| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2942765 = | 18 (0.770) | 3 (0.130) | 3/244 | NT | 13.5% | intergenic (‑523/‑850) | PP_2575/PP_2577 | hypothetical protein/paraquat‑inducible protein B |
| ? | NC_002947 | 2942805 = | 21 (0.940) | intergenic (‑563/‑810) | PP_2575/PP_2577 | hypothetical protein/paraquat‑inducible protein B | |||||
TGACCCACTCGGCCACATTGTGGGACGCCGTGCAGATCCTCAGTCACGGCAGTATCACCTTCATCGCTCTGGTCATGGCGCTGTCGATCATTTTTGCGCCGCTGCTGCAAATTGCCCTGTTGTGCTGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGGTGTGTCTGCTGGGGGCGATGGTGGCGGTGATCAAGCTGGCGGGGCTGCTCGATGTGATC > NC_002947/2942616‑2942896 | tGACCCGCTCGGCTTGATTGTGCGACGCCGGGGCGATCCTCAGTCACGGCAGTATCACCTTCATCGCTCTGGTCATGGCTCTGTCGATCATTTTTGCGCCGCTGCTGCAAATTGCCCTGTTGTGCTGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCCg < 2:231971/150‑1 (MQ=255) aCCCACTCGGTCACATTGTGAGACGGTGTGCCATTCAGCAGACAGATCAGTAGCATCTTCGTCGCTCTGGTCATGGCGCTGTCGATCATTTTTGCGCCGCTGCTGCAAATTGCCCTGTTGTGCTGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCCGGc < 2:67550/150‑1 (MQ=255) ggACGCCGTGCAGATCCTCAGTCACGGCAGTATCACCTTCATCGCTCTGGTCAGGGCGCTGTCGATCATTTTTGCGCCGCTGCTGCAAATTGCCCTGTTGTGCTGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGc > 1:322807/1‑150 (MQ=255) ggccagcaggccgataccggggatcacatcgagcagccccgccagcttgatcaccgccaccatcgcccccagcagacacacctccagcatgctccagggccgcaggctttccaGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTg > 2:28122‑M1/114‑150 (MQ=255) tCAGTCACGGCAGTATCACCTTCATCGCTCTGGTCATGGCGCTGTCGATCATTTTTGCGCCGCTGCTGCAAATTGCCCTGTTGTGCTGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGcc > 2:15489/1‑150 (MQ=255) tCACGGCAGTATCACCTTCATCGCTCTGGTCATGGCGCTGTCGATCATTTTTGCGCCGCTGCTGCAAATTGCCCTGTTGTGCTGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGa > 1:304985/1‑150 (MQ=255) gCAGTATCACCTTCATCGCTCTGGTCATGGCTCTGTCGAGCATTTTTGCGCCGGTACTGCAAATTGCCCTGTTGTGCTGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCGGGCCAGCCTGCCGCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGcc > 1:495641/1‑150 (MQ=255) tCACCTTCATCGCTCTGGTCATGGCGCTGTCGATCATTTTTGCGCCGCTGCTGCAAATTGCCCTGTTGTGCTGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGc > 1:185347/1‑150 (MQ=255) aCCTTCATCGCTCTGGTCATGGCGCTGTCGATCATTTTTGCGCCGCTGCTGCAAATTGCCCTGTTGTGCTGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGccc < 2:502580/150‑1 (MQ=255) ccTTCATCGCTCTGGTCATGGCGCTGTCGATCATTTTTGCGCCGCTGCTGCAAATTGCCCTGTTGTGCTGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCt < 1:15489/150‑1 (MQ=255) tcgagcagccccgccagcttgatcaccgccaccatcgcccccagcagacacacctccagcatgctccagggccgcaggctttccaGGc > 1:373092‑M1/86‑88 (MQ=255) tcgagcagccccgccagcttgatcaccgccaccatcgcccccagcagacacacctccagcatgctccagggccgcaggctttccaGGc < 2:373092‑M1/3‑1 (MQ=255) cATGGCGCTGTCGATCATTTTTGCGCCGCTGCTGCAAATTGCCCTGTTGTGCTGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGgt < 1:394209/150‑1 (MQ=255) tGGCGCTGTCGATCATTTTTGCGCCGCTGCTGCAAATTGCCCTGTTGTGCTGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGgtgt < 1:345502/150‑1 (MQ=255) tGGCGCCGTCGATCAGGTTTGCGCCGCTGCTGCAAATTGCCCTGTTGTGCTGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGgtgt < 2:475351/150‑1 (MQ=255) cATTTTTGCGCCGCTGCTGCAAATTGCCCTGTTGTGCTGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGGTGTGTCTGCTGGGGGc > 2:409203/1‑150 (MQ=255) ccgccaccatcgcccccagcagacacacctccagcatgctccagggccgcaggctttccaGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGc > 1:600085‑M1/61‑99 (MQ=255) ccgccaccatcgcccccagcagacacacctccagcatgctccagggccgcaggctttccaGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGc < 2:600085‑M1/39‑1 (MQ=255) gcgcCGCTGCTGCAAATTGCCCTGTTGTGCTGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGGTGTGTCTGCTGGGGGCGAtggtg < 1:409203/150‑1 (MQ=255) gcgcCGCTGCTGCAAATTGCCCTGTTGTGCTGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGGTGTGTCTGCTGGGGGCGAtggtg < 1:584929/150‑1 (MQ=255) ccgcTGCTGCAAATTGCCCTGTTGTGCTGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGGTGTGTCTGCTGGGGGCGATGGTGGCg < 2:185347/150‑1 (MQ=255) tGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGGTGTGTCTGCTGGGGGCGATGGTGGCGGTGATCAAGCTGGCGGGGCTGCTCGAt < 2:304985/150‑1 (MQ=255) ttGGGTTTTGCCCTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGGTGTGTCTGCTGGGGGCGATGGTGGCGGTGATCAAGCTGGCGGGGCTGCTAGATGTGATc > 1:257918/1‑150 (MQ=255) cTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGGTGTGTCTGCTggg > 2:331929/1‑92 (MQ=255) cTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGGTGTGTCTGCTggg < 1:331929/92‑1 (MQ=255) | TGACCCACTCGGCCACATTGTGGGACGCCGTGCAGATCCTCAGTCACGGCAGTATCACCTTCATCGCTCTGGTCATGGCGCTGTCGATCATTTTTGCGCCGCTGCTGCAAATTGCCCTGTTGTGCTGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGGTGTGTCTGCTGGGGGCGATGGTGGCGGTGATCAAGCTGGCGGGGCTGCTCGATGTGATC > NC_002947/2942616‑2942896 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |