New junction evidence
		seq id	position	reads (cov)	reads (cov)	score	skew	freq	annotation	gene	product
*	?	CP000730	57551 =	62 (0.950)	5 (0.080)	4/242	NT	8.6%	coding (618/621 nt)	USA300HOU_0048	hypothetical membrane protein
	?	CP000730	57600 =	48 (0.780)					intergenic (+46/+871)	USA300HOU_0048/USA300HOU_0049	hypothetical membrane protein/hypothetical protein

AACAAGCGGTCAACACCCTAATTTAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGATCTCTTATGTACTCAGTACATACTGGATTTTCTGTTAATTCATCAACTGTATTAGTTTAATCAGA  >  CP000730/57461‑57739                                                                                                                                            |                                                                                                                                            aaCAAGCGGTCAACACCCTAATTTAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTg                                                                                                                                            <  2:124315/141‑1 (MQ=255)   cAAGCGGTCAACACCCTAATTTAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGaa                                                                                                                                          >  2:94677/1‑141 (MQ=255)    gtacataagagatcgaacagaagctagagaaaaaggtcaaggtagaacttattaagcatattaaattaattaacttgatacttttcaATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGaaa                                                                                                                                         >  2:178060‑M1/88‑141 (MQ=255)      gCGGTCAACACCCTAATTTAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAg                                                                                                                                       >  1:139873/1‑141 (MQ=255)        ggTCAACACCCTAATTTAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTCATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTa                                                                                                                                     <  2:751146/141‑1 (MQ=255)        ggTCAACACCCTAATTTAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTa                                                                                                                                     >  1:386790/1‑141 (MQ=255)        ggTCAACACCCTAATTTAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTa                                                                                                                                     >  2:436882/1‑141 (MQ=255)          tCAACACCCTAATTTAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATc                                                                                                                                   >  2:642547/1‑141 (MQ=255)           cAACACCCTAATTTAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCa                                                                                                                                  <  1:454674/141‑1 (MQ=255)              cacCCTAATTTAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGt                                                                                                                               >  1:711468/1‑141 (MQ=255)              cacCCTAATTTAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATAAAGt                                                                                                                               >  1:582675/1‑141 (MQ=255)                cccTAATTTAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGtta                                                                                                                             >  1:662993/1‑141 (MQ=255)                 ccTAATTTAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGttaa                                                                                                                            <  1:31014/141‑1 (MQ=255)                      tttAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTtagttaat                                                                                                                       >  1:165845/1‑141 (MQ=255)                               tGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGc                                                                                                              <  1:94677/141‑1 (MQ=255)                                    aTCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTtaat                                                                                                         <  2:82858/141‑1 (MQ=255)                                        tGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGt                                                                                                     >  2:377755/1‑141 (MQ=255)                                         gAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTACAGGCGTTATAAAAAAATAGAGCCTCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAAACAACTTAATATGCTTGATACGtt                                                                                                    >  1:674761/1‑141 (MQ=255)                                         gAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGtt                                                                                                    <  2:13198/141‑1 (MQ=255)                                            ggTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTa                                                                                                 >  1:26032/1‑141 (MQ=255)                                            ggTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTa                                                                                                 >  1:26108/1‑141 (MQ=255)                                              tattaatattaaTAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTAcc                                                                                               >  1:693347/1‑141 (MQ=255)                                                ttaatattaataAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCtt                                                                                             <  2:13644/141‑1 (MQ=255)                                                ttaatattaataAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCtt                                                                                             <  1:151651/141‑1 (MQ=255)                                                   atattaataAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGAc                                                                                          >  2:126565/1‑141 (MQ=255)                                                    tattaataAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGAcc                                                                                         <  1:65217/141‑1 (MQ=255)                                                      ttaataTAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCtt                                                                                       >  2:635175/1‑141 (MQ=255)                                                      ttaataAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCtt                                                                                       <  1:642547/141‑1 (MQ=255)                                                      ttaataAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCtt                                                                                       <  2:302890/141‑1 (MQ=255)                                                      ttaataAAAATGAATTTGAAATATTATTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGTTGCTCTTTTTTTTATTGAAAAGTATCAATTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCtt                                                                                       <  2:270774/141‑1 (MQ=255)                                                        aataaCGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGAGCTCTGATTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAGTTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCtttt                                                                                     >  2:108993/1‑141 (MQ=255)                                                         ataaAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCttttt                                                                                    <  2:9125/141‑1 (MQ=255)                                                              gATGAATTTGAAAAATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTa                                                                               >  2:122877/1‑141 (MQ=255)                                                               aTGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGAGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAg                                                                              <  2:416235/141‑1 (MQ=255)                                                                      tGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGt                                                                       >  1:116424/1‑141 (MQ=255)                                                                      tGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGt                                                                       <  1:223518/141‑1 (MQ=255)                                                                        aaaTATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTc                                                                     <  2:300646/141‑1 (MQ=255)                                                                        aaaTATTAGTAAATGAGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTGATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTc                                                                     <  2:43449/141‑1 (MQ=255)                                                                            atTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGAtc                                                                 <  2:427092/141‑1 (MQ=255)                                                                             ttAGAAAATGCGCTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGCGCTCTGATTTTTATTGAAACGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGATACTGTTCGAtct                                                                >  2:755601/1‑141 (MQ=255)                                                                                gTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGATCTCtt                                                             >  2:122020/1‑141 (MQ=255)                                                                                gTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGATCTCtt                                                             >  2:237484/1‑141 (MQ=255)                                                                                      tttcaataaaaaacagagcacctccataacgtggaggatgctctatttttttatTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGATCTCTTATGTAc                                                       >  2:178060‑M2/55‑141 (MQ=255)                                                                                            TAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGATCTCTTATGTACTGAGTa                                                 >  1:707793‑M1/1‑141 (MQ=255)                                                                                               AAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGATCTCTTATGTACTCAGTACAt                                              <  1:2149‑M1/141‑1 (MQ=255)                                                                                                AAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGATCTCTTATGTACTCAGTACATa                                             >  2:26108‑M1/1‑141 (MQ=255)                                                                                                AAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGATCCCTTATGTACTCAGTACATa                                             >  2:26032‑M1/1‑141 (MQ=255)                                                                                                 AAATTGGGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGATCTCTTATGTACTGAGTACAtaa                                            >  1:571566‑M1/1‑140 (MQ=255)                                                                                                 AAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGATCTCTTATGTACTCAGTACATAc                                            >  2:145781‑M1/1‑141 (MQ=255)                                                                                                 AAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGATCTCTTATGTACTCAGTACATAc                                            >  2:377199‑M1/1‑141 (MQ=255)                                                                                                   cagagcacctccataacgtggaggatgctctatttttttatTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGATCTCTTATGTACTCAGTACATACTg                                          <  1:742171‑M2/100‑1 (MQ=255)                                                                                                   aTAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGATCTCTTATGTACTCAGTACATACTg                                          >  1:439954/1‑141 (MQ=255)                                                                                                    tAGAGCAGCCTCCGCGTTATGGAGGTGCTCTGTTTGTGATGGAAAAGTATGAAGTTAATGAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGATCTCTTATGTACTCAGTACATACTgg                                         <  1:356480/141‑1 (MQ=255)                                                                                                      gagcacctccataacgtggaggatgctctattttttatTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGATCTCTTATGTACTCAGTACATACTGGAt                                       >  1:656096‑M2/39‑141 (MQ=255)                                                                                                      gagcacctccataacgtggaggatgctctattttttatTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGATCTCTTATGTACTCAGTACATACTGGAt                                       >  1:503056‑M2/39‑141 (MQ=255)                                                                                                      gagCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGATCTCTTATGTACTCAGTACATACTGGAt                                       >  1:248329/1‑141 (MQ=255)                                                                                                      gagCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGATCTCTTATGTACTCAGTACATACTGGAt                                       >  1:563738/1‑141 (MQ=255)                                                                                                       agCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGATCTCTTATGTACTCAGTACATACTGGAtt                                      <  2:560928/141‑1 (MQ=255)                                                                                                        gCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGATCTCTTATGTACTCAGTACATACTGGAttt                                     >  1:554978/1‑141 (MQ=255)                                                                                                                    ttctGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTATACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGATCTCTTATGTACTCAGTACATACTGGATCTTCTGTTAATtca                         >  1:519343/4‑141 (MQ=255)                                                                                                                       tGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGATCTCTTATGTACTCAGTACATACTGGATTTTCTGTTAATtcatca                      <  1:543453/141‑1 (MQ=255)                                                                                                                       tGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGATCTCTTATGTACTCAGTACATACTGGATTTTCTGTTAATtcatca                      >  2:271041/1‑141 (MQ=255)                                                                                                                        aggatgctctatttttttatTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGATCTCTTATGTACTCAGTACATACTGGATTTTCTGTTAATTCATCaa                     <  1:178060‑M2/121‑1 (MQ=255)                                                                                                                                   gttgtttatTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGATCTCTTATGTACTCAGTACATACTGGATTTTCTGTTAATTCATCAACTGTATTAGtt          <  1:663052‑M2/132‑1 (MQ=255) 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                                                                                                                                    tttttatTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGATCTCTTATGTACGCAGTACATACTGGATTTTCTGTTAATTCATCAACTGTATTAGTTTa        <  2:38011‑M2/134‑1 (MQ=255)                                                                                                                                        ttatTTAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGATCTCTTATGTACTCAGTACATACTGGATTTTCTGTTAATTCATCAACTGTATTAGTTTAATc     >  2:37089‑M2/5‑141 (MQ=255)                                                                                                                                        ttatTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGATCTCTTATGTACTCAGTACATACTGGATTTTCTGTTAATTCATCAACTGTATTAGTTTAATc     <  1:436882‑M2/137‑1 (MQ=255) 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AACAAGCGGTCAACACCCTAATTTAGTAAATGTTAATCTTGAAGGTATTAATATTAATAAAGATGAATTTGAAATATTAGTAAATGCGTTATAAAAAAATAGAGCATCCTCCACGTTATGGAGGTGCTCTGTTTTTTATTGAAAAGTATCAAGTTAATTAATTTAATATGCTTAATAAGTTCTACCTTGACCTTTTTCTCTAGCTTCTGTTCGATCTCTTATGTACTCAGTACATACTGGATTTTCTGTTAATTCATCAACTGTATTAGTTTAATCAGA  >  CP000730/57461‑57739

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.