaattaacttgatacttttcaATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTg                                                                                           <  1:742171‑M1/41‑1 (MQ=255) 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                                                                                                       ttaataTAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCtt                            >  2:635175/1‑141 (MQ=255)                                                                                                        ttaataAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCtt                            <  1:642547/141‑1 (MQ=255)                                                                                                        ttaataAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCtt                            <  2:302890/141‑1 (MQ=255)                                                                                                        ttaataAAAATGAATTTGAAATATTATTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGTTGCTCTTTTTTTTATTGAAAAGTATCAATTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCtt                            <  2:270774/141‑1 (MQ=255)                                                                                                          aataaCGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGAGCTCTGATTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAGTTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCtttt                          >  2:108993/1‑141 (MQ=255)                                                                                                           ataaAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCttttt                         <  2:9125/141‑1 (MQ=255)                                                                                                                gATGAATTTGAAAAATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTa                    >  2:122877/1‑141 (MQ=255)                                                                                                                 aTGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGAGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAg                   <  2:416235/141‑1 (MQ=255)                                                                                                                        tGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGt            <  1:223518/141‑1 (MQ=255)                                                                                                                        tGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGt            >  1:116424/1‑141 (MQ=255)                                                                                                                          aaaTATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTc          <  2:300646/141‑1 (MQ=255)                                                                                                                          aaaTATTAGTAAATGAGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTGATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTc          <  2:43449/141‑1 (MQ=255)                                                                                                                              atTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGAtc      <  2:427092/141‑1 (MQ=255)                                                                                                                               ttAGAAAATGCGCTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGCGCTCTGATTTTTATTGAAACGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGATACTGTTCGAtct     >  2:755601/1‑141 (MQ=255)                                                                                                                                  gTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGATCTCtt  >  2:122020/1‑141 (MQ=255)                                                                                                                                  gTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGATCTCtt  >  2:237484/1‑141 (MQ=255)                                                                                                                                             |                                                                                                                                  ATCATGCCTATCGTTAATGAAACATGTCCACATATTGAAGTATATGTCCTAACAAGCGGTCAACACCCTAATTTAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGATCTCTT  >  CP000730/57411‑57680

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.