New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5216577 = | 22 (0.870) | 8 (0.330) | 8/262 | 1.7 | 28.0% | coding (177/2331 nt) | PP_4596 | putative oxidoreductase |
? | NC_002947 | 5216608 = | 20 (0.820) | coding (146/2331 nt) | PP_4596 | putative oxidoreductase |
GCTGACGCTGTATTTGGCGAAGAAAGCCGGGTCGACCGAGCGGCCGGTGGCTTCCCAGTTGACCGCCTTGGCGCCGTTTTCGCAGAACTTGACCATGTCGCTTTCCGGCGACTCGCCCCAGGCACAGCCGGGGCAGTCGAAACCGCCGTTCTGGTTGGTCTTGAGCATGGCCCGCAGGTTCTTGAAGGCGTTGTCGCTGCCCAGCCAGCTCTTGGTCACGCTTTTGAGCGCCCCCCAGCCGGCAGCGGCGCCCTTGTAGTCCCTGATGTGTTCGTCCTGGCTCATGCGA > NC_002947/5216469‑5216757 | gcTGACGCCGGATTTGGCGAAGAAAGCCGGGTAGACCTCGCGGCCGGTGGCTTCGCAGTTGACCGCCTTGGCTCCGTTGTCGCAGAACTTGACCATGTCGCTTTCCGACGACTCGGCCCACGCACAGCCGGGGCAGTCGAAGcagccgat > 2:485553/1‑148 (MQ=255) gCGAAGAAAGCCGGGTCGACCGAGCGGCCGGTGGCTTCCCAGTTGACCGCCTTGGCGCCGTTTTCGCAGAACTTGTCCATGTCGCTTTCCGGCGACTCGCCCCAGGCACAGCCGGGGCAGTCGAAAc > 1:295219/1‑127 (MQ=255) gCGAAGAAAGCCGGGTCGACCGAGCGGCCGGTGGCTTCCCAGTTGACCGCCTTGGCGCCGTTTTCGCAGAACTTGACCATGTCGCTTTCCGGCGACTCGCCCCAGGCACAGCCGGGGCAGTCGAAAc < 2:295219/127‑1 (MQ=255) aaaGCCGGGTCGACCGAGCGGCCGGTGGCTTCCCAGTTGACCGCCTTGGCGCCGTTTTCGCAGAACTTGACCATGTCGCTTTCCGGCGACTCGCCCCAGGCACAGCCGGGGCAGTCGAAACCGCCGTTCTGGTTGGTCTTGAGCATGGcc > 1:283190/1‑150 (MQ=255) gTCGACCGAGCGGCCGGTGGCTTCCCAGTTGACCGCCTTGGCGCCGTTTTCGCAGAACTTGACCATGTCGCTTTCCGGCGACTCGCCCCAGGCACAGCCGGGGCAGTCGAAACCGCCGTTCTGGTTGGTCTTGAGCATGGCCCGCAGGtt > 2:541343/1‑150 (MQ=255) ctaGCGGCCGGTGGCTTCCCAGTTGACCGCCTTGGCGCCGTTTTCGCAGAACTTGACCATGTCGCTTTCCGGCGACTCGCCCCAGGCACAGCCGGGGCAGTCGAAACCGCCGTTCTGGTTGGTCTTGAGCATGGCCCGCAGGTTCTTGaa < 1:72705/148‑1 (MQ=255) gCCGGTGGCTTCCCAGTTGACCGCCTTGGCGCCGTTTTCGCAGAACTTGACCATGTCGCTTTCCGGCGACTCGCCCCAGGCACAGCCGGGGCAGTCGAAACCGCCGTTCTGGTTGGTCTTGAGCATGGCCCGCAGGTTCTTGAAGGCGtt < 2:283190/150‑1 (MQ=255) gTGGCTTCCGAGTTGACCGCCTTGGCGCCGTTTTCGCAGAACTTGACCATGTCGCTTTCCGGCGACTCGCCCCAGGCACAGCCGGGGCAGTCGAAACCGCCGTTCTGGTTGGTCTTGAGCATGGCCCGCAGGTTCTTGAAGGCGTTGTCg > 2:60109/1‑150 (MQ=255) gacaacgccttcaagaacctgcgggccatgctcaagaccaaccagaacggcggtttCGACTCGCCCCAGGCACAGCCGGGGCAGTCGAAACCGCCGTTc < 1:280248‑M1/43‑1 (MQ=255) gacaacgccttcaagaacctgcgggccatgctcaagaccaaccagaacggcggtttCGACTCGCCCCAGGCACAGCCGGGGCAGTCGAAACCGCCGTTc > 2:280248‑M1/57‑99 (MQ=255) aCCGCCTTGGCGCCGTTTTCGCAGAACTTGACCATGTCGCTTTCCGGCGACTCGCCCCAGGCACAGCCGGGGCAGTCGAAACCGCCGTTCtgg < 2:573625/93‑1 (MQ=255) aCCGCCTTGGCGCCGTTTTCGCAGAACTTGACCATGTCGCTTTCCGGCGACTCGCCCCAGGCACAGCCGGGGCAGTCGAAACCGCCGTTCtgg > 1:573625/1‑93 (MQ=255) gCCTTGGCGCCGTTTTCGCAGAACTTGACCATGTCGCTTTCCGGCGACTCGCCCCAGGCACAGCCGGGGCAGTCGAAACCGCCGTTCTGGTTGGTCTTGAGCATGGCCCGCAGGTTCTTGAAGGCGTTGTCGCTGCCCAGCCAGCTCTTg < 1:541343/150‑1 (MQ=255) ccTTGGCGCCGTTTTCGCAGAACTTGACCATGTCGCTTTCCGGCGACTCGCCCCAGGCACAGCCGGGGCAGTCGAAACCGCCGTTCTGGTTGGTCTTGAGCATGGCCCGCAGGTTCTTGAAGGCGTTGTCGCTGCCCAGCCAGCTCTTgg < 1:611408/150‑1 (MQ=255) gcCGTTTTCGCAGAACTTGACCATGACGCTTTCCGGCGACTCGCCCCAGGCACAGCCGGGGCAGTCGAAACCGCCGTTCTGGTTGGTCTTGAGCATGGCCCGCAGGTTCTTGAAGGCGTTGTCGCTGCCCAGCCAGCTCTTGGTCACGCt > 2:570622/1‑150 (MQ=255) ttttCGCAGAACTTGACCATGTCGCTTTCCGGCGACTCGCCCCAGGCACAGCCGGGGCAGTCGAAACCGCCGTTCTGGTTGGTCTTGAGCATGGCCCGCAGGTTCTTGAAg > 1:140169/1‑111 (MQ=255) ttttCGCAGAACTTGACCATGTCGCTTTCCGGCGACTCGCCCCAGGCACAGCCGGGGCAGTCGAAACCGCCGTTCTGGTTGGTCTTGAGCATGGCCCGCAGGTTCTTGAAg < 2:140169/111‑1 (MQ=255) aCCATGTCGCTTTCCGGCGTCTCGCCCCAGGCACAGCCGGGGCAGTCGAAACCGCCGTTCTGGTTGGTCTTGAGCATGGCCCGCAGGTTCTTGAAGGCGTTGTCGCTGCCCAGCCAGCTCTTGGTCACGCTTTTGAGCGCCCCCCAGCCg < 1:485553/150‑1 (MQ=255) tGTCGCTTTCCGGCGACTCGCCCCAGGCACAGCCGGGGCAGTCGAAACCGCCGTTCTGGTTGGTCTTGAGCATGGCCCGCAGGTTCTTGAAGGCGTTGTCGCTGCCCAGCCAGCTCTTGGTCACGCTTTTGAGCGCCCCCCAGCCGGCAg < 1:570622/150‑1 (MQ=255) gaacggcggtttcgactgccccggctgtgcctggggcgagtcgAAACCGCCGTTCTGGTTGGTCTTGAGCATGGCCCGCAGGTTCTTGAAGGCGTTGTc < 1:280248‑M2/56‑1 (MQ=255) gaacggcggtttcgactgccccggctgtgcctggggcgagtcgAAACCGCCGTTCTGGTTGGTCTTGAGCATGGCCCGCAGGTTCTTGAAGGCGTTGTc > 2:280248‑M2/44‑99 (MQ=255) gactgccccggctgtgcctggggcagtcgAAACCGCCGTTCTGGTTGGTCTTGAGCATGGCCCGCAGGTTCTTGAAGGCGTTGTCGCTGCCCAGCCAGCTCTTGGTCACGCTTTTGAGCGCCCCCCAGCCGGCAGCGGCGCCCTTGTa < 1:492052‑M2/119‑1 (MQ=255) gactgccccggctgtgcctggggcagtcgAAACCGCCGTTCTGGTTGGTCTTGAGCATGGCCCGCAGGTTCTTGAAGGCGTTGTCGCTGCCCAGCCAGCTCTTGGTCACGCTTTTGAGCGCCCCCCAGCCGGCAGCGGCGCCCTTGTa > 2:492052‑M2/30‑148 (MQ=255) actgccccggctgtgcctggggcgagtcgAAACCGCCGTTCTGGTTGGTCTTGAGCATGGCCCGCAGGTTCTTGAAGGCGTTGTCGCTGCCCAGCCAGCTCTTgg > 2:315219‑M2/30‑105 (MQ=255) actgccccggctgtgcctggggcgagtcgAAACCGCCGTTCTGGTTGGTCTTGAGCATGGCCCGCAGGTTCTTGAAGGCGTTGTCGCTGCCCAGCCAGCTCTTgg < 1:315219‑M2/76‑1 (MQ=255) TCGCCCCAGGCACAGTCGGGGCAGTCGAAACCGCCGTTCTGGTTGGTCTTGAGCATGGCCCGCAGGTTc < 2:154923‑M1/69‑1 (MQ=255) TCGCCCCAGGCACAGCCGGGGCAGTCGAAACCGCCGTTCTGGTTGGTCTTGAGCATGGCCCGCAGGTTc > 1:154923‑M1/1‑69 (MQ=255) TCGCCCCAGGCACAGCCGGGGCAGTCGAAACCGCCGTTCTGGTTGGTCTTGAGCATGGCCCGCAGGTTCTTGAAGGCGTTGTCGCTGCCCAGCCAGCTCTTGGTCACGCTTTTGAGCGCCCCCCAGCCGGCAGCGGCGCCCTTGTAGTcc < 1:47040‑M1/150‑1 (MQ=255) ggctgtgcctggggcagtcgAAACCGCCGTTCTGGTTGGTCTTGAGCATGGCCCGCAGGTTCTTGAAGGCGTTGTCGCTGCcca > 2:216776‑M2/21‑84 (MQ=255) ggctgtgcctggggcagtcgAAACCGCCGTTCTGGTTGGTCTTGAGCATGGCCCGCAGGTTCTTGAAGGCGTTGTCGCTGCcca < 1:216776‑M2/64‑1 (MQ=255) ggCACAGCCGGGGCAGTCGAAACCGCCGTTCTGGTTGGTCTTGAGCATGGCCCGCAGGTTCTTGAAGGCGTTGTCGCTGCCCAGCCAGCTCTTGGTCACGCTTTTGAGCGCCCCCCAGCCGGCAGCGGCGCCCTTGTAGTCCCTGAtgtg < 1:60109/150‑1 (MQ=255) cacaGTCGGGGCAGTCGAAACCGCCGTTCTGGTTGGTCTTGAGCATGGCTCGCAGGTTCTTGAAGGCGTTGTCGCTGCCCAGCCAGCTCTTGGTCACGCTTTTGAGCGCCCCCCAGCCGGCAGCGGCGCCCTTGTAGTCCCTGATGTGtt < 1:447184/150‑1 (MQ=255) accgCCGAGGCAGTCGAAACCGCCGTGATGGCTGATCTTAAGCATGGCACGCAGCTTCGTGAACGCGTTGTCGCGGCCCAGCCACCTCTTGTTCACGCTTTTGAGGGCCCCCCAGCCGGCAGCGGGGCCCTTGTAGTCCCTGATTTGttt > 2:415243/4‑149 (MQ=255) gAAACCGCCGTTCTGGTTGGTCTTGAGCATGGCCCGCAGGTTCTTGAAGGCGTTGTCGCTGCCCAGCCAGCTCTTGGTCACGCTTTTGAGCGCCCCCCAGCCGGCAGCGGCGCCCTTGTAGTCCCTGATGTGTTCGTCCTGGCTCATGCg > 1:523314‑M2/2‑150 (MQ=255) aaaCCGCCGTTCTGGTTGGTCTTGAGCATGGCCCGCAGGTTCTTGAAGGCGTTGTCGCTGCCCAGCCAGCTCTTGGTCACGCTTTTGAGCGCCCCCCAGCCGGCAGCGGCGCCCTTGTAGTCCCTGATGTGTTCGTCCTGGCTCATGCGa < 2:47040/150‑1 (MQ=255) | GCTGACGCTGTATTTGGCGAAGAAAGCCGGGTCGACCGAGCGGCCGGTGGCTTCCCAGTTGACCGCCTTGGCGCCGTTTTCGCAGAACTTGACCATGTCGCTTTCCGGCGACTCGCCCCAGGCACAGCCGGGGCAGTCGAAACCGCCGTTCTGGTTGGTCTTGAGCATGGCCCGCAGGTTCTTGAAGGCGTTGTCGCTGCCCAGCCAGCTCTTGGTCACGCTTTTGAGCGCCCCCCAGCCGGCAGCGGCGCCCTTGTAGTCCCTGATGTGTTCGTCCTGGCTCATGCGA > NC_002947/5216469‑5216757 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |