New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1240065 | 280 (1.050) | 10 (0.040) | 10/528 | 31.1 | 3.6% | intergenic (+116/+270) | dadX/cvrA | alanine racemase, catabolic, PLP‑binding/putative cation/proton antiporter |
? | NC_000913 | = 1240072 | 274 (1.070) | intergenic (+123/+263) | dadX/cvrA | alanine racemase, catabolic, PLP‑binding/putative cation/proton antiporter | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
ACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1239755‑1240065 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atagtgtccatCCTTTTAATGGACACTATCATGGGCAATGGCTCTGT‑CACATTAACAACTACAGTTGCTGACCAGCCGGATGGATGATTTTTTTGCACCCAGAAGACGTTGCCTCCGATCCGGCTTACAACAAGTTACACCGTCACAACCGGGACGCGTAGCGCCAGCGCGCACATCAACTCATAGCCCACCGTTCCGGCAGCGGCGGCGACATCATCAATTTTGATCTCCTTGCCCCACAGCTCAACCGGCGTACCAATACCCGCCTGCGGGCAAGGCGTTAAATCGACCGCTAGCATATCCATCGAGAC < NC_000913/1240072‑1239773 ACCATGGCGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGA < 1:1193330/301‑1 gagacggtccccACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGGTACAGAGCCATTGCCCATGGTA > 1:1201948/13‑300 ATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGAGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCCTTGCCCATGAT > 1:1661760/1‑299 ATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGACCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCGATGAGTGGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGGCCCGGTTGTGACGGTGTAACGTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTATTCTGGGTGCCAAAAAATCATTCATACGGCTGGGCAGCAACTGTCGTTGTTAATGTGACCGAGCCATTTCCACTGATAt > 1:891007/1‑300 ACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATAAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTGGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGCCTTCTGGGCGCAAAAAAATCATCCATCCGGTGGGTCAGCAACGGTAGGTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCTTGATATTGT > 2:748111/1‑301 gGGGGACCGGCTCGATGGATAGGCTAGCGGTCGATTTAAAGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGAAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCAT < 1:1204851/300‑1 GGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTTCGCGCTGGCGCTACGCCTCCCGGCTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGGTCGGAGGCAACGGCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCCGGTCAGCAACTGTCGTTGTTAATTGGACAGACCCATTGCCCATGATAGTGTCCAT > 2:1204491/1‑300 ATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATCCTTTTAATGGACACTAT < 1:748307/301‑1 gcagcgGGCGAGTAGGGGTGCGCGGGGTGGGGTGGGGGGCAAGGAGGTCAAAATTGCTGATGTGGCCGCCGCGGCCGGAACGGTTGGGTATGGGTTGAGGTGCGGGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATCCTTTTAATGGACACTATCATGGGCAATGGCTCTGT‑CACATTAACA < 2:2489875/295‑1 GGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATCCTTTTAATGGACAC < 1:2099172/254‑1 GTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATCCTTTTAATGGACACTATAATGGG > 2:2014849/1‑262 GTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGAGGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATCCTTTTAATGGACACTATCATGGG < 1:2015450/262‑1 ggGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGAGGAGGTCGCCGCCGCTGCCGGAAGGGTGGGCTATGGGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATCCTTTTAATGGACACTATCAT < 2:1792595/246‑1 GAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATCCTTTTAATGGACACTATCAT > 1:1793123/1‑248 AGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACAGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGT > 1:80064/1‑210 GATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCCACTGGAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCTATGA > 1:1344927/1‑200 AAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCACCTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCACATGATAGTGTCCATCCTTTTAATGGACACTATCATGGGCCATGGCTCTGT‑CACATTAACAACTAAAGTGGCTGACCAGCCGGATGGA > 1:1363622/1‑279 GTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATCCTTTTAATGGACACTATCATGGGCAATGGCTCAGT‑CACATTAACAACTACAGTTGCTGACCAGCCGGAT < 1:1628233/190‑1 GTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATCCTTTTAATGGACACTATCATGGGCAATGGCTCAGT‑CACATTAACAACTACAGTTGCTGACCAGCCGGAT > 2:1627751/1‑190 TAGTGTCCATCCTTTTAATGGACACTATCATGGGCAATGGCTCTGT‑CACATTAACAACTACAGTTGCTGACCAGCCGGATGGATGATTTTTTTGCACCCAGAAGACGTTGCCTCCGATCCGGCTTACAACAAGTTACACCGTCACAACCGGGACGCGTAGCGCCAGCGCGCACATCAACTCATAGCCCACCGTTCCGGCAGCGGCGGCGACATCATCAATTTTGATCTCCTTGCCCCACAGCTCAACCGGCG < 1:1885657/252‑1 aggtaCCATCCTTATAATGGACACTATCATGGGCAATGGCT‑TGTACACATTACCAACTACCGTTTCTGACCAGCCGGATGGATGATTTTTTTGCCCCCAGAAGACGTTGCCTCCGATCCGGCTTACAACAAGTTACACCGTCACAACCGGGACGCGTAGCGCCAGCGCGCACATCAACTCATAGCCCACCGTTCCGGCAGCGGCGGCGACATCATCAATTTTGATCTCCTTGCCCCACAGCTCAACCGGCGTACCAATACCCGCCTGCGGGCAAGGCGTTAAATCGACCGCTAGCATATC < 2:1531098/295‑1 AGTGTCCATCCTTTTAATGGACACTATAATGGGCAATGGCTCTGT‑CACATTAACAACTACAGTTGCTGACCAGCCGGATGGATGATTTTTTTGCACCCAGAAGACGTTGCCTCCGATCCGGCATACAACAAGTTACACCGTCACAACCGGGACGCGTAGCGCCAGCGCGCACATCAACTCATAGCCCACCGTTCCGGCAGCGGCGGCGACATCATCAATTTTGATCTCCTTGCCCCACAGCTCAACCGGCGTACCAATACCCGCCTGCGGGCAAGGCGTTAAATCGACCGCTAGCATATC < 1:39100/300‑1 CCATCCTTTTAATGGACACTATCATGGGCAATGGCTCTGT‑CACATTAACAACTACAGTTGCTGACCAGCCGGATGGATGATTTTTTTGCACCCAGAAGACGTTGCCTCCGATCCGGCTTACAACAAGTTACACCGTCACAACCGGGACGCGTAGCGCCAGCGCGCACATCAACTCATAGCCCACCGTTCCGGCAGCGGCGGCGACATCATCAATTTTGATCTCCTTGCCCCACAGCTCAACCGGCGTACCAATACCCGCCTGCGGGCAAGGCGTTAAATCGACCGCTAGCATATCCATCG < 1:957934/300‑1 CCATCCTTTTAATGGACACTATCATGGGCAATGGCTCTGT‑CACATTAACAACTACAGTTGCTGACCAGCCGAATGGATGATTTTTTTGCACCCAGAAGACGTTGCCTCCGATCCGGCTTACAACAAGTTACACCGTCACAACCGGGACGCGTAGCGCCAGCGCGCACATCAACTCATAGCCCACCGTTCCGGCAGCGGCGGCGACATCATCAATTTTGATCTCCTTGCCCCACAGCTCAACCGGCGTACCAATACCCGCCTGCGGGCAAGGCGTTAAATCGACCGCTAGCATACTCATCG > 1:1774561/1‑300 CCAACCTTTTAATGGACACTAGCATGGGAAATGGCTCTGT‑CACATTAACAACTACAGGTGCTGCCCAGCCGGATGGATGATTTTTTTGCACCCAGAGGACGTTGCCTCCGATCCGGCTTACAACAAGTTACACCGTCACAACCGGGACGCGTAGCGCCAGCGCGCACATCAACTCATAGCCCACCGTTCCGGCAGCGGCGGCGACATCATCAATTTTGATCTCCTTGCCCCACAGCTCAACCGGCGTACCAATACCCGCCTGCGGGCAAGGCGTTAAATCGACCGCTAGCATATCCATCG < 2:801507/300‑1 CATCCTTTTAATGGACACTATCATGGGCAATGGCTCTGT‑CACATTAACAACTACAGTTGCTGACCAGCCGGATGGATGATTTTTTTGCACCCAGAAGACGTTGCCTCCGATCCGGCTTACAACAAGTTACACCGTCACAACCGGGACGCGTAGCGCCAGCGCGCACATCAACTCATAGCCCACCGTTCCGGCAGCGGCGGCGACATCATCAATTTTGATCTCCTTGCCCCACAGCTCAACCGGCGTACC > 1:1339159/1‑249 CATCCTTTTAATGGACACTATCATGGGCAATGGCTCTGT‑CACATTAACAACTACAGTTGCTGACCAGCCGGATGGATGATTTTTTTGCACCCAGAAGACGTTGCCTCCGATCCGGCTTACAACAAGTTACACCGTCACAACCGGGACGCGTAGCGCCAGCGCGCACATCAACTCATAGCCCACCGTTCCGGCAGCGGCGGCGACATCATCAATTTTGATCTCCTTGCCCCACAGCTCAACCGG < 1:1866063/243‑1 TCCTTTTAATGGACACTATCATGGGCAATGGCTCTGT‑CACATTAACAACTACAGTTGCTGACCAGCCGGATGGATGATTTTTTTGCACCCAGAAGACGTTGCCTCCGATCCGGCTTACAACAAGTTACACCGTCACAACCGGGACGCGTAGCGCCAGCGCGCACATCAACTCATAGCCCACCGTTCCGGCAGCGGCGGCGACATCCTCAATTTTGATCTCCTTGCCCCACAGCTCAACCGGCGTACCAATCCCCGCCTGCGGGCCAGGCGTTAAATCGACCGCTACCATACCCATCGAGAC > 1:2150257/1‑301 ACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1239755‑1240065 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atagtgtccatCCTTTTAATGGACACTATCATGGGCAATGGCTCTGT‑CACATTAACAACTACAGTTGCTGACCAGCCGGATGGATGATTTTTTTGCACCCAGAAGACGTTGCCTCCGATCCGGCTTACAACAAGTTACACCGTCACAACCGGGACGCGTAGCGCCAGCGCGCACATCAACTCATAGCCCACCGTTCCGGCAGCGGCGGCGACATCATCAATTTTGATCTCCTTGCCCCACAGCTCAACCGGCGTACCAATACCCGCCTGCGGGCAAGGCGTTAAATCGACCGCTAGCATATCCATCGAGAC < NC_000913/1240072‑1239773 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |