| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 2699163 = | 129 (1.130) | 46 (0.420) +TAGTGT |
3/282 | 10.2 | 26.0% | intergenic (+67/‑224) | copA/merP | P‑ATPase superfamily P‑type ATPase copper (Cu2+) transporter/MerTP family mercury (Hg2+) permease, binding protein MerP |
| ? | CP000730 | = 2699363 | 144 (1.260) | intergenic (+267/‑24) | copA/merP | P‑ATPase superfamily P‑type ATPase copper (Cu2+) transporter/MerTP family mercury (Hg2+) permease, binding protein MerP | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
TAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTGACGGTGTCACTTCAGCTGACGTTAACCTTGAAAATGGTCAAG > CP000730/2699218‑2699510 | taataaGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTgg > 1:868631/1‑148 (MQ=255)taataaGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTgg > 2:650284/1‑148 (MQ=255) aattaGCACCCTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGc < 2:1154220/148‑1 (MQ=255) ataacaacccTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGct < 2:668587/139‑1 (MQ=255) ataaGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGct < 1:577049/148‑1 (MQ=255) ataaGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGct < 1:687322/148‑1 (MQ=255) agaagtagatgaCGGTTTACTGTTGGATCTACGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAACTAATAAGTACAATACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGct < 2:432942/137‑1 (MQ=11) aaGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGctct > 1:1031250/1‑148 (MQ=255) gTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATACTAAGTGGCTCTaa > 1:1047805/1‑148 (MQ=255) gTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAAAGGCACTAGTTATTATAAATGATAAGTGGCTATaa > 2:1066262/1‑148 (MQ=14) tACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTaaa > 1:1159429/1‑148 (MQ=255) cTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTCCGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACAAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAagga > 1:479257/1‑148 (MQ=255) cTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAAGAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAagga > 1:483532/1‑148 (MQ=255) tagtgtctagaGTTGGATCTTCGCTCCCACTGCGTAATAGCCACTAATTAGTATAAATAATAAGTACATTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAaggag < 2:851524/138‑1 (MQ=14) aCGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAaggagg > 1:451090/1‑148 (MQ=255) ggTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTg < 2:350458/148‑1 (MQ=255) gTTTACAGTTGGATCTTCGCTACAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGa > 1:680473/1‑148 (MQ=255) cAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGAGAATGca > 2:952151/1‑147 (MQ=255) ttGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATg < 1:1069916/148‑1 (MQ=255) 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cTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTGACGGTGTCACTTCAGCTGACg < 1:608324/148‑1 (MQ=255) cTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTGACGGTGTCACTTCAGCTGACg > 2:1244730/1‑148 (MQ=255) attatAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTGACGGTGTCACTTCAGCTGACGTTAAcc < 2:1168996/148‑1 (MQ=255) ttatAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTGACGGTGTCACTTCAGCTGACGTTAACCt < 1:1066262/148‑1 (MQ=255) tataAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTAGGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTGACGGTGTCACTTCAGCTGACGTTAACCtt < 1:811850/148‑1 (MQ=255) taaataaTAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTGACGGTGTCACTTCAGCTGACGTTAACCTTGa > 2:1378/1‑148 (MQ=255) aaataaTAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTGACGGTGTCACTTCAGCTGACGTTAACCTTGaa > 2:557325/1‑148 (MQ=255) aaataaTAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTGACGGTGTCACTTCAGCTGACGTTAACCTTGaa > 1:253666/1‑148 (MQ=255) aataatAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTGACGGTGTCACTTCCGCTGACGTTAACCTTGaaa > 1:202041/1‑148 (MQ=255) ataataAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTGACGGTGTCACTTCAGCTGACGTTAACCTTGaaaa > 1:509932/1‑148 (MQ=255) taataaGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTGACGGTGTCACTTCAGCTGACGTTAACCTTGaaacg > 2:1117827/1‑146 (MQ=255) taataaGTGGCTCTAAAAGGAGGGGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTGACGGTGTCACTTCAGCTGACGTTAACCTTGAAAAt > 2:73711/1‑148 (MQ=255) taaGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTGACGGTGTCACTTCAGCTGACGTTAACCTTGAAAATGGt > 2:1053197/1‑148 (MQ=255) taaGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTGACGGTGTCACTTCAGCTGACGTTAACCTTGAAAATGGt > 2:842406/1‑148 (MQ=255) taaGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTGAAGGTGTCACTTCAGCTGACGTTAACCTTGAAAATgga > 2:1127032/1‑147 (MQ=255) aaaGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTGACGGTGTCACTTCAGCTGACGTTAACCTTGAAAATGGt < 2:451090/147‑1 (MQ=255) aaGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTGACGGTGTCACTTCAGCTGACGTTAACCTTGAAAATGGTc > 1:660238/1‑148 (MQ=255) aaGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTGACGGTGTCACTTCAGCTGACGTTAACCTTGAAAATGGTc < 1:1076942/148‑1 (MQ=255) aGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTGACGGTGTCACTTCAGCTGACGTTAACCTTGAAAATGGTCa < 2:387628/148‑1 (MQ=255) gTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTCTGCGCAGTGGTCACTGCACAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTGACGGTGTCACTTCGGCTGACGTTAACATTCAAAATTGTcga > 1:1041275/1‑146 (MQ=255) tGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTAAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTGACGGTGTCACTTCAGCTGACGTTAACCTTGAAAATGGTCaag > 1:1179530/1‑148 (MQ=255) | TAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTGGCTCTAAAAGGAGGTGAATGCTATGTCACAAGAAATTTTAAATGTTGAAGGTATGAGCTGTGGTCACTGCAAAAGTGCTGTTGAATCTGCATTAAATAATATTGACGGTGTCACTTCAGCTGACGTTAACCTTGAAAATGGTCAAG > CP000730/2699218‑2699510 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |