New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2581091 = | 26 (1.120) | 4 (0.180) | 4/238 | NT | 13.9% | coding (270/867 nt) | PP_2262 | sugar ABC transporter permease |
? | NC_002947 | 2581119 = | 25 (1.150) | coding (298/867 nt) | PP_2262 | sugar ABC transporter permease |
GTCCAGCCGCTACTTCGTCGGTGCCGACTGGTACCGCCAGGTGCTGCGCGACCCGGCGCTGCACGACGCATTGCTGCGCCAGTTCATTTACTCGGCCTGCGTCCTGCTGATCGAAATTCCATTGGGTATAGGCATCGCTCTGGCCATGCCAACCAAAGGCCGCATGGCCTCGGTGTGCCTGATCGTCATGGCTATCCCGTTGCTGATCCCGTGGAACGTGGTCGGCACTATC‑TGGCAGATTTTCGGCCGTGCCGATATCGGCCTGCTCGGCGCTTCCCTGGCCAAG > NC_002947/2580950‑2581235 | gTCCAGCCGCTACTTCGTCGGTGCCGACTGGTACCGCCAGGTGCTGCGCGACCCGGCGCTGCACGACGCATTGCTGCGCCAGTTCATTTACTCGGCCTGCGTCCTGCTGATCGAAATTCCATTGGGTATAGGCATCGCTCTGGCCATGcc > 1:403116/1‑150 (MQ=255) gTCCAGCCGCTACTTCGTCGGTGCCGACTGGTACCGCCAGGTGCTGCGCGACCCGGCGCTGCACGACGCATTGCTGCGCCAGTTCATTTACTCGGCCTGCGTCCTGCTGATCGAAATTCCATTGGGTATAGGCATCGCTCTGGCCATGcc > 1:388551/1‑150 (MQ=255) ccGCTACTTCGTCGGTGCCGACTGGTACCGCCAGGTGCTGCGCGACCCGGCGCTGCACGACGCATTGCTGCGCCAGTTCATTTACTCGGCCTGCGTCCTGCTGATCGAAATTCCATTGGGTATAGGCATCGCTCTGGCCATGccaaccaa > 2:337930/1‑150 (MQ=255) ttCGTCGGTGCCGACTGGTACCGCCAGGTGCTGCGCGACCCGGCGCTGCACGACGCATTGCTGCGCCAGTTCATTGAGTCGGCCTGCGTCCTCCTGATAGCAGTTCGATTGTGGAGATGCATCGCTCTGGCCTTGCCAACCAAAGGTCgg > 1:442195/1‑149 (MQ=255) ccGACTGGTACCGCCAGGTGCTGCGCGACCCGGCGCTGCACGACGCATTGCTGCGCCAGTTCATTTACTCGGCCTGCGTCCTGCTGATCGAAATTCCATTGGGTATAGGCATCGCTCTGGCCATGCCAACCAAAGGCCGCATGGCCTCgg < 2:4370/150‑1 (MQ=255) aCTGGTACCGCCAGGTGCTGCGCGACCCGGCGCTGCACGACGCATTGCTGCGCCAGTTCATTTACTCGGCCTGCGTCCTGCTGATCGAAATTCCATTGGGTATAGGCATCGCTCTGGCCATGCCAACCAAAGGCCGCATGGCCTCGgtgt > 2:3771/1‑150 (MQ=255) ccAGGTGCTGCGCGACCCGGCGCTGCACGACGCATTGCTGCGCCAGTTCATTTACTCGGCCTGCGTCCTGCTGATCGAAATTCCATTGGGTATAGGCATCGCTCTGGCCATGCCAACCAAAGGCCGCATGGCCTCGGTGTGCCTGATCGt > 1:478601/1‑150 (MQ=255) ggTGCTGCGCGACCCGGCGCTGCACGACGCATTGCTGCGCCAGTTCATTTACTCGGCCTGCGTCCTGCTGATCGAAATTCCATTGGGTATAGGCATCGCTCTGGCCATGCCAACCAAAGGCCGCATGGCCTCGGTGTGCCTGATCGTCAt < 2:478601/150‑1 (MQ=255) gTGCTGCGCGACCCGGCGCTGCACGACGCATTGCTGCGCCAGTTCATTTACTCGGCCTGCGTCCTGCTGATCGAAATTCCATTGGGTATAGGCATCGCTCTGGCCATGCCAACCAAAGGCCGCATGGCCTCGGTGTGCCTGATCGTCATg < 1:369059/150‑1 (MQ=255) cccGGCGCTGCACGACGCATTGCTGCGCCAGTTCATTTACTCGGCCTGCGTCCTGCTGATCGAAATTCCATTGGGTATAGGCATCGCTCTGGCCATGCCAACCAAAGGCCGCATGGCCTCGGTGTGCCTGATCGTCATGGCTATCCCGtt > 2:265079/1‑150 (MQ=255) cGGCGCTGCACGACGCATTGCTGCGCCAGTTCATTTACTCGAGCTGCGTGCTGCTGATCGAAATTCCATTGGGTATAGGCATCGCTCTGGCCATGCCAACCAAAGGCCGCATGGCCTCGGTGTGCCTGATCGTCATGGCTATCCTGTTGc > 1:261716/1‑150 (MQ=255) tGCACGACGCATTGCTGCGCCCGTTCATTTACTCGGCCTGCGTCCTCCTGCTCGAAATTCCATTGGGTATAAGCATCGCTCTGGCCATGCCAACCAAAGGCTGCATAGCCTCGGTGTGCCTGAATGTCATGACTACACCGTTGCTGATcc > 2:77763/1‑150 (MQ=255) tGCACGACGCATTGCTGCGCCAGTTCATTTACTCGGCCTGCGTCCTGCTGATCGAAATTCCATTGGGTATAGGCATCGCTCTGGCCATGCCAACCAAAGGCCGCATGGCCTCGGTGTGCCTGATCGTCATGGCTATCCCGTTGc > 2:237668/1‑144 (MQ=255) tGCACGACGCATTGCTGCGCCAGTTCATTTACTCGGCCTGCGTCCTGCTGATCGAAATTCCATTGGGTATAGGCATCGCTCTGGCCATGCCAACCAAAGGCCGCATGGCCTCGGTGTGCCTGATCGTCATGGCTATCCCGTTGc < 1:237668/144‑1 (MQ=255) ttGCTGCGCCAGTTCATTTACTCGGCCTGCGTCCTGCTGATCGAAATTCCATTGGGTATAGGCATCGCTCTGGCCATGCCAACCAAAGGCCGCATGGCCTCGGTGTGCCTGATCGTCATGGCTATCCCGTTGCTGATCCCGTGGAACGTg < 2:79057/150‑1 (MQ=255) gcCAGTTCATTTACTCGGCCTGCGTCCTGCTGATCGAAATTCCATTGGGTATAGGCATCGCTCTGGCCATGCCAACCAAAGGCCGCATGGCCTCGGTGTGCCTGATCGTCATGGCTATCCCGTTGCTGATCCCGTGGAACGTGGTCGGCa < 1:150629/150‑1 (MQ=255) cAGTTCATTTACTCGGCCTGCGTCCTGCTGATCGAAATTCCATTGGGTATAGGCATCGCTCTGGCCATGCCAACCAAAGGCCGCATGGCCTCGGTGTGCCTGATCGTCATGGCTATCCCGTTGCTGATCCCGTGGAACGTGGTCGGCACt > 2:462713/1‑150 (MQ=255) cAGTTCATTTACTCGGCCTGCGTCCTGCTGATCGAAATTCCATTGGGTATAGGCATCGCTCTGGCCATGCCAACCAAAGGCCGCATGGCCCAGGTGAACCGGATCGTCATGGCTATCCCGTTGCTGATCCCGTGGAACGTGGTCGGCACt > 2:16539/1‑150 (MQ=255) ttCATTTACTCGGCCTGCGTCCTGCTGATCGAAATTCCATTGGGTATAGGCATCGCTCTGGCCATGCCAACCAAAGGCCGCATGGCCTCGGTGTGCCTGATCGTCATGGCTATCCCGTTGCTGATCCCGTGGAACGTGGTCGGCACTATc < 2:388551/150‑1 (MQ=255) tgccgaccacgttccacgggatcagcaacgggatagccatgacgatcaggcacaccgaGGCCATGCCAACCAAAGGCCGCATGGCCTCGgt < 1:165835‑M1/33‑1 (MQ=255) tgccgaccacgttccacgggatcagcaacgggatagccatgacgatcaggcacaccgaGGCCATGCCAACCAAAGGCCGCATGGCCTCGgt > 2:165835‑M1/59‑91 (MQ=255) ttccacgggatcagcaacgggatagccatgacgatcaggcacaccgaGGCCATGCCAACCAAAGGCCGCATGGCCTCg < 2:351776‑M1/31‑1 (MQ=255) ttccacgggatcagcaacgggatagccatgacgatcaggcacaccgaGGCCATGCCAACCAAAGGCCGCATGGCCTCg > 1:351776‑M1/48‑78 (MQ=255) gCCTGCGTCCTGCTGATCGAAATTCCATTGGGTATAGGCATCGCTCTGGCCATGCCAACCAAAGGCCGCATGGCCTCGGTGTGCCTGATCGTCATGGCTATCCCGTTGCTGATCCCGTGGAACGTGGTCGGCACTATC‑TGGCAGATTTTc < 2:442195/150‑1 (MQ=255) aaaatcacATTGGGTATAGGCCTCGCTGTCGCTATGCCAACCAAAGGCCGCATGGCCGCGGTGTGCCTGATCGTCATGGCTTTCCCGTTGCTGGTCCCATGGAGCCTGGTCCGCATGATC‑TGTCAGATTTTCGTCCGTGCCGGTATCTGc < 2:6494/143‑1 (MQ=255) ccATTGGGTATAGGCATCGCTCTGGCCATGCCAACCAAAGGCCGCATGGCCTCGGTGTGCCTGATCGTCATGGCTATCCCGTTGCTGATCCCGTGGAACGTGGTCGGCACTATC‑TGGCAGATTTTCGGCCGTGCCGATATCGGCCTGCTc < 1:462713/150‑1 (MQ=255) aGGCATCGCTCTGGCCATGCCAACCAAAGGCCGCATGGCCTCGGTGTGCCTGATCGTCATGGCTATCCCGTTGCTGATCCCGTGGAACGTGGTCGGCACTATC‑TGGCAGATTTTCGGCCGTGCCGATATCGGCCTGCTCGGCGCTTCCCt > 1:83334/1‑150 (MQ=255) gCATCGCTCTGGCCATGCCAACCAAAGGCCGCATGGCCTCGGTGTGCCTGATCGTCATGGCTATCCCGTTGCTGATCCCGTGGAACGTGGTCGGCACTATC‑TGGCAGATTTTCGGCCGTGCCGATATCGGCCTGCTCGGCGCTTCCCTgg > 2:299536/1‑150 (MQ=255) cATCGCTCTGGCCATGCCAACCAAAGGCCGCATGGCCTCGGTGTGCCTGATCGTCATGGCTATCCCGTTGCTGATCCCGTGGAACGTGGTCGGCACTATC‑TGGCAGATTTTCGGCCGTGCCGATATCGGCCTGCTCGGCGCTTCCCTGGc < 2:83334/150‑1 (MQ=255) aTCGCTCTGGCCATGCCAACCAAAGGCCGCATGGCCTCGGTGTGCCTGATCGTCATGGCTATCCCGTTGCTGATCCCGTGGAACGTGGTCGTCACTATC‑TGGCAGATTTTCGGCCGTGCCGATATCGGCCTGCTCGGCGCTTCCCTGGcc > 2:141727/1‑150 (MQ=255) gCTCTGGCCCTACCCACAAAAGGCCGCATTGGCTCGGGGTGCCTGATTGTCATGGCTATCCCGTTGCTGATCCCGTCGAACGTGGTCGGCCCTACCACGCCTGAGCATC‑CCGGTCCCGAGATTGGCCTGCGTGTCGCTTCCCTGGCCAAg > 2:135371/1‑150 (MQ=255) | GTCCAGCCGCTACTTCGTCGGTGCCGACTGGTACCGCCAGGTGCTGCGCGACCCGGCGCTGCACGACGCATTGCTGCGCCAGTTCATTTACTCGGCCTGCGTCCTGCTGATCGAAATTCCATTGGGTATAGGCATCGCTCTGGCCATGCCAACCAAAGGCCGCATGGCCTCGGTGTGCCTGATCGTCATGGCTATCCCGTTGCTGATCCCGTGGAACGTGGTCGGCACTATC‑TGGCAGATTTTCGGCCGTGCCGATATCGGCCTGCTCGGCGCTTCCCTGGCCAAG > NC_002947/2580950‑2581235 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |