| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3915783 | 183 (1.200) | 3 (0.020) | 3/520 | NT | 1.7% | coding (190/420 nt) | atpC | F1 sector of membrane‑bound ATP synthase, epsilon subunit |
| ? | NC_000913 | 3915788 = | 169 (1.130) | coding (185/420 nt) | atpC | F1 sector of membrane‑bound ATP synthase, epsilon subunit | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 215 total aligned reads displayed.
ACGGGTCACACGCGCAAAAAA‑AAGCCAGCCTGTTTCCAGACTGGCTTTTGTGCTTTTCAAGCCGGTGTTACATCGCTTTTTTGGTCAACTCGATAACGCGCAGCTGCGCGATCGCTTTGGCCAGTTCCGCAGACGCCTGAGCGTAATCTACGTCGCCGTGAGAGCTGCTAATGTGCTCTTCAGCCTTACGTTTCGCTTCCATGGCTCGCGCTTCGTCGAGATCCTGGCCGCGAATTGCGGTGTCGGCCAGAACGGTCACGTTGCCAGGCTGCACTTCAAGAATGCCGCCAGACAGATAGATAAACTCTTCGTGACCGTGCTGTTTCACGATGCGAATCATACCAGGCTTAATGGCGGTGAGCAGCGGTGCGTGGCCAGGGTAGATCCCCAGTTCACCTTCGCTACCCGTTACCTGGATTTTCTCGACCAGACCAGAGAACATTTGTTGCTCTGCGCTGACGACGTCCAGGTGGTAAGTCATTGCCATATCACCCTCCGATTAAGGCGTTAAAGTTTTTTGGCTTTTTCCACAGCTTCTTCGATGGAACCGACCATGTAGAACGCCTGCTCCGGCAGGTGATCGTATTCGCCTTCCAT > NC_000913/3915486‑3916082 | tcGGGTCAACCGTGCAAAAAA‑AAGCCATCCGGGTTCCAGACTGGCTTTTGTGCTTTTCAAGCCGGTGTTACTTCGCTTTTTTGGTCAACTCGATACCGCTCAGCTGCGCGCTCGCTTTGGCCAGGTCCGCAGACGCCTGAGCGTAATCTACGGCGCCGTGAGAGCTGCTAATGTGCGCTTCAGCCTTACGTTTCGCTTCCATGGCTCGCGCTTCGTCGAGATCCTGGCCGCGAATTGCGGTGTCGGCCAGAACGGTCACGTTGCCAGGCTGCACTTCAAGAATGCCGCCAGACagatagat < 2:1331198/300‑1 (MQ=255) cggttaaaaggagcAAAAAA‑AAGCTAGCATGGTTCCGGACTGGTTTTTTGGCTTTTCAGGCCGGGGTTACATTGCTTTTTTTGTCAACTCGATAACCCGCAGCTGCGCGATCGCTTTGGCCAGTTCCGCAGACGCCTGAGCGTAATCTACGTCGCCGTGAGAGCTGCTAATGTGCTCTTCAGCCTTACGTTTCGCTTCCATGGCTCGCGCTTCGTCGAGATCCTGGCCGCGAATTGCGGTGTCGGCCAGAACGGTCACGTTGCCAGGCTGCACTTCAAGAATGCCGCCAGACagatagat < 1:1531329/288‑1 (MQ=255) gggTCACAAGCGCAAAAAACAAGCCAGGCTGTTTCCAGACGGGCTTTTGTGCTTTTCAAGCCGGTGTTACATCGCTTTTTTGGTCAACTCGATAACGCGCAGCTGCGCGATCGCTTTGGCCAGTTCCGCAGACGCCTTAGCGTAATCTACGTCGCCGTGAGAGCTGCTAATGTGCTCTTCAGCCTTACGTTTCGCTTCCATGGCTCGCGCTTCGTCGAGATCCTGGCCGCGAATTGCGGTGTCGGCCAGAACGGTCACTTTGCCAGGCTGCACTTCAAGAATTCCGCCAGACagatagat < 2:672046/300‑1 (MQ=255) ttCACACGCGCAAAAAA‑AAGCCCGCCTGTTTCCAGACTGGCTTTTGTGCTTTTCAAGCCGGTGTTACATCGCTTTTTTGGTCAACTCGATAACGCGCAGCTGCGCGATCGCTTTGGCCAGTTCCGCAGACGCCTGAGCGTAATCTACGTCGCCGTGAGAGCTGCTAATGTGCTCTTCAGCCTTACGTTTCGCTTCCATGGCTCGCGCTTCGTCGAGATCCTGGCCGCGAATTGCGGTGTCGGCCAGAACGGTCACGTTGCCAGGCTGCACTTCAAGAATGCCGCCAGACAGATAGATAAAc < 2:533598/300‑1 (MQ=255) taaaacgcagcaaaaa‑aaGCCAGCTGGGTTCCGGACGGGCTTTGGTGCGTTTCAAGCCGGGGTTACATCGCTGTTTTGGTCAACTCGATAACGCTCTGCTGCGCGATCGCGTGGGCCAGTTCCGCAGACGCCTGAGCGTAATCTACGTCGCCGTGAGAGCTGCTAATGTGCTCTTCAGCCTTACGTTTCGCTTCCATGGCTCGCGCTTCGTCGAGATCCTGGCCGCGAATTGCGGTGTCGGCCAGAACGGTCACGTTGCCAGGCTGCACTTCAAGAATGCCGCCAGACAGATAGATAAAc < 1:377586/289‑1 (MQ=255) tCAGACGCGCAAAAAA‑AAGCCAGACTGTTTCCAGACTGGCTTTGGTGCTTTTCAGTCCGGTTTTACATCGCTTTTTTGGTCAACTCGATAACGCGCAGCTGCGCGATCGCTTTGGCCAGGGCCGCAGACGCCTGAGCGTAATCTACGTCGCCTGGAGAGCTGCTAATGTGCTCTTCAGCCTTACGTTTCGCTTCCATGGCTCGCGCTTCGTCGAGATCCTGGCCGCGAATTGCGGTGTCGGCCAGAACGGTCACGTTGCCAGGCTGCACTTCAAGAATGCCGCCAGACAGATAGATAAAc < 2:79607/300‑1 (MQ=255) cacaCGCTCAAAAAA‑AAGCCATCCTGGTTCGCGAGTGGCTTTTGTGCTTTTCAAGCCGGTGGTACAGCGCTTTTTGGGTCAACTCGAGAACGCGCAGCTGCGGGATCGCGTTGGCCAGGTCTGCAGACGCCTGAGCGTAATCTACGTCGCCGTGAGAGCTGCTAATGTGCTCTTCAGCCTTACGTTTCGCTTCCATGGCTCGCGCTTCGTCGAGATCCTGGCCGCGAATTGCGGTGTCGGCCAGAACGGTCACGTTGCCAGGCTGCACTTCAAGAATGCCGCCAGACAGATAGATAAActc < 2:1492501/301‑1 (MQ=255) cacaCGCCAAAAAAA‑AAGCCAGCCTGTTTCCAGACTGGCTTTGGTGTTTTTCAAGCCGGTGTTTCAGCGCTTGTTTGGTCAACGCGATAACGCGCAGCTGCGCGTTCGCTTTGGCCAGTTCCGCAGACGCCTGAGCGGAATCTACGTCGTCGTGAGTGCTGCTAATGTGCTCTTCAGCCTTACGTTTCGCTTCCATGGCTCGCGCTTCGTCGAGATCCTGGCCGCGAATTGCGGTGTCGGCCAGAACGGTCACGTTGCCAGGCTGCACTTCAAGAATGCCGCCAGACAGATAGATAAActc < 2:679580/301‑1 (MQ=255) aaaaaaa‑atGCCAGCCTTGTTCAAGACTTGCTTTTGTGCTGTGAAAGCCTGTGTTACATCGCTTTTTGGGTCAAATCGTGAGCGCGCAGCTGCGCGTTCGCTTTGGGCAGATCCGCAGACTCCTGAGCGTAATCTACGTCGCCGTCAGGGCTGCTAATGTGCTCTTCAGCCTTACGTTTCGCTTCCATGGCTCGCGCTTCGTCGAGATCCTGGCCGCGAATTGCGTTGTCGGCCAGAACGGTCACGTTGCCAGGCTGCACTTCAAGAATGCCGCCAGACAGATAGATAAACTCTTCGTGAc < 2:1420274/300‑1 (MQ=255) aaaaa‑aaGCCAGCCTGTTTCCAGACTGGCTTTTGTGCTTTTCAAGCCGGTGTTACATCGCTTTTTTGGTCAACTCGATAACGCGCAGCTGCGCGATCGCTTTGGCCAGTTCCGCAGACGCCTGAGCGTAATCTACGTCGCCGTGAGAGCTGCTAATGTGCTCTTCAGCCTTACGTTTCGCTTCCATGGCTCGCGCTTCGTCGAGATCCTGGCCGCGAATTGCGGTGTCGGCCAGCACGGTCACGTTGCCAGGCTGCCCTTCAAGCATGCCGCCCGACAGATAGATAAACTCTTCGTGCCCg > 2:56797/1‑301 (MQ=255) aa‑aaCCCAGCCTTTTCCCCGGCCGGCTTTTGGTCTTTCCAGTCGGTTGTTAACTCGCTTGTTTGGTCAACGCGATAACGCGCAGCTGCGCGATCGCTTTGGCCAGTTCCGCATACGCCTGAGCGTAATCTACGTCGCCGTTAGAGCTGCTAATGTTCTCTTCAGCCTTACGTTTCGCTGCCAGGGCTCGCGCTTCGTCGAGATCCTGGCCGCGAATTGCGGTGTCGGCCAGAACGGTCACGTTGCCAGGCTGCACTTCAAGAATGCCGCCAGACAGATAGATAAACTCTTCGTGACCGTGc < 2:212152/301‑1 (MQ=255) ttgtgttcagacagggtggtgtgATTTTCAAGCCGGGGTTACATCGCTTTTTTGGTAAACTCGATAACGCGCAGGTGCGCGATCGCTTTGGCCAGTTCCGCAGACGCCGGAGCGTAATCTACGTCGCCGTGAGAGATGCTAATGTGCTCTTCAGACTTACGTTTCGCTTCCATGGCTCGCGCTTCGTCGAGATCCTGGCCGCGAATTGCGGTGTCGGCCAGAACGGTCACGTTGCCAGGCTGCACTTCAAGAATGCCGCCAGACAGATAGATAAACTCTTCGTGACCGTGCTGTTTCACGa < 2:874271/282‑1 (MQ=255) ttgtgtcctgtcggggttgtgtgCTTTTCAGGCCGGTGTGTCATCGCGTTTTTCGGCAACTAGATAACGCGCAGCTGCGCGATCGCTTTGGCCAGTTCCGCAGACGACTGAGCGTAATCTACGTCGCCGTGAGAGCTGCTAATGTGCTCTTCAGCCTTACGTGTCGCTGCCATGGCTGGCGCTTCGTCGAGATCCTGGCCGCGAATTGCGGTGTCGGCCAGAACGGTCACGTTGCCAGGCTGCACTTCAAGAATGCCGCCAGACAGATAGATAAACTCTTCGTGACCGTGCTGTTTCACGa < 1:199294/282‑1 (MQ=255) ctttttCCAGACTGGCTTTTGTGCTTTTCAAGCCGGTGTTACATCGCTTTTTTGGTCAACTCGATAACGCGCAGCTGCGCGATCGCTTTGGCCAGTTCCTCAGACGCCTGAGCGTAATCTACGTCGCCGTGAGAGCTGCTAATGTGCTCTTCAGCCTTACGTTTCGCTTCCATGGCTCGCGCTTCGTCGAGATCCTGGCCGCGAATTGCGGTGTCGGCCAGAACGGTCACGTTGCCAGGCTGCACTTCAAGAATGCCGCCAGACAGATAGATAAACTCTTCGTGACCGTGCTGTTTCACGa < 2:466755/298‑1 (MQ=255) cTGTTTCCCGACTGGCTTTTGTGCTTTTCAAGCCGGTGTTACATCGCTTTTTTGGTCAACTCGATAACGCGCAGCTGCGCGATCGCTTTGGCCAGTTCCGCAGACGCCTGAGCGTAATCTACGTCGCCGTGAGAGCTGCTAATGTGCTCTTCAGCCTTACGTTTCGCTTCCATGGCTCGCGCTTCGTCGAGATCCTGGCCGCGAATTGCGGTGTCGGCCAGAACGGTCACGTTGCCAGGCTGCACTTCAAGAATGCCGCCAGACAGATAGATAAACTCTTCGTGACCGTGCTGTTTCACGa < 2:1259775/301‑1 (MQ=255) tGTTTCCAGACTGGCTTTTGTGCTTTTCAAGCCGGTGTTACATCGCTTTTTTGGTCAACTCGATAACGCGCAGCTGCGCGATCGCTTTGTCCCGTTCCGCCGACGCCTCAGCGTAATCTACGTCGCCGTAATAGCTGCTAATGTGCTCTTCAGCCTTACATTTCTCTTCCTTGGCTCGCGCGTCGTCGAGATCCTGGCCGCGAGTAGCAGCGTTGGCCCGAGAGAGCACTGTGCCAGACTGGACTTCCAGGCTGCTGCCAGCATGATAGATATAATGTTCGTGACATTGCTGttacctgag > 2:385786/1‑294 (MQ=255) 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ACGGGTCACACGCGCAAAAAA‑AAGCCAGCCTGTTTCCAGACTGGCTTTTGTGCTTTTCAAGCCGGTGTTACATCGCTTTTTTGGTCAACTCGATAACGCGCAGCTGCGCGATCGCTTTGGCCAGTTCCGCAGACGCCTGAGCGTAATCTACGTCGCCGTGAGAGCTGCTAATGTGCTCTTCAGCCTTACGTTTCGCTTCCATGGCTCGCGCTTCGTCGAGATCCTGGCCGCGAATTGCGGTGTCGGCCAGAACGGTCACGTTGCCAGGCTGCACTTCAAGAATGCCGCCAGACAGATAGATAAACTCTTCGTGACCGTGCTGTTTCACGATGCGAATCATACCAGGCTTAATGGCGGTGAGCAGCGGTGCGTGGCCAGGGTAGATCCCCAGTTCACCTTCGCTACCCGTTACCTGGATTTTCTCGACCAGACCAGAGAACATTTGTTGCTCTGCGCTGACGACGTCCAGGTGGTAAGTCATTGCCATATCACCCTCCGATTAAGGCGTTAAAGTTTTTTGGCTTTTTCCACAGCTTCTTCGATGGAACCGACCATGTAGAACGCCTGCTCCGGCAGGTGATCGTATTCGCCTTCCAT > NC_000913/3915486‑3916082 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |