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Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
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aTTCTGAGATAGGCTAGTGATTGGCT‑CTATAATGTCGCGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCA‑T‑AAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCAc < 2:32204/148‑1 (MQ=255) cTGAGATAGGCTAGTGATTGGCT‑CTATAATGTCTCGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCAACCAACA‑C‑TAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTaa < 1:289700/148‑1 (MQ=17) cTGAGATAGGCTAGTGATTGGCT‑CTATAATGTCGCGGTTTACAGTTGGATCTTAGCTCCAACTGCA‑T‑AAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTaa > 1:1096784/1‑148 (MQ=255) cTGAGATAGGCTAGTGATCGGCT‑CTATACTGTCGCGGTTTACAGTTGGATCCTCGCTCCAACTGCA‑G‑AAGAGCCACTAACTATTACAAATAAGAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCTCTCCAACTGCATAAGAGCCACTaa < 1:145042/148‑1 (MQ=17) gagaTAGGCTAGTGATTGGCT‑CTATAGTGTCGCGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCA‑T‑AAGAGCCACTAGTTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAatt < 2:748997/148‑1 (MQ=255) gaTAGGCTAGTGATTGGCT‑CTAAAAGGTCGCGGTTTACAGTTTGATCTTCGCTCCAACTGCA‑T‑AAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAattat < 2:73466/148‑1 (MQ=255) atcggCTAGTGATTGGCT‑CTATAATGTCGCGGTTTACAGTTGGATCTTCGCCCC‑‑CCGCAGTAAATAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCTAACTGCATAAGAGCCACTAattatt < 1:1229018/145‑1 (MQ=17) aGGCTAGGGATTGGCT‑CTATAAGGTCGCGTTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACGGCA‑T‑AAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATtattat < 1:61646/148‑1 (MQ=255) gTGATTGGCT‑CTATAATGTCGCGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAGCTGCA‑T‑AAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAAAGCCCCTAATTATTataaataa > 2:811850/1‑148 (MQ=255) gTGATTGGCT‑CTATAATGTCGCGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCA‑T‑AAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTataaataa > 1:215442/1‑148 (MQ=255) 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aaTGTCGCGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCA‑T‑AAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACgg > 1:1200028/1‑148 (MQ=255) cgGTTTACCGTTGGATCTTCGCTTCGGGTGCA‑T‑TAGAGCCACTAATTATTTTATGTAATAAGTACCCTACGGTTTACAGTTGGGTCTTCGCTCCTACTGCATTAGTGCCCCTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTTCAg < 1:863721/148‑1 (MQ=14) | CACTAAGTTCAGTAAGTGTTGTCACAAACGCACTTAGATTGAAAAAGATGCGATTAGAACCACGCCGTAAAGATGCCTAGATTCCTTAATAATGAAGGATTCGTTGGTGATTCTGAGATAGGCTAGTGATTGGCT‑CTATAATGTCGCGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCA‑T‑AAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAGTTGGATCTTCGCTCCAACTGCATAAGAGCCACTAATTATTATAAATAATAAGTACACTACGGTTTACAG > CP000730/2699017‑2699310 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |