| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 2713224 | 72 (1.100) | 4 (0.070) | 4/240 | NT | 5.5% | intergenic (‑322/+286) | isaA/USA300HOU_2565 | immunodominant antigen A/hypothetical membrane protein |
| ? | CP000730 | = 2713244 | 70 (1.150) | intergenic (‑342/+266) | isaA/USA300HOU_2565 | immunodominant antigen A/hypothetical membrane protein | |||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
GTAATGTTGAAATATGGCTGTTTTATACTGTAATGTGAAATATGTGCCCTTTAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATCAACAAATATGTTTCTACACATGTATTGATTGCTATTATTGTTGTATATTCAAAGTT > CP000730/2713085‑2713364 | gTAATGTTGAAATATGGCTGTTTTATACTGTAATGTGAAATATGTGCCCTTTAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGa < 1:211028/141‑1 (MQ=255) tAATGTTGAAATATGGCTGTTTTATACTGTAATGTGAAATATGTGCCCTTTAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGAt < 1:642321/141‑1 (MQ=255) aTGTTGAAATATGGCTGTTTTATACTGTAATGTGAAATATGTGCCCTTTAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTg > 1:546904/1‑141 (MQ=255) tGTTGAAATATGGCTGTTTTATACTGTAATGTGAAATATGTGCCCTTTAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGt < 1:477280/141‑1 (MQ=255) gTTGAAATATGGCTGTTTTATACTGTAATGTGAAATATGTGCCCTTTAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGcttgta > 2:568377‑M1/1‑135 (MQ=255) aaaTATGGCTGTTTTATACTGTAATGTGAAATATGTGCCCTTTAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTAtttt > 2:498571/1‑141 (MQ=255) aaaTATGGCTGTTTTATACTGTAATGTGAAATATGTGCCCTTTAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTAtttt < 2:754357/141‑1 (MQ=255) aaTATGGCTGTTTTATACTGTAATGTGAAATATGTGCCCTTTAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTAttttt < 1:131062/141‑1 (MQ=255) tatGTCTGTTTTAGACGGTAATGTTAAATATGTGCCCTTTAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGt < 2:466790/141‑1 (MQ=255) tatGGCTGTTTTATACTGTAATGTGAAATATGTGCCCTTTAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGt < 2:669163/141‑1 (MQ=255) tGGCTGTTTTATACTGTAATGTGAAATATGTGCCCTTTAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTa > 2:203905/1‑141 (MQ=255) tGTTTTATACTGTAATGTGAAATATGTGCCCTTTAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATa < 2:133319/141‑1 (MQ=255) ttttATACTGTAATGTGAAATATGTGCCCTTTAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGc > 1:360844‑M2/1‑140 (MQ=255) ataCTGTAATGTGAAATATGTGCCCTTTAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGctgta < 1:168022‑M2/141‑6 (MQ=255) taCTGTAATGTGAAATATGTGCCCTTTAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGctgtaa > 2:613753‑M2/1‑135 (MQ=255) aCTGTAATGTGAAATATGTGCCCTTTAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGctatgtaacaaaaatacaatctgtaat < 1:560804‑M1/141‑28 (MQ=255) tGTAATGTGAAATATGTGCCCTTTAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGctgtaatat > 2:373986‑M2/1‑132 (MQ=255) tGTAATGTGAAATATGTGCCCTTTAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGctgtaatat > 2:574818‑M2/1‑132 (MQ=255) aTGTGAAATATGTGCCCTTTAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCt > 2:394821/1‑141 (MQ=255) aTGTGAAATATGTGCCCTTTAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCt > 2:21307/1‑141 (MQ=255) gtgAAATATGTGCCCTTTAGAATCCAATCAACCCTTGAAGTAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGa > 1:21359/1‑141 (MQ=255) gAAATATGTGCCCTTTAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACa < 1:249743/141‑1 (MQ=255) aaaTATGTGCCCTTTAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACAt > 1:660160/1‑141 (MQ=255) aaaTATGTGCCCTTTAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACAt > 2:558243/1‑141 (MQ=255) tatGTGCCCTTTAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTa < 1:673965/141‑1 (MQ=255) tatGTGCCCTTTAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTACGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTa < 2:716628/141‑1 (MQ=255) atGTGCCCTTTAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTaa > 1:649888/1‑141 (MQ=255) tgtgCCCTTTAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAAc > 1:227723/1‑141 (MQ=255) gCCCTTTAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTtc < 1:308773/141‑1 (MQ=255) gCCCTTTAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTtc > 1:506797/1‑141 (MQ=255) cccTTTAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTtct < 1:263546/141‑1 (MQ=255) tttAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCtt < 1:778061/141‑1 (MQ=255) tttAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCtt < 2:720151/141‑1 (MQ=255) aGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTAtt > 1:171166/1‑141 (MQ=255) tCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCg > 1:714648/1‑141 (MQ=255) tCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCg < 1:706296/141‑1 (MQ=255) cAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTa > 1:371503/1‑141 (MQ=255) tCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACAt < 1:211026/141‑1 (MQ=255) aaCCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTa > 1:261623/1‑141 (MQ=255) ccTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAAc < 1:707061/141‑1 (MQ=255) ttGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGc > 1:722453/1‑141 (MQ=255) tGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGctatgtaacaaaaatacaatctgtaatattacgaaagctgtaatagttgagctaaatatagtaaaaatct > 2:225670‑M1/1‑71 (MQ=255) tGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCa > 1:127974/1‑141 (MQ=255) tGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCa < 2:182103/141‑1 (MQ=255) tGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTATCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGctgtaatattacgaaagctgtaatagttgagctaaatatagtaaaaatct < 1:225670‑M2/141‑51 (MQ=255) gAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCaa > 1:499685/1‑141 (MQ=255) aaaTAGTCTTTAACACATTAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGctatgtaacaaaaatacaatctgtaatattacgaaagctgtaatagttgagctaaatatagtaaaaatctta < 1:260540‑M1/141‑73 (MQ=255) aaTAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATCTCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAAtt > 1:599885/1‑141 (MQ=255) tAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTATCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTaa < 1:477344/141‑1 (MQ=255) tAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTaa < 2:113707/141‑1 (MQ=255) gTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTaaaa > 1:431307/1‑141 (MQ=255) tCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTGAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTaaaaa < 1:726318/141‑1 (MQ=255) tCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTaaaaa < 1:539911/141‑1 (MQ=255) aaCACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAAt > 1:203397/1‑141 (MQ=255) acaTAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATcaa < 2:371503/141‑1 (MQ=255) acaTAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATcaa < 1:133690/141‑1 (MQ=255) tAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGctgtaatattacgaaagctgtaatagttgagctaaatatagtaaaaatctaatgtgttaaagactattt < 1:260540‑M2/141‑70 (MQ=255) aaGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATCAACaaa > 2:185774/1‑141 (MQ=255) aGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGctatgtaacaaaaatacaatctgtaatattacgatagctgtaatagttgagctaaatatagtaaaaatcttatgtgttaaagactatttca < 1:225670‑M1/141‑92 (MQ=255) aGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGctgtaatattacgaaagctgtaatagttgagctaaatatagtaaaaatcttatgtgttaaagactatttca > 2:225670‑M2/1‑70 (MQ=255) aGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATCAACAAat < 2:647010/141‑1 (MQ=255) tttACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATCAACAAATATGtt > 2:65210/1‑141 (MQ=255) tACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATCAACAAATATGtttt > 2:58102/1‑140 (MQ=255) tACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATAAACACATATGTTTc > 2:352666/1‑141 (MQ=255) tttAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATCAACAAATATGTTTCTACACAt < 1:203905/141‑1 (MQ=255) tttAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATCAACAAATATGTTTCTACACAt > 1:258070/1‑141 (MQ=255) aGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATCAACAAATATGTTTCTACACATGTa < 2:530177/141‑1 (MQ=255) cTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATCAACAAATATGTTTCTACACATGTatt > 1:501414/1‑141 (MQ=255) tCAACTATTACAGCTTTCATAATATTACAGATGGTATTTTTGTTACATAGCTGCAACTTTTCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATCAACAAATATGTTTCTACACATGTattg < 1:173333/141‑1 (MQ=255) cAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATCAACAAATATGTTTCTACACATGTattga < 2:2870/141‑1 (MQ=255) cAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATCAACAAATATGTTTCTACACATGTattga > 2:204301/1‑141 (MQ=255) aCTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTTTTACTTTTTTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATCAACAAATATGTTTCTACACATGTattgatt > 2:397677/1‑141 (MQ=255) aCTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATCAACAAATATGTTTCTACACATGTattgatt < 1:595347/141‑1 (MQ=255) cTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATCAACAAATATGTTTCTACACATGTattgattg < 1:560540/141‑1 (MQ=255) aTTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCACTTAAAAAGCAATCAACAAATATGTTTCTACACATGTATTGATTGCt > 1:593303/1‑141 (MQ=255) aTTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATCAACAAATATGTTTCTACACATGTATTGATTGCt < 2:660160/141‑1 (MQ=255) aTTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATCAACAAATATGTTTCTACACATGTATTGATTGCt < 1:394821/141‑1 (MQ=255) tACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTTTTACATTTCTGTAATATATCTGACATGTAACTTTTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAACAATCAACAAATATGTTTATACACAAGTATTGATTGTtat > 2:396145/1‑141 (MQ=255) aCAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATCAACAAATATGTTTCTACACATGTATTGATTGCtatt > 1:327758/1‑141 (MQ=255) cTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATCAACAAATATGTTTCTACACATGTATTGATTGCTATTAttg < 1:300998/141‑1 (MQ=255) tCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATCAACAAATATGTTTCTa > 2:638997/1‑114 (MQ=255) tCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATCAACAAATATGTTTCTa < 1:638997/114‑1 (MQ=255) cGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATCAACAAATATGTTTCTACACATGTATTGATTGCTATTATtgttgt < 1:634569/141‑1 (MQ=255) cGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATCAACAAATATGTTTCTACACATGTATTGATTGCTATTATtgttgt < 1:81872/141‑1 (MQ=255) aaTATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATCAACAAATATGTTTCTACACATGTATTGATTGCTATTATTGTTGtata > 2:57129/1‑141 (MQ=255) aaTATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATCAACAAATATGTTTCTACACATGTATTGATTGCTATTATTGTTGtata > 2:57243/1‑141 (MQ=255) atatTACAGctatgtaacaaaaatacaatctgtaatattacgaaagctgtaatagttgagctaaatatagtaaaaatcttatgtgttaaagactatttcaagggttgattggattctaaagggcacatatttcacattaca > 2:574818‑M1/1‑9 (MQ=255) atatTACAGctatgtaacaaaaatacaatctgtaatattacgaaagctgtaatagttgagctaaatatagtaaaaatcttatgtgttaaagactatttcaagggttgattggattctaaagggcacatatttcacattaca > 2:272358‑M1/1‑9 (MQ=255) atatTACAGctatgtaacaaaaatacaatctgtaatattacgaaagctgtaatagttgagctaaatatagtaaaaatcttatgtgttaaagactatttcaagggttgattggattctaaagggcacatatttcacattaca > 2:373986‑M1/1‑9 (MQ=255) tatTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGATGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATCAACAAATATGTTTCTACACATGTATTGATTGCTATTATTGTTGTATAtt > 2:284484/1‑141 (MQ=255) atTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGctgtaatattacgaaagctgtaatagttgagctaaatatagtaaaaatcttatgtgttaaagactatttcaagggttgattggattctaaagggcacatatttcacattacagt < 1:560804‑M2/141‑115 (MQ=255) atTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATCAACAAATATGTTTCTACACATGTATTGATTGCTATTATTGTTGTATATTc > 1:318589/1‑141 (MQ=255) ttACAGctatgtaacaaaaatacaatctgtaatattacgaaagctgtaatagttgagctaaatatagtaaaaatcttatgtgttaaagactatttcaagggttgattggattctaaagggcacatatttcacattacagta > 2:613753‑M1/1‑6 (MQ=255) ttACAGctatgtaacaaaaatacaatctgtaatattacgaaagctgtaatagttgagctaaatatagtaaaaatcttatgtgttaaagactatttcaagggttgattggattctaaagggcacatatttcacattacagta > 2:780518‑M1/1‑6 (MQ=255) ttACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATCAACAAATATGTTTCTACACATGTATTGATTGCTATTATTGTTGTATATTCa > 2:359161/1‑141 (MQ=255) tACAGctatgtaacaaaaatacaatctgtaatattacgaaagctgtaatagttgagctaaatatagtaaaaatcttatgtgttaaagactatttcaagggttgattggattctaaagggcacatatttcacattacagtat < 1:168022‑M1/141‑137 (MQ=255) tACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATCAACAAATATGTTTCTACACATGTATTGATTGCTATTATTGTTGTATATTCaa < 2:407537/141‑1 (MQ=255) aGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATCAACAAATATGTTTCTACACATGTATTGATTGCTATTATTGTTGTATATTCAAAGt > 2:220294/1‑141 (MQ=255) gctatgtaacaaaaatacaatctgtaatattacgaaagctgtaatagttgagctaaatatagtaaaaatcttatgtgttaaagactatttcaagggttgattggattctaaagggcacatatttcacattacagtataaaa > 1:360844‑M1/1‑1 (MQ=255) gATTGGATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATCAACAAATATGTTTCTACACATGTATTGATTGCTATTATTGTTGTATATTCAAAGtt < 2:436139/141‑1 (MQ=255) | GTAATGTTGAAATATGGCTGTTTTATACTGTAATGTGAAATATGTGCCCTTTAGAATCCAATCAACCCTTGAAATAGTCTTTAACACATAAGATTTTTACTATATTTAGCTCAACTATTACAGCTTTCGTAATATTACAGATTGTATTTTTGTTACATAGCTGTAATATATCTGACATGTAACTTCTCTTATTTTCGTACATTAAACGCAATTAAAAAGCAATCAACAAATATGTTTCTACACATGTATTGATTGCTATTATTGTTGTATATTCAAAGTT > CP000730/2713085‑2713364 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |