New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1789697 | 108 (1.160) | 9 (0.100) | 8/236 | NT | 8.0% | coding (373/816 nt) | cdsA | CTP:phosphatidate cytidyltransferase |
? | NC_002947 | = 1789716 | 104 (1.180) | coding (392/816 nt) | cdsA | CTP:phosphatidate cytidyltransferase |
CGGAACTGGCGCCCTGGGTGCTGGGCGCTGCCGTGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/1789542‑1789697 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑caagggcCAGTGCTTGAGCAGCACCAGCCCTTGCCAGGCCGGCAGCAACACCAGCAGGCCGATCAACAACCGACAGGCCGCACTGGCCCACAGGTCGCTGCTGCGCGGGTAGGTA‑AGCACCAGCCAGGTGGCCAGCCCCCACCAGATCACGGCAGC < NC_002947/1789716‑1789568 CGGAACTGGCGCCCTGGGTGCTGGGCGCTGCCGTGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGC > 1:673986/1‑150 GGAACTGGCGCCCTGGGTGCTGGGCGCTGCCGTGATGTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCA > 2:1072278/1‑150 GAACTGGCGCCCTGGGTGCTGGGCGCTGCCGTGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAA < 2:595789/150‑1 AACTGGCGCCCTGGGTGCTGGGCGCTGCCGTGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAG < 2:223356/150‑1 AACTGGCGCCCTGGGTGCTGGGCGCTGCCGTGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAG < 2:1344642/150‑1 AACTGGCGCCCTGGGTGCTGGGCGCTGCCGTGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCACCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAG < 2:1374191/150‑1 cCTGCCGCCCTGGGTGCTGGGCGCTGCCGTGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGG < 1:925490/149‑1 ACTGGCGCCCTGGGTGCTGGGCGCTGCCGTGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGG < 2:1585121/150‑1 GTGCTGGGCGCTGCCGTGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCCAGTGCTTGAG > 2:1889122/1‑150 CGTGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCCAGTGCTTGAGCAGCACCAGCCCTT < 1:659549/150‑1 TCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCCAGTGCTTGAGCAGCACCAGCCCTTGCCAG < 1:1889122/150‑1 TGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCCAGTGCTTGTGCAGCACCAGCCCTTGCCA > 1:2238881/1‑125 TGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCCAGTGCTTGAGCAGCACCAGCCCTTGCCA < 2:2238881/125‑1 ACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCCAGTGCTTGAGCAGCACCAGCC > 2:454904/1‑110 ACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCCAGTGCTTGAGCAGCACCAGCC < 1:454904/110‑1 CAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCCAGTGCTTGAGCAGCACCAGCCCTTGCCAG < 1:1162826/89‑1 CAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCCAGTGCTTGAGCAGCACCAGCCCTTGCCAG > 2:1162826/1‑89 gaatGGCCAGTGCTTGAGCAGCACCAGCCCTTGCCAGGCCGGCAGCAACACCAGCAGGCCGATCAACAACCGACAGGCCGCACTGGCCCACAGGTCGCTGCTGCGCGGGTAGGTA‑AGCACCAGCCAGGGGGCCAGCCCCCACCAGATCAC > 1:1264923/5‑150 CAAGGGCCAGTGCTTGAGCAGCACCAGCCCTTGCCAGGCCGGCAGCAACACCAGCAGGCCGATCAACAACCGACAGGCCGCACTGGCCCACAGGTCGCTGCTGCGCGGGTAGGTA‑AGCACCAGCCAGGTGGCCAGCCCCCACCAGATCAC > 1:1504147/1‑150 AAGGGCCAGTGCTTGAGCAGCACCAGCCCTTGCCAGGCCGGCAGCAACACCAGCAGGCCGATCAACAACCGACAGGCCGCACTGGCCCACAGGTCGCTGCTGCGCGGGTAGGTA‑AGCACCAGCCAGGTGGCCAGCCCCCACCAGATCACG > 1:372165/1‑150 AAGGGCCAGTGCTTGAGCAGCACCAGCCCTTGCCAGGCCGGCAGCAACACCAGCAGGCCGATCAACAACCGACAGGCCGCACTGGCCCACAGGTCGCTGCTGCGCGGGTAGGTA‑AGCACCAGCCAGGTGGCCAGCCCCCACCAGATCACG > 2:2422912/1‑150 AAGGGCCAGTGCTTGAGCAGCACCAGCCCTTGCCAGGCCGGCAGCAACACCAGCAGGCCGATCAACAACCGACAGGCCGCACTGGCCCACAGGTCGCTGCTGCGCGGG‑AGACATAGCACCAGCCAGGTGGCCAGCCCCCACCAGATCACG > 1:23709/1‑150 GGGCCAGTGCTTGAGCAGCACCAGCCCTTGCCAGGCCGGCAGCAACACCAGCAGGCCGATCAACAACCGACAGGCCGCACTGGCCCACAGGTCGCTGCTGCGCGGGTAGGTA‑AGCACCAGCCAGGTGGCCAGCCCCCACCAGATCACGGC < 1:1531498/150‑1 GCCAGTGCTTGAGCAGCACCAGCCCTTGCCAGGCCGGCAGCAACACCAGCAGGCCGATCAACAACCGACAGGCCGCACTGGCCCACAGGTCGCTGCTGCGCGGGTAGGTA‑AGCACCAGCCAGGTGGCCAGCCCCCACCAGATCACGGCAG > 2:1966447/1‑150 CCAGTGCTTGAGCAGCACCAGCCCTTGCCAGGCCGGCAGCAACACCAGCAGGCCGATCAACAACCGACAGGCCGCACTGGCCCACAGGTCGCTGGTGCGCGGGTAGGTA‑AGCACCAGCCAGGTGGCCAGCCCCCACCAGATCACGGCAGC < 2:1285327/150‑1 CGGAACTGGCGCCCTGGGTGCTGGGCGCTGCCGTGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/1789542‑1789697 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑caagggcCAGTGCTTGAGCAGCACCAGCCCTTGCCAGGCCGGCAGCAACACCAGCAGGCCGATCAACAACCGACAGGCCGCACTGGCCCACAGGTCGCTGCTGCGCGGGTAGGTA‑AGCACCAGCCAGGTGGCCAGCCCCCACCAGATCACGGCAGC < NC_002947/1789716‑1789568 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |