| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 998447 | 250 (1.140) | 8 (0.040) | 7/560 | 27.0 | 3.2% | intergenic (+40/‑43) | elfA/elfD | laminin‑binding fimbrin subunit/putative periplasmic pilin chaperone |
| ? | NC_000913 | = 998451 | 246 (1.160) | intergenic (+44/‑39) | elfA/elfD | laminin‑binding fimbrin subunit/putative periplasmic pilin chaperone | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 257 total aligned reads displayed.
CCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGT‑GTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAG‑CTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGATTGGACTTGCAGCAACAC‑GTCTTGTTTATTCAGA‑AGGTGAAGAGCAAATTTCACTGGGTGTACGTAACACCAGTCCGGATGTTCCTTATCTTATTCAGTCATGGGTGATGACCCCAGATAATAAAAAATCAGCAGACTTTATTATTACACCACCGCTATTTGTGCTG > NC_000913/998151‑998750 | ccTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGT‑Gtt > 2:765800/1‑301 (MQ=255) aaaggCACTGCGGATACTACTCAGAGTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGT‑GTTCTGGa < 2:476069/298‑1 (MQ=255) tGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACTGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTCTTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTTCTGT‑TTTCTTGAgg > 1:494214/1‑301 (MQ=255) gCGGATACTACTCAGATGACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGGTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGT‑GTTCTGGAGGGGata < 2:875567/299‑1 (MQ=255) cctCAGATTAAAACGTTTGCTAACCAGGCCTCACCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTTAAAATGTATATAAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACAGTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGT‑GTTCTGGAGGGGATATTCATAttttt < 1:856350/300‑1 (MQ=255) actCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACACTTCAAGT‑GTTCTGGAGGGTATATTCATtttttt > 1:936394/1‑301 (MQ=255) aagcAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTAATCTGATGCTACTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGT‑GTTCTGGAGGGGATATTCATAttt < 1:765607/296‑1 (MQ=255) ctCAGATTTCAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAAAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGT‑GTTCTGGAGGGGATATTCAtttttttt > 1:77385/1‑301 (MQ=255) ctCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTAATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGT‑GTTCGGGAGGGGATATTCATAtttttt > 2:1161115/1‑301 (MQ=255) cAGATTACAGTGTTTGCTAACCAGGCCTCAGCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATGAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGT‑GTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTa < 2:196330/300‑1 (MQ=255) aTTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTCCGGGGACAGAGACTACAGGTAATGTGAATGCGGTACCAAATTTCCATATTACCTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTAATTAATTTGTACCTCTCTGGTAGTTC‑GGAGGGAAAATTCATATTTTTTAagtt > 1:1929378/1‑299 (MQ=255) gTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGT‑GTTCTGGAGGGGTTATTCATATTTTTTAAGTGTGACTAtt > 2:1467559/1‑301 (MQ=255) gTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGT‑GTTCTGGAGGGGATATTCATTTTTTTTAAGAGTGACTAtt > 1:1186747/1‑301 (MQ=255) ttGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACCACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGTACATTTTGTTGCAGGGTAGATAACAGAGGTTGACTTGGAAAGTTGATTATTTCGCTTCGGGGAAAGCGGCTTCAGGTAATTTTAATGCAGCAACAGATTTCCATATTAACTATTATAAATTGCACTAATTAATTGTTGTATTAATTTGTACCATACTATT‑GTTCTGGAGGGTGGTCTGATTTTTTTTAAGATTAACTAtttt > 1:527449/1‑300 (MQ=255) gCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGT‑GTTCTGGAGGGGATCTTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTg > 2:785507/1‑300 (MQ=255) ctgctACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGCGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCATACAGT‑GTTCTgg > 1:1760049/1‑242 (MQ=255) aCAAACGTGGACCTGCAAAATGATATGAATGAATGTACAACGGCCATCAAGGCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGT‑GTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATtg < 1:1643509/299‑1 (MQ=255) aacggtgCCCTGCAAAGGTATATGAAGGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGT‑GTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGAcc < 2:973879/295‑1 (MQ=255) cGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCAAGT‑GTTCTGGAGGGGGTTTTCATATTTTTTAGTAGTGACTATTTATGAAAACTTTCATAACAAAGGAAAtttttactgt > 1:1682708/1‑293 (MQ=255) gTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGT‑GTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTa < 2:405829/301‑1 (MQ=255) gCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGT‑GTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGc > 2:1703451/1‑274 (MQ=255) gcaagattataTGAATGATGGTACAACCGCCATCAAGCAAGACAAAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGTTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGT‑GTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAAc < 1:99024/294‑1 (MQ=255) cAAACGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCTAGACACAGAAACCGGGACCATTTTGTTGCAGGATGGCGCTCCGACGTTGACTTTTCATGTTGATTATATCTCTACGGGGAAAGCGACTTCAGCAAACGTGAATGCGGTAACTATTTCCAATATTACCTATTATTAATAGATATCATTAATTGTTTTCTTAATTAGTACACTTTCAGA‑GTTTCGAAGGGGATCTTCATATTTTTTAAGAGTGACTCTTTATGAAAACTTGTATAACAACGGCACTTGAGACCGTAAGTATAACg > 1:155827/1‑301 (MQ=255) aaTGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGT‑GTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTTTGACCGTAAGTTTAACgtc > 2:1361257/1‑299 (MQ=255) ggaaatgaatgaTGGTACATCGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGAGAACATTTTGTGTCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGT‑GTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCaa < 2:571307/296‑1 (MQ=255) tatGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAAAGGGGAACATGTTGTTGCAGGAGGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGTTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGT‑GTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTTACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTAACGTAAATTTTAATGTCAATAtt > 1:963112/1‑301 (MQ=255) tgaatgaTGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCTGGAACATTTTGTTGTAGTATGGAGAGCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGT‑GTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATg < 2:509352/249‑1 (MQ=255) tgaatgaTGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGT‑GTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTa > 2:650837/1‑300 (MQ=255) gaatgaTGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGT‑GTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACACAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGATATATTACt > 2:932741/1‑301 (MQ=255) atgaagGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGGGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGT‑GTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCa < 1:1704610/301‑1 (MQ=255) tgatgGGACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGT‑GTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACaaa < 2:673251/262‑1 (MQ=255) atgGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGT‑GTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGc < 1:426312/287‑1 (MQ=255) atgGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGT‑GTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAAAGGAAATATTaactagct > 1:1407814/1‑294 (MQ=255) atgGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACACCTCCAGT‑GTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTTTGACCGTAGGTTTAACGGCAATATTACTCAg‑ct > 1:253048/1‑301 (MQ=255) 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(MQ=255) aattaGTACCCCTCCAGT‑GTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAG‑CTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGATTGGACTTGCAGCAACAC‑GTCTTGTTTATTCAGA‑AGGTGAAGAGAAAATTTCACTGGGGGTACGTAACACCAGTCCGGATGTTCCTTATCTTATTCAGTCATGGGTGATGACCCCAGATAATAAAAAATCAGCAGACTTTATTATTac > 1:642868/1‑301 (MQ=255) aattaGTACCCCTCCAGT‑GTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAG‑CTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGATTGGACTTGCAGCAAAAC‑GTCTTGTTTATTCAGA‑AGGTGAAGAGCAAATTTCACGGGGTGTAAGTAACACCAGTCCGGATGTTCCTTAACTTATTCAGTCATGGGTGATGACCCCAGat > 2:635760/1‑272 (MQ=255) ccccTCCAGT‑GTTTTGGATGGGATATTCATATTTTTTAAGAATGACTATTTATTAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAG‑CTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGATTGGACTTGCAGCAACGC‑GTCTTGTTTATCCAGA‑AGGTGAAGAGCAAATTTCACTGGGTGTACGTAACACCAGTCCGGATGTTCCTTATCTTATTCAGTCATGGGTGATGACCCCAGATAATAAAAAATCAGCAGACTTTATTATTACACCACCGc < 2:240808/301‑1 (MQ=255) ccccTCCAGT‑GTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAG‑CTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGATTGGACTTGCAGCAACAC‑GTCTTGTTTATTCAGA‑AGGTGAAGAGCAAATTTCACTGGGTGTACGTAACACCAGTCCGGCTGTTCCTTATCTTATTCAGTCATGGGTGATGACCCCAGATAATAAAAAATCAGCAGATTTTATTATTACACCACCGc > 2:140577/1‑301 (MQ=255) tCCAGT‑GTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAG‑CTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGATTGGACTTGCAGCAACAC‑GTCTTGTTTATTCAGA‑AGGAGAATAGCAAAATTCACTGGGTGTACGTAACACTAGTCCGGATGTTCCTTATCTTATTCAGTCATGGGTGATAACCCCAGCTAATAAAAAATCAGCCGACTTTATTATTACACCACCGATAtt > 2:1787517/1‑301 (MQ=255) gt‑gtTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAG‑CTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGATTGGACTTGCAGCAACAC‑GTCTTGTTTATTCAGA‑AGGTGAAGAGCAAATTTCACTGGGTGTACGTAACACCAGTCCGGATGTTCCTTATCTTATTCAGTCATGGGTGATGACCCCAGATAATAAAAAATCAGCAGACTTTATTATTACCCCACCGCTATTtgtg > 2:790179/1‑301 (MQ=255) gtTCTGGAGGGGATATTCAAATTTTTTAAGAGTGATTATTTATGAAAACGTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCTTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAG‑CTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGATTGGACTTGCAGCAACAC‑GTCTTGTTTATTCAGA‑AGGTGAAGAGCAAATTTCACTGGGTGTACGTAACACCAGTCCGGATGTTCCTTATCTTATTCAGTCATGGGTGATGACCCCAGATAATAAAAAATCAGCAGACTTTATTATTACACCACCGCTATTTGTGc < 1:104205/300‑1 (MQ=255) tCTGGAGGGTAGATTCATATTTTTTAAGAGTGACTAATTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAG‑CTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGATTGGACTTGCAGCAACAC‑GTCTTGTTTATTCAGA‑AGGTGAAGAGCAAATTTCACTGGGTGTACGTAACACCAGTCCGGATGTTCCTTATCTTATTCAGTCATGGGTGATGACCCCAGATAATAAAAAATCAGCAGACTTTATTATTACACCACCGCTATTTGTGCTg < 1:789972/300‑1 (MQ=255) | CCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGT‑GTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAG‑CTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGATTGGACTTGCAGCAACAC‑GTCTTGTTTATTCAGA‑AGGTGAAGAGCAAATTTCACTGGGTGTACGTAACACCAGTCCGGATGTTCCTTATCTTATTCAGTCATGGGTGATGACCCCAGATAATAAAAAATCAGCAGACTTTATTATTACACCACCGCTATTTGTGCTG > NC_000913/998151‑998750 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |