| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 2699163 = | 129 (1.130) | 46 (0.420) +TAGTGT |
3/282 | 10.2 | 26.0% | intergenic (+67/‑224) | copA/merP | P‑ATPase superfamily P‑type ATPase copper (Cu2+) transporter/MerTP family mercury (Hg2+) permease, binding protein MerP |
| ? | CP000730 | = 2699363 | 144 (1.260) | intergenic (+267/‑24) | copA/merP | P‑ATPase superfamily P‑type ATPase copper (Cu2+) transporter/MerTP family mercury (Hg2+) permease, binding protein MerP | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
CCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP000730/2699303‑2699163‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCG < CP000730/2699363‑2699232 |||||| ttttgaggcagTTATTATTTATCATAATTAGTGGCTTTTATGTAGTTGGAGCGAAGGCACAACTGTACATCGTTGTGCACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTA < 2:478157/137‑1tatagggcccCTTATCATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTA < 1:936992/138‑1 ccatTTAGTATTTATAATACTTTGTGGCTCTTATGCTTTTGGAGAGAAGATCCACCTGTAATCCGTGGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTA < 2:643935/144‑1 ATTACTTATAATAATTTGTGGCTCTTATGCAGTTTGAGCGAAGATCCAACTGTCATCCGTGGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATA < 2:954040/148‑1 TTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAA < 1:1032674/148‑1 taaAATAATTTGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATT < 1:426890/145‑1 tATAATCTGTGCCTTTTATGAATTTGGTGTGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAACCCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGT < 2:386736/147‑1 ATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTG > 1:849173/1‑148 attacgGGCTCTTATGGAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCT < 1:275126/142‑1 ATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGGGCGAAGATCCAACTGTAAACGGTGGCGTACTTATTCTTTGTAATAATTAGTGGCT > 2:182851/1‑148 TTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTCTTTATAATAATTAGTGGCTC > 1:1026795/1‑148 TGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCTAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCGACTGTGAACCGTAGTGTCCTTCATCTTCATACTAATTTGTCGCTCTTgt > 1:640749/1‑146 TGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTAT > 1:762009/1‑148 GGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACAGTAAACCGTGGTGTACTTAGGCTGTGTAATAATTAGTcccagcatta > 2:187609/1‑138 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GCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCC < 1:350458/148‑1 CTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCCGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCG > 1:206514/1‑148 GTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAATGTAATTGGTATTTATAATAATTAGTGTCTCTTATGCGGTCGGAGCGTAGATTCCTCAGTAAACCacg > 2:1068068/1‑145 CCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTCTTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCCGTCGGAGCGAAGATCATACTGTAAACtacgccact > 2:906279/1‑139 CCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATGTATACTAATTAGTGGCACTTATGCAGTTGGAGCTCAGATTCAACTGTAACCCtcgatatt > 2:426042/1‑140 agggccatTTATTATTTATGATAATTAGGAGCTTGTATGCAGTCGGCGCGACGCTCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGATGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTT < 1:758403/140‑1 ctcATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTT < 1:398129/145‑1 CTTATTATTTTTAAGAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGCGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTT < 1:40469/148‑1 TTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAA < 1:568584/148‑1 TAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGG > 1:821797/1‑148 AATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTCGAACGAAGATCCAACTGTAAACAGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGC > 1:782135/1‑148 ATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCT < 1:1073639/148‑1 aaccCTTATGCGGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGGGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATACAACTGGAAACCGTGGTGTACTTGTTATATTTAATAATTGGTTCCTCTCATG > 2:1149106/5‑148 GGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTGGTGTACTAGTTCCTTATAATAATTAATGGCcgtaata > 2:781514/1‑141 GGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATG > 1:792324/1‑148 GGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCGCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTGAAGTACTTAGTATTTTAAATAATTtatcgctgatttg > 2:771848/1‑135 TCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAG > 1:1185569/1‑148 TCTTATGCAGTGGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAATGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTGCTTATGATGAATAATAATCAGTGGCagaattccaa > 2:334433/1‑138 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TCCAACTGTAAACCGTAGTGCACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGGAGATCCAACTGTA > 1:444111/1‑148 CTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCG < 1:242477/148‑1 |||||| CCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP000730/2699303‑2699163‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCGTAGTGTACTTATTATTTATAATAATTAGTGGCTCTTATGCAGTTGGAGCGAAGATCCAACTGTAAACCG < CP000730/2699363‑2699232 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |