New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP006584 | 346068 = | NA (NA) | 51 (0.810) | 48/588 | 0.4 | 96.2% | intergenic (‑51/‑107) | LY180_01675/LY180_01680 | CadC family transcriptional regulator/hypothetical protein |
? | CP006584 | = 363812 | 2 (0.030) | intergenic (‑39/‑249) | LY180_01770/LY180_01775 | outer membrane phosphoporin protein E/gamma‑glutamyl kinase |
ATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGA‑TTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP006584/346347‑346068 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAAAGGCGAAACACAAATTAACGATCAACTGACTGGCTATGGCCGTTGGGAAGCGGAGTTTGCCGGA < CP006584/363812‑363525 ATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGATGTTGATTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGTCAGAATGGGTAAAGAGAGTCGTGTAACATATAGAGTTCGCACCTCTTGTTGTCTGATTATTAATTTTTCGCGAAACCCTTTGAACTTATGACAAGATGTGTAACTAACTTCCATTAATGATTTTTTAACAAAA‑AATTAAGGGATGAATCAGCGCGGAATATTCGtcatgt > 2:394983/1‑293 tttgtgtgtgtgttGTTGGCGGGTTACGGGCAAGTTGTGTAAGAGTGAGAGGTGTACAGGTAAGTAATGCGTGGGAAGGCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTGTTAAGTGTAATTCGGGGAAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTTATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGA‑TTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATC < 2:155886/285‑1 TGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGA‑TTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCA < 1:701595/299‑1 TTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGGAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTGGTTGTCTGATTATTTATTTTTCGCGACACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTCTCCACCTTACCTTAATGA‑TTTTTACCAAAATAATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCTCGCGTTAATTAAACTCAGa > 2:465956/1‑298 CTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGA‑TTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAA > 1:52910/1‑299 GCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGA‑TTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGA > 1:487284/1‑299 CTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGA‑TTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAA < 1:7343/299‑1 GGCAGGTTACGGCCAAGTTGGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTTAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGA‑TTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAA < 2:234865/299‑1 GGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGA‑TTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAG < 1:158077/299‑1 CCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGA‑TTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGG > 1:193561/1‑299 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AATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGA‑TTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCG > 1:661640/1‑299 GCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGA‑TTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTAC < 1:352637/299‑1 CGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGA‑TTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACA < 1:465956/299‑1 CTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTCACTTAATGA‑TTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACA > 2:521406/1‑299 AGTGTAATTCGGGGAAGAATTGGTAAGAGGAGTCGGATAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGA‑TTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACT < 2:297064/299‑1 GGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGA‑TTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTAT > 1:562134/1‑299 GGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGA‑TTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTAT < 1:597749/299‑1 GCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGA‑TTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTCAATGCCGCAGAAATATAAAACAAAGACGGTAATAAACTGGAGGTCACTGGC > 2:58199/1‑299 GAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGA‑TTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAA > 1:222734/1‑299 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CCACCTTAACTTAATGA‑TTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGACTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAAGTAAATCAGTTTTGGTTATAAAGGCGAAAAACAAAGAAAAGAGCAACT > 2:306676/1‑299 cgTAACTTAATGT‑TTTGTTACAAAATAATAAGGGGATTATTCAGGTCTGAATATTCGCGCGTGAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGTTAATAAACTGTATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAAAGGCGAAACACAAATTAACGATCAACTGACT < 2:343085/297‑1 CTTAACTTAATGA‑TTTTTACTAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTCGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTACTAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGACTGATCACGACAGTAAAGATGGCGACAAGAGTTGTATCCGTTTTGGTTTTAAAGACGAAACACAAATAACCGATCAACTGACT > 2:592988/1‑299 CTTAACTTAATGA‑TTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAAAGGCGAAACACAAATTAACGATCAACTGACT < 1:587487/299‑1 TTAACTTAATGA‑TTTTTACACAAAACATTAGGGGATTTATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAAAGGCGAAACACAAATTAACGATCAACTGACTG < 2:208571/299‑1 CTTAATGA‑TTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAAAGGCGAAACACAAATTAACGATCAACTGACTGGCTA > 1:655566/1‑299 ATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAAAGGCGAAACACAAATTAACGATCAACTGACTGGCTATGGCCGTTGGGAAGCGGAGTTT > 1:619399/1‑299 ggcTTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGAGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCAGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAACATGACACCCAGAGTTATATCCGTTTTGTGTTTAAAGCGTAAACACAACATAACCATCAACTGACTGACTATGGTCGTGGGGAAGCGGATTCTGACGGA > 2:86091/4‑299 ATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGA‑TTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP006584/346347‑346068 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAAAGGCGAAACACAAATTAACGATCAACTGACTGGCTATGGCCGTTGGGAAGCGGAGTTTGCCGGA < CP006584/363812‑363525 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |