New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3915783 | 183 (1.200) | 3 (0.020) | 3/520 | NT | 1.7% | coding (190/420 nt) | atpC | F1 sector of membrane‑bound ATP synthase, epsilon subunit |
? | NC_000913 | 3915788 = | 169 (1.130) | coding (185/420 nt) | atpC | F1 sector of membrane‑bound ATP synthase, epsilon subunit | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
GGTCACACGCGCAAAAAAAAGCCAGCCTGTTTCCAGACTGGCTTTTGTGCTTTTCAAGCCGGTGTTACATCGCTTTTTTGGTCAACTCGATAACGCGCAGCTGCGCGATCGCTTTGGCCAGTTCCGCAGACGCCTGAGCGTAATCTACGTCGCCGTGAGAG‑CTGCTAATGTGCTCTTCAGCCTTACGTTTCGCTTCCATGGCTCGCGCTTCGTCGAGATCCTGGCCGCGAATTGCGGTGTCGGCCAGAACGGTCACGTTGCCAGGCTGCACTTCAAGAATGCCGCCAGACAGATAGATAAACTCTTCGTGACCGTGCTGTTTCACGATGCGAATCATACCAGGCTTAATGGCGGTGAGCAGCGGTGCGTGGCCAGGGTAGATCCCCAGTTCACCTTCGCTACCCGTTACCTGGATTTTCTCGACCAGACCAGAGAACATTTGTTGCTCTGCGCTGACGACGTCCAGGTGGTAAGTCATTGCCATATCACCCTCCGATTAAGGCGTTAAAGTTTTTTGGCTTTTTCCACAGCTTCTTCGATGGAACCGACCATGTAGAACGCCTGCTCCGGCAGGTGATCGTATTCGCCTTCCATGATGC > NC_000913/3915489‑3916087 | ggTCACACGCGCAAAAAAAAGCCAGCCTGTTTCCAGACTGGCTTTTGTGCTTTTCAAGCCGGTGTTACATCGCTTTTTTGGTCAACTCGATAAAGCGCAGATTCGCGATCGCTTTGGCCAGTTCCGCAGACGCCTGGGCGTAATCTACGTCGCCGTGAGAG‑CTGCTAATGTGCTCTTCAGCCTTACGTTTCGCTTCCATGGCTCGCGCGTGATCGAGCTCCTGGCCGCGAATTGCGGTGACGGACCAAACGGTCACGTTTCCCGGCTGCACTTCAAGAATTCCGCCAGCCAGCTAGATaaa > 2:428220/1‑301 (MQ=255) ttCACACGCGCAAAAAAAAGCCCGCCTGTTTCCAGACTGGCTTTTGTGCTTTTCAAGCCGGTGTTACATCGCTTTTTTGGTCAACTCGATAACGCGCAGCTGCGCGATCGCTTTGGCCAGTTCCGCAGACGCCTGAGCGTAATCTACGTCGCCGTGAGAG‑CTGCTAATGTGCTCTTCAGCCTTACGTTTCGCTTCCATGGCTCGCGCTTCGTCGAGATCCTGGCCGCGAATTGCGGTGTCGGCCAGAACGGTCACGTTGCCAGGCTGCACTTCAAGAATGCCGCCAGACAGATAGATAAAc < 2:533598/300‑1 (MQ=255) taaaacgcagcaaaaaaaGCCAGCTGGGTTCCGGACGGGCTTTGGTGCGTTTCAAGCCGGGGTTACATCGCTGTTTTGGTCAACTCGATAACGCTCTGCTGCGCGATCGCGTGGGCCAGTTCCGCAGACGCCTGAGCGTAATCTACGTCGCCGTGAGAG‑CTGCTAATGTGCTCTTCAGCCTTACGTTTCGCTTCCATGGCTCGCGCTTCGTCGAGATCCTGGCCGCGAATTGCGGTGTCGGCCAGAACGGTCACGTTGCCAGGCTGCACTTCAAGAATGCCGCCAGACAGATAGATAAAc < 1:377586/289‑1 (MQ=255) tCACACGCGCAAAAAAAAGCCAGCCTGTTTCCAGACGGGCTTTTGGTCGTTTCAAGCCGGTGTTACATCGCTTGTTTGGGCAACTCGATAACGCGCAGCTGCGCGATCGCTTTGGCCAGGTCCGCAGGCGCCTGAGCGTAATCTACGTCGCCGTGAGAG‑CTGCTAATGTGCTCTTCAGCCTTACGTTTCGCTTCCATGGCTCGCGCTTCGTCGAGATCCTGGCCGCGAATTGCGGTGTCGGCCAGAACGGTCACGTTGCCAGGCTGCACTTCAAGAATGCCGCCAGACAGATAGATAAAc < 2:1489149/300‑1 (MQ=255) tacacGCGCAAAAAAAAGCCTGCCTGTGTCCAGACTTGCTTGTGTGCTTTTCAAGCCGGTTGTACATCGCTTTTTGGGTCAACGCGATAACGCGCAGCTGCGCGATCGCTTTGGCCAGTTCCGCAGGCGCCTGAGCGTAATCTACGTCGCCGTGAGAG‑CTGCTAATGTGCTCTTCAGCCTTACGTTTCGCTTCCATGGCTCGCGCTTCGTCGAGATCCTGGCCGCGAATTGCGGTGTCGGCCAGAACGGTCACGTTGCCAGGCTGCACTTCAAGAATGCCGCCAGACAGATAGATAAActc < 2:1354533/300‑1 (MQ=255) aaaGCCAGCCTGTTTCCAGACTGGCTTTTGTGCTTTTCAAGCCGGTGTTACATCGCTTTTTTGGTCAACTCGATAACGCGCAGCTGCGCGATCGCTTTGGCCAGTTCCGCAGACGCCTGAGCGTAATCTACGTCGCCGTGAGAG‑CTGCTAATGTGCTCTTCAGCCTTACGTTTCGCTTCCATGGCTCGCGCTTCGTCGCGATCCTGGCCGCGAATTGCGGTGTCGGCCAGAACGGTCACGTTGCCCGGCTGCCCTTCAAGAATGCCCCCAGACATATAGATAAACTCTTCGTTACCGTg > 2:1205354/1‑299 (MQ=255) gccTGTTTCCAGACTGGCTTTTGTGCTTTTCAAGCCGGTGTTACATCGCTTTTTTGGTCAACTCGATAACGCGCAGCTGCGCGATCGCTTTGGCCAGTTCCGCAGACGCCTGAGCGTAATCTACGTCGCCGTGAGAG‑CTGCTAATGTGCTCTTCAGCCTTACGTTTCGCTTCCATGGCTCGCGCTTCGTCGAGATCCTGGCCGCGAATTGCGGTGTCGGCCAGAACGGTCCCGTTGCCAGGCTGCCCTTCAAGAATGCCGCCAGACAGATAGATAAACTCTTCGTGACCGTTCTGTTTCa > 2:306474/1‑300 (MQ=255) 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tttttgcaGCCGGGGTTACACTGCTTTTTGGGTCAACTCTATAACGCGCAGCGGCGCGATCGCTTTGGCCAGTTCCGCAGACGCCTGAGCGTAATCTACGTCTCCGTGAGAG‑CTTCTAATGTGCTCTTCAGCCTTACGTTTCGCTTCCATGGCTCGCGCTTCGTCGAGATCCTGGCCGAGAATTGCGGTGTCGGCCAGAACGGTCACGTTGCCAGGCTGCACTTCAAGAATGCCGCCAGACAGATAGATAAACTCTTCGTGACCGTGCTGTTTCACGATGCGAATCAAACCAGGCTTAATg < 2:1448041/294‑1 (MQ=255) ccGTTGTTACATTGCTTTGTGGTTCAACTCGATACCGCGAAGTTGCGCGAGCGCTTTGGCCAGTTCCGCAGACGCCTGAGCGTAATCTACGTCGCCGTGAGAG‑CTGCTAATGTGCTCTTCAGCCTTACGTTTCGCTTCCATGGCTCGCGCTTCGGCGAGATCCTGGCCGCGAATTGCGGTGTCGGCCAGAACGGTCACGTTGCCATGCTGCACTTCAAGAATGCTGCCAGACAGATAGATAAACTCTTCGTGACCGTGCTGTTTCACGATGCGAATCATACCAGGCTTAATGGCGGTGagc < 2:908937/301‑1 (MQ=255) gtgtTACATCGCTTTTTTGGTCAACTCGATAACGCGCAGCTGCGCGATCGCTTTGGCCAGTTCCGCAGACGCCTGAGCGTAATCTACGTCGCCGTGAGAG‑CTGCTAATGTGCTCTTCAGCCTTACGTTTCGCTTCCATGGCTCGCGCTTCGTCGCGATCCTGGCCGCGAATTGCGGTTTCGGCCAGAACGGTCACGTTGCCCGGCTGCACTTCAAGAATTCCGCCAGACAGCTAGCTAAACTCTTCGTTACCGTGCTGTTTCACGATGCACATCCTACCAGGCTTAATGGCTGTTagcac > 2:1145289/1‑299 (MQ=255) 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GGTCACACGCGCAAAAAAAAGCCAGCCTGTTTCCAGACTGGCTTTTGTGCTTTTCAAGCCGGTGTTACATCGCTTTTTTGGTCAACTCGATAACGCGCAGCTGCGCGATCGCTTTGGCCAGTTCCGCAGACGCCTGAGCGTAATCTACGTCGCCGTGAGAG‑CTGCTAATGTGCTCTTCAGCCTTACGTTTCGCTTCCATGGCTCGCGCTTCGTCGAGATCCTGGCCGCGAATTGCGGTGTCGGCCAGAACGGTCACGTTGCCAGGCTGCACTTCAAGAATGCCGCCAGACAGATAGATAAACTCTTCGTGACCGTGCTGTTTCACGATGCGAATCATACCAGGCTTAATGGCGGTGAGCAGCGGTGCGTGGCCAGGGTAGATCCCCAGTTCACCTTCGCTACCCGTTACCTGGATTTTCTCGACCAGACCAGAGAACATTTGTTGCTCTGCGCTGACGACGTCCAGGTGGTAAGTCATTGCCATATCACCCTCCGATTAAGGCGTTAAAGTTTTTTGGCTTTTTCCACAGCTTCTTCGATGGAACCGACCATGTAGAACGCCTGCTCCGGCAGGTGATCGTATTCGCCTTCCATGATGC > NC_000913/3915489‑3916087 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |