| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 3233587 = | 11 (0.390) | 4 (0.150) | 4/230 | NT | 26.4% | coding (732/948 nt) | GbpR | galactose‑binding protein regulator |
| ? | NC_002947 | 3233624 = | 12 (0.460) | coding (769/948 nt) | GbpR | galactose‑binding protein regulator | |||||
GTGGATCTTGCACCCCATCGGCAGCCCGATGCGCCGTCGCGTCGAAAGCGCATTGCAGGCCGGCGGCATGGTGCAGTCGCTGGATATCGTCGAAACCGCTTCGATCCTGGCGACCACTGCCATGCTCGAAGCGTCCGAAATGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCGCTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGA > NC_002947/3233491‑3233772 | gTGGATCTTGCACCCCATCGGCAGCCCGATGCGCCGTCGCGTCGAAAGCGCATTGCAGGCCGGCGGCATGGTGCAGTCGCTGGATATCGTCGAAACAGCTTCGATCCTGGCGACCACTGCCATGCTCGAAGCGTCCGAAATGATTGCggt > 2:296953/1‑150 (MQ=255) gcaactccaccggcaggacggcgaccgtgccatagcgggcataatgcttggccacgtcattgggcaccaccgcaatcatttcggacgcttcgatcctggcgaccactgccatgctcgaagcgTCCGAAATGATTGCggtggt > 2:365226‑M2/123‑142 (MQ=255) gcaactccaccggcaggacggcgaccgtgccatagcgggcataatgcttggccacgtcattgggcaccaccgcaatcatttcggaCGCTTCGATCCTGGCGACCACTGCCATGCTCGAAGCGTCCGAAATGATTGCggtggt > 1:365226‑M1/86‑142 (MQ=255) aCCCCATCGGCAGCCCGATGCGCCGTCGCGTCGAAAGCGCATTGCAGGCCGGCGGCATGGTGCAGTCGCTGGATATCGTCGAAACCGCTTCGATCCTGGCGACAACTGCCATGCTCGATGCGTCCGAAATTATTTCGGGGGGGCCCAGTg > 2:607600/1‑150 (MQ=255) aTCGGCAGCCCGATGCGCCGTCGCGTCGAAAGCGCATTGCAGGCCGGCGGCATGGTGCAGTCGCTGGATATCGTCGAAACCGCTTCGATCCTGGCGACCACTGCCATGCTCGAAGCGTCCGAAATGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTg > 2:363861/1‑150 (MQ=255) aGCCCGATGCGCCGTCGCGTCGAAAGCGCATTGCAGGCCGGCGGCATGGTGCAGTCGCTGGATATCGTCGAAACCGCTTCGATCCTGGCGACCACTGCCATGCTCGAAGCGTCCGAAATGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAg > 1:427926/1‑150 (MQ=255) cccGATGCGCCGTCGCGTCGAAAGCGCATTGCAGGCCGGCGGCATGGTGCAGTCGCTGGATATCGTCGAAACCGCTTCGATCCTGGCGACCACTGCCATGCTCGAAGCGTCCGAAATGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAGCa > 1:110100/1‑150 (MQ=255) gcCGTCGCGTCGAAAGCGCATTGCAGGCCGGCGGCATGGTGCAGTCGCTGGATATCGTCGAAACCGCTTCGATCCTGGCGACCACTGCCATGCTCGAAGCGTCCGAAATGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAGCATTATGccc < 2:427926/150‑1 (MQ=255) tGGTGCAGTCGCTGGATATCGTCGAAACCGCTTCGATCCTGGCGACCACTGCCATGCTCGAAGCGTCCGAAATGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGc < 2:110100/150‑1 (MQ=255) accaccgcaatcatttcggacgcttcgagcatggcagtggtcgccaggatcgaagcgTCCGAAATGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCAAGCATTATGCCCGCTATGGCACGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGc > 1:365226‑M2/58‑142 (MQ=255) accaccgcaatcatttcggaCGCTTCGAGCATGGCAGTGGTCGCCAGGATCGAAGCGTCCGAAATGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCAAGCATTATGCCCGCTATGGCACGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGc > 2:365226‑M1/21‑142 (MQ=255) gtcgAAACCGCTTCGATCCTGGCGACCACTGCCATGCTCGAAGCGTCCGAAATGATTGCggt < 1:108141/62‑1 (MQ=255) gtcgAAACCGCTTCGATCCTGGCGACCACTGCCATGCTCGAAGCGTCCGAAATGATTGCggt > 2:108141/1‑62 (MQ=255) aCCGCTTCGATCCTGGCGACCACTGCCATGCTCGAAGCGTCCGAAATGATTGCggtg > 1:438202/1‑57 (MQ=255) aCCGCTTCGATCCTGGCGACCACTGCCATGCTCGAAGCGTCCGAAATGATTGCggtg < 2:438202/57‑1 (MQ=255) ttcgagcatggcagtggtcgccaggatcgaagcgTCCGAAATGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCgg > 2:282881‑M2/35‑110 (MQ=255) ttcgagcatggcagtggtcgccaggatcgaagcgTCCGAAATGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCgg < 1:282881‑M2/76‑1 (MQ=255) TTCGATCCTGGCGACCACTGCCATGCTCGAAGCGTCCGAAATGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAAc < 2:247076‑M1/136‑1 (MQ=255) TTCGATCCTGGCGACCACTGCCATGCTCGAAGCGTCCGAAATGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAAc > 1:247076‑M1/1‑136 (MQ=255) GATCCTGGCGACCACTGCCATGCTCGAAGCGTCCGAAATGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGc < 1:341412‑M1/143‑1 (MQ=255) GATCCTGGCGACCACTGCCATGCTCGAAGCGTCCGAAATGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGc > 2:341412‑M1/1‑143 (MQ=255) tGGCGACCACTGCCATGCTCGAAGCGTCCGAAATGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTCTGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCGCt > 1:352687/1‑150 (MQ=255) aTGCTCGAAGCGTCCGAAATGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCGCTCGCGGCCCAACTCg < 1:607600/150‑1 (MQ=255) aTGCTCGAAGCGTCCGAAATGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCGCTCGCGGCCCAACTCg > 2:595116/1‑150 (MQ=255) gTCCGAAATGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCGCTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGa < 1:595116‑M2/149‑1 (MQ=255) | GTGGATCTTGCACCCCATCGGCAGCCCGATGCGCCGTCGCGTCGAAAGCGCATTGCAGGCCGGCGGCATGGTGCAGTCGCTGGATATCGTCGAAACCGCTTCGATCCTGGCGACCACTGCCATGCTCGAAGCGTCCGAAATGATTGCGGTGGTGCCCAATGACGTGGCCCAGCATTATGCCCGCTATGGCATGGTCGCCGTCCTGCCGGTGGAGTTGCCACTGGCGATGGCCAACCTCGGCGTGCTGACCCTGCGCTCGCGGCCCAACTCGGTTGCCCTTGA > NC_002947/3233491‑3233772 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |