| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,199,680 | IS1 (+) +8 bp | coding (1120‑1127/1128 nt) | intE ← | e14 prophage; putative integrase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 257908 = | NA (NA) | 118 (1.170) | 101/298 | 0.0 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1199680 = | 0 (0.000) | coding (1127/1128 nt) | intE | e14 prophage; putative integrase | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1199687 | 0 (0.000) | 92 (0.910) | 79/298 | 0.3 | 100% | coding (1120/1128 nt) | intE | e14 prophage; putative integrase |
| ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
Only 100 of 206 total aligned reads displayed.
TCGATTTTAGGTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTG > NC_000913/1199538‑1199833 | gcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCt < 1:449260‑M2/9‑1 (MQ=255) cggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTa < 2:10536‑M2/10‑1 (MQ=255) cGATTTTAGGTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCgg > 1:1554619‑M1/1‑149 (MQ=255) 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gggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACg < 1:1081381‑M2/47‑1 (MQ=255) aCCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgt < 1:848559‑M1/151‑41 (MQ=255) gTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttttt < 2:247702‑M1/151‑45 (MQ=255) cggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCgg > 1:1224661‑M2/100‑151 (MQ=255) gATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggt < 1:1102411‑M1/150‑50 (MQ=255) 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ggCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaa < 2:394684‑M1/150‑121 (MQ=255) ttGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagc > 2:435589‑M1/1‑26 (MQ=255) tGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcac > 1:1386099‑M1/1‑25 (MQ=255) tGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagggtatgatggcgtttttgagttgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcac > 2:501350‑M1/1‑25 (MQ=255) gaTGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcacc < 1:1065806‑M1/149‑128 (MQ=255) aTGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgcc < 2:1440118‑M1/151‑131 (MQ=255) tGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccg > 1:487388‑M1/1‑20 (MQ=255) agtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATgg < 2:1378172‑M2/141‑1 (MQ=255) ttAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggac > 1:1073817‑M1/1‑17 (MQ=255) cattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAAt < 1:743205‑M2/144‑1 (MQ=255) 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caACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGt < 2:810653/151‑1 (MQ=255) aaCGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTg > 2:331234/1‑151 (MQ=255) | TCGATTTTAGGTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTG > NC_000913/1199538‑1199833 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |