New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2757417 | 219 (1.280) | 6 (0.040) | 6/550 | 20.8 | 2.8% | intergenic (+17/+227) | intA/yfjH | CP4‑57 prophage; integrase/CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
? | NC_000913 | = 2757421 | 208 (1.260) | intergenic (+21/+223) | intA/yfjH | CP4‑57 prophage; integrase/CP4‑57 prophage; uncharacterized protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
Only 100 of 221 total aligned reads displayed.
GCAGCACTCAAGCGTGCTGGCTTAGGAGGTGTACTTGTTTCACACGGCTTGCGTTCTATCGCCAGTACGGCACTCAATGAGGAAGGATTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGC‑TTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTCGCGCTTATAACCGCAGTGATTATCTTGAGCAACGTCGTCCGATGATGCAATGGTGGGCTGATCTCGTAAAAGCAGCAGATAGTGGTAGCATCGTTTTAACTCATTTGAGCAAAATTCGTCTTGTCGGATAAAATATTTATCAGCCCAGCTCTCTGGGCTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGCCCTTTCAGAGGTAAGACATTAGGGCAATTTCACTGTATGACTGCGCAGTCATCGAGTCTGTGGGGTGTTGCTCCTTTTGCAACGTATCACTTGTCAATAAATAGAAAGTGTAGATGTATTAGGCGCAGCTATTTAGTCTATATGGCAAGTAGTAATTATTTACTTCTTTTTTTTCTACGAACAGCGCTATCGAAAGCTTGTTTTACATCTTCATTTTTTAAAGACCATT > NC_000913/2757125‑2757717 | gcagcaCTCAAGCGTGCTGTGTTAGGAGGTGTACTTTTTTCACACGGATTGCGTTCTATCGCCAGTACGGCACTCAATGAGGAAGGAGTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGC‑TTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTCGCGCTTATAACCGCAGTGATTATCTTGAGCAACGTCGTCCGATGATGCAATGGTGGGCCGATCTCGTAAAAGCAGCAGATAGTGGTAGCATCGTTTTAACTCATTTGAGCAAAATTCGTCTTGTCGGATAAAATATTTATCAGCCCAGCTCTCTgg < 2:1389977/301‑1 (MQ=255) ccagcaCTCCAGCGTGCTGGCTTAGGAGGTGTACTTGTTTCGCACGGCTTGCGTTCTATCGCCAGTTCGGCACGCAATGAGGAAGGATTTCCACCGGATGGCATTGAAGCAGCGC‑TTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTCGCGCTTATCACCGCAGTGATTATCTTGAGCAACGTCGTCCGATGATGCAATGGTGGGCTGATCTCGTAAAAGCAGCAGATAGTGGTAGCATCGTTTTAACTCATTTGAGCAAAATTCGTCTTGTCGGATAAAATATTTATCAGCCCAGCTCTCTgg < 2:447744/300‑1 (MQ=255) cagcaCTCAAGCGTGCTGGCTTAGGAGGTGTACTTGTTTCACACGGCTTGCGTTCTATCGCCAGTACGGCACTCAATGAGGAAGGATTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGC‑TTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTCGCGCTTATAACCGCAGTGATTATCTTGAGCAACGTCGTCCGATGATGCAATGGTGGGCTGATCTCGTAAAAGCAGCAGATAGTGGTAGCATCGTTTTAACTCATTTGGGCAAAATTCGTCTTGTCGGATAAAATATTTATAAGCCAAg > 1:1379457/1‑292 (MQ=255) gCGTGCTGGCTTAGGAGGTGTACTTGTTTCACACGGCTTGCGTTCTATCGCCAGTACGGCACTCAATGAGGAAGGATTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGC‑TTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTCGCGCTTATAACCGCAGTGATTATCTTGAGCAACGTCGTCCGATGATGCAATGGTGGGCTGATCTCGTAAAAGCAGCAGATAGTGGTAGCATCGTTTTAAACCATTTGAGCAAAATTCGTCTTGTCGGATAAAATATTTATCAGCCCAGCTCTCTGGGCTGATAtttt > 1:1473848/1‑300 (MQ=255) tGCTGTCTTAGGGTGTGTCCTTGTTTCACACGGCTTGCGTTGTCTCGCCAGTACGGCACTCAATGAGGAAGGATTTCCACCTGATCTCATTGAAGCAGCGC‑TTGCTCATGTATACAAAAATGAGGTGCGTCGCTCTTATAACCGCAGTGATTATCTTGAGCAACGTCGTCCGATGATGCAATGGTGGGCTGATCTCGTAAAAGCAGCAGATAGTGGTAGCATCGTTTTAACTCATTTGAGCAAAATTCGTCTTGTCGGATAAAATATTTATCAGCCCAGCTCTCTGGGCTGATATTTc < 2:1493080/298‑1 (MQ=255) ggCTTAGGAGGTGTACTTGTTTCACACGGCTTGCGTTCTATCGCCAGTACGGCACTCAATGAGGAAGGATTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGC‑TTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTCGCGCTTATAACCGCAGTGATTATCTTGAGCAACGTCGTCCGATGATGCAATGGTGGGCTGATCTCGTAAAAGCAGCAGATAGTGGTAGCATCGTTTTAACTCATTTGAGCAAAATTCGTCTTGTCGGATAAAATATTTATCAGCCCAGCTCTCTGGGCTGATATTTCTAAAAg < 1:1251221/300‑1 (MQ=255) ttaagcggtttccTTGTTTCACACGGTTTGCTGTCTATCGCCAGTACGGCACTCAATGAGGAAGGATTTCCACCTGATGTACTTGAAGCAGCGC‑TTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTCGCGCTTATAACCGCAGTGATTATCTTGAGCAACGTCGTCCGATGATGCAATGGTGGGCTGATCTCGTAAAAGCAGCAGATAGTGGTAGCATCGTTTTAACTCATTTGAGCAAAATTCGTCTTGTCGGATAAAATATTTATCAGCCCAGCTCTCTGGGCTGATATTTCTAAAAGATc < 2:793994/288‑1 (MQ=255) aggcggTTTACTTGTTTCACCCGGCTTGCGTTCTAACGCCAGTACGGGACTCAATTAGGAAGGATTTACACCTGATGTCAGTGAAGCAGCGC‑TTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTCGCGCTTATAACCGCAGTGATTATCTTGAGCAACGTCGTCCGATGATGCAATGGTGGGCTGATCTCGTAAAAGCAGCAGATAGTGGTAGCATCGTTTTAACTCATTTGAGCAAAATTCGTCTTGTCGGATAAAATATTTATCAGCCCAGCTCTCTGGGCTGATATTTCTAAAAGATCGc < 2:28493/300‑1 (MQ=255) gaggTGTACTTGTTTCACACGGCTTGCGTTCTATCGCCAGTACGGCACTCAATGAGGAAGGATTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGC‑TTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTCGCGCTTATAACCGCAGTGATTATCTTGAGCAACGTCGTCCGATGATGCAATGGTGGGCTGATCTCGTAAAAGCAGCAGATAGTGGTAGCATCGTTTTAACTCATTTGAGCAAAATTCGTCTTGTCGGATAAAATATTTATCAGCCCAGctct < 1:1180831/272‑1 (MQ=255) gaggTGTACTTGTTTCACACGGCTTGCGTTCTATCGCCAGTACGGCACTCAATGAGGAAGGATTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGC‑TTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTCGCGCTTATAACCGCAGTGATTATCTTGAGCAACGTCGTCCGATGATGCAATGGTGGGCTGATCTCGTAAAAGCAGCAGATAGTGGTAGCATCGTTTTAACTCATTTGAGCAAAATTCGTCTTGTCGGATAAAATATTTATCAGCACAGctct > 2:1180515/1‑272 (MQ=255) tgtACTTGTTTCACACGGCTTGCGTTCTATCGCCAGTACGGCACTCAATGAGGAAGGATTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGC‑TTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTCGCGCTTATAACCGCAGTGATTATCTTGAGCAACGACGTCCGATGCGGCAATGGTGGGCTGATCTCGTAAAAGCTGCAGATAGTGGTAGAATCGTTTTAACTTATTTGAGCAAAATACGTCTTGTCGGATAAAATATTAATCAGCCCAGCTCTCTGGGCTGATATTTCTAAACGATCGAACTaac > 2:1516512/1‑299 (MQ=255) cacaCGGCTTGCGTTCTATCGCCAGTACGGCACTCAATGAGGAAGGATTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGC‑TTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTCGCGCTTATAACCGCAGTGATTATCTTGAGCAACGTCGTCCGATGTTGCAATGGTGGGCTGTTCTCGTAAAAGCAGCAGATAGTGATAGCATTGTTTTAACTCATTTGAGCCAAATTCGTCTTGTCGGATAAAATATTTATCAGCCCATTTCTTTGGGTTGATATTTCTTAAAGAACGCACTAAATAGCTAAGCgg > 2:355984/1‑300 (MQ=255) tgtgTTCAATCGCCAGTACGGCAATTTGTGAGGAAGGATGTCCACCTGATGTCTTTGAAGCAGCGC‑GTGGTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTTGCGCTTATAACCGCAGTGATTATCTTGAGCAACGTCGTCCGATGATGCAATGGTGGGCTGATCTCGTAACAGCAGCAGATAGTGGTAGCATCGTTTTAACTCATTTGAGCAAAATTCGTCTTGTCGGATAAAATATTTATCAGCCCAGCTCTCTGGGCTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGc < 1:1161145/296‑1 (MQ=255) cGTTCTATCGCCAGTACGGCACTCAATGAGGAAGGATTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGC‑TTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTCGCGCTTATAACCGCAGTGATTATCTTGAGCAACGTCGTCCGATGATGCAATGGTGGGCTGATCTCGTAAAAGCAGCAGATAGTGGTTGCATCGTTTTAACTCATTTGAGCAAAACTCGTCTTGTCGGATAAAATATTTATCAGCCCAGCTCTCTGGGCTGATATTTCTTAATGATTGCACTAAATAgtacagatgaatagtgttctt > 2:218834/1‑281 (MQ=255) tCTATCGCCAGTACGTCACTCAATGAGGAAGGATTTCCACCTGATGTCATTGAAGCATCGC‑TTGCTCATGTAGACAAAAATGAGTTGCGTCGCGCTTATAACCGCAGTGATTATCTTGAGCAACGTCGTCCGATGATGCAATGGTGGGCTGATCTCGTAAAAGCAGCAGATAGTGGTAGCATCGTTTTAACTCATTTGAGCAAAATTCGTCTTGTCGGATAAAATATTTATCAGCCCAGCTCTCTGGGCTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACt < 1:79083/300‑1 (MQ=255) cccgccgcccttccgagctggaaggaTTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGC‑TTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCTTCGCGCTTATAACCGCAGTGATTATCTTGAGCAACGTCGTCCGATGATGCAATGGTGGGCTGATCTCGTAAAAGCAGCAGATAGTGGTAGCATCGTTTTAACTCATTTGAGCAAAATTCGTCTTGTCGGATAAAATATTTATCAGCCCAGCTCTCTGGGCTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTa < 2:1511204/282‑1 (MQ=255) cAGTACGGCACTCAATGAGGAAGGATTTCCACCTGATGGCATTGAAGCAGCGC‑GTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTCGCGCTTATAACCGCAGTGATTATCTTGAGCAACGTCGTCCGATGATGCAATGGTGGGCTGATCTCGTAAAAGCAGCAGATAGTGGTAGCATCGTTTTAACTCATTTGAGCAAAATTCGTCTTGTCGGATAAAATATTTATCAGCCCAGCTCTCTGGGCTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAg < 1:636054/301‑1 (MQ=255) cGGCACTCAATGAGGAAGGATTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGC‑TTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTCGCGCTTATAACCGCAGTGATTATCTTGAGCAACGTCGTCCGATGATGCAATGGTGGGCTGATCTCGTAAAAGCAGCAGATAGTGGTAGCATCGTTTTAACTCATTTGAGCAAAATTCGTCTTGTCGGATAAAATATTTATCAGCCCAGCTCTCTGGGCTGATATTTCTAAAAGATCGCACTACATAGCTACGCGGAATAGGGCTCTACTTTCGTTTTGCCCtt > 1:292873/1‑301 (MQ=255) ggaaggaTTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGC‑TTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTCGCGCTTATAACCGCAGTGATTATCTTGAGCAACGTCGTCCGATGATGCAATGGTGGGCTGATCTCGTAAAAGCAGCAGATAGTGGTAGCATCGTTTTAACTCATTTGAGCAAAATTCGTCTTGTCGGATAAAATATTTATCAGCCCAGCTCTCTGGGCTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGa < 1:53370/261‑1 (MQ=255) aaggaTTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGC‑TTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTCGCGCTTATAACCGCAGTGATTATCTTGAGCAACGTCGTCCGATGATGCAATGGTGGGCTGATCTCGTAAAAGCAGCAGATAGTGGTAGCATCGTTTTAACTCATTTGAGCAAAATTCGTCTTGTCGGATAAAATATTTATCAGCCCAGCTCTCTGGGCTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGTCCTTTAAGAGGTAAGACAt > 1:1021556/1‑301 (MQ=255) aaggaTTTCCACCTGATATCATTGAAGCAGCGC‑TTGCTCATTGAGACAAAAATGATGTGCGTCGCGCTTATAACCGCAGTGATTATCTTGAGCAACGCCGTCCGATGATGCAATGGTGGGCTGATCTCGTAAAAGCAGCAGATAGTGGTAGCATCGTTTTAACTCATTTGAGCAAAATTCGTCTTGTCGGATAAAATATTTATCAGCCCAGCTCTCTGGGCTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGCCCTTTCAGAGGTAAGACAt < 1:164038/301‑1 (MQ=255) aTTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGC‑TTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTCGCGCTTATAACCGCAGTGATTATCTTGAGCAACGTCGTCCGATGATGCAATGGTGGGCTGATCTCGTAAAAGCAGCAGATAGTGGTAGCATCGTTTTAACTCATTTGAGCAAAATTCGTCTTGTCGGATAAAATATTTATCAGCCCAGCTCTCTGGGCTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGCCCTTTCAGAGGTAAGACATTAgg > 1:1020018/1‑301 (MQ=255) ccACCTGATGTCATTGAAGCAGCGC‑TTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTCGCGCTTATAACCGCAGTGATTATCTTGAGCAACGTCGTCCGATGATGCAATGGTGGGCTGATCTCGTAAAAGCAGCAGATAGTGGTAGCATCGTTTTAACTCATTTGAGCAAAATTCGTCTTGTCGGATAAAATATTTATCAGCCCAGCTCTCTGGGCTTATATTTCTTAAAGATCTCCATCAATATATACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGCCTTTTCTGAGTTAAGACATTAGGGCa > 2:1373765/1‑300 (MQ=255) cccTTATGTCATTGAAACAGCGC‑TGTCTCATTTAGACAAAAATGAGGTGGGTCGCGCTTATAACCGCAGTGATTATCTTGAGCAACGTCGTCCGATGATGCAATGGTGGGCTGATCTCGTAAAAGCAGCAGATAGTGGTAGCATCGTTTTAACTCATTTGAGCAAAATTCGTCTTGTCGGATAAAATATTTATCAGCCCAGCTCTCTGGGCTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGCCCTTTCAGAGGTAAGACATTAGGGCAAtt < 2:1019745/300‑1 (MQ=255) ccTGAGGTCATTGAAGCAGCGC‑TTGCTCCTGTAGACTAAAATGATGGGCGTCGCGCTTATAACCGCAGTGATTATCTTGAGCAACGACGTCCGATGATGCAATGGTGGGCTGATCTCGTAAAAGCAGCAGATAGTGGTAGCATCGTTTTAACTCATTTGAGCAAAATTCGTCTTGTCGGATAAAATATTTATCAGCCCAGCTCTCTGGGCTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGCCCTTTCAGAGGTAAGACATTAGGGCAAttt < 2:272392/301‑1 (MQ=255) 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cagcGC‑TTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTCGCGCTTATAACCGCAGTGATTATCTTGAGCAACGTCGTCCGATGATGCAATGGTGGGCTGATCTCGTAAAAGCAGCAGATAGTGGTAGCATCGTTTTAACTCATTTGAGCAAAATTCGTCTTGTCGGATAAAATATTTATCAGCCCAGCTCTCTGGGCTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGCCCTTTCAGAGGTAAGACATTAGGGCAATTTCACTGTATGACTgcgc > 1:694279/1‑301 (MQ=255) agcGC‑TTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTCGCGCTTATAACCGCAGTGATTATCTTGAGCAACGTCGTCCGATGATGCAATGGTGGGCTGATCTCGTAAAAGCAGCAGATAGTGGTAGCATCGTTTTAACTCATTTGAGCAAAATTCGTCTTGTCGGATAAAATATTTATCAGCCCAGCTCTCTGGGCTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGCCCTTTCAGAGGTAAGAAATTAGGGCAATTTCACTTTATGACTgcgc > 2:1441586/1‑300 (MQ=255) gcgc‑TTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTTCGTCGCGCTTATAACCGCAGTGATTATCTTGAGCAACGTCGTCCGATGATGCAATGGTGGGCTGATCTCGTAAAAGCAGCAGATAGTGGTAGCATCGTTTTAACTCATTTGAGCAAAATTCGTCTTGTCGGATAAAATATTTATCAGCCCAGCTCTCTGGGCTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGCCCTTTCAGAGGTAAGACATTAGGGCAATTTCACTGTATGACTGCGCAg < 1:863591/301‑1 (MQ=255) gcgc‑TTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTCGCGCTTATAACCGCAGTGATTATCTTGAGCAACGTCGTCCGATGATGCAATGGTGGGCTGATCTCGTAAAAGCAGCAGCTAGTGGTAGCATCGTTTTAACTCATTTGAGCAAAATTCGTCTTGTCGGATAAAATATTTATCAGCCCAGCTCTCTGGGCTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGCCCTTTCAGATGTaa > 1:562348/1‑267 (MQ=255) gcgc‑TTGCTCAGGTAGACCAAAATGAGGTGCGTCGCGCTTATAACCGCAGTGATTATCTTGAGCAACGTCGTCCGATGATGCAATGGTGGGCTGATCTCGTAAAAGCAGCAGATAGTGGTAGCATCGTTTTAACTCATTTGAGCAAAATTCGTCTTGTCGGATAAAATATTTATCAGCCCAGCTCTCTGGGCTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGCCCTTTCAGAGGTAAGACATTAGGGCAATTTCACTGTATGACTGCGCAg < 1:886482/301‑1 (MQ=255) ttGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTCGCGCTTATAACCGCAGTGATTATCTTGAGCAACGTCGTCCGATGATGCAATGGTGGGCTGATCTCGTAAAAGCAGCAGATAGTGGTAGCATCGTTTTAACTCATTTGAGCAAAATTCGTCTTGTCGGATAAAATATTTATCAGCCCAGCTCTCTGGGCTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATATTGCTCTACTTTCGTTTAGCCCTTTCAGAGGTAAGACCTTAGGGCAATTTCACTTTATGACTGCGCAGTCAt > 2:631873/1‑301 (MQ=255) 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aaatTTATAAGCCCAGAGCTTTGGGCTTATAATTCTAAAAGATCGCCCTAAATAGCTACGAGGAATAGTTATCGACTTTCGTTTTGCCCTTTCAGAGGTAAGACATTAGGGCAATTTCACTGTATGACTGCGCAGTCATCGAGTCTGTGGGGTGTTGCTCCTTTTGCAACGTATCACTTGTCAATAAATAGAAAGTGTAGATGTATTAGGCGCAGCTATTTAGTCTATATGGCAAGTAGTAATTATTTACTTCTTTTTTTTCTACGAACAGCGCTATCGAAAGCTTGTTTTACATCTTCAt < 1:1326266/299‑1 (MQ=255) aTCAGCCCAGCTCTCTGGGCTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGCCCTTTCAGAGGTAAGACATTAGGGCAATTTCACTGTATGACTGCGCAGTCATCGAGTCTGTGGGGTGTTGCTCCTTTTGCAACGTATCACTTGTCAATAAATAGAAAGTGTAGATGTATTAGGCGCAGCTATTTAGTCTATATGGCAAGTAGTAATTATTTACTTCTTTTTTTTCTACGAACAGCGCTATCGAAAGCTTGTTTTACATCTTCAttttttt > 1:1553683/1‑300 (MQ=255) gCCCAGCTCTCTGGGCTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGCCCTTTCAGAGGTAAGACATTAGGGCAATTTCACTGTATGACTGCGCAGTCATCGAGTCTGTGGGGTGTTGCTCCTTTTGCAACGTATCACTTGTCAATAAATAGAAAGTGTAGATGTATTAGGCGCAGCTATTTAGTCTATATGGCAAGTAGTAATTATTTACTTCTTTTTTTTCTACGAACAGCGCTATCGAAAGCTTGTTTTa < 1:838690/282‑1 (MQ=255) | GCAGCACTCAAGCGTGCTGGCTTAGGAGGTGTACTTGTTTCACACGGCTTGCGTTCTATCGCCAGTACGGCACTCAATGAGGAAGGATTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGC‑TTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTCGCGCTTATAACCGCAGTGATTATCTTGAGCAACGTCGTCCGATGATGCAATGGTGGGCTGATCTCGTAAAAGCAGCAGATAGTGGTAGCATCGTTTTAACTCATTTGAGCAAAATTCGTCTTGTCGGATAAAATATTTATCAGCCCAGCTCTCTGGGCTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGCCCTTTCAGAGGTAAGACATTAGGGCAATTTCACTGTATGACTGCGCAGTCATCGAGTCTGTGGGGTGTTGCTCCTTTTGCAACGTATCACTTGTCAATAAATAGAAAGTGTAGATGTATTAGGCGCAGCTATTTAGTCTATATGGCAAGTAGTAATTATTTACTTCTTTTTTTTCTACGAACAGCGCTATCGAAAGCTTGTTTTACATCTTCATTTTTTAAAGACCATT > NC_000913/2757125‑2757717 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |