| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 802757 | 19 (0.690) | 3 (0.120) | 3/244 | NT | 15.0% | coding (544/918 nt) | dgkA1 | possible diacylglycerol kinase |
| ? | CP000730 | = 802799 | 16 (0.610) | coding (502/918 nt) | dgkA1 | possible diacylglycerol kinase | |||||
CGACTACCACCAATGAATGGACCATTTGCTGTTAGTATCATGGTCGTTTCGCCAGAATATGTCTTATCATCTATTGATAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATGAGACCTAAGCCAACAAAGTTGAGTGCATATTGATTATTTATTTTAATTACATCGTATGTACCAACTTGTGCAGAAATCA > CP000730/802663‑802936 | cGACTACCACCAATGATTGGACCATATGCTGTTAGTATCATGGTCATTTCGTCAGAATATGTTTTATCACCTATTGATAATTTATATATAAGTTTTGTTGGATTTAGCAGTGATTTGACAGTTTATCGAAAATAATTTAAt > 2:7263/1‑141 (MQ=255)cGACTACCACCAATGAATGTACCATTTGCTGTTAGTATCATGGTCGTTTCGCCAGAATATGTCTTATCATCTATTGATAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTcaat < 2:7610‑M2/141‑5 (MQ=255) gACTACCACCAATGAATGGACCATTTGCTGTTAGTATCATGGTCGTTTCGCCAGAATATGTCTTATCATCTATTGATAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTcaatt < 2:315116‑M2/141‑6 (MQ=255) atgGACCATTTGCTGTTAGTATCATGGTCGTTTCGCCAGAATATGTCTTATCATCTATTGATAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCtt > 1:305669/1‑141 (MQ=255) gCTGTTAGTATCATGGTCGTTTCGCCAGAATATGTCTTATCATCTATTGATAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCt > 2:25956/1‑141 (MQ=255) tttCGCCAGAATATGTCTTATCATCTATTGATAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTGTACGTTTTCAGCGtttt > 2:69960/1‑141 (MQ=255) tttCGCCAGAATATGTCTTATCATCTATCGATAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTGTACGTTTTCAGCGtttt < 1:326789/141‑1 (MQ=255) gCCAGAATATGTCTTATCATCTATTGATAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTCTACGTTCTAAGCGTTTTGAAc > 2:299769/1‑141 (MQ=255) aaTATGTCTTATCATCTATTGATAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATga < 1:18984/141‑1 (MQ=255) atcTATTGATAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATGAGACCTAAGCcaac < 1:7610/141‑1 (MQ=255) atcTATTGATAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATGAGACCTAAGCcaac < 1:7263/141‑1 (MQ=255) tATTGATAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGTTCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATGAGACCTAAGCCAACaaa < 2:62613/141‑1 (MQ=255) ttgataattAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTcaatttaattatcaattatcaatagatgataagacatattctggcgaaacgaccatgatactaacagcaaatggtccattcatt < 2:287233‑M2/141‑85 (MQ=255) tAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTcaatttaattatcaattatcaatagatgataagacatattctggcgaaacgaccatgatactaacagcaaatggtccattcattggtggtag < 1:140044‑M2/141‑93 (MQ=255) aTTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATGAGACCTAAGCCAACAAAGTTGAGTGCATATTGattat > 1:136540/1‑141 (MQ=255) gtgtTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATGAGACCTAAGCCAACAAAGTTGAGTGCATATTGAttattta < 1:117857/141‑1 (MQ=255) gtTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAACA‑‑‑‑aatttaattatcaattatcaatagatgataagacatattctggcgaaacgaccatgatactaacagcaaatggtccattcattggtggtagtcgtataccattg < 2:181218‑M2/141‑105 (MQ=255) tttAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATGAGACCTAAGCCAACAAAGTTGAGTGCATATTGATTATTTATTTTAAtt < 1:103114/141‑1 (MQ=255) aGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATGAGACCTAAGCCAACAAAGTTGAGTGCATATTGATTATTTATTTTAATTACATCg > 2:319829/1‑141 (MQ=255) gTTGATCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGACCCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATGAGTTCTACGACACCACAGTTGAGTGCATATTGATTATTTATTTTAATTACATCGTATGTCCCAACt < 2:57096/141‑1 (MQ=255) tCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATGAGACCTAAGCCAACAAAGTTGAGTGCATATTGATTATTTATTTTAATTACATCGTATGTACCAACTTGTGc > 1:1285/1‑141 (MQ=255) cAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATGAGACCTAAGCCAACAAAGTTGAGTGCATATTGATTATTTATTTTAATTACATCGTATGTACCAACTTGTGCAg > 2:105850/1‑141 (MQ=255) aaCTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATGAGACCTAAGCCAACAAAGTTGAGTGCATATTGATTATTTATTTTAATTACATCGTATGTACCAACTTGTGCAGAAATCa < 2:126397/141‑1 (MQ=255) | CGACTACCACCAATGAATGGACCATTTGCTGTTAGTATCATGGTCGTTTCGCCAGAATATGTCTTATCATCTATTGATAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATGAGACCTAAGCCAACAAAGTTGAGTGCATATTGATTATTTATTTTAATTACATCGTATGTACCAACTTGTGCAGAAATCA > CP000730/802663‑802936 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |