| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 190272 = | 64 (0.980) | 3 (0.050) | 3/244 | NT | 5.1% | coding (824/1176 nt) | cap5P | capsular polysaccharide biosynthesis protein Cap5P |
| ? | CP000730 | 190304 = | 52 (0.840) | coding (856/1176 nt) | cap5P | capsular polysaccharide biosynthesis protein Cap5P | |||||
TAAAGCAGTAAGAGATTTGGCAGATGAATATAAAGATGTTGTCTTCATTTATCCAATGCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTCAAGAGGAGGCTCCTACATTTGGAAAACCTGTGTTGGTATTAAGGAATCATACAGAGCGTCCCGAAGGCGTTGAGGCGG > CP000730/190132‑190412 | tAAAGCAGTAAGAGATTTGGCAGATGAATATAAAGATGTTGTCTTCATTTATCCAATGCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGc > 1:500035/1‑141 (MQ=255)tAAAGCACTAAGAGATTTTGCACATGAATATAAATATGTTGTCTTCATTTATCCAATGCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGc < 2:436833/141‑1 (MQ=255) ttttttttttttgaTTTGGCAGATGAATATAAAGATGTTGTTTTCATTTATCCAATGCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCTGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGGTTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCg > 2:760773/13‑141 (MQ=255) ataatctgtgccaattactctcgatgttcccgcctcaacgccttcgggacgctctgtatgattccttaataccaacacaggttttccaaatgtaggagcctcctcttgaataccaccagaatctgtcagcacgaggtaCGa < 2:134951‑M1/3‑1 (MQ=255) aGCAGTAAGAGATTTGGCAGATGAATATAAAGATGTTGTCTTCATTTATCCAATGCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGAt > 2:434089/1‑141 (MQ=255) aagctgtgccaattactctcgatgttcccgcctcaacgccttcgggacgctctgtatgattccttaataccaacacaggtgttccaaatgtcggagcctcctcttgaataccaccagaatctgtcagcacgaggcaCGata < 2:435067‑M1/5‑2 (MQ=255) cAGTAAGAGATTTGGCAGATGAATATAAAGATGTTGTCTTCATTTATCCAATGCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTg < 2:205574/141‑1 (MQ=255) tctgtgccaattactctcgatgttcccgcctcaacgccttcgggacgctctgtatgattccttaataccaacacaggttttccaaatgtaggagcctcctcttgaataccaccagaatctgtcagcacgaggtaCGATTGa > 2:693378‑M1/135‑141 (MQ=255) gagaTTTGGCAGATGAATATAAAGATGTTGTCTTCATTTATCCAATGCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGTCAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTcc > 1:410468/1‑141 (MQ=255) gagaTTTGGCAGATGAATATAAAGATGTTGTCTTCATTTATCCAATGCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTcc > 2:262422/1‑141 (MQ=255) agaTTTGGCAGATGAATATAAAGATGTTGTCTTCATTTATCCAATGCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCa > 1:134951/1‑141 (MQ=255) tGGCAGATGAATATAAAGATGTTGTCTTCATTTATCCAATGCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAAtt > 1:99781/1‑141 (MQ=255) tGGCAGATGAATATAAAGATGTTGTCTTCATTTATCCAATGCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAAtt > 1:223330/1‑141 (MQ=255) ggCAGATGAATATAAAGATGTTGTCTTCATTTATCCAATGCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAAttt > 2:763159/1‑141 (MQ=255) aGATGAATATAAAGATGTTGTCTTCATTTATCCAATGCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTAc < 1:370947/141‑1 (MQ=255) aTGAATATAAAGATGTTGTCTTCATTTATCCAATGCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACaa < 2:314412/141‑1 (MQ=255) gAATATAAAGATGTCGTCTTCATTTATCCAATGCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGAGATTGCCAAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAaat < 2:664330/141‑1 (MQ=255) tgttcccgcctcaacgccttcgggacgctctgtatgattccttaataccaacacaggttttccaaatgtaggagcctcctcttgaataccaccagaatctgtcagcacgaggtaCGATTGAGTTCCATAATTTTACAaatc > 1:35750‑M1/115‑141 (MQ=255) tataAAGATGTTGTCTTCATTTATCCAATGCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAaatcaa > 2:543922/1‑141 (MQ=255) tataAAGATGTTGTCTTCATTTATCCAATGCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAaagcaa > 2:601057/1‑141 (MQ=255) aGATGTTGTCTTCATTTATCCAATGCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTa < 2:284758/141‑1 (MQ=255) gATGTTGTCTTCATTTATCCAATGCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTAc > 1:458569/1‑141 (MQ=255) gATGTTGTCTTCATTTATCCAATGCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTAc > 2:609622/1‑141 (MQ=255) aTGTTGTCTTCATTTATCCAATGCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGCTGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTAcc < 1:416642/141‑1 (MQ=255) gtCTTCATTTATCCAATGCATCGTAATCCAAAGGTAAGCGTCAGTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTg > 1:768870/1‑141 (MQ=255) gttCATTTATACAATGCATCGTAATCCAAAGGTAGGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAAGCGGATTGAATTAATTAGGCCATTAGATGCGATGGAGCTTCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCt > 2:508665/2‑141 (MQ=255) cTTCATTTATCCAATGCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCt < 1:319679/141‑1 (MQ=255) tCATTTATCCAATGCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGa < 2:58962/141‑1 (MQ=255) tCATTTATCCAATGCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGa < 2:727578/141‑1 (MQ=255) tttATCCAATGCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAg < 1:364917/141‑1 (MQ=255) tttATCCAATGCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCANTAGATGCGATTGAGTTCCNTAATTNTACAAATCAATCGNACCTCGTGCTGACAg < 2:201791/141‑1 (MQ=255) tATCCAATGCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGAt > 1:86273/1‑141 (MQ=255) tATCCAATGCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGAt < 1:293758/141‑1 (MQ=255) tATCCAATGCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGAt < 1:727037/141‑1 (MQ=255) cAATGCATCTTAATCCAAACGTAACGTCGATTGCCTAAAAAGATTTATCCCGTATAAAGCTAATTTAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCtg < 1:72255/141‑1 (MQ=255) aaTGCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCtgg > 1:691198/1‑141 (MQ=255) tGCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCtggtg < 1:110394/141‑1 (MQ=255) gCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAGTCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCtggtgg < 2:140313/141‑1 (MQ=255) gCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCtggtgg > 2:454762/1‑141 (MQ=255) gCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCtggtgg < 2:370530/141‑1 (MQ=255) gCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGAGTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCtggtgg < 1:309669/141‑1 (MQ=255) ttCGTAATACAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTa < 2:332229/140‑1 (MQ=255) aTCGTAGTCAAAGGGGACGAGCGAGTGCCGAAAAATATTGATCTGGGAGGAATCGGATAGAATTAAGTGAGCCATTGGATGCGATTGGGTTCCGTGATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGGGGTa < 2:250381/141‑1 (MQ=255) gTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTc > 2:413985/1‑141 (MQ=255) ccAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTCAagag < 2:75902/141‑1 (MQ=255) ccAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTCAagag > 2:326410/1‑141 (MQ=255) ccAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTCAagag > 2:753588/1‑141 (MQ=255) cAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTCAAgagg > 1:76844/1‑141 (MQ=255) gTAAGAGCGTTTGCCGAAAAATATTTATCTGGGGGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATATTTTTACAAATGAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTCAAGAGGAGGCt < 2:600932/141‑1 (MQ=255) gTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTCAAGAGGAGGcc > 2:357836/1‑140 (MQ=255) gagCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTCAAGAGGAGGCTCCTa > 1:780174/1‑141 (MQ=255) ttGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTCAAGAGGAGGCTCCTACATTTg > 2:612437/1‑141 (MQ=255) cGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTAAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCAGACAGATTCTGGTGGTATTCAAGAGGAGGCTCCTACATTTGGaaa > 2:381625/1‑141 (MQ=255) tgtaggagcctcctcttgaataccaccagaatctgtcagcacgaggtaCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCg > 1:506199‑M1/49‑80 (MQ=255) tgtaggagcctcctcttgaataccaccagaatctgtcagcacgaggtaCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCg < 2:506199‑M1/32‑1 (MQ=255) aaTATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGACATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTCAAGAGGAGGCTCCTACATTTGGAAAACCtg > 1:415790/1‑141 (MQ=255) atTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTCAAGAGGAGGCTCCTACATTTGGAAAACCTgtgt < 2:599311/141‑1 (MQ=255) tttATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTCAAGAGGAGGCTCCTACATTTGGAAAACCTGTGtt < 1:681522/141‑1 (MQ=255) tttATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTCAAGAGGAGGCTCCTACATTTGGAAAACCTGTGtt < 1:379638/141‑1 (MQ=255) tttATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTCAAGAGGAGGCTCCTACATTTGGAAAACCTGTGtt < 1:357148/141‑1 (MQ=255) tATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTCAAGAGG‑TGCTCCTACATTTGGAAAACCTGTGTTGGt > 2:85268/1‑141 (MQ=255) tCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTCAAGAGGAGGCTCCTACATTTGGAAAACCTGTGTTGGTa > 2:174089/1‑141 (MQ=255) tGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTCCCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTCGAAAGGAGGCTCCTACATTTGGAAAACCTGTGTTGGTAtt < 1:573288/141‑1 (MQ=255) gggAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTCAAGAGGAGGCTCCTACATTTGGAAAACCTGTGTTGGTATTa < 1:184819/141‑1 (MQ=255) agaAATCGGATTGAATTAGTTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTCAAGAGGAGGCTCCTACATTTGGAAAACCTGTGTTGGTATTAAgg < 1:598266/141‑1 (MQ=255) ggATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTCAAGAGGAGGCTCCTACATTTGGAAAACCTGTGTTGGTATTAAGGAATCATa > 2:385730/1‑141 (MQ=255) gATTGAATTAATTGAGCGATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTAGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTAAAGAGGAGGCTCCTACATTTGGAAAACCTGGGTTGGTATTAAGGGATCATAc > 2:727602/1‑141 (MQ=255) gATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTCAAGAGGAGGCTCCTACATTTGGAAAACCTGTGTTGGTATTAAGGAATCATAc < 2:171268/141‑1 (MQ=255) gATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTCAAGAGGAGGCTCCTACATTTGGAAAACCTGTGTTGGTATTAAGGAATCATAc < 2:458827/141‑1 (MQ=255) gAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTCAAGAGGAGGCTCCTACATTTGGAAAACCTGTGTTGGTATTAAGGAATCATACagag < 2:765045/141‑1 (MQ=255) gAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTCAAGAGGAGGCTCCTACATTTGGAAAACCTGTGTTGGTATTAAGGAATCATACagag < 2:614906/141‑1 (MQ=255) aGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTCAAGAGGAGGCTCCTACATTTGGAAAACCTGTGTTGGTATTAAGGAATCATACAGAGCGTCCCGAAg > 1:368248/1‑141 (MQ=255) gCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTCAAGAGGAGGCTCCTACATTTGGAAAACCTGTGTTGGTATTAAGGAATCATACAGAGCGTCCCGAAgg > 1:224555/1‑141 (MQ=255) ccATTAGATGGGATTGAGGTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTCAAGAGGAGGGTCCTACATTTGGAAAACCTGTGTTGGTATTAAGGAATCATACAGAGCGTCCCGAAGGc < 2:630122/141‑1 (MQ=255) gCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTCAAGAGGAGGCTCCTACATTTGGAAAACCTGTGTTGGTATTAAGGAATCATACAGAGCGTCCCGAAGGCGTTGAGGCg > 2:707023/1‑141 (MQ=255) gCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTCAAGAGGAGGCTCCTACATTTGGAAAACCTGTGTTGGTATTAAGGAATCATACAGAGCGTCCCGAAGGCGTTGAGGCg < 1:172685/141‑1 (MQ=255) CGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTCAAGAGGAGGCTCCTACATTTGGAAAACTTGTGTTGGTATTAAGGAATCATACAGAGCGTCCCGAAGGCGTTGAGGCgg > 2:500035‑M1/1‑141 (MQ=255) CGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTCAAGAGGAGGCTCCTACATTTGGAAAACCTGTGTTGGTATTAAGGAATCATACAGAGCGTCCCGAAGGCGTTGAGGCgg > 2:399864‑M1/1‑141 (MQ=255) CGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTCAAGAGGAGGCTCCTACATTTGGAAAACCTGTGTTGGTATTAAGGAATCATACAGAGCGTCCCGAAGGCGTTGAGGCgg > 2:617129‑M1/1‑141 (MQ=255) | TAAAGCAGTAAGAGATTTGGCAGATGAATATAAAGATGTTGTCTTCATTTATCCAATGCATCGTAATCCAAAGGTAAGAGCGATTGCCGAAAAATATTTATCTGGGAGAAATCGGATTGAATTAATTGAGCCATTAGATGCGATTGAGTTCCATAATTTTACAAATCAATCGTACCTCGTGCTGACAGATTCTGGTGGTATTCAAGAGGAGGCTCCTACATTTGGAAAACCTGTGTTGGTATTAAGGAATCATACAGAGCGTCCCGAAGGCGTTGAGGCGG > CP000730/190132‑190412 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |