| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 1368504 = | 65 (1.000) | 3 (0.050) | 3/236 | NT | 4.9% | intergenic (+2803/‑1967) | rpmG2/tkt | ribosomal protein L33/transketolase |
| ? | CP000730 | 1368533 = | 56 (0.940) | intergenic (+2832/‑1938) | rpmG2/tkt | ribosomal protein L33/transketolase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AAAAAAGATGGTATTACATTTAACTCAGCCGGAGAGAATTTAGCATATGGTCAAGTTAGTAGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTGGCATGAGATTAAAGGGTAATGTTTGTCTGTAAGGAAGTAGATAAACATGATGACAACAGATAAACCA > CP000730/1368396‑1368671 | aaaaaaGATGGTATTACATTTAACTCAGCCGGAGAGAATTTAGCATATGGTCAAGTTAGTAGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAggt < 1:174844/141‑1 (MQ=255) aaaGATGGTATTACATTTAACTCAGCCGGAGAGAATTTAGCATATGGTCAAGTTAGTAGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAggtgtt < 1:174760/141‑1 (MQ=255) aGATGGTATTACATTTAACTCAGCCGGAGAGAATTTAGCATATGGTCAAGTTAGTAGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAggtgttgg > 2:649233/1‑141 (MQ=255) aGATGGTATTACATTTAACTCAGCCGGAGAGAATTTAGCATATGGTCAAGTTAGTAGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAggtgttgg > 1:136625/1‑141 (MQ=255) 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(MQ=255) aaCTCAGCCGGAGAGAATTTAGCATATGGTCAAGTTAGTAGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTATAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAatgct > 1:397356/1‑139 (MQ=255) aCTCAGCCGGAGAGAATTTAGCATATGGTCAAGTTAGTTGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAatgatg > 2:248425/1‑141 (MQ=255) aGCCGGAGAGAATTTAGCATATGGTCAAGTTAGTAGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGaaaa > 1:730257/1‑141 (MQ=255) aGCCGGAGAGAATTTAGCATATGGTCAAGTTAGTAGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGaaaa > 2:751953/1‑141 (MQ=255) ccGGAGAGAATTTAGCATATGGTCAAGTTAGTAGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAaac > 1:105577/1‑141 (MQ=255) gagagaATTTAGCATATGGTCAAGTTAGTAGTATCTATGTACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAaacaac < 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(MQ=255) atGGTCAAGTTAGTAGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGaaa < 1:553151/141‑1 (MQ=255) aGTTAGTAGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATAc > 1:473488/1‑141 (MQ=255) gtagtaTCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGtt < 2:140655/141‑1 (MQ=255) tagtaTCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTa < 2:213253/141‑1 (MQ=255) gtaTCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAAt < 1:158518/141‑1 (MQ=255) taTCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATg < 1:751953/141‑1 (MQ=255) aTCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGt < 1:536579/141‑1 (MQ=255) cTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGttt < 2:702697/141‑1 (MQ=255) aTGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGttttt < 1:15613/141‑1 (MQ=255) tGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTg > 1:504635/1‑141 (MQ=255) tGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTg > 1:413151/1‑141 (MQ=255) 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(MQ=255) ggATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTGGCATGAGAtt > 2:507877/1‑141 (MQ=255) aaTGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTGGCATGAGATTAAAgg > 1:780651/1‑141 (MQ=255) aaTGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTGGCATGAGATTAAAgg > 2:546030/1‑141 (MQ=255) tGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTGGCATGAGATTAAAGGGt < 2:551144/141‑1 (MQ=255) tGAATTCTATTCGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTGGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTGGAATGAGATTAAAGGGt > 2:308247/1‑141 (MQ=255) aTTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTGGCATGAGATTAAAGGGTAAt > 2:536334/1‑141 (MQ=255) aTTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTGGCATGAGATTAAAGGGTAATGTTTg > 1:751940/1‑141 (MQ=255) ttGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTGGCATGAGATTAAAGGGTAATGTTTGt > 2:708288/1‑141 (MQ=255) tGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTGGCATGAGATTAAAGGGTAATGTTTGTc < 1:731613/141‑1 (MQ=255) caGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTGGCATGAGATTAAAGGGTAATGTTTGTCTGTAAg > 2:264560/1‑141 (MQ=255) aaGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTGGCATGAGATTAAAGGGTAATGTTTGTCTGTAAg < 2:373840/140‑1 (MQ=255) 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1:27044‑M1/1‑141 (MQ=255) tttaaacgtatcatttaaaatattAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTGGCATGAGATTAAAGGGTAATGTTTGTCTGTAAGGAAGTAGATaaa > 2:291062‑M2/25‑141 (MQ=255) ttaaacgtatcatttaaaatattAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAaac < 2:117026‑M2/32‑1 (MQ=255) ttaaacgtatcatttaaaatattAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAaac > 1:117026‑M2/24‑55 (MQ=255) AATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTGGCATGAGATTAAAGGGTAATGTTTGTCTGTAAGGAAGTAGATAAACATg > 2:604932‑M1/1‑141 (MQ=255) tACGGTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTGGCATGAGATTAAAGGGTAATGTTTGTCTGTAAGGAAGTAGATAAACATGATGac < 2:235848/141‑1 (MQ=255) cGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGGGTAATGTTTGTCTGTAAGGAAGTAGATAAACATGATGacaa > 2:683282/1‑141 (MQ=255) gTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTGGCATGAGATTAAAGGGTAATGTTTGTCTGTAAGGAAGTAGATAAACATGATGacaac > 2:328353/1‑141 (MQ=255) attAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTGGCATGAGATTAAAGGGTAATGTTTGTCTGTAAGGAAGTAGATAAACATGATGACAACAGATAAAcc < 1:40737‑M2/138‑1 (MQ=255) ttAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTGGCATGAGATTAAAGGGTAATGTTTGTCTGTAAGGAAGTAGATAAACATGATGACAACAGATAAACCa < 1:229540‑M2/139‑1 (MQ=255) ttAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTGGCATGAGATTAAAGGGTAATGTTTGTCTGTAAGGAAGTAGATAAACATGATGACAACAGATAAACCa > 2:76908‑M2/3‑141 (MQ=255) | AAAAAAGATGGTATTACATTTAACTCAGCCGGAGAGAATTTAGCATATGGTCAAGTTAGTAGTATCTATGCACATCAAGGATTAATGAATTCTATTGGTCACAGAAAAAATATTTTAAATGATACGTTTAAAATATTAGGTGTTGGTGTTGATTTTAATGATGAAAAACAACCTTTTTGGACAGAAAATTATACTGGTTAATGTTTTTGGCATGAGATTAAAGGGTAATGTTTGTCTGTAAGGAAGTAGATAAACATGATGACAACAGATAAACCA > CP000730/1368396‑1368671 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |