| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5306259 = | 18 (0.780) | 3 (0.130) | 3/242 | NT | 14.1% | coding (1041/3483 nt) | recC | multifunctional ATP‑dependent DNA helicase/dsDNA/ssDNA exonuclease/ssDNA endonuclease recombinase subunit |
| ? | NC_002947 | 5306292 = | 19 (0.850) | coding (1008/3483 nt) | recC | multifunctional ATP‑dependent DNA helicase/dsDNA/ssDNA exonuclease/ssDNA endonuclease recombinase subunit | |||||
CGGGCTGTGCGCGATATGGAAGCGGATCGAGCGGTCTTTTGTGGTGTCGACTGCCGGCCACCGTTCGCGGCTCTCGGCGAGCGGGCGCAATTCCAGGATGTCGTCCTGCAGTTCGTTGAGCAGCGTGGTGGGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGCCTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCC > NC_002947/5306112‑5306400 | cGGGCTGTGCGCGATATGGAAGCGGATCGAGCGGTCTTTTGTGGTGTCGACTGCCGGCCACCGTTCGCGGCTCTCGGCGAGCGGGCGCAATTCCAGGATGTCGTCCTGCAGTTCGTTGAGCAGCGTGGTGGGCGAACCGTCGCTGAACAg < 1:46735/150‑1 (MQ=255)aaacgccagcaacgcaagcaaggcatgcccctgcaactggacgaccagacgctgcaccagcatgcccacccgttgctggcagcctggggtaaacaaggccgcgactacatcaacctgctcgacagctatgatgacccaggcagctacCAg < 1:366156‑M1/3‑1 (MQ=255) aGCGGTCTTTTGTGGTGTCGACTGCCGGCCACCGTTCGCGACTCTCGGCGAGCGGGCGCAATTCCAGGATGTCGTCCTGCAGTTCGTTGAGCAGCGTGGTGGGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCt > 2:121816/1‑150 (MQ=255) caactggactaccagacgctgcaccagcatgcccacccgttgctggcagcctggggtaaacaaggccgcgactacatcgacctgctcgacagctatgatgacccaggcagctacCAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTa > 2:20583‑M1/115‑150 (MQ=255) ttttGTGGTGTCGACTGCCGGCCACCGTTCGCGGCTCTCGGCGAGCGGGCGCAATTCCAGGATGTCGTCCTGCAGTTCGTTGAGCAGCGTGGTGGGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCt > 2:142817/1‑150 (MQ=255) ccGGCCACCGTTCGCGGCTCTCGGCGAGCGGGCGCAATTCCAGGATGTCGTCCTGCAGTTCGTTGAGCAGCGTGGTGGGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGc < 1:160745/150‑1 (MQ=255) cACCGTTCGCGGCTCTCGGCGAGCGGGCGCAATTCCAGGATGTCGTCCTGCAGTTCGTTGAGCAGCGTGGTGGGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCg > 2:564386/1‑150 (MQ=255) aCCGTTCGCGGCTCTCGGCGAGCGGGCGCAATTCCAGGATGTCGTCCTGCAGTTCGTTGAGCAGCGTGGTGGGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCACTGGTAGCTGCCTGGGTCGGTGTAGCTGTCGa > 2:113581/1‑150 (MQ=255) ccacccgttgctggcagcctggggtaaacaaggccgcgactacatcaacctgctcgacagctatgatgacccaggcagctacCAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTg < 2:565319‑M1/33‑1 (MQ=255) ccacccgttgctggcagcctggggtaaacaaggccgcgactacatcaacctgctcgacagctatgatgacccaggcagctacCAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTg > 1:565319‑M1/83‑115 (MQ=255) ggCTCTCGGCGAGCGGGCGCAATTCCAGGATGTCGTACTGCAGTTCGTTGAGCAGCGTGGTGGGCGAACTGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCGGTCGCTGAACAGGCACTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGa > 2:225184/1‑150 (MQ=255) ctctCGGCGAGCGGGCGCAATTCCAGGATGTCGTCCTGCAGTTCGTTGAGCAGCGTGGTGGGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATg < 1:290383/150‑1 (MQ=255) gcgcAATTCCAGGATGTCGTCCTGCAGTTCGTTGAGCAGCGTGGTGGGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGCCTTg > 1:592868/1‑150 (MQ=255) gcAATTCCAGGATGTCGTCCTGCAGTTCGTTGAGCAGCGTGGTGGGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGCCTTGtt < 1:121816/150‑1 (MQ=255) ccAGGATGTCGTCCTGCAGTTCGTTGAGCAGCGTGGTGGGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCgg > 1:539018/1‑68 (MQ=255) ccAGGATGTCGTCCTGCAGTTCGTTGAGCAGCGTGGTGGGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCgg < 2:539018/68‑1 (MQ=255) gtcCTGCAGTTCGTTGAGCAGCGTGGTGGGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGcc > 1:518932/1‑87 (MQ=255) gtcCTGCAGTTCGTTGAGCAGCGTGGTGGGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGcc < 2:518932/87‑1 (MQ=255) cTGCAGTTCGTTGAGCAGCGTGGTGGGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGCCTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCaa > 1:213069/1‑150 (MQ=255) gcagcGTGGTGGGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGCCTTGTTTACCCCAGGCTGCGAGCAACGGGGGGGCATGCt > 2:102996/1‑150 (MQ=255) gtggtgGGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTGGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGCCTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGc > 1:586400/1‑150 (MQ=255) acggTCACTGAACAGGCCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTTCCTGGTTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGCCTTGTTTACCCCAAGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGgtc < 1:223417/147‑1 (MQ=255) tCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGCCTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTcc < 1:142817/150‑1 (MQ=255) | CGGGCTGTGCGCGATATGGAAGCGGATCGAGCGGTCTTTTGTGGTGTCGACTGCCGGCCACCGTTCGCGGCTCTCGGCGAGCGGGCGCAATTCCAGGATGTCGTCCTGCAGTTCGTTGAGCAGCGTGGTGGGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGCCTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCC > NC_002947/5306112‑5306400 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |