| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 1368504 = | 65 (1.000) | 3 (0.050) | 3/236 | NT | 4.9% | intergenic (+2803/‑1967) | rpmG2/tkt | ribosomal protein L33/transketolase |
| ? | CP000730 | 1368533 = | 56 (0.940) | intergenic (+2832/‑1938) | rpmG2/tkt | ribosomal protein L33/transketolase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ATTTAAAAGGTCAATCACCATTTGATCGATTGAAAAAAGATGGTATTACATTTAACTCAGCCGGAGAGAATTTAGCATATGGTCAAGTTAGTAGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTGGCATGAGATTAAAGGGTAATGTTTGTCTGTAAGGAAGTAG > CP000730/1368364‑1368644 | aTTTAAAAGGTCAATCACCATTTGATCGATTGAAAAAAGATGGTATTACATTTAACTCAGCCGGAGAGAATTTAGCATATGGTCAAGTTAGTAGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGaaaaa < 1:754484/141‑1 (MQ=255) tttAAAAGGTCAATCACCATTTGATCGATTGAAAAAAGATGGTATTACATTTAACTCAGCCGGAGAGAATTTAGCATATGGTCAAGTTAGTAGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGaaaaaa < 1:612661/141‑1 (MQ=255) tggtttatctgttgtcatcatgtttatctacttccttacagacaaacattaccctttaatctcatgccaaaaacattaaccagtataattttctgtccaaaaaggttgtttttcatcattaaaatcaacaccaacacctaa > 2:76908‑M1/140‑141 (MQ=255) tggtttatctgttgtcatcatgtttatctacttccttacagacaaacattaccctttaatctcatgccaaaaacattaaccagtataattttctgtccaaaaaggttgtttttcatcattaaaatcaacaccaacacctaa < 1:229540‑M1/2‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) tCACCATTTGATCGATTGAAAAAAGATGGTATTACATTTAACTCAGCCGGAGAGAATTTAGCATATGGTCAAGTTAGTAGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGAt < 1:191590/141‑1 (MQ=255) aTTTGATCGATTGAAAAAAGATGGTATTACATTTAACTCAGCCGGAGAGAATTTAGCATATGGTCAAGTTAGTAGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGtt < 1:143568/141‑1 (MQ=255) aTTTGATCGATTGAAAAAAGATGGTATTACATTTAACTCAGCCGGAGAGAATTTAGCATATGGTCAAGTTAGTAGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGtt < 1:338073/141‑1 (MQ=255) tttGATCGATTGAAAAAAGATGGTATTACATTTAACTCAGCCGGAGAGAATTTAGCATATGGTCAAGTTAGTAGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGttt < 1:484307/141‑1 (MQ=255) tttatctacttccttacagacaaacattaccctttaatctcatgccaaaaacattaaccagtataattttctgtccaaaaaggttgtttttcatcattaaaatcaacaccaacacctAATATTTTAAATGATACGTTTaaa > 2:291062‑M1/118‑141 (MQ=255) gATCGATTGAAAAAAGATGGTATTACATTTAACTCAGCCGGAGAGAATTTAGCATATGGTCAAGTTAGTAGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTaaacgtatcatttaaa < 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(MQ=255) tAACTCAGCCGGAGAGAATTTAGCATATGGTCAAGTTAGTAGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAatga > 2:731613/1‑141 (MQ=255) aaCTCAGCCGGAGAGAATTTAGCATATGGTCAAGTTAGTAGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTATAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAatgct > 1:397356/1‑139 (MQ=255) aCTCAGCCGGAGAGAATTTAGCATATGGTCAAGTTAGTTGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAatgatg > 2:248425/1‑141 (MQ=255) aGCCGGAGAGAATTTAGCATATGGTCAAGTTAGTAGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGaaaa > 1:730257/1‑141 (MQ=255) aGCCGGAGAGAATTTAGCATATGGTCAAGTTAGTAGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGaaaa > 2:751953/1‑141 (MQ=255) ccGGAGAGAATTTAGCATATGGTCAAGTTAGTAGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAaac > 1:105577/1‑141 (MQ=255) gagagaATTTAGCATATGGTCAAGTTAGTAGTATCTATGTACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAaacaac < 1:424844/141‑1 (MQ=255) gagagaATTTAGCATATGGTCAAGTTAGTAGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGGTTAAAATAGTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAaacaac < 2:636829/141‑1 (MQ=255) gagagaATATAGCATATGGTCAAGTTAGTAGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCATAGCAAAAATATTTTAAATGATACGTTTGAAATATGAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAaacaac < 1:676326/141‑1 (MQ=255) gagaATTTAGCATATGGTCAAGTTAGTAGTATCGATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAACTATTAGAGATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCt > 1:410298/1‑141 (MQ=255) gaATTTAGCATATGGTCAAGTTAGTAGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCttt < 1:306527/141‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) tatGGTCAAGTTAGTAGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGaa > 1:241179/1‑141 (MQ=255) atGGTCAAGTTAGTAGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGaaa < 1:553151/141‑1 (MQ=255) aGTTAGTAGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATAc > 1:473488/1‑141 (MQ=255) gtagtaTCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGtt < 2:140655/141‑1 (MQ=255) tagtaTCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTa < 2:213253/141‑1 (MQ=255) gtaTCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAAt < 1:158518/141‑1 (MQ=255) taTCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATg < 1:751953/141‑1 (MQ=255) aTCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGt < 1:536579/141‑1 (MQ=255) cTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGttt < 2:702697/141‑1 (MQ=255) aTGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGttttt < 1:15613/141‑1 (MQ=255) tGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTg > 1:413151/1‑141 (MQ=255) 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(MQ=255) gtttttcatcattaaaatcaacaccaacacctAATATTTTAAATGATACGTTTaa < 2:117026‑M1/23‑1 (MQ=255) gtttttcatcattaaaatcaacaccaacacctAATATTTTAAATGATACGTTTaa > 1:117026‑M1/33‑55 (MQ=255) aaGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTGGCATgaga > 1:83853/1‑141 (MQ=255) ggATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTGGCATGAGAtt > 2:507877/1‑141 (MQ=255) aaTGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTGGCATGAGATTAAAgg > 1:780651/1‑141 (MQ=255) aaTGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTGGCATGAGATTAAAgg > 2:546030/1‑141 (MQ=255) tGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTGGCATGAGATTAAAGGGt < 2:551144/141‑1 (MQ=255) tGAATTCTATTCGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTGGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTGGAATGAGATTAAAGGGt > 2:308247/1‑141 (MQ=255) aTTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTGGCATGAGATTAAAGGGTAAt > 2:536334/1‑141 (MQ=255) aTTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTGGCATGAGATTAAAGGGTAATGTTTg > 1:751940/1‑141 (MQ=255) ttGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTGGCATGAGATTAAAGGGTAATGTTTGt > 2:708288/1‑141 (MQ=255) tGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTGGCATGAGATTAAAGGGTAATGTTTGTc < 1:731613/141‑1 (MQ=255) 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ATTTAAAAGGTCAATCACCATTTGATCGATTGAAAAAAGATGGTATTACATTTAACTCAGCCGGAGAGAATTTAGCATATGGTCAAGTTAGTAGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTGGCATGAGATTAAAGGGTAATGTTTGTCTGTAAGGAAGTAG > CP000730/1368364‑1368644 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |