New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP006584 | 1153410 = | NA (NA) | 73 (1.190) | 61/586 | 0.1 | 91.2% | intergenic (‑822/+13) | pgaA/LY180_05365 | poly‑beta‑1,6‑N‑acetyl‑D‑glucosamine export protein/hypothetical protein |
? | CP006584 | 1213575 = | 7 (0.110) | intergenic (+274/‑21) | LY180_05705/LY180_05710 | DNAse/PTS glucose transporter subunit IIBC |
TTTGATATCATGCTGCTAATCGCCCTGATGCTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP006584/1153680‑1153410 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATG‑CTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATCCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGTCTTTGCAAACATGCCACTG‑ATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGCTTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTGGCCGCAGTTGTTGCCTATGGCATCATGGTTAAAA > CP006584/1213575‑1213869 gTTGATATCATGCTGCTAATCGCCCTGATGCTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTT < 1:274535/297‑1 GATATCATGCTGCTAATCGCCCTGATGCTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAG > 1:558679/1‑298 GATATCATGCTGCTAATCGCCCTGATGCTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTAGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTGGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCCGAAGCACCCTACATTATGTTTAAG > 2:356307/1‑298 TGCTGCTAATCGCCCTGATGCTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCAT < 1:152823/298‑1 GCTGCTAAGCGCCCTGAGTCTTCAACGAACAGGTTGGCTTGCGAGGGTTTAAGCTTAGAAACAAGGGTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAAACCAGGCAGAAATCGGAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTGTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGTGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTGACGCTTTGGGGAAATTATGAGTGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATT < 2:498424/298‑1 CTGCTAATCGCCCTGATGCTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTT < 1:570745/298‑1 CTGCTAATCGCCCTGATGCTTCAACGAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTT < 1:1442/298‑1 GATGCTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAA < 1:425407/298‑1 ATGCTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAG > 1:228411/1‑298 aaaaagttgGGCTTGACGGCGTACATGCTGTGAAAAAAGGGTGCGCCGAGCAATGCCAGGTTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTAATCTCAACAGATCGGTTAGGGATGGAAGTTTTGGGGCGTTCTAGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACGCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTGACGCTTTGGGTAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAAT < 2:298494/289‑1 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TGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATG‑CTGCC < 1:307451/298‑1 tctaaaagcaCAGAAACAAGTTTGGGACCAGCCGTTCCAGTCATACACAGTTAGAAATCCAAACGTACTCTAAACAGTTCGCTGAGGCATGTGAGTTTTGCTGCATTCTGGCTACACAATAAAATGGGAAGACTTACTCGTGGCTGGAAGCCTACTAGCGCAAAATTGATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACGCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATG‑CTGCCGGTATC < 2:153789/288‑1 TCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATG‑CTGCCGGTATCCGT > 1:572881/1‑298 TGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTAC < 1:296815/212‑1 TGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTAC > 2:296815/1‑212 GCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGCAAGACTTACTCGTTGCTGCAACCCTACTAGCCCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCCCAATTATGTTTAAGACTGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCAGTAACTCCCTGAGT‑CTGCCGGTATTCGTtccg > 2:5555/1‑294 AAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATT < 2:368788/240‑1 AAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATT > 1:368788/1‑240 AAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGACACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCTTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGACTGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTTAATCGCAAATG‑CTCCCGGTATCCCTCCTGCCTACTGCCGATATCCCGCTG > 2:343990/1‑298 GCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATG‑CTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATCCTGCTGGGCGTCGGTTCC > 1:221718/1‑298 ACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATG‑CTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATCCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGA > 1:548701/1‑298 CACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTCTGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTAAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAACAGGTCGGTAAATCGCTGATG‑CTGCCGGTCTCCCTACTGCCTATCGCCGGTATCCTGCTGGGCGTCGGTTCCcaggc > 2:372492/1‑293 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AATCGAAAAGGACTGTCAACGATTGGCTTAAGCATGGAAGTTTGGCGCGATTCAGTCTACACAATAACAAGGAAAGCGTAACTCGTGGGTGGAACCCTACGAGCTCAAAATGTATTCACGCAGGGGTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCGGATG‑CTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATCCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGG < 2:574321/298‑1 ATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATG‑CTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATCCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGC < 1:481015/298‑1 ATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCATACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATG‑CTTCCGGTATCCGTACTGCCTATAGCAGGTATACTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGC > 1:549727/1‑298 TCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATG‑CTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATCCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCT > 1:224570/1‑298 AAACTTACACTCCAAAGTTCGCTGAGGCATGGAAGTTTGGCGGCATTCTGGCTACAAAATAAAAAGGGAAGACTTGCTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAGATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCAGTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATG‑CTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATCCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCC < 2:527963/298‑1 AACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGC > 1:65172/1‑189 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ATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATG‑CTGCCGGTATCCGTACTGCCTACCGCAGGTAACCTTCTGGGCGTCGGTTCCCCCAATTTCAGCTGGCTGCCCGACGTTGTATCGCATGTGTTGGCAAAA > 2:255475/1‑298 ATGGAAGTTTTGCGGCATTCTAGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATG‑CTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGTTATCCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTACGGCACAA > 2:563805/1‑298 GAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATG‑CTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATCCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCA > 1:494801/1‑298 AAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCT > 1:414639/1‑170 AAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCT < 2:414639/170‑1 TTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATG‑CTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATCCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCG > 1:162182/1‑298 GGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATG‑CTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATCCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCG > 1:616596/1‑298 GGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATG‑CTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATCCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCG > 1:359236/1‑298 CATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATG‑CTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATCCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGTC < 1:584632/298‑1 ATTTTGGCTACAAAATAGCATGGGACGACTTATGCGTGGCGGCAACCCTACTAGTACAAATTTTATTCACACGTGGGGCAGCTTTGGGGAAATTATGAGTGGATCTCTCCGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTGAAGAATGCATTTGCTAACCTGAAAAAGGACGGTAAATCGCTGATG‑CTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGTTATCCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCTGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGTCT < 2:377389/298‑1 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ACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATG‑CTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATCCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCG > 2:227950/1‑268 TCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATG‑CTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATCCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGGCTTTGCAAACATGCCACTG‑ATTTTTGCGATCGGTG > 1:403075/1‑298 CGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAGTTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATG‑CTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATCCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGTCTTTGCAAACATGCCACTG‑ATTTTTGCGATCGGTGT < 1:79565/298‑1 TACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCACTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAACGGTCGGTAAATCGCTGATG‑CTGCCGGTATCCGTCCTGCCTCTCGCAGTTATCCTGCTGGGCGTCGGCTCCGCGAATCTCAGCTGTCTCCCCGCCGTTGTATCGCATGTTCTGCCACCACCAACCGGTCACGTCTTTGCAAACATG‑CACTGCGTTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCCGCTTct > 2:305131/1‑296 TCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATG‑CTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATCCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGTCTTTGCAAACATGCCACTG‑ATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGCTTTACCAATAA > 1:149816/1‑298 ATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCACTTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATG‑CTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATCCTCCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGCCTGCCCGCCGTTGTCTCGCCTGTTATGGCATAAGCAGGCGGTTCCGTCCTTGCAAACATGCCACTG‑CTTTTTGCGATCCGTGTCCCCCTCGGCCTTACCAATCACGATG > 2:598928/1‑298 TTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATG‑CTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATCCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGTCTTTGCAAACATGCCACTG‑ATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGCTTTACCAATAACGATGG > 1:641125/1‑298 TTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATG‑CTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATCCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGTCTTTGCAAACATGCCACTG‑ATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGCTTTACCAATAACGATGG < 1:372492/298‑1 TATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATG‑CTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATCCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGTCTTTGCACACATGCCACTG‑ATTTTTGCGATCGGTTTCGCCCTCTGCTTTACCACTAACGCTGGCG > 2:505819/1‑298 TTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATG‑CTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATCCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGTCTTTGCAAACATGCCACTG‑ATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGCTTTACCAATAACGATGGCGTA > 1:519120/1‑298 ACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATG‑CTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATCCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGCCGGTTCCGTCTTTGCAAACATGCCACGG‑ATGTTTGCGCGCGGTGTGCCCCTCGGCTTTCCCCATAACGAAGGAGTATGCGg > 2:277994/1‑297 GGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCTCTGATG‑CTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATCCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGTCTTTGCAAACATGCCACTG‑ATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGCTTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTG > 1:333073/1‑298 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GGGGATCTCTCAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATG‑CTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATCCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGTCTTTGCAAACATGCCACTG‑ATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGCTTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTGGCCGCAGTTGTTGCCTATGGCATC < 1:320188/298‑1 CAGTACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATG‑CTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATCCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGTCTTTGCAAACATGCCACTG‑ATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGCTTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTGGCCGCAGTTGTTGCCTATGGCATCATGGTTAAAA < 1:637130/298‑1 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‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATG‑CTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATCCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGTCTTTGCAAACATGCCACTG‑ATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGCTTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTGGCCGCAGTTGTTGCCTATGGCATCATGGTTAAAA > CP006584/1213575‑1213869 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |