New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 5652989 = | 79 (1.580) | 19 (0.450) | 14/224 | 2.3 | 23.7% | intergenic (‑39/+122) | PP_4961/PP_4962 | lipoprotein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 5653045 = | 56 (1.330) | intergenic (‑95/+66) | PP_4961/PP_4962 | lipoprotein/hypothetical protein |
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
GGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGTGAGCATCCTGCCAGTGTCGCCAGGGCCGTCACGGCCAAAAGCGCTTTCATTCAGTTTCCTCGATTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCTTCTCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACAGTGCAGTCTCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGCGAAGGGCCGCACAGCGGCCCCTTCTTCAAGACCACAAATCAACGTTCAGGTTGCCTATTACCCGATCAAGGGCAACCCGGCGCCTTGCGCTGG > NC_002947/5652840‑5653138 | ggTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGTGAGCATCCTGCCAGTGTCGCCAGGGCCGTCACGGCCAAAAGCGCTTTCATTCAGTTTCCTCGATTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCTtctc < 2:1069639/150‑1 (MQ=255) gtcatcggcaagcgcgtgggcccggaaggcctggaaaagtacgacgaagaccaccagcgcaaggcgccgggttgcccttgatcgggtaataggcaacctgaacgttgatttgtggtcttgaagaaggggccgctgtgcggcccttcgCgg > 2:946180‑M1/148‑150 (MQ=255) gtcatcggcaagcgcgggggcccggaaggcctggaaaagtacgatgaagaccaccagcgcaaggcgccgggttgcccttgatcgggtaatacgcaacctgaacgttgatttgtggtcttgaagaaggggccgctgtgcggcccttcgCgg > 1:1048003‑M1/148‑150 (MQ=255) gtCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGCCTGCAGCAGTGAGCATCCTGCCAGTGTCGCCAGGGCCGTCACGGCCAAAAGCGCTTTCATTCAGTTTCCTCGATTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCTTCTCggg < 1:1186381/150‑1 (MQ=255) tCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGTGAGCATCCTGCCAGTGTCGCCAGGGCCGTCACGGCCAAAAGCGCTTTCATTCAGTTTCCTCGATTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCTTCTCGGGc < 1:722735/150‑1 (MQ=255) aGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGTGAGCATCCTGCCAGTGTCGCCAGGGCCGTCACGGCCAAAAGCGCTTTCATTCAGTTTCCTCGATTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCTTCTCGGGCTCGc < 1:50126/150‑1 (MQ=255) caagcgcgtgggcccggaaggccttgaaaagtacgacgaagaccaccagcgcaaggcgccgggttgcccttgatcgggtaataggcaacctgaacgttgatttgtggtcttgaagaaggggccgctgtgcggcccttcgCGGGCTCGccc > 2:169010‑M1/140‑150 (MQ=255) caagcgcgtgggcccggaaggcctggaaaagtacgacgaagaccaccagcgcaaggcgccgggttgcccttgatcgggtaataggcaacctgaacgttgatttgtggtcttgaagaaggggccgctgtgcggcccttcgCGGGCTCGccc < 2:1138112‑M1/11‑1 (MQ=255) cAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGCTGCGCCCAATGCGGCAATCACCTTCCTGCCAGTGTCGCCAGGGCCGTCACGGCCAAAAGCGCTTTCATTCAGTTTCCTCGATTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCTTCTCGGGCTCGCCCGCt > 1:214049/1‑150 (MQ=255) cAACGGGTCCAGTTGTCCGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGTGAGCATCCTGCCAGTGTCGCCAGGGCCGTCACGGCCAAAAGCGCTTTCATTCAGTTTCCTCGATTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCTTCTCGGGCTCGCCCGCt > 2:158498/1‑150 (MQ=255) aaCGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGTGAGCCTGCTGCCAGTGTCGCCAGGGCCGTCACGGCCAAAAGCGCTTTCATTCAGTTTCCTCGATTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCTTCTCGGGCTCTCCCGCTc > 2:913129/1‑150 (MQ=255) aaCGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGTGAGCATCCTGCCAGTGTCGCCAGGGCCGTCACGGCCAAAAGCGCTTTCATTCAGTTTCCTCGATTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCTTCTCGGGCTCGCCCGCTc > 2:548151/1‑150 (MQ=255) aaCGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGTGAGCATCCTGCCAGTGTCGCCAGGGCCGTCACGGCCAAAAGCGCTTTCATTCAGTTTCCTCGATTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCTTCTCGGGCTCGCCCGCTc > 1:251594/1‑150 (MQ=255) aCGGGTCCAGTTGTCTGCCGGTGCCGGTTGCGCCGGCTGCATCAGTGAGCATCCTGCCAGTGTCGCCATGGCCGTCACTGCCAAAAGCGCTTTCATTCAGTGTCCTCGATTTCGGGCTGCTGTGCAGCCCTTCTCTGGCTCGCCCGCTcc < 1:400736/150‑1 (MQ=255) gggTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGTGAGCATCCTGCCAGTGTCGCCAGGGCCGTCACGGCCAAAAGCGCTTTCATTCAGTTTCCTCGATTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCTTCTCGGGCTCGCCCGCTCCca > 1:180733/1‑150 (MQ=255) gTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGTGAGCATCCTGCCAGTGTCGCCAGGGCCGTCACGGCCAAAAGCGCTTTCATTCAGTTTCCTCGATTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCTTCTCGGGCTCGCCCGCTCCcaca > 2:502104/1‑150 (MQ=255) gTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGTGAGCATCCTGCCAGTGTCGCCAGGGCCGTCACGGCCAAAAGCGCTTTCATTCAGTTTCCTCGAGTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCTTCTCGGGCTCGCCCGCTCCcaca > 2:885098/1‑150 (MQ=255) gTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGTGAGCATCCTGCCAGTGTCGCCAGGGCCGTCACCGCCAAAAGCGCTTTCATTCAGTTTCCTCGATTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCTTCTCGGGCTCGCCCGCTCCcaca < 2:543096/150‑1 (MQ=255) 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aGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGCCAGCATCCTGCCAGTGTCGCCAGGGCCGTCACGGCCAAAAGCGCTTTCATTCAGTTTCCTCGATTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCTTCTCGGGCTCGCCCGCTCCCACAg < 2:842140/147‑1 (MQ=255) cggaaggcctggaaaagtacgacgaagaccaccagcgcaaggcgccgggttgcccttgatcgggtaataggcaacctgaacgttgatttgtggtcttgaagaaggggccgctgtgcagcccttctCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTAc < 2:628362‑M1/25‑1 (MQ=255) aggcctggaaaagtacgacgaagaccaccagcgcaaggcgccgggttgcccttgatcgggtaataggcaacctgaacgttgatttgtggtcttgaagaaggggccgctgtgcagcccttctCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACAGTg > 1:628362‑M1/122‑150 (MQ=255) gCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGTGAGCATCCTGCCAGTGTCGCCAGGGCCGTCACGGCCAAAAGCGCTTTCATTCAGTTTCCTCGATTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCTTCTCGGGCTCGCCCGCTCCCACAgg > 1:679007/1‑140 (MQ=255) gCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGTGAGCATCCTGCCAGTGTCGCCAGGGCCGTCACGGCCAAAAGCGCTTTCATTCAGTTTCCTCGATTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCTTCTCGGGCTCGCCCGCTCCCACAgg < 2:679007/140‑1 (MQ=255) 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tCCTCGATTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCTTCTCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACAGTGCAGTCTCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGCGAAGGGCCGCACAGCGGCCCCTTCTTCAAGACCACAAATCAACGTTCAGGTTGCCTATTAc < 1:502104/150‑1 (MQ=255) cTCGATTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCTTCTCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACAGTGCAGTCTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCACAGCGGCCCCTTCTTCAAGACCACAAATCAACGTTCAGGTTGCCTATTAccc > 1:275992/1‑150 (MQ=255) cTCGATTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCTTCTCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACAGTGCAGTCTCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGCGAAGGGCCGCACAGCGGCCCCTTCTTCAAGACCACAAATCAACGTTCAGGTTGCCTATTAccc < 1:714196/150‑1 (MQ=255) cTCGATTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCTTCTCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACAGTGCAGTCTCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGCGAAGGGCCGCACAGCGGCCCCTTCTTCAAGACCACAAATCAACGTTCAGGTTGCCTATTAccc > 1:140294/1‑150 (MQ=255) cTCGATTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCTTCTCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACAGTGCAGTCTCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGCGAAGGGCCGCACAGCGGCCCCTTC‑TCAAGACCACAAATCAACGTTCAGGTTGCCTATTAcccc > 2:640604/1‑149 (MQ=255) tCGATTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCTTCTCGGGCTCGCACGCTCCCACAGGTACAGTGCAGTCTCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGCGAAGGGCCGCACAGCGGCCCCTTCTTCAAGACCACAAATCAACGTTCAGGTTGCCTATTACCCg > 1:96598/1‑150 (MQ=255) gaagaaggggccgctgtgcggcccttcgCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACAGTGCAGTCTCtgt > 1:844521‑M1/29‑67 (MQ=255) gaagaaggggccgctgtgcggcccttcgCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACAGTGCAGTCTCtgt < 2:844521‑M1/39‑1 (MQ=255) gaagaaggggccgctgtgcggcccttcgCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGAGACTGCACTGTACCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGAGAAGGGCTGCACAGCAGCCCCTTCTTCAAGACCACAAATCAACGTTCAGGTTGCCTATTACCCGa < 2:316641‑M1/122‑1 (MQ=255) gaagaaggggccgctgtgcggcccttcgCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGAGACTGCACTGTACCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGAGAAGGGCTGCACAGCAGCCCCTTCTTCAAGACCACAAATCAACGTTCAGGTTGCCTATTACCCGa < 1:775535‑M1/122‑1 (MQ=255) aTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCTTCTCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACAGTGCAGTCTCTGTGGGAGCGGGCGAGGCCGCGAAGGGCCGCACAGCGGCCCCTTCTTCAAGACCACAAATCAACGTTCAGGTTGCCTATTACCCGAtg > 1:273461/1‑149 (MQ=255) tGGGGCTGCTGTGCAGCCCTTCTCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTAGAGTGCAGTCTCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGCGAAGGGCCGCACAGCGGCCCCTTCTTCAAGACCACAAATCAACGTTCAGGTTGCCTATTACCCGATCAAg < 2:251594/150‑1 (MQ=255) tGGGGCTGCTGTGCAGCCCTTCTCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACAGTGCAGTCTCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGCGAAGGGCCGCACAGCGGCCCCTTCTTCAAGACCACAAATCAACGTTCAGGTTGCCTATTACCCGATCAAg < 1:173393/150‑1 (MQ=255) gggCTGCTGTGCAGCCCTTCTCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACAGTGCAGTCTCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGCGAAGGGCCGCACAGCGGCCCCTTCTTCAAGACCACAAATCAACGTTCAGGTTGCCTATTACCCGATCAAggg < 2:142079/150‑1 (MQ=255) gctgTGCAGCCCTTCTCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACAGTGCAGTCTCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGCGAAGGGCCGCACAGCGGCCCCTTCTTCAAGACCACAAATCAACGTTCAGGTTGCCTATTACCCGATCAAGGGCAAcc < 2:600941/150‑1 (MQ=255) cAGCCCTTCTCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACAGTGCAGTCTCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGCGAAGGGCCGCACAGCGGCCCCTTCTTCAAGACCACAAATCAACGTTCAGGTTGCCTATTACCCGATCAAGGGCAACCCGgcgc > 2:38024/1‑150 (MQ=255) cAGCCCTTCTCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACAGTGCAGTCTCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGCGAAGGGCCGCACAGCGGCCCCTTCTTCAAGACCACAAATCAACGTTCAGGTTGCCTATTACCCGATCAAGGGCAACCCGgcgc < 2:140294/150‑1 (MQ=255) cccTTCTCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACAGTGCAGTCTCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGCGAAGGGCCGCACAGCGGCCCCTTCTTCAAGACCACAAATCAACGTTCAGGTTGCCTATTACCCGATCAAGGGCAACCCGGCGCCtt > 1:181981/1‑150 (MQ=255) cttcgCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGAGACTGCACTGTACCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGAGAAGGGCTGCACAGCGGCCCCTTCTTCAAGACCACAAATCAACGTTCAGGTTGCCTATTACCCGATCAAGGGCAACCCGGCGCCTTgc < 2:405658‑M1/145‑1 (MQ=255) cttcgCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGAGACTGCACTGTACCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGAGAAGGGCTGCACAGCAGCCCCTTCTTCAAGACCACAAATCAACGTTCAGGTTGCCTATTACCCGATCAAGGGCAACCCGGCGCCTTgc > 2:417206‑M1/6‑150 (MQ=255) ttCTCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACAGTGCAGTCTCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGCGAAGGGCCGCACAGCGGCCCCTTCTTCAAGACCACAAATCAACGTTCAGGTTGCCTATTACCCGATCAAGGGCAACCCGGCGCCTTgcg > 1:833408/1‑150 (MQ=255) CGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACAGTGCAGTCTCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGCGAAGGGCCGCACAGCGGCCCCTTCTTCAAGACCACAAATCAACGTTCAGGTTGCCTATTACCCGATCAAGGGCAACCCGGCGCCTTGCGCtgg > 2:296124‑M1/1‑150 (MQ=255) CGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACAGTGCAGTCTCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGCGAAGGGCCGCACAGCGGCCCCTTCTTCAAGACCACAAATCAACGTTCAGGTTGCCTATTACCCGATCAAGGGCAACCCGGCGCCTTGCGCtgg > 2:275992‑M1/1‑150 (MQ=255) CGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACAGTGCAGTCTCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGCGAAGGGCCGCACAGCGGCCCCTTCTTCAAGACCACAAATCAACGTTCAGGTTGCCTATTAACTACCCAAGGGCAACCCGGCGCCTTGCGCtgg > 1:342338‑M1/1‑150 (MQ=255) | GGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGTGAGCATCCTGCCAGTGTCGCCAGGGCCGTCACGGCCAAAAGCGCTTTCATTCAGTTTCCTCGATTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCTTCTCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACAGTGCAGTCTCTGTGGGAGCGGGCGAGCCCGCGAAGGGCCGCACAGCGGCCCCTTCTTCAAGACCACAAATCAACGTTCAGGTTGCCTATTACCCGATCAAGGGCAACCCGGCGCCTTGCGCTGG > NC_002947/5652840‑5653138 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |