| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,199,680 | IS1 (+) +8 bp | coding (1120‑1127/1128 nt) | intE ← | e14 prophage; putative integrase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 257908 = | NA (NA) | 118 (1.170) | 101/298 | 0.0 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1199680 = | 0 (0.000) | coding (1127/1128 nt) | intE | e14 prophage; putative integrase | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1199687 | 0 (0.000) | 92 (0.910) | 79/298 | 0.3 | 100% | coding (1120/1128 nt) | intE | e14 prophage; putative integrase |
| ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
CCTTTTCATCGATTTTAGGTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCG > NC_000913/1199530‑1199827 | cgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccc > 1:230479‑M2/151‑151 (MQ=255) gaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccc > 1:1442153‑M2/150‑150 (MQ=255) tCATCGATTTTAGGTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACaa < 1:1245217/150‑1 (MQ=255) gagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACg > 2:1481879‑M2/145‑151 (MQ=255) agcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTCAAc < 2:548572‑M2/6‑1 (MQ=255) gcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCt < 1:449260‑M2/9‑1 (MQ=255) ataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACttt < 2:575398‑M2/14‑1 (MQ=255) aacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTg < 2:1442035‑M2/15‑1 (MQ=255) aacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGc < 2:562464‑M2/16‑1 (MQ=255) aGGTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgct > 1:1426862‑M1/1‑142 (MQ=255) tGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgcc > 1:1027212‑M1/1‑139 (MQ=255) gaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCa < 1:424266‑M2/20‑1 (MQ=255) aatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATc < 1:43367‑M2/22‑1 (MQ=255) ctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCtt > 2:837645‑M2/127‑151 (MQ=255) tctcTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaac < 2:840281‑M1/148‑16 (MQ=255) gaggcagcacctggcacggctgggacggaaggcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacgctatcaataagtaggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCt < 1:956294‑M2/24‑1 (MQ=255) aggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTAc < 1:574194‑M2/28‑1 (MQ=255) ctGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaactta < 2:1468664‑M1/148‑19 (MQ=255) tgtgATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGCTATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactg > 1:1396896‑M1/1‑129 (MQ=255) cagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTc > 2:1346819‑M2/121‑151 (MQ=255) tgATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatt > 2:353611‑M1/1‑127 (MQ=255) agcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCg < 1:242‑M2/32‑1 (MQ=255) agcacccggcacggctgggacggaaatcgcagtcgttctcaaaatcggcggggctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacagtatcaataagacggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCg > 1:1201773‑M2/120‑151 (MQ=255) acctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGatc < 2:1113360‑M2/35‑1 (MQ=255) tttCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtg > 2:1065866‑M1/1‑122 (MQ=255) ggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGatcat < 2:299964‑M2/37‑1 (MQ=255) aCGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatg > 1:528698‑M1/1‑118 (MQ=255) aCGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatg < 2:920207‑M1/151‑34 (MQ=255) gTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgat > 1:924874‑M1/1‑116 (MQ=255) tACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatgg < 1:1239037‑M1/149‑38 (MQ=255) tACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatg < 2:734084‑M1/148‑37 (MQ=255) tACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatg < 1:1062131‑M1/148‑37 (MQ=255) gggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAAc < 1:1259032‑M2/46‑1 (MQ=255) gggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACg < 1:1081381‑M2/47‑1 (MQ=255) aCCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgt < 1:848559‑M1/151‑41 (MQ=255) ggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGAt > 1:1578762‑M2/103‑151 (MQ=255) gacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATc < 2:129283‑M2/50‑1 (MQ=255) aGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttt > 2:1213010‑M1/1‑108 (MQ=255) cTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgagg > 1:363870‑M1/1‑103 (MQ=255) tGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgagg > 2:1161186‑M1/1‑102 (MQ=255) tcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTttgtt > 2:1250930‑M2/94‑151 (MQ=255) gATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtg < 2:1429679‑M1/151‑51 (MQ=255) gATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggt < 1:1102411‑M1/150‑50 (MQ=255) gCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccag < 1:125381‑M1/151‑57 (MQ=255) cTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagt > 2:1498334‑M1/1‑94 (MQ=255) caaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTAt < 2:650382‑M2/70‑1 (MQ=255) aaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGAc < 1:464867‑M2/73‑1 (MQ=255) ggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAagtag < 2:1556521‑M2/80‑1 (MQ=255) gagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGtt < 2:390855‑M2/82‑1 (MQ=255) agctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGttt < 2:857426‑M2/83‑1 (MQ=255) aaGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcag < 1:331553‑M1/151‑76 (MQ=255) gctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGtttt < 2:1380097‑M2/84‑1 (MQ=255) gTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagct > 2:483374‑M1/1‑74 (MQ=255) ctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGttttt > 2:1043917‑M2/67‑151 (MQ=255) tgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTtg > 1:658854‑M2/66‑151 (MQ=255) catgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTtgtg > 2:1103617‑M2/64‑151 (MQ=255) catgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTtgt < 1:1000481‑M2/87‑1 (MQ=255) atgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTtgtgt < 1:973510‑M2/89‑1 (MQ=255) atgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTtgtgt > 1:728849‑M2/63‑151 (MQ=255) tttAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcc > 1:1352603‑M1/1‑66 (MQ=255) tAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctg > 2:98333‑M1/1‑64 (MQ=255) gtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAAcc < 1:880264‑M2/97‑1 (MQ=255) tttATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttc > 2:432071‑M1/1‑59 (MQ=255) atcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCt < 2:933547‑M2/100‑1 (MQ=255) ttATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcag < 1:499454‑M1/150‑93 (MQ=255) cgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTg < 2:801600‑M2/101‑1 (MQ=255) aTCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagcta < 1:896434‑M1/151‑96 (MQ=255) cATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctac < 1:1151193‑M1/150‑97 (MQ=255) cattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCtt < 1:1530075‑M2/106‑1 (MQ=255) cattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCtt < 1:817300‑M2/106‑1 (MQ=255) attatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCttt > 2:1210141‑M2/45‑151 (MQ=255) gtgCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgac < 2:776548‑M1/151‑101 (MQ=255) cGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggg < 2:169825‑M1/151‑104 (MQ=255) ggTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacgggg > 2:180504‑M1/1‑47 (MQ=255) ctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATAc > 1:996313‑M2/40‑150 (MQ=255) tgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATAc > 2:215727‑M2/39‑149 (MQ=255) gaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTtata < 1:309487‑M2/110‑1 (MQ=255) gaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACa < 1:1180508‑M2/112‑1 (MQ=255) gagaAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtgg > 1:1169220‑M1/1‑44 (MQ=255) gagaAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtgg > 1:1318754‑M1/1‑44 (MQ=255) gagaAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtgg < 2:1100587‑M1/151‑108 (MQ=255) cataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGt < 2:331987‑M2/117‑1 (MQ=255) cataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGt > 1:690178‑M2/35‑151 (MQ=255) aaaTTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgc < 2:238205‑M1/151‑111 (MQ=255) aaTTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcg < 1:1231386‑M1/151‑112 (MQ=255) aaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTc < 1:521041‑M2/119‑1 (MQ=255) atcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAg < 1:1494379‑M2/127‑1 (MQ=255) atcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAg < 2:659354‑M2/127‑1 (MQ=255) caataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGAcc < 1:179359‑M2/130‑1 (MQ=255) caataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGAcc < 2:502639‑M2/130‑1 (MQ=255) ataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCtt > 2:1566388‑M2/20‑151 (MQ=255) tGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcac > 1:1386099‑M1/1‑25 (MQ=255) agttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGc > 2:437317‑M2/17‑151 (MQ=255) ttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTc > 2:250598‑M2/15‑151 (MQ=255) gaTGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcacc < 1:1065806‑M1/149‑128 (MQ=255) ggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCAt < 1:503610‑M2/139‑1 (MQ=255) agtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATgg < 2:1378172‑M2/141‑1 (MQ=255) ttAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggac > 1:1073817‑M1/1‑17 (MQ=255) cattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAAt < 1:743205‑M2/144‑1 (MQ=255) ttaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGt > 2:589662‑M2/6‑151 (MQ=255) | CCTTTTCATCGATTTTAGGTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCG > NC_000913/1199530‑1199827 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |