New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP006584 | = 269130 | 30 (1.070) | 19 (0.720) +TCATGTCATTAGTGCGTT |
16/550 | 0.7 | 57.4% | coding (377/414 nt) | LY180_01180 | hypothetical protein |
? | CP006584 | 1594499 = | 0 (0.000) | coding (168/909 nt) | LY180_07575 | hypothetical protein |
GATATTCTACTGTTGACTATTTGCGCTGTCATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGTGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGCGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGTCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGCCGCAGGGGAGCGATCAGGGAAAGATCATCAGAAGTTCACTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAGGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGG > CP006584/268835‑269427 | tttatTCTCCTTTTTTCTGTTTGAGTTGTCTTTTCTGGTGAAGAAGTCTGGGAAGAGATTGAGGTTTTTGTTGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATTGTGATTTTGAAAATGTTATTCCTGGTCACGATACCATTGCCAGCTTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTTCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGTCATTCTTCATATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGCCGCAGGGGAGCGAtga < 2:157377/296‑3 (MQ=11) cTGTTGACTATTTGCGCTGTCATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGTGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGCGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGTCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGCCGCAGGGGAGCGATCAGGGAAAGat < 1:406/298‑1 (MQ=255) cTGTTGACTATTTGCGCTGTCATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGTGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACAATCCCATTGCCAGCTTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCTTGATTGTCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGATTCGCCGCAGGGGAGCCATCCGGGAAAGaa > 2:85799/1‑297 (MQ=255) tGACTATTTGCTATTTCATTTCTGGGGCAGAAGGTTGGGCAGCTATAGAGGATTTTGTGAAAACCAATCTCGATGTCTTGAAGCAATATGGGGATTTTGAAAATGTGATTCCTGTAGACGATACCATTGCCAGCGTTGTATCCTGTAGCAGTCCGGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGAGTGTCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGCCGCAGGGGAGCGATCAGGGAAAGagcatc < 2:42733/298‑1 (MQ=11) gACTATTTGCGCTGTCATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGTGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGCGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGTCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGCCGCAGGGGAGCGATCAGGGAAAGAtcatca < 1:24181/298‑1 (MQ=255) cTGTCATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGTGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGCGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGTCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGCCGCAGGGGAGCGATCAGGGAAAGATCATCAGAAGTTCACtt < 1:26247/298‑1 (MQ=255) ggTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGGGGATTTTGGGAAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGCGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGTCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGCCGCAGGGGAGCGATCAGGGAAAGATCATCAGAAGTTCACTTTTTGTACTaaa < 2:135951/298‑1 (MQ=255) tGCTGAAGGCTTGAAATATATATAGGATTTTGGTGAAAAACCTTTTCGTTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGCGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTAGTAACTGGATGCGTGATTGTCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGCCGCAGGGGAGCGATCAGGGAAAGATCATCAGAAGTTCACTTTTTGTACTAaata < 2:241752/298‑1 (MQ=17) gAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGTGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGCGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGTCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGCCGCAGGGGAGCGATCAGGGAAAGATCATCAGAAGTTCACTTTTTGTAc > 2:245348/1‑288 (MQ=255) gAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGTGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGCGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGTCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGCCGCAGGGGAGCGATCAGGGAAAGATCATCAGAAGTTCACTTTTTGTAc < 1:245348/288‑1 (MQ=255) agGATTTTGGTGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTACCAGCGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGGGATTGTCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGCCAAGAGTCGCCGCAGGGGAGCGATCAGTGAAAGATCATCAGAAGTTCACTTTTTGTACTAAAAAATTCGACTTTTATTTTTAAAAAt > 2:258217/1‑298 (MQ=255) atgttttgaaGTGATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATATCATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGACTGCCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGTCGCAGGGGAGCGATtcatgtcattagtgcgttctcaacaatgcatagtctggtcctcggacagatcaagacggatgagaaatccaatgagattacagccat > 1:328628‑M1/4‑211 (MQ=255) gagtgatatgggggTTTTGAAAATTGTATTCCTGTTCACGATATCATTGCCAGAGTTGTATCCTTTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGACTGCCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGTCGCAGGGGAGCGATtcatgtcattagtgcgttctcaacaatgcatagtctggtcctcggacagatcaagacggatgagaaatccaatgagattacagccattcctgaac < 2:197773‑M1/293‑96 (MQ=255) tatGGGGTTTTTGAATATGGTATTCCTTTTCACGATATCATTGCTAGAGTTTTTTCCTGTATTAGTCCTTCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGGGACGTCCATTCTTCAGATGATAAAGACGGCATTGCACTTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGTCGCAGTGTAGCGATtcatgtcattagtgcgttctcaacaatgcatagtctggtcctcggacagatcaagacggatgagaaatccaatgagattacagccattcctgaacttctta < 2:328628‑M1/298‑102 (MQ=255) ctcttccgtttttggtattccttttTAGGATATCATTGTCAGATTTTTATCCTTGATCAGTCCTTCAAAATTTTACGATTGCTTTAGTAACTGGATGCGTTACGGCCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATGGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGTCGCAGGGGAGCGATtcatgtcattagtgcgttctcaacaatgcatagtctggtcctcggacagatcaagacggatgagaaatccaatgagattacagccattcctgaacttcttaacatg < 2:122692‑M1/286‑107 (MQ=255) ttttAAAAATCTTTTTTCTGGTCACGATTCCATTGCCAACTTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAATATTTCCTGATTGCTTGATTAACTGGATGCGTGATTGTCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTTCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGCCGCAGGGGAGCGATCAGGGAAAGATCATCAGAAGTGCACTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATGCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACAt < 2:309015/298‑1 (MQ=21) ggTATTCCTGTTCACGATATCATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGACTGCCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGTCGCAGGGGAGCGATtcatgtcattagtgcgttctcaacaatgcatagtctggtcctcggacagatcaagacggatgagaaatccaatgagattacagccattcctgaacttcttaacatgaagatcggaagag > 1:122692‑M1/1‑179 (MQ=255) tgtCCTTTTCACGATACCATTGCCAGTGTTGTATCCTGTATCATTCCTGCAAAATTTAACGAGTGCTTTATTAACTTGTTGCGTGATTGTCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCAGTGCAATTGATTGAAAAACGCTCCGGCATTCTTATGACAAGAGTCGCCGCAGGGGAGCGATCAGGGAAAGATCATCAGAAGTTCACTTTTTGTACTCAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTcc < 2:178440/296‑1 (MQ=37) ccTGTTCACGATTCCATTGACAGCGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTGACGAGTGATTTATTAACTGCATGCGTGATTGTCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGTTAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGGCGCAGGGGAGCGATCAGGGAAAGATCATCAGAAGTTCACTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTCCTTa < 1:287857/298‑1 (MQ=255) cTGTTCACGATATCATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGACTGCCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTATTATGCCAAGAGTCGTCGCAGGGGAGCGATtcatgtcattattgcgtcctcaacaattcctagtctggtcctcggcaacatcaagacggatgagcaatctaatgagattacagcccttccataactcctaaacaagaagaatattaaaggaaaaat > 2:25837‑M1/1‑172 (MQ=255) gTTCACGATACCATTGCCAGCGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGTCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAACACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGCCGCAGGGGAGCGATCAGGGAAAGATCATCAGAAGTTCACTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACAt < 1:327052/298‑1 (MQ=255) ttCACGATATCATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGACTGCCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGTCGCAGGGGAGCGATtcatgtcattagtgcgttctcaacaatgcatagtctggtcctcggacagatcaagacggatgagaaatccaatgagattacagccattcctgaacttcttaacatgatggatattaaaggaaaaatcat < 1:37400‑M1/298‑130 (MQ=255) gATACCATTGCCAGCGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCACAATTTCACGAGCGCTTTTTTAACTGGATGCGTTATTGTCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCCATTGATTGAACACCGCTCCGGCACTCTTATGAAAAGATTCGCCGCAAGGGAGCGATCAGGGAAAGATCATAAGAAGTTCACTTTTTGTACTACATACTTCGCATTTTATGTTTACAACTTCAGATATTCCTTATTACCTGACGTTGTTTTCTATTGCTTATAAATTATACAATACCCCTTACATACttca > 2:226398/1‑296 (MQ=255) cagagttgttgactgtattattcctGCAAAATTTCAGGAGTTGTTGATTAACTGGATGCGTGCTTGCAATTCTTCGAATGAGAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGTCGCAGGGGAGCGATtcatgtcattagtgcgttctcaacaatgcatagtctggtcatcggacagatcaagacggatgagaaatccaatgagattaaagccattcctgaacttcttaacatgatggatattaaaggaaaaatcatcacaactgatgcgatg < 2:302472‑M1/286‑146 (MQ=255) cAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGACTGCCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGTCGCAGGGGAGCGATtcatgtcattagtgcgttctcaacaatgcatagtctggtcctcggacagatcaagacggatgagaaatccaatgagattacagccattcctgaacttcttaacatgatggatattaaaggaaaaatcatcacaactgatgcgatg > 1:82327‑M1/1‑153 (MQ=255) cGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGTCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGCCGCAGGGGAGCGATCAGGGAAAGATCATCAGAAGTTCACTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATgg < 1:20136/298‑1 (MQ=255) tCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGTCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGCCGCAGGGGAGCGATCAGGGAAAGATCATCAGAAGTTCACTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTaa < 1:85799/298‑1 (MQ=255) tATTAGTCCTGCCAGATTTCACGAGTGATTTATTAACTGGATGCGTGATTGTCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGCCGCAGGGGAGCGATCAGGGAAAGATCATCAGAAGTTCACTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAAt < 1:230846/298‑1 (MQ=255) tATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGACTGCCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGTCGCAGGGGAGCGATtcatgtcattagtgcgttctcaacaatgcatagtctggtcctcggacagatcaagacggatgagaaatccaatgagattacagccattcctgaacttcttaacatgatggatattaaaggaaaaatcatcacaactgatgcgatgggctgccagaaagat < 1:25837‑M1/298‑161 (MQ=255) tCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGTCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACCAGAGTCGCCGCAGGGTAGAGATCAGGGAAAGATCATCAGAAGTTAACTTTTTGTACTAAATAATTCGCCATTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATTCATGATCAATTACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGTAACTTAAAAAAttt > 2:11634/1‑297 (MQ=255) gTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGTCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGCCGCAGGGGAGCGATCAGGGAAAGATCATCAGAAGTTCACTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATg < 1:15680/298‑1 (MQ=255) ttCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGTCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGCCGCAGGGGAGCGATCAGGGAAAGATCATCAGAAGTTCACTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCt < 1:258217/298‑1 (MQ=255) taACTGGATGCGTGACTGCCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGTCGCAGGGGAGCGATtcatgtcattagtgcgttctcaacaatgcatagtctggtcctcggacagatcaagacggatgagaaatccaatgagattacagccattcctgaacttcttaacatgatggatattaaaggaaaaatcatcacaactgatgcgatgggctgccagaaagatattgcagaaaagatacaaaaacagggaggtgat > 1:154939‑M1/1‑105 (MQ=255) accagATGCGGTATTGTCATTCTTCATATGATAAAGCAGGCATTGCAATTGATGGAAACACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGATTAGCCTCATGGGGGCGATTAGGTAAAGATCATCAGAAGTTCACTTTTTGTACTAAATTATTCGCATTTTATGTTTATAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATAGCTTATACATGATCAAATACTCCGTACATAATTACGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGa < 2:301233/294‑1 (MQ=17) aCTGGATGCGTGACTGCCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGTCGCAGGGGAGCGATtcatgtcattagtgcgttctcaacaatgcatagtctggtcctcggacagatcaagacggatgagaaatccaatgagattacagccattcctgaacttcttaacatgatggatattaaaggaaaaatcatcacaactgatgcgatgggctgccagaaagatattgcagaaaagatacaaaaacagggaggtgatta < 1:112470‑M1/298‑196 (MQ=255) tGCGTTATTTGCATTCTTCAGGTGATAAAGACGTCATTGTAAATGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGCCGCAGGGGAGCGATCAGGGAAAGATCATCAGAAGTTCACTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATT‑CTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCt < 2:143886/298‑1 (MQ=255) tGCGTGACTGCCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGTCGCAGGGGAGCGATtcatgtcattagtgcgttctcaacaatgcatagtctggtcctcggacagatcaagacggatgagaaatccaatgagattacagccattcctgaacttcttaacatgatggatattaaaggaaaaatcatcacaactgatgcgatgggctgccagaaagatattgcagaaaagatacaaaaacagggaggtgattatttatt > 1:280524‑M1/1‑97 (MQ=255) ctgccattcTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGTCGCAGGGGAGCGATtcatgtcattagtgcgttctcaacaatgcatagtctggtcctcggacagatcaagacggatgagaaatccaatgagattacagccattcctgaacttcttaacatgatggatattaaaggaaaaatcatcacaactgatgcgatgggctgccagaaagatattgcagaaaagatacaaaaacagggaggtgattatttattcgcggta > 1:189597‑M1/5‑90 (MQ=255) aTTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGCCGCAGGGGAGCGATCAGGGAAAGATCATCAGAAGTTCACTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGaa < 1:161025/298‑1 (MQ=255) gatgatAAAGACGTGAGTGCAATTGATGGAAAAACTGTCCGGGACGCTTATGGACAGAGTCGTCGCAGGGGAGCGATtcatgttagtagtgagttctcaacaatgcatagtctgggcctcgtacagatcaagacggatgagaaatccaatgagattacagccattcctgaacttcttaacatgatggatattaaaggaaaaatcatcacaactgaggcgatgggctgccagaaagatattgcagaaaagatacaaaaacagggaggtgattatttattcgcggtaaaaggaaaccagg < 2:298367‑M1/298‑222 (MQ=255) ttGATGGACAAACGCTCCGGCACTCTTATGACCAGGGGCGTTGCAGGGGAGCGATtcatgtcattagtgcgttctcaacaatgcatagtctggtcctcggacagatcaagacggatgagaaatccaatgagattacagccattcctgaacttcgtaacaggatggatattaaaggaaaactcatcacaactgatgcgatgggctgccagaaagatattgcagaaaagatacaaaaacagggaggtgattatttattcgcggtaaaaggaaaccaggggcggctaaataaagccgttga < 2:82327‑M1/298‑244 (MQ=255) ttGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGTCGCAGGGGAGCGATtcatgtcattagtgcgttctcaacaatgcatagtctggtcctcggacagatcaagacggatgagaaatccaatgagattacagccattcctgaacttcttaacatgatggatattaaaggaaaaatcatcacaactgatgcgatgggctgccagaaagatattgcagaaaagatacaaaaacagggaggtgattatttattcgcggtaaaaggaaaccaggggcggctaaataaagcctttga > 1:116331‑M1/1‑55 (MQ=255) cTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGCCGCAGGGGAGCGATCAGGGAAAGATCATCAGAAGTTCACTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTAt < 1:11634/298‑1 (MQ=255) tctTATGACAAGAGTCGTCGCAGGGGAGCGATtcatgtcattagtgcgttctcaacaatgcatagtctggtcctcggacagatcaagacggatgagaaatccaatgagattacagccattcctgaacttcttaacatgatggatattaaaggaaaaatcatcacaactgatgcgatgggctgccagaaagatattgcagaaaagatacaaaaacagggaggtgattatttattcgcggtaaaaggaaaccaggggcggctaaataaagcctttgaggaaaaatttccgctgaaagaat < 1:89003‑M1/298‑267 (MQ=255) cAAGAGTCGCCGCAGGGGAGCGATCAGGGAAAGATCATCAGAAGTTCACTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAGGGtt > 1:248222/1‑298 (MQ=255) gcAGGGGAGCGATtcatgtcattagtgcgttctcaacaatgcatagtctggtcctcggacagatcaagacggatgagaaatccaatgagattacagccattcctgaacttcttaacatgatggatattaaaggaaaaatcatcacaactgatgcgatgggctgccagaaagatattgcagaaaagatacaaaaacagggaggtgattatttattcgcggtaaaaggaaaccaggggcggctaaataaagcctttgaggaaaaatttccgctgaaagaattaaataattcagagcatga > 1:286389‑M1/1‑13 (MQ=255) tccggtttgATCAGGGAAAGATCATTAGAAGTTTACTTTTTGTACTTAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAGGGTTGGGAAGATATaga < 2:4835/290‑1 (MQ=255) gAGCGATCAGGGAAAGATCATCAGAAGTTCACTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAGGGTTGGGAAGATATAGAGGAt > 1:316165/1‑298 (MQ=37) aTCAGGGAAAGATCATCAGAAGTTCACTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAGGGTTGGGAAGATATagagagatcgga > 1:4835/1‑290 (MQ=25) tCAGGGAAAGATCATCAGAAGTTCACTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGTCGTTATTTTTGGTGCAGGGGGTTGGGTAGATATAGAGGGTTTTggg > 2:107995/1‑298 (MQ=255) | GATATTCTACTGTTGACTATTTGCGCTGTCATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGTGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGCGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGTCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGCCGCAGGGGAGCGATCAGGGAAAGATCATCAGAAGTTCACTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAGGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGG > CP006584/268835‑269427 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |