New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5480444 | 26 (1.120) | 3 (0.140) | 3/236 | NT | 10.1% | coding (920/993 nt) | prmA | ribosomal protein L11 methyltransferase |
? | NC_002947 | = 5480514 | 29 (1.330) | coding (990/993 nt) | prmA | ribosomal protein L11 methyltransferase |
GTGCTGGTTGCCAACATCCTCGCCGGCCCGCTGGTGTCGCTGGCGCCACAGTTGTCCGGCCTGGTTCGCCCAGGTGGCCTGCTGGCGCTTTCGGGCATCCTCGCCGAGCAAGGTGAAGACGTGGCCGCCGCTTATGCCGCCGACTTTGAACTGGACCCGATCGTCGTGCGCGACGGCTGGGTGCGCATCAGTGGTCGGCGTCGCTAAGCGGGCCTAGAATACTTTTCTGCACAGCTCCCGGATCGCCGCATGACCGACAGTTTCGTCACCCAGTGCCCGCA > NC_002947/5480311‑5480591 | gTGCTGGTTGCCAACATCCTCGCCGGCCCGCTGGTGTCGCTGGCGCCACAGTTGTCCGGCCTGGTTCGCCCAGGTGGCCTGCTGGCGCTTTCGGGCATCCTCGCCGAGCAAGGTGAAGACGTGGCCGCCGCTTATGCCGCCGACTTTGaa < 2:122796/150‑1 (MQ=255) gCTGGTTGCCAACATCCTCGCCGGCCCGCTGGTGTCGCTGGCGCCACAGTTGTCCGGCCTGGTTCGCCCAGGTGGCCTGCTGGCGCTTTCGGGCATCCTCGCCGAGCAAGGTGAAGACGTGGCCGCCGCTTATGCCGCCGACTTTGAACt < 2:279806/150‑1 (MQ=255) tCGCCGGCCCGCTGGTGTCGCTGGCGCCACAGTTGTCCGGCCTGGTTCGCCCAGGTGGCCTGCTGGCGCTTTCGGGCATCCTCGCCGAGCAAGGTGAAGACGTGGCCGCCGCTTATGCCGCCGACTTTGAACTGGACCCGATCGTCGTgc > 1:365538/1‑150 (MQ=255) tCGCCGGCCCGCTGGTGTCGCTGGCGCCACAGTTGTCCGGCCTGGTTCGCCCAGGTGGCCTGCTGGCGCTTTCGGGCATCCTCGCCGAGCAAGGTGAAGACGTGGCCGCCGCTTATGCCGCCGACTTTGAACTGGACCCGATCGTCGTgc > 1:460738/1‑150 (MQ=255) cGGCCCGCTGGTGTCGCTGGCGCCACAGTTGTCCGGCCTGGTTCGCCCAGGTGGCCTGCTGGCGCTTTCGGGCATCCTCGCCGAGCAAGGTGAAGACGTGGCCGCCGCTTATGCCGCCGACTTTGAACTGGACCCGATCGTCGTGCGCGa < 2:576386/150‑1 (MQ=255) ggCCCGCTGGTGTCGCTGGCGCCACAGTTGTCCGGCCTGGTTCGCCCAGGTGGCCTGCTGGCGCTTTCGGGCATCCTCGCCGAGCAAGGTGAAGACGTGGCCGCCGCTTATGCCGCCGACTTTGAACTGGACCCGATCGTCGTGCGCGAc < 1:374166/150‑1 (MQ=255) gCCCGCTGGTGTCGCTGGCGCCACAGTTGTCCGGCCTGGTTCGCCCAGGTGGCCTGCTGGCGCTTTCGGGCATCCTCGCCGAGCAAGGTGAAGACGTGGCCGCCGCTTAgcgacgccgaccactgatgcgcacccagccgtcgcgcacga > 2:13845‑M1/1‑109 (MQ=255) cGCTGGTGTCGCTGGCGCCACAGTTGTCCGGCCTGGTTCGCCCAGGTGGCCTGCTGGCGCTTTCGGGCATCCTCGCCGAGCAAGGTGAAGACGTGGCCGCCGCTTATGCCGCCGACTTTGAACTGGACCCGAtcgtc < 2:567631/137‑1 (MQ=255) cGCTGGTGTCGCTGGCGCCACAGTTGTCCGGCCTGGTTCGCCCAGGTGGCCTGCTGGCGCTTTCGGGCATCCTCGCCGAGCAAGGTGAAGACGTGGCCGCCGCTTATGCCGCCGACTTTGAACTGGACCCGAtcgtc > 1:567631/1‑137 (MQ=255) tCCGGCCTGGTTCGCCCAGGTGGCCTGCTGGCGCTTTCGGGCATCCTCGCCGAGCAAGGTGAAGACGTGGCCGCCGCTTATGCCGCCGACTTTGAACTGGACCCGATCGTCGTGCGCGACGGCTGGGTGCGCATCAGTGGTCGGCGTCGc < 2:460738/150‑1 (MQ=255) gccGGCCTGGTTCGCCCAGGTGGCCTGCTGGCGCTTTCGGGCATCCTCGCCGAGCAAGGTGAAGACGTGGCCGCCGCTTATGCCGCCGACTTTGAACTGGCCCCGATCGTCGTGCGCGACGGCTGGGTGCGCATCAGTGGTCGGCGTCGc < 1:347560/149‑1 (MQ=255) ggCCTGGTTCGCCCAGGTGGCCTGCTGGCGCTTTCGGGCATCCTCGCCGAGCAAGGTGAAGACGTGGCCGCCGCTTATGCCGCCGACTTTGAACTGGACCCGATCGTCGTGCGCGACGGCTGGGTGCGCATCAGTGGTCGGCGTCGCtaa < 1:545985‑M2/150‑4 (MQ=255) ggTTCGCCCAGGTGGCCTGCTGGCGCTTTCGGGCATCCTCGCCGAGCAAGGTGAAGACGTGGCCGCCGCTTAgcgacgccgaccactgatgcgcacccagccgtcgcgcacgacgatcgggtccagttcaaagtcggcggcataagcggc < 1:13845‑M1/150‑79 (MQ=255) ggCCTGCTGGCGCTTTCGGGCATCCTCGCCGAGCAAGGTGAAGACGTGGCCGCCGCTTAgcgacgccgaccactgatgcgcacccagccgtcgcgcacgacgatcgggtccagttcaaagtcggcggcataagcggcggccacgtcttca < 1:142631‑M1/150‑92 (MQ=255) gCCTGCTGGCGCTTTCGGGCATCCTCGCCGAGCAAGGTGAAGACGTGGCCGCCGCTTATGCCGCCGACTTTGAACTGGACCCGATCGTCGTGCTCGACGGCTGGGTGCGCATCAGTGGTCGGCGTCGCTAAGCGGGCCTAGAATACtttt < 2:545985/150‑1 (MQ=255) ctgctgGCGCTTTCGGGCATCCTCGCCGAGCAAGGTGAAGACGTGGCCGCCGCTTATGCCGCCGACTTTGAACTGGACCCGATCGTCGTGCGCGACGGCTGGGTGCGCATCAGTGGTCGGCGTCGGTAAGCGGGCCTAGAATACTTTTCt > 1:283960/1‑150 (MQ=255) ctgctgGCGCTTTCGGGCATCCTCGCCGAGCAAGGTGAAGACGTGGCCGCCGCTTATGCCGCCGACTTTGAACTGGACCCGATCGTCGTGCGCGACGGCTGGGTGCGCATCAGTGGTCGGCGTCGCTAAGCGGGCCTAGAATACTTTTCt > 2:30505/1‑150 (MQ=255) tgctgGCGCTTTCGGGCATCCTCGCCGAGCAAGGTGAAGACGTGGCCGCCGCTTATGCCGCCGACTTTGAACTGGACCCGATCGTCGTGCGCGACGGCTGGGTGCGCATCa > 1:354154/1‑111 (MQ=255) tgctgGCGCTTTCGGGCATCCTCGCCGAGCAAGGTGAAGACGTGGCCGCCGCTTATGCCGCCGACTTTGAACTGGACCCGATCGTCGTGCGCGACGGCTGGGTGCGCATCa < 2:354154/111‑1 (MQ=255) tttCGGGCATCCTCGCCGAGCAAGGTGAAGACGTGGCCGCCGCTTATGCCGCCGACTTTGAACTGGACCCGATCGTCGTGCGCGACGGCTGGGTGCGCATCAGTGGTCGGCGTCGCTAAGCGGGCCTAGAATACTTTTCTGCACAGCTcc > 2:480785/1‑150 (MQ=255) gCATCCTCGCCGAGCAAGGTGAAGACGTGGCCGCCGCTTATGCCGCCGACTTTGAACTGGACCCGATCGTCGTGCGCGACGGCTGGGTGCGCATCAGTGGTCGGCGTCGCTAAGCGGGCCTAGAATACTTTTCTGCACAGCTCCCGGATc < 2:365538/150‑1 (MQ=255) cATCCTCGCCGAGCAAGGTGAAGACGTGGCCGCCGCTTATGCCGCCGACTTTGAACTGGACCCGATCGTCGTGCGCGACGGCTGGGTGCGCATCAGTGGTCGGCGTCGCTAAGCGGGCCTAGAATACTTTTCTg > 1:65059/1‑134 (MQ=255) cATCCTCGCCGAGCAAGGTGAAGACGTGGCCGCCGCTTATGCCGCCGACTTTGAACTGGACCCGATCGTCGTGCGCGACGGCTGGGTGCGCATCAGTGGTCGGCGTCGCTAAGCGGGCCTAGAATACTTTTCTg < 2:65059/134‑1 (MQ=255) ccTCGCCGAGCAAGGTGAAGACGTGGCCGCCGCTTATGCCGCCGACTTTGAACTGGACCCGATCGTCGTGCGCGACGGCTGGGTGCGCATCAGTGGTCGGCGTCGCTAAGCGGGCCTAGAATACTTTTCTGCACAGCTCCCGGATcgccg > 2:590037/1‑150 (MQ=255) gAGCAAGGTGAAGACGTGGCCGCCGCTTATGCCGCCGACTTTGAACTGGACCCGATCGTCGTGCGCGACGGCTGGGTGCGCATCAGTGGTCGGCGTCGCTAAGCGGGCGTAGAATACTTTTCTGCACAGCTCCCGGATCGCCGCATGAcc > 1:600594/1‑150 (MQ=255) gAGCAAGGTGAAGACGTGGCCGCCGCTTATGCCGCCGACTTTGAACTGGACCCGATCGTCGTGCGCGACGGCTGGGTGCGCATCAGTGGTCGGCGTCGCTAAGCGGGCCTAGAATACTTTTCTGCACAGCTCCCGGATCGCCGCATGAcc < 1:590037/150‑1 (MQ=255) tGAAGACGTGGCCGCCGCTTATGCCGCCGACTTTGAACTGGACCCGATCGTCGTGCGCGACGGCTGGGTGCGCATCAGTGGTCGGCGTCGCtaagcggcggccacgtcttcaccttgctcggcgaggatgcccgaaagcgccagcaggcc < 1:142631‑M2/150‑60 (MQ=255) gACGTGGCCGCCGCTTATGCCGCCGACTTTGAACTGGACCCGATCGTCGTGCGCGACGGCTGGGTGCGCATCAGTGGTCGGCGTCGCTAAGCGGGCCTAGAATACTTTTCTGCACAGCTCCCGGATcgcc < 2:516053/130‑1 (MQ=255) gACGTGGCCGCCGCTTATGCCGCCGACTTTGAACTGGACCCGATCGTCGTGCGCGACGGCTGGGTGCGCATCAGTGGTCGGCGTCGCTAAGCGGGCCTAGAATACTTTTCTGCACAGCTCCCGGATcgcc > 1:516053/1‑130 (MQ=255) cgccgcTTATGCCGCCGACTTTGAACTGTACCCGATCGTCGTGCGCGACGGCTGGGTGCGCATCAGTGGTCGGCGTCGCTAAGCGGGCCTAGAATACTTTTCTGCACAGCTCCCGGATCGCCGCATGACCGACAGTTTCGTCACCCAGTg > 1:544994/1‑150 (MQ=255) gccgcTTATGCCGCCGACTTTGAACTGGACCCGATCGTCGTGCGCGACGGCTGGGTGCGCATCAGTGGTCGGCGTCGCtaagcggcggccacgtcttcaccttgctcggcgaggatgcccgaaagcgccagcaggccacctgggcgaacc < 1:13845‑M2/150‑73 (MQ=255) gccgcTTATGCCGCCGACTTTGAACTGGACCCGATCGTCGTGCGCGACGGCTGGGTGCGCATCAGTGGTCGGCGTCGCTAAGCGGGCCTAGAATACTTTTCTGCACAGCTCCCGGATCGCCGCATGACCGACAGTTTCGTCACCCAGTGc > 2:502882/1‑150 (MQ=255) ttAgcgacgccgaccactgatgcgcacccagccgtcgcgcacgacgatcgggtccagttcaaagtcggcggcataagcggcggccacgtcttcaccttgctcggcgaggatgcccgaaagcgccagcaggccacctgggcgaaccaggcc < 1:545985‑M1/150‑148 (MQ=255) | GTGCTGGTTGCCAACATCCTCGCCGGCCCGCTGGTGTCGCTGGCGCCACAGTTGTCCGGCCTGGTTCGCCCAGGTGGCCTGCTGGCGCTTTCGGGCATCCTCGCCGAGCAAGGTGAAGACGTGGCCGCCGCTTATGCCGCCGACTTTGAACTGGACCCGATCGTCGTGCGCGACGGCTGGGTGCGCATCAGTGGTCGGCGTCGCTAAGCGGGCCTAGAATACTTTTCTGCACAGCTCCCGGATCGCCGCATGACCGACAGTTTCGTCACCCAGTGCCCGCA > NC_002947/5480311‑5480591 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |