New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | 1218705 = | 73 (1.120) | 8 (0.140) | 5/228 | NT | 11.3% | intergenic (+196/+67) | USA300HOU_1145/fbpA | possible 3‑demethylubiquinone‑9 3‑methyltransferase/fibrinogen‑binding protein |
? | CP000730 | 1218759 = | 61 (1.060) | intergenic (+250/+13) | USA300HOU_1145/fbpA | possible 3‑demethylubiquinone‑9 3‑methyltransferase/fibrinogen‑binding protein |
TAAAATCACAAAGATAATTTGTAACTTAAATGATGATACGTTATTTAAAAACACGATACTTCGTTTCAATGAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAACCCAGGCTTTGCACCTGATGGTTTATGCACATTTTTAATTAATGT > CP000730/1218619‑1218894 | tAAAATCACAAAGATAATTTGTAACTTAAATGATGATACGTTATTTAAAAACACGATACTTCGTTTCAATGAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTg > 2:698281/1‑141 (MQ=255) aaaTCACAAAGATAATTTGTAACTTAAATGATGATACGTTATTTAAAAACACGATACTTCGTTTCAATGAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTc < 1:528107/141‑1 (MQ=255) aTCACAAAGATAATTTGTAACTTAAATGATGATACGTTATTTAAAAACACGATACTTCGTTTCAATGAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTTTCGa > 2:13661/1‑141 (MQ=255) aTCACAAAGATAATTTGTAACTTAAATGATGATACGTTATTTAAAAACACGATACTTCGTTTCAATGAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGa > 1:643080/1‑141 (MQ=255) acaGAGATAATTTGTAACTTAAATGATGATACGTTATTTAAAAACACGCTACTTCGTTTCAATGAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTACTTTTGTGAGGTGTTTATTTCTCGACaa > 2:11463/1‑141 (MQ=255) acaAAGATAATTTGTAACTTAAATGATGATACGTTATTTAAAAACACGATACTTCGTTTCAATGAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACaa > 1:336776/1‑141 (MQ=255) aGATAATTTGTAACTTAAATGATGATACGTTATTTAAAAACACGATACTTCGTTTCAATGAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTg > 1:404892/1‑141 (MQ=255) aGATAATTTGTAACTTAAATGATGATACGTTATTTAAAAACACGATACTTCGTTTCAATGAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTg < 1:135996/141‑1 (MQ=255) tGTAACTTAAATGATGATACGTTATTTAAAAACACGATACTTCGTTTCAATGAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGAt > 2:10845/1‑141 (MQ=255) gTAACTTAAATGATGATACGTTATTTAAAAACACGATACTTCGTTTCAATGAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGAtt > 2:528827/1‑141 (MQ=255) aCTTAAATGATGATACGTTATTTAAAAACACGATACTTCGTTTCAATGAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGtt < 1:490755/141‑1 (MQ=255) aCTTAAATGATGATACGTTATTTAAAAACACGATACTTCGTTTCAATGAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGtt < 1:605014/141‑1 (MQ=255) aCTTAAATGATGATACGTTATTTAAAAACACGATACTTCGTTTCAATGAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGtt < 1:205572/141‑1 (MQ=255) aCTTAAATGATGATACGTTATTTAAAAACACGATACTTCGTTTCAATGAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGtt < 2:247953/141‑1 (MQ=255) ttAAATGATGATACGTTATTTAAAAACACGATACTTCGTTTCTATCAACGAATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATGAGTAAGGACTACTTACTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGGCACCTTGTTTATGGTTGTTTc < 2:750822/141‑1 (MQ=255) ttAAATGATGATACGTTATTTAAAAACACGATACTTCGTTTCAATGGACGCATTAAAGAGGAAATAAACTCCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTc < 1:662687/141‑1 (MQ=255) aaaTGATGATACGTTATTTAAAAACACGATACTTCGTTTCAATGAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCAt < 2:581498/141‑1 (MQ=255) aaaTGATGATACGTTATTTAAAAACACGATACTTCGTTTCAATGAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCAt > 1:413199/1‑141 (MQ=255) atgatgATACGTTATTTAAAAACACGATACTTCGTTTCAATGAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCAttt < 2:627769/141‑1 (MQ=255) tgatgaTACGTTATTTAAAAACACGATACTTCGTTTCAATGAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCAtttt < 2:241642/141‑1 (MQ=255) gatgatACGTTATTTAAAAACACGATACTTCGTTTCAATGAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTTTTTCAttttt > 2:424658/1‑141 (MQ=255) tATTTAAAAACACGATACTTCGTTTCAATGAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGATGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGtt < 2:313798/141‑1 (MQ=255) tttAAAAACACGATACTTCGTTTCAATGAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCa < 2:480839/141‑1 (MQ=255) aaaaaCACGATACTTCGTTTCAATGAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATaa < 2:539664/141‑1 (MQ=255) aaaaCACGATACTTCGTTTCAATGAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTCTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAAt > 1:151931/1‑141 (MQ=255) acacGATTCTTCGTTTCAATGAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAg < 1:326700/141‑1 (MQ=255) acGATACTTCGTTTCAATGAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGgt > 2:443128/1‑141 (MQ=255) aTACTTCGTTTCAATGAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTa < 1:645020/141‑1 (MQ=255) cTTCGTTTCAATGAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCa < 2:336776/141‑1 (MQ=255) cGTTTCAATGAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATTATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATAc < 1:37043/141‑1 (MQ=255) cGTTTCAATGAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGCTTGTTTCATTTTTTTAATTTGTTCATAATCAGTTGTAGCAtcc > 2:681517/1‑139 (MQ=255) tGAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGtttt < 1:41438/141‑1 (MQ=255) tGAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGtttt < 1:41449/141‑1 (MQ=255) gAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGttttt > 2:491946/1‑141 (MQ=255) gAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGttttt > 2:10215/1‑141 (MQ=255) gAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTAATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGttttt < 2:269785/141‑1 (MQ=255) cGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGa > 2:14692/1‑141 (MQ=255) aTTAAATNATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTg < 2:588991/141‑1 (MQ=255) ttAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGt < 2:695123/141‑1 (MQ=255) taaataataaataaACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTc < 2:274228/141‑1 (MQ=255) aataataaataaACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCat > 2:733336/1‑141 (MQ=255) aataataaataaACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCat > 1:79254/1‑141 (MQ=255) aataataaataaACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCat > 1:192992/1‑141 (MQ=255) taataaataaACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCatat > 2:257976/1‑141 (MQ=255) ataaataaACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGt < 2:381784/141‑1 (MQ=255) taaataaaCACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGt > 1:433653/1‑140 (MQ=255) taaataaaCACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGt < 2:433653/140‑1 (MQ=255) AATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTAc > 1:508560‑M1/1‑141 (MQ=255) AACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCCTACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAAc > 2:362967‑M1/1‑141 (MQ=255) ACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAAcc > 1:495496‑M1/1‑141 (MQ=255) CCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAACCCAg < 1:289064‑M1/141‑1 (MQ=255) tcacaaaagaaagtagtcctttcttatggtgaggtgtttatttGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTc > 2:118736‑M2/44‑69 (MQ=255) tcacaaaagaaagtagtcctttcttatggtgaggtgtttatttGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTc < 1:118736‑M2/26‑1 (MQ=255) tcacaaaagaaagtagtcctttcttatggtgaggtgtttatttGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTc < 1:118711‑M2/26‑1 (MQ=255) tcacaaaagaaagtagtcctttcttatggtgaggtgtttatttGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTc > 2:118711‑M2/44‑69 (MQ=255) TCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAACCCAGGc < 2:77918‑M1/141‑1 (MQ=255) CACCATAACAAAGGACTACTTTCTTTTGTGCGGTGTTTATTTGTCTACAACTTGATTATGTTTGGTTCATGTTTTGAATAAGTTCATAAGCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAACCCAGGCt > 1:31669‑M1/1‑141 (MQ=255) actaTAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAACCCAGGCtt < 1:673377/138‑1 (MQ=255) acaaaagaaagtagtcctttcttatggtgaggtgtttatttGTCGACAACTTGATTATGATCGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAACCCAGGCtt > 1:30736‑M2/42‑141 (MQ=255) cATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTTTTTTTTTTCATAATCAAGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAACTCAGGCtttt > 2:586539/1‑140 (MQ=255) tAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAACCCAGGCTTTGCa > 1:681154/1‑141 (MQ=255) aagaaagtagtcctttcttatggtgaggtgtttatttGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAACCCAGGCTTTGCa > 2:426910‑M2/38‑141 (MQ=255) agaaagtagtcctttcttatggtgaggtgtttatttGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAACCCAGGCTTTGCAc > 2:754714‑M2/37‑141 (MQ=255) agaaagtagtcctttcttatggtgaggtgtttatttGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAACCCAGGCTTTGCAc > 1:618530‑M2/37‑141 (MQ=255) aaGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAACCCAGGCTTTGCAc < 2:375838/141‑1 (MQ=255) aGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAACCCAGGCTTTGCAcc < 1:500690/141‑1 (MQ=255) aGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGGTACAAACCCAGGCTTTGCAcc > 2:273593/1‑141 (MQ=255) aaaGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAACCCAGGCTTTGCACCTg < 1:103396/141‑1 (MQ=255) aaGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAACCCAGGCTTTGCACCTGa > 1:666648/1‑141 (MQ=255) aaGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAACCCAGGCTTTGCACCTGa < 2:744529/141‑1 (MQ=255) aGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAACCCAGGCTTTGCACCTGAt < 2:517948/141‑1 (MQ=255) actTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTTTTTTTTTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAACCCAGGCTTTGCACCTGATGGTTTa > 2:243645/1‑141 (MQ=255) actTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAACCCAGGCTTTGCACCTGATGGTTTa < 1:76120/141‑1 (MQ=255) actTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAACCCAGGCTTTGCACCTGATGGTTTa < 1:454969/141‑1 (MQ=255) ctttctttTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTACAAACCCAGGCTTTGCACCTGATGGttttt > 2:31582/1‑139 (MQ=255) ctttctttTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAACCCAGGCTTTGCACCTGATGGTTTAt < 1:581874/141‑1 (MQ=255) tttctttTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAACCCAGGCTTTGCACCTGATGGTTTATg > 1:492088/1‑141 (MQ=255) ttctttTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAACCCAGGCTTTGCACCTGATGGTTTATGc < 2:693047/141‑1 (MQ=255) tctttTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAACCCAGGCTTTGCACCTGATGGTTTATGca < 2:187322/141‑1 (MQ=255) ttttGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCAGACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAACCCAGGCTTTGCACCTGATGGTTTATGcaca > 2:612225/1‑141 (MQ=255) ttGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAACCCAGGCTTTGCACCTGATGGTTTATGCACAtt < 2:404892/141‑1 (MQ=255) tgtgAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAACCCAGGCTTTGCACCTGATGGTTTATGCACAttt < 1:679516/141‑1 (MQ=255) gtgaggtgtttatttGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAACCCAGGCTTTGCACCTGATGGTTTATGCACAtttt > 1:699639‑M2/16‑141 (MQ=255) gaggtgtttatttGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAACCCAGGCTTTGCACCTGATGGTTTATGCACATTTtta < 1:443128‑M2/128‑1 (MQ=255) aggtgtttatttGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAACCCAGGCTTTGCACCTGATGGTTTATGCACATTTttaa > 2:293909‑M2/13‑141 (MQ=255) ttatttGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAACCCAGGCTTTGCACCTGATGGTTTATGCACATTTTTAATTAATg < 2:446701‑M2/135‑1 (MQ=255) tatttGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAACCCAGGCTTTGCACCTGATGGTTTATGCACATTTTTAATTAATGt < 1:372815‑M2/136‑1 (MQ=255) | TAAAATCACAAAGATAATTTGTAACTTAAATGATGATACGTTATTTAAAAACACGATACTTCGTTTCAATGAACGCATTAAATAATAAATAAACACCTCACCATAAGAAAGGACTACTTTCTTTTGTGAGGTGTTTATTTGTCGACAACTTGATTATGATTGTTTCATTTTTTGAATAAGTTCATAATCAGGTGTAGCATACAAAGTTTTTTGATTGTCATATGTTACAAACCCAGGCTTTGCACCTGATGGTTTATGCACATTTTTAATTAATGT > CP000730/1218619‑1218894 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |