| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1968086 | 14 (0.610) | 4 (0.190) | 4/224 | NT | 22.5% | intergenic (‑54/+104) | yciK/gph | putative oxidoreductase/phosphoglycolate phosphatase |
| ? | NC_002947 | = 1968145 | 15 (0.720) | intergenic (‑113/+45) | yciK/gph | putative oxidoreductase/phosphoglycolate phosphatase | |||||
CAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTCCAGCGGGTGGTCCACCACCACGTCGGCACCCCAGTTGTTGGGGTTGTCCTCT > NC_002947/1968003‑1968283 | aaggCCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGaacccgc > 2:470201‑M2/2‑143 (MQ=255) cggTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGGGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGGAAATGCGTCCGATCAGGCGTGTTGACTGCCCCGACGATCTCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGc < 1:262054/150‑1 (MQ=255) ggTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCg < 1:485237/150‑1 (MQ=255) tCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCt > 1:154260/1‑150 (MQ=255) gAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCa > 2:114324/1‑150 (MQ=255) gcggcCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAgcgc > 2:456236/1‑150 (MQ=255) ggCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGa < 2:392123/150‑1 (MQ=255) cTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGaacccgctcctacgataggcccaggccgcccacacgaactcgaaggacagaaccatgttcgactacaccgccc < 1:558660‑M2/150‑74 (MQ=255) aTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACt > 1:487775/1‑150 (MQ=255) tAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGaac < 2:584268‑M2/74‑4 (MQ=255) tAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGaac > 1:584268‑M2/1‑71 (MQ=255) tAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGACGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGCGCCCGGTCATCGGTCTGTGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTgc > 2:17712/1‑150 (MQ=255) gggTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGtt > 2:295819/1‑109 (MQ=255) gggTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGtt < 1:295819/109‑1 (MQ=255) ccGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGaacccgctcctacgataggcccaggccgcccacacgaactcgaaggacagaaccatgttcgactacaccgcccgc < 2:232376‑M2/131‑76 (MQ=255) ccGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGaacccgctcctacgataggcccaggccgcccacacgaactcgaaggacagaaccatgttcgactacaccgcccgc > 1:232376‑M2/1‑56 (MQ=255) gCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTCCAGCGGGTGGTccacc < 1:399296/150‑1 (MQ=255) aGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGACCCCGCTCCTACAAAATGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTCCAGCGGGTGGTCCACCACCACGTCgg < 2:499932/150‑1 (MQ=255) ccAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTCCAGCGGGTGGTCCACCCATACGTCCGCAccc < 2:154260/150‑1 (MQ=255) aGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTCCAGCGGGTGGTCCACCACCACGTCGGCACCCCa < 1:456236/150‑1 (MQ=255) gTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGaacccgctcctacgataggcccaggccgcccacacgaactcgaaggacagaaccatgttcgactacaccgcccgccccgacctgctgcaaggccgggtcatcctggttaccggtgccggccgtgg > 2:558660‑M2/1‑25 (MQ=255) cATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTCCAGCGGGTGGTCCACCACCACGTCGGCACCCCAGTTGTTGGGGTTGTCctct < 1:164623/150‑1 (MQ=255) | CAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGTTCCAGCGGGTGGTCCACCACCACGTCGGCACCCCAGTTGTTGGGGTTGTCCTCT > NC_002947/1968003‑1968283 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |