| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1240065 | 280 (1.050) | 10 (0.040) | 10/528 | 31.1 | 3.6% | intergenic (+116/+270) | dadX/cvrA | alanine racemase, catabolic, PLP‑binding/putative cation/proton antiporter |
| ? | NC_000913 | = 1240072 | 274 (1.070) | intergenic (+123/+263) | dadX/cvrA | alanine racemase, catabolic, PLP‑binding/putative cation/proton antiporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 283 total aligned reads displayed.
GTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATGGACACTATTTCCCCGGAACCTGAACTCACCGCACAGGCGTTCTACATAAAACGCTTACGCTTCATT‑GTTGACTCGAACTCGACTTCAGATAAATCACGCTTTACCCTTGATGGAGCCTGTACATAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATTCAACATCAAATGAAGGTTAAATTATGGACGACAAACAATTGCAGGCTCAGGCTGCGTTCAGCAAAGCATCGCAACCGGCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAA > NC_000913/1239773‑1240372 | gTCTCGATGGGTATGGTAGCGGTCGATTTAACGCCTGGCCCGCAGGCGGGGATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGAGGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGa < 1:2150257/301‑1 (MQ=255) cGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCCTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGGCAGCACCTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTTCCCATGCTAGTGTCCATTAAAAGGTTgg > 2:801507/1‑300 (MQ=255) cGATGAGTATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATTCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATgg < 1:1774561/300‑1 (MQ=255) ttgtgagcgtgagATGTAACGCCTAGCCGGCTGGCGGGTGTTGGGAGGCCGGTTGGGCGGTGGGGCAAGGAGATCAAAATGGGTGATGTAGCAGCCGCCGCCGGAACGGTGGGTTATGGGTTGATGTGCGCGATGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACGTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATGGACACTAtt < 1:564217/288‑1 (MQ=255) taaccctgtgccgcgcggCGGGTATTGGTAGCCCGGTTGGGGTGTGGGGCAAGGGGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGGGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATGGACACTATTTCCCCGGAACCTGAAc < 2:957669/284‑1 (MQ=255) gcGCCTTGCCAGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATGGACACTATTTCCCCGGAACCTGAACTCa < 1:591361/300‑1 (MQ=255) cGCCTTGCCCGCAGGGGGGGAGTGGTACGCCGGTTGAGCTGGGGGGCCAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGTGGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTATGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATGGACACTATTTCCCCGGAACCTGAACTCAc < 2:39098/301‑1 (MQ=255) ttGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCTGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCGACGAGTTGATGTTCGCGCTGCCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTTACTTGTTGTAAGCCGGGGTGGGGGCAACGTCTTCTGGGAGCAAAAAAATCATCCCTCCGGTTGGTCAGCACCTGTAGTTTCTAATGTGACAGAGACATTGCCCACGTTTAGGTCCATGTAAAGGATAGACCCTATTTCcgcgatcatcggcagggagacg > 2:187616/1‑283 (MQ=255) gCCCGCAGGCGTGTATTGGTACGCCGGTTGAGCGGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGGTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATGGACACTATTTCCCCGGAACCTGAACTCACCGcaca < 1:801718/301‑1 (MQ=255) gCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATTATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGCGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTTTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAAAGTCTTCTGGGGTCACAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGCCAGAGCCATTGCCCATGATATTGTCCATTACAAGTATGGCCCCTGTTTCTCCGGAACCTGACATCACCgagcc > 1:1183212/1‑297 (MQ=255) ggCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAACAATAATCCATCCGGCTGGTCCGCAACTGTAGTTGTTAAGGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATGGACACTATTTCCCCGGAACCTGAACTCCCCGCCCAGGCGttt > 1:500774/1‑300 (MQ=255) ggTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACGGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTTCCCATGATAGTGTCCATGAAAAGGATGGACACTATTTCCCCGGAACCTGAACTCACCGCACAGGCGGTCTAc > 2:2142347/1‑300 (MQ=255) tATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATGGACACTATTTCCCCGGAACCTGAACTAACCGCACCGGCGTTCTAcct > 2:1671444/1‑298 (MQ=255) ttGGTACGCCGGTTGGGCTGGGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCGGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATGGACACTATTTc < 2:781970/262‑1 (MQ=255) cGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATGGACACTa > 1:1885657/1‑252 (MQ=255) cGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATAATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTCGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTCGCCATGCTAATGTCCATGAAAAGGATGGGTACTATTTTCCCGGAACCTGACCTCACCGCACAGGGGTTCTACATCACacgctt > 1:478834/1‑301 (MQ=255) ccGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATg > 1:1866063/1‑243 (MQ=255) ggTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATGGACACTATTTCCCCGGAACCTGAACTCACCGCACAGGCGTTCTACATAAAacgcttacgc > 1:2368069/1‑301 (MQ=255) aGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTTCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATGTACACTATTTCACCGGAACCTGAACTCAACGCTCAGGCGTTCGAACTAAAACTCTTATGCTTCAt > 2:2101228/1‑301 (MQ=255) gtgGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATGGACACTATTTCTCCGGAACCTGAACTCAACGCACAGCCGGTCTACCTAAAagccttactctttcttgct > 2:1725086/1‑294 (MQ=255) gtgGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAAGCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGCTGGAAGCTATTTCCCCGGAACCTGAACTCACCGCACAGGAGTTCGACATAAAACGCTTAATCTTCAtt‑gtt > 1:2516127/1‑301 (MQ=255) ggggCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGTAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATGGACACTATTTCCCCGGAACCTGAACTCACCGCACAGGCGTTCTACATAAAACGCTTACGCTTCATT‑GTTGa < 1:418699/301‑1 (MQ=255) cAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATGGACACTATTTCCCCGGAACCTGAACTCACCGCACAGGCGTTCTACATAAAACGCTTAAGCTTCATT‑GTTTactcg > 1:1506221/1‑301 (MQ=255) aaaGGTGATAAAAATGGAGGAGGGCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTCTGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATAGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATGGACACTATTTCCCCGGAACCTGAACTCACCGCACAGGCGTTCTACATAAAACGCTTACGCTTCATT‑GTTGactcg < 1:1581017/300‑1 (MQ=255) aaGGAGATCAAAATTGATGCGGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATGGACACTATTTc < 2:904196/236‑1 (MQ=255) aaGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATGGACACTATTTCCCCGGAACCTGAACTCAc < 1:584371/254‑1 (MQ=255) aaGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATGGACACTATTTCCCCGGAACCTGAACTCACCGCACAGGCGTTCTACATAAAACGCTTACTCTTCATT‑GTTAactcg > 1:2501455/1‑300 (MQ=255) tCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATGGACACTATTTCCCCGGAACCTGAACTCACCGCACAGGCGTTCTACATAAAACGCTTACGCTTCAtt‑gttg > 1:856168/1‑288 (MQ=255) aatggatgtgggcgccgcgggTGCCGGAACGGGGGGGGTTGAGTTGATGTGCGCGGTGGCGCTACGGGTCCCTGTTGTGAAGGTGTAACGTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATGGACACTATTTCCCCGGAACCTGAACTCACCGCACAGGCGTTCTACATAAAACGCTTACGCTTCATT‑GTTGACTCGAACTCGACTTCa < 2:677223/289‑1 (MQ=255) gatgatGTCGCCGACGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGC‑AAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATGGACAATATTTACCCGGAACCTGAACTCACCGACCAGGTGTTCTACATAAAACGCTTACGCTTCCTT‑GTTGACTCGAACTCGACTTCAGATa > 2:832622/1‑300 (MQ=255) gtgTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATGGACACTATTTCCCCGGAACCTGAACTCACCGCACAGGCGTTCTACATAAAACGCTTACGCTTCATT‑GTTGACTCGAACTCGACTTCAGATAAATc < 1:1725608/300‑1 (MQ=255) atgCCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTAGGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATGGACACTATTTCCCCGGAACCTGAACTCACCGCACAGGCGTTCTACATAAAACGCTTACGCTTCATT‑GTTGACTCGAACTCGACTTCAGATAAATc < 1:386958/301‑1 (MQ=255) ggtcgagcccgcAGCCGGGACGGGGGGGTATTGGTGTGTGTCCGCGGTGGCTCTACGCTTCCCGGTGGTGACGGTGTAACTTGTTGTACGCCGGATCGGAGGCAAAGTCTTCTAGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATGGACACTATTTCCCCGGAACCTGAACTCACCGCACAGGCGTTCTACATAAAACGCTTACGCTTCATT‑GTTGACTCGAACTCGACTTCAGATAAATc < 2:1774067/292‑1 (MQ=255) cgccgccgcTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATGGACACTATTTCCCCGGAACCTGAACTCACCGCACAGGCGTTCTACATAAAACGCTTACGCTTCATT‑GTTGCCTCGAACTCGACTTCAGAAAAATCACGc > 2:555867/1‑301 (MQ=255) 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gATGGACATCATTTCCCCGTAACATGAACGCACCGCACAGGCGTACTACATAAAACTCTTACGCTTCATT‑GTTGACTATAACTCGACTTCAGATAAATCACTCTTTACCCTTGATGGAGCCTGTACATAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATTCAACATCAAATGAAGGTTAAATTATGGACGACAAACAATTGCAGGCTCAGGCTGCGTTCAGCAAAGCATCGCAACCGGCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCaa < 1:2319802/301‑1 (MQ=255) | GTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATGGACACTATTTCCCCGGAACCTGAACTCACCGCACAGGCGTTCTACATAAAACGCTTACGCTTCATT‑GTTGACTCGAACTCGACTTCAGATAAATCACGCTTTACCCTTGATGGAGCCTGTACATAGATTTGTGTAATTGCCTGATTTTGATATGTTCAATTCAACATCAAATGAAGGTTAAATTATGGACGACAAACAATTGCAGGCTCAGGCTGCGTTCAGCAAAGCATCGCAACCGGCGATAGATGCTTCATTAAATTTAAGATTCAGCTTCCTCTTCAGCCACCCGTACGCCAA > NC_000913/1239773‑1240372 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |