New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2942765 = | 18 (0.770) | 3 (0.130) | 3/244 | NT | 13.5% | intergenic (‑523/‑850) | PP_2575/PP_2577 | hypothetical protein/paraquat‑inducible protein B |
? | NC_002947 | 2942805 = | 21 (0.940) | intergenic (‑563/‑810) | PP_2575/PP_2577 | hypothetical protein/paraquat‑inducible protein B |
TCACGGCAGTATCACCTTCATCGCTCTGGTCATGGCGCTGTCGATCATTTTTGCGCCGCTGCTGCAAATTGCCCTGTTGTGCTGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGGTGTGTCTGCTGGGGGCGATGGTGGCGGTGATCAAGCTGGCGGGGCTGCTCGATGTGATCCCCGGTATCGGCCTGCTGGCCCTGGCCGCATTGAGCATGTTGATCAT > NC_002947/2942659‑2942943 | tCACGGCAGTATCACCTTCATCGCTCTGGTCATGGCGCTGTCGATCATTTTTGCGCCGCTGCTGCAAATTGCCCTGTTGTGCTGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGa > 1:304985/1‑150 (MQ=255) gCAGTATCACCTTCATCGCTCTGGTCATGGCTCTGTCGAGCATTTTTGCGCCGGTACTGCAAATTGCCCTGTTGTGCTGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCGGGCCAGCCTGCCGCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGcc > 1:495641/1‑150 (MQ=255) tCACCTTCATCGCTCTGGTCATGGCGCTGTCGATCATTTTTGCGCCGCTGCTGCAAATTGCCCTGTTGTGCTGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGc > 1:185347/1‑150 (MQ=255) aCCTTCATCGCTCTGGTCATGGCGCTGTCGATCATTTTTGCGCCGCTGCTGCAAATTGCCCTGTTGTGCTGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGccc < 2:502580/150‑1 (MQ=255) ccTTCATCGCTCTGGTCATGGCGCTGTCGATCATTTTTGCGCCGCTGCTGCAAATTGCCCTGTTGTGCTGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCt < 1:15489/150‑1 (MQ=255) cATGGCGCTGTCGATCATTTTTGCGCCGCTGCTGCAAATTGCCCTGTTGTGCTGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGgt < 1:394209/150‑1 (MQ=255) tGGCGCTGTCGATCATTTTTGCGCCGCTGCTGCAAATTGCCCTGTTGTGCTGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGgtgt < 1:345502/150‑1 (MQ=255) tGGCGCCGTCGATCAGGTTTGCGCCGCTGCTGCAAATTGCCCTGTTGTGCTGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGgtgt < 2:475351/150‑1 (MQ=255) cATTTTTGCGCCGCTGCTGCAAATTGCCCTGTTGTGCTGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGGTGTGTCTGCTGGGGGc > 2:409203/1‑150 (MQ=255) gcgcCGCTGCTGCAAATTGCCCTGTTGTGCTGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGGTGTGTCTGCTGGGGGCGAtggtg < 1:409203/150‑1 (MQ=255) gcgcCGCTGCTGCAAATTGCCCTGTTGTGCTGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGGTGTGTCTGCTGGGGGCGAtggtg < 1:584929/150‑1 (MQ=255) ccgcTGCTGCAAATTGCCCTGTTGTGCTGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGGTGTGTCTGCTGGGGGCGATGGTGGCg < 2:185347/150‑1 (MQ=255) tGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGGTGTGTCTGCTGGGGGCGATGGTGGCGGTGATCAAGCTGGCGGGGCTGCTCGAt < 2:304985/150‑1 (MQ=255) ttGGGTTTTGCCCTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGGTGTGTCTGCTGGGGGCGATGGTGGCGGTGATCAAGCTGGCGGGGCTGCTAGATGTGATc > 1:257918/1‑150 (MQ=255) cTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGGTGTGTCTGCTggg < 1:331929/92‑1 (MQ=255) cTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGGTGTGTCTGCTggg > 2:331929/1‑92 (MQ=255) gccacgcatgcacagggcaaagccgggggcacgctggccTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGGTGTGTCTGCTGGGGGCGATGGTGGCgg < 2:600085‑M2/60‑1 (MQ=255) gccacgcatgcacagggcaaagccgggggcacgctggccTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGGTGTGTCTGCTGGGGGCGATGGTGGCgg > 1:600085‑M2/40‑99 (MQ=255) cacgcatgcacagggcaaagccgggggcacgctggccTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGGTGTGTCTGCTGGGGGCGATGGTGGCGGTGATCAAGCTGGCGGGGCTGCTCGATGTGATCCCCGGTATCGGCCTGctggcc > 2:28122‑M2/38‑150 (MQ=255) atcGTGCCCCCGGCTTTCCCCTGTCCCTGCTTCGCCTGAACCGCCTGCTGCCATGGCGCATGCTGGAGGTGTGTCTGCTGTGCGCGATGTTGTTGTCGTTCCAGCTGGCGTGGCTGCTCGATGTGATCCCCGGTATCGGCCTGctggccc < 2:257918/148‑1 (MQ=255) gCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGGTGTGTCTGCTGGGGGCGATGGTGGCGGTGATCAAGCTGGCGGGGCTGCTCGAt < 2:147936/105‑1 (MQ=255) gCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGGTGTGTCTGCTGGGGGCGATGGTGGCGGTGATCAAGCTGGCGGGGCTGCTCGAt > 1:147936/1‑105 (MQ=255) ccTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGGTGTGTCTGCTGGGGGCGATGGTGGCGGTGATCAAGCTGGCGGGGCTGCTCGATGTGATCCCCGGTATCGGCCTGctggccctgg < 1:582850/134‑1 (MQ=255) ccTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGGTGTGTCTGCTGGGGGCGATGGTGGCGGTGATCAAGCTGGCGGGGCTGCTCGATGTGATCCCCGGTATCGGCCTGctggccctgg > 2:582850/1‑134 (MQ=255) cATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGGTGTGTCTGCTGGGGGCGATGGTGGCGGTGATCAAGCTGGCGGGGCTGCTCGATGTGATCCCCGGTATCGGCCTGCTGGCCCTGGCCGCATTGAGCATGTTGatcat > 1:78914/1‑150 (MQ=255) aTGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGGTGTGTCTGCTGGGGGCGATGGTGGCGGTGATCAAGCTGGCgg > 2:423492/1‑85 (MQ=255) aTGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGGTGTGTCTGCTGGGGGCGATGGTGGCGGTGATCAAGCTGGCgg < 1:423492/85‑1 (MQ=255) gccTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGGTGTGTCTGCTGGGGGCGATGGTGGCGGTGATCAAGCTGGCGGGGCTGCTCGa < 2:373092‑M2/85‑1 (MQ=255) gccTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGGTGTGTCTGCTGGGGGCGATGGTGGCGGTGATCAAGCTGGCGGGGCTGCTCGa > 1:373092‑M2/4‑88 (MQ=255) | TCACGGCAGTATCACCTTCATCGCTCTGGTCATGGCGCTGTCGATCATTTTTGCGCCGCTGCTGCAAATTGCCCTGTTGTGCTGGGTGTTGGGTTTTGCCCTTGCCGGCCAGCGTGCCCCCGGCTTTGCCCTGTGCATGCGTGGCCTGGAAAGCCTGCGGCCCTGGAGCATGCTGGAGGTGTGTCTGCTGGGGGCGATGGTGGCGGTGATCAAGCTGGCGGGGCTGCTCGATGTGATCCCCGGTATCGGCCTGCTGGCCCTGGCCGCATTGAGCATGTTGATCAT > NC_002947/2942659‑2942943 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |